New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1262909 | 79 (0.890) | 3 (0.040) | 3/258 | 11.0 | 3.8% | intergenic (+34/‑193) | sucD/lytN_1 | Succinate‑‑CoA ligase [ADP‑forming] subunit alpha/putative cell wall hydrolase LytN |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1262932 | 80 (0.970) | intergenic (+57/‑170) | sucD/lytN_1 | Succinate‑‑CoA ligase [ADP‑forming] subunit alpha/putative cell wall hydrolase LytN | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CACCTTCAGAAATTGGTTCAACATTAATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTTTAATTAAAATATATAGCGCACTATGTTATAA > USA300TCH1516_ALE/1262793‑1263069 | cacCTTCAGAAATTGGTTCAACATTAATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGa < 2:109938/140‑1 (MQ=255) acCTTCAGAAATTGGTTCAACATTAAGTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGaa < 1:447525/140‑1 (MQ=255) tCAGAAATTTGTTCAACATTAATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTAAGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATgg < 1:354498/140‑1 (MQ=255) cAGAAATTGGTTCAACATTAATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATggg < 2:577325/140‑1 (MQ=255) cgAAATTGGTTTAACATTAATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGc < 1:438234/139‑1 (MQ=255) aaTTGGTTCAACATTAATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAATTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATTAAAGCATCGGAAATGGGCTAt < 1:516792/140‑1 (MQ=255) aaTTGGTTCAACATTAATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTAt < 2:666947/140‑1 (MQ=255) aaTTGGTTCAACATTAATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATACCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTAt < 2:664279/140‑1 (MQ=255) tGGTTCAACATTAATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTg < 2:848506/140‑1 (MQ=255) cATTAATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGa < 1:95000/140‑1 (MQ=255) ttGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAAtt > 2:390623/1‑140 (MQ=255) ttGAAGCTGCTAAAGAAGCACGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGGGCGATGAAtt < 2:243749/140‑1 (MQ=255) ctAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCAATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTCTCGTGCGATGGATTTTAGttaac > 1:829677/1‑136 (MQ=255) aaaGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACtt < 2:354928/140‑1 (MQ=255) aGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATATCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAACTCGGCTAATTCTTATTCGATGAATTTTAGTACAATTTTCATAtt > 2:454571/1‑140 (MQ=255) aGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATAtt > 1:351735/1‑140 (MQ=255) aGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATAtt > 1:388203/1‑140 (MQ=255) gTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTTACTAAAATGGGCTATTTTTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATAtttt > 1:188892/1‑140 (MQ=255) tATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTg > 1:760922/1‑140 (MQ=255) aTTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTgg > 1:988778/1‑140 (MQ=255) aTTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTgg < 2:938212/140‑1 (MQ=255) tATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACCCTTTTCATATCTTGGaca > 2:936390/1‑138 (MQ=255) aTGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGGAAg > 1:107159/1‑140 (MQ=255) aTGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGAGACAAATCGTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAg < 1:738332/140‑1 (MQ=255) aaactatatgaACTCTTAACAAATAAAATTAAAAGATGATATAAATGGCTATTTCCCATTCCATATTTTATAAAAGTATCGGATATTGGCTATTTGTCGTGAGATGATTTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACa < 2:8385/134‑1 (MQ=255) aaTCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGGTGGATTTTAGTACTCTTTTGATATTTTGGAAAGGCa > 1:17092/1‑140 (MQ=255) aaTCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACa < 2:359156/140‑1 (MQ=255) aagtattaACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGACGATATAAATGGCTATAGCCCAATCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTTGTGCGATGAATTTTAGTTCACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGt < 1:349894/137‑1 (MQ=255) ttattaACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGACTTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTa > 2:527623/1‑140 (MQ=255) taACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAatta > 1:969588/1‑140 (MQ=255) taACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAatta > 1:181609/1‑140 (MQ=255) taACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAatta > 1:787633/1‑140 (MQ=255) aaCTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAattat < 2:297498/140‑1 (MQ=255) aCTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAattatt > 1:585477/1‑140 (MQ=255) aCTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATAATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATAATTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAattatt < 2:208685/140‑1 (MQ=255) tGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTAtttt > 2:849577/1‑140 (MQ=255) gTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGACAGACAAGTTAATTATTTTa > 2:768947/1‑140 (MQ=255) taaataaaGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGTATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTAcctcc > 2:857856/1‑140 (MQ=255) aaataaaGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTCCATATTTTGGAAAGACAGGTTAATTATTTTAcctcct > 1:256168/1‑140 (MQ=255) aataaaGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTAGCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACATTTCATATTTTGGACAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTa > 2:295987/1‑140 (MQ=255) ataaaGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTAc > 1:658387/1‑140 (MQ=255) taaaGTTAAAAGGTGGTATAAATGGCTATGGCCCATTCCATTCTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACa < 2:89097/140‑1 (MQ=255) gtAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCACATTCCACACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGc < 2:703147/139‑1 (MQ=255) aaaaGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTGTCGGAAATGGCCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACaccacata > 2:286241/1‑133 (MQ=255) aaaGATGATCTAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGAAAATGGCCCAATGGTCGTGCGATGAATCTAAGTACACTTTTCACATTTTGCGAAGCCAAGTTAATTATTTTACTTCCTACAATAGCttc > 2:302391/1‑139 (MQ=255) aaaGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCttt > 2:304309/1‑140 (MQ=255) aaaGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCttt > 1:877942/1‑140 (MQ=255) aaaGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTACTACAATAGCttt > 2:966351/1‑140 (MQ=255) aGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTatat > 2:422123/1‑140 (MQ=255) gatgatATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTACTTATTTTACCTCCTACAATAGCTTtata > 2:360603/1‑140 (MQ=255) gatgatATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTtata > 2:733037/1‑140 (MQ=255) gatgatATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATAGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACATACTACTATAGCTTtata > 2:683544/1‑140 (MQ=255) gatgatATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTGTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATGTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTACTACAATAGCTTtatg > 2:884396/1‑139 (MQ=255) tgatATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACTTCCTACAATAGCTTTATaaa > 1:653323/1‑140 (MQ=255) gatATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTCCAATATCTTTATaaaa > 1:375594/1‑140 (MQ=255) tataAATGGCTATAGTCGTGTCCCTACGTTAGAAAAGTTTCGGAAATGGGCCATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACa < 2:999075/140‑1 (MQ=255) tataAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGTCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTCATTATTTTGACTCCTACAATAGCTTTATAAAAcc > 1:675918/1‑139 (MQ=255) tataAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTCCATCCTACACTTGCTTTATaaacaa > 2:976954/1‑137 (MQ=255) tataAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACa < 1:460863/140‑1 (MQ=255) ataAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTGAGTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACaa > 1:174003/1‑140 (MQ=255) aaaTGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAg < 1:763091/140‑1 (MQ=255) aTGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATGGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGGTAATTATTTTACCTCCTACAACAGCTTTATAAAACAAAGaa < 1:562206/140‑1 (MQ=255) tGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGaaa < 1:802328/140‑1 (MQ=255) aGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTttaa > 2:136501/1‑140 (MQ=255) gCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGGCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTttaat > 1:691179/1‑140 (MQ=255) cATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACACAGAAAATTttaattaa < 1:497707/140‑1 (MQ=255) cATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTttaattaa > 1:822008/1‑140 (MQ=255) tcATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTTTAATTAAAata < 2:163764/139‑1 (MQ=255) aTACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTTTAATTAAAatata > 1:565524/1‑140 (MQ=255) aTACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTTTAATTAAAatata > 1:565573/1‑140 (MQ=255) tACTTTGTAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTTTAATTAAAatatat < 1:849577/140‑1 (MQ=255) cTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTCTAATTCAAAGAATAGTTTAATTAAAATATATAg < 1:486142/140‑1 (MQ=255) tataAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTTTAATTAAAATATATAgcgc < 1:622117/140‑1 (MQ=255) taaaaaaGTAACGGAAATGGGCTATTTGACGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTCTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTTTAATTAAAATATATAgcgc < 2:65177/137‑1 (MQ=255) 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tATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTTTAATTAAAATATATAGCGCACTATGtt < 1:491378/140‑1 (MQ=255) tCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTTTAATTAAAATATATAGCGCACTATGTtat > 1:264702/1‑140 (MQ=255) gggAAATGGGCTATTTGTTGTGAGATGAATGTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACATGTTAATTATTTTACATCCTACAATAGCTTTATATAAAAACGAGAATTTTAATTAAAATATATGGAGAACTATGTtgta > 2:513759/2‑140 (MQ=255) cGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTTTAATTAAAATATATAGCGCACTATGTtata > 2:820432/1‑140 (MQ=255) cGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTTTAATTAAAATATATAGCGCACTATGTtata > 1:1005526/1‑140 (MQ=255) cGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTTTAATTAAAATATATAGCGCACAATGTtata > 2:243115/1‑140 (MQ=255) ggAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTTTAATTAAAATATATAGCGCACTATGTTATaa < 1:390623/140‑1 (MQ=255) ggAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTACTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTTTAATTAAAATATATAGCGCACTATGTTATaa > 1:426197/1‑140 (MQ=255) | CACCTTCAGAAATTGGTTCAACATTAATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTTTAATTAAAATATATAGCGCACTATGTTATAA > USA300TCH1516_ALE/1262793‑1263069 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |