New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 739800 | 74 (0.830) | 6 (0.070) | 3/252 | 10.8 | 7.6% | intergenic (+27/+561) | pitA_1/sle1_2 | Low‑affinity inorganic phosphate transporter 1/N‑acetylmuramoyl‑L‑alanine amidase sle1 |
? | USA300TCH1516_ALE | = 739823 | 79 (0.980) | intergenic (+50/+538) | pitA_1/sle1_2 | Low‑affinity inorganic phosphate transporter 1/N‑acetylmuramoyl‑L‑alanine amidase sle1 | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
AACGAATGATCATTACATGGGTGATTACATTACCTATTTCAGCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGAACATAATCAGTTAGGTCATTAAAAT > USA300TCH1516_ALE/739685‑739958 | aaCGAGTGATCATTACAGGGGTGATTACATTACCTATTTCATCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTAtt < 2:792094/140‑1 (MQ=255) aCGAATGATCATTACATGGGTGATTACATTACCTATTTCAGCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTg > 1:318644/1‑140 (MQ=255) aaTGATTATTACATGGGTGATTACATTACCCATTTGAGCATTTTTATCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAg < 2:207997/140‑1 (MQ=255) tGATCATTACATTGGTGATTACATTACCTATTTCAGCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGtt < 1:358994/140‑1 (MQ=255) tACATGGGTGATTACATTACCTATTTCAGCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGtttt > 1:781601/1‑140 (MQ=255) cATGGGTGATTACATTACCTATTTCAGCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGtttttt < 1:221714/140‑1 (MQ=255) aTGGGTGATTACATTACCTATTTCAGCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTa > 2:630668/1‑140 (MQ=255) gTGATTACATTACCTATTTCAGCATTATTAGTATGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAACCTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTa < 1:533130/140‑1 (MQ=255) gATTACATTACTTATTTCAGCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAg < 2:64695/140‑1 (MQ=255) attacattacCTATTTCAGCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGt < 1:97829/140‑1 (MQ=255) tacattacCTATTTCAGCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAg < 2:856751/140‑1 (MQ=255) cattatCTATTTCAGCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGAt < 2:7166/140‑1 (MQ=255) ttacCTATTTCAGCATTGTTAGCCGGTTTACTAGTCTATAGACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATaa > 2:586394/1‑140 (MQ=255) ttCAGCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATAtttt > 1:405718/1‑140 (MQ=255) tCAGCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTTAAAATACAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAATTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATGTTTta > 1:689596/1‑140 (MQ=255) tCAGCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTta > 1:518947/1‑140 (MQ=255) catcATTGTTAGCATGTTTACTATTCTAGATACTTAACCTATTTTTGTCAGTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTG‑AGTATCACAAACCTATGGTGGTATTGAAGTCCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTtat < 1:883189/137‑1 (MQ=255) cAGCATTGTTAGCATGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTtat < 1:877968/140‑1 (MQ=255) aagtaTTGTTAGCAGGTTTACTATTTTATAGACGTAACTTATTTTTCCAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATACGTTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTtat < 1:883175/136‑1 (MQ=255) gCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAg < 2:229205/140‑1 (MQ=255) gCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAg > 1:372178/1‑140 (MQ=255) gCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAg < 1:7892/140‑1 (MQ=255) gCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAg < 2:894754/140‑1 (MQ=255) gCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGAGAACATATTTTATAg > 1:546279/1‑140 (MQ=255) gCAATGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTAATTTTCAAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAg < 1:573452/140‑1 (MQ=255) tGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAAtt > 2:808246/1‑140 (MQ=255) aGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACg > 1:247035/1‑140 (MQ=255) gCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAGCTTTATCGATCGTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGt < 1:476988/140‑1 (MQ=255) tttACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAAt > 1:798359/1‑140 (MQ=255) tttACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATAAGGAGGAATAGACGTTCAGTTTTAAATGTAAGTAGATAACATATTGTAAAAAATTAACGTAAAAt > 2:690347/1‑140 (MQ=255) tttACTATTCTATATACTTAAATTATTTTTCTAATTGCCAATAACTCATTAGGTAATGGC‑GGTATGAGAAACATATGGGGGGAATAACGTTGAGTTTTTGATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATGTACGGAGAAt > 2:113361/1‑140 (MQ=255) tttACTATTCTAAATACTTAACTTATTTTTCTACTAGCGTAATAAACTAAA‑AATACTACAAAGATCACGAAGATATGGTGATATTGAAGTTCAGTTTTTTGTGTAAGTAGATAACATATGTTATAGACTTTACGTAGAAt > 2:113366/1‑140 (MQ=255) gttACTGGTCTAGAGACGTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAAt > 2:996465/2‑140 (MQ=255) cTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAATTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACTTAGAATGAcc < 2:515433/140‑1 (MQ=255) tCTATATTCTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAACCTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGa < 2:53246/140‑1 (MQ=255) tatataCTTAACTTAATGTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACa < 2:425131/140‑1 (MQ=255) tataCTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACaaa < 1:366155/140‑1 (MQ=255) taCTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGc > 1:253155/1‑140 (MQ=255) 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(MQ=255) aTTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTa > 2:167177/1‑140 (MQ=255) aTTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTa > 1:672650/1‑140 (MQ=255) aTTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATACGGTGGTATTGAAGGTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGAACTAGACAAAGCATTTTAAttt > 1:189976/1‑139 (MQ=255) ttttCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGAATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTagg > 1:248930/1‑140 (MQ=255) ttttCTAATTGAAAAAAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTagg > 1:747088/1‑140 (MQ=255) cTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGAAAAAGGATTTTAATTAGGAGGc > 1:41945/1‑140 (MQ=255) taagttaaaaTAAAACTAAACTGCACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCt < 2:703518/134‑1 (MQ=255) tAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGAAGGCt > 1:752085/1‑140 (MQ=255) aaaaTAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTAtattt > 1:214057/1‑139 (MQ=255) aaaaTAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGAGGGTATTCAAGTTCAGTTTTATATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTACATTAGGAGGCTAtatta > 2:805975/1‑140 (MQ=255) aTAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGACGCTCCGGCTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGAAGAATAACCAAGACAAAGCATGTTAATTAGGAGGCTATATTATaa > 1:836290/1‑140 (MQ=255) tAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGAGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAACCATTTTAATTAGGAGCCTATATGAaaaa > 2:199349/1‑140 (MQ=255) actaaactGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTa > 1:841970/1‑140 (MQ=255) ctaaactGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTAATGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTCTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTAt > 2:749315/1‑140 (MQ=255) aaactGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTc > 2:913536/1‑140 (MQ=255) actGAACTTT‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCa < 2:821166/140‑1 (MQ=255) ctGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAGACATTTTAATTAGGAGGCTATATTTTAAATGTATTCCAt > 1:260391/1‑140 (MQ=255) ctGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATAAGACTTCTATATTATCCATGTATTcttt > 1:472108/1‑137 (MQ=255) tacacgtC‑AGTATCACAAACAGATGGGGGTATTGAAGTTAAGTGTTTTACGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAACGACCAAGACAAATCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTACTCCATg < 2:50659/134‑1 (MQ=255) tGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATg < 2:95384/140‑1 (MQ=255) aCTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGaa > 1:140376/1‑140 (MQ=255) cTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGAAc > 1:467379/1‑140 (MQ=255) gTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGAACTTAAt > 2:952812/1‑140 (MQ=255) tATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGAACATAATc > 1:804410/1‑140 (MQ=255) ttctcaAACCTAGGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTCTGTAAGTAGATAACCTATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGAACATAATCa < 2:287853/136‑1 (MQ=255) aTCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGAAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATCACCAAGACTAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGAACATAATCa < 1:581721/140‑1 (MQ=255) aTCACAAACAAATGGTGGTATTGAAATTCAGTCTTTTATGTCAGTACATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCCATTCTAATTAGTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGAACATAATCa < 1:581858/140‑1 (MQ=255) tCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGAACATAATCAg < 1:882173/140‑1 (MQ=255) acacaAACATATGGTGGTATTGAAAGTCAGTTTTTTATGTAAGCAGATAACCTATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAACCATTTTCATTAGGAGGCTCTATTATAAATGTATTCCATGGAACATAATCAg < 1:308455/139‑1 (MQ=255) acaAACATAAGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATATAATTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGAACATAATCAGtt > 1:735906/1‑140 (MQ=255) aaCATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATCAGTTTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGAACATAATCAGTTAgg < 1:730109/140‑1 (MQ=255) aaCATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGAACATAATCAGTTAgg < 2:140376/140‑1 (MQ=255) aaCATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGAACATAATCAGTTAgg < 2:442107/140‑1 (MQ=255) aaCATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGGAAGCAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGAACATAATCAGTTAgg < 2:301156/140‑1 (MQ=255) cATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGCCAAAGCCTTTTGAGTATGTGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGAACATAATCAGTTAGGTc < 2:361645/140‑1 (MQ=255) tatGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGAACATAATCAGTTAGGTCAt > 1:586509/1‑140 (MQ=255) attgtggtATTGAATTTCAGTTTTTTATGGAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGAACATATTCAGTTAGGTCAtt < 1:392223/137‑1 (MQ=255) gtggtATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGAACATAATCAGTTAGGTCATTaaa > 1:456471/1‑140 (MQ=255) ggtATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGAACATAATCAGTTAGGTCATTAAAat < 2:329013/140‑1 (MQ=255) | AACGAATGATCATTACATGGGTGATTACATTACCTATTTCAGCATTGTTAGCAGGTTTACTATTCTATATACTTAACTTATTTTTCTAATTGAAAATAAAACTAAACTGAACTTC‑AGTATCACAAACATATGGTGGTATTGAAGTTCAGTTTTTTATGTAAGTAGATAACATATTTTATAGAATTTACGTAGAATGACCAAGACAAAGCATTTTAATTAGGAGGCTATATTATAAATGTATTCCATGGAACATAATCAGTTAGGTCATTAAAAT > USA300TCH1516_ALE/739685‑739958 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |