Predicted mutation | ||||||
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MC JC | USA300TCH1516_ALE | 2,501,188 | Δ3,014 bp | melR_2–ydaG | melR_2, ydaG |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | USA300TCH1516_ALE | 2501188 | 2504201 | 3014 | 94 [0] | [0] 96 | melR_2–ydaG | melR_2,ydaG |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2501187 | 0 (0.000) | 91 (1.140) | 62/250 | 0.1 | 100% | intergenic (+1198/‑290) | USA300HOU_RS12875/melR_2 | hypothetical protein/Melibiose operon regulatory protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 2504202 = | 0 (0.000) | intergenic (+127/‑138) | ydaG/USA300HOU_RS12890 | General stress protein 26/hypothetical protein |
GATAAAATTTAAGTCATGGGTACATTTAATGTTTTTTGATTCAAACTTCCATTTTGGTCAATTTGCTTTTTTTATAACATAGTTGAATATCAATAAAAGATTAGCAAGTTAGTTCAAAATGGCTATGTATTGTTTTTTGAAATACATAGGTTTGAAATCTATATTAATTATGCACCAAATAATTTAATTAGACTCTATCGAAAATTTCCAAATTTTGCTTACTATCTTTCTAATTTTACTTTTATATTGTTCGCAATGCATAAAAACAAGCGTTT > USA300TCH1516_ALE/2501050‑2501324 | gATAAAATTTAAGTCATGGGTACATTTAATGTTTTTTGATTCAAACTTCCATTTTGGTCAATTTGCTTTTTTTATAACATAGTTGAATATCAATAAAAGATTAGCAAGTTAGTTCAAAATGGCTATGTATTGTTTTTTag < 1:528381‑M1/140‑3 (MQ=255) aaaTTTAAGTCATGGGTACATTTAATGTTTTTTGATTCAAACTTCCATTTTGGTCAATTTGCTTTTTTTATAACATAGTTGAATATCAATAAAAGATTAGCAAGTTAGTTCAAAATGGCTATGTATTGTTTTTTagacac > 2:625270‑M1/1‑134 (MQ=255) aaTTTAAGTCATGGGTACATTTAATGTTTTTTGATTCAAACTTCCATTTTGGTCAATTTGCTTTTTTTATAACATAGTTGAATATCACTAAAAGATTAGCAAGTTAGTTCAAAATGGCTACGTATTGTTTTTTagacaca > 2:75193‑M1/1‑133 (MQ=255) aTTTAAGTTATGAGTAAATTTAATATTTTTTATTACAAACTTCCACTTAGGTCAATTCGCTTTTTTTATAACATAGTTGAATATCAATAAAAGATTAGCAAGTTAGTTCAAAATGGCTATGTATTGTTTTTTagacacac < 1:1751‑M1/140‑9 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |