| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_bme_pgi | = 618066 | 174 (0.910) | 24 (0.140) | 14/170 | 16.2 | 13.4% | intergenic (+28/‑188) | entF/fepE | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent/regulator of length of O‑antigen component of lipopolysaccharide chains |
| ? | NC_000913_3_bme_pgi | = 618073 | 160 (0.960) | intergenic (+35/‑181) | entF/fepE | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent/regulator of length of O‑antigen component of lipopolysaccharide chains | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
CATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTAC > NC_000913_3_bme_pgi/617967‑618164 | cATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTa > 1:192529/1‑100 (MQ=255) tgtgGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACa < 1:1009627/100‑1 (MQ=255) tgtgGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCAGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGAAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTa > 1:4374100/1‑98 (MQ=255) gtgGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTa > 2:2315669/1‑97 (MQ=255) tgGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAg < 2:966602/99‑1 (MQ=255) tgGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAg > 1:3996548/1‑99 (MQ=255) ggATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGa > 1:4500416/1‑99 (MQ=255) tattatCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGaaaa > 1:2903733/1‑99 (MQ=255) tattatCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAaat < 2:1112870/100‑1 (MQ=255) attatCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAaat > 1:2009756/1‑99 (MQ=255) atCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAaataat < 2:1227850/99‑1 (MQ=255) tctcCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATg > 1:497927/1‑100 (MQ=255) tcCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATggg > 2:4562003/1‑100 (MQ=255) tcCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATg < 2:1080055/98‑1 (MQ=255) cAGGGACGTTTGAAAAAATTTGGACGATTAGTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATggg < 2:1279729/98‑1 (MQ=255) cAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATggg < 2:1577436/98‑1 (MQ=255) cAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGtt < 1:891796/100‑1 (MQ=255) aGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTCTGGGttt > 2:4134062/1‑100 (MQ=255) cGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTAt > 2:1313616/1‑100 (MQ=255) gTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTAtt > 2:3254244/1‑100 (MQ=255) gTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTAtt > 1:4208336/1‑100 (MQ=255) 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2:4178429/1‑100 (MQ=255) aaaaaaTTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTAtttgttt < 2:552024/100‑1 (MQ=255) aaaaaaTTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTAtttgtt < 1:3950285/99‑1 (MQ=255) aaaaaaTTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTAgttgttt > 1:3821009/1‑100 (MQ=255) aaaaaTTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTAtttgtttg < 2:3430037/100‑1 (MQ=255) aaaaaTTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTAtttgtttg < 1:617244/100‑1 (MQ=255) aaTTGGGCCGATTATTCGCGAAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAATCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGAtt < 2:3323196/100‑1 (MQ=255) aaTTGGGCCGAGTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGAtt < 2:3060171/100‑1 (MQ=255) ttGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTta < 1:4702776/100‑1 (MQ=255) tGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTta > 1:1435936/1‑99 (MQ=255) ggCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAg < 1:2692748/100‑1 (MQ=255) ggCAGATTATTCGCACCACGCTAAACCGGTAACTTCATCTTATTTATAAACCCATAATTACACCAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGCTTtcta < 2:1432585/99‑1 (MQ=255) ccGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGt > 2:4721074/1‑100 (MQ=255) ccGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGt > 2:4086779/1‑100 (MQ=255) ttattCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTtga < 2:2698981/100‑1 (MQ=255) tattCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTAtttgttt > 2:1880918/1‑84 (MQ=255) attCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTtgat < 1:3266192/99‑1 (MQ=255) attCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTtgat < 2:3516098/99‑1 (MQ=255) cgcgCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGTTTTATAGGTTTGATGaa > 2:4200489/1‑99 (MQ=255) cgcgCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTCTTGTTTTGATGaa > 2:2686523/1‑99 (MQ=255) gcgcAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAata < 2:4018584/100‑1 (MQ=255) gcgcAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAata > 2:237356/1‑100 (MQ=255) gcAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAACATAATTATGGGTTTTTTATTTCTTTGATTTATAGGTTTGATGAATAtt > 2:1491166/1‑100 (MQ=255) aaCGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTtc < 1:4615883/100‑1 (MQ=255) aaCGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTtc < 2:2323509/100‑1 (MQ=255) tAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATTGGTTTTTAATTTATTTGATTTATAGGTTTGATGTATTTTtcttt > 2:780991/1‑96 (MQ=255) aaCAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTaaa < 2:2147184/100‑1 (MQ=255) aaCAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTa < 2:3980497/98‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAAt < 1:1130035/100‑1 (MQ=255) ggTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTTTTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTaaa > 2:858587/1‑96 (MQ=255) ggTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATATGTTTGATGAATATTTctct > 2:4036085/1‑92 (MQ=255) gTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATagag 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2:3555508/1‑97 (MQ=255) cccATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTggaag < 1:1317082/100‑1 (MQ=255) cccATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTggaag < 1:299426/100‑1 (MQ=255) cccATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTggaag < 2:617289/100‑1 (MQ=255) cccATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTggaag < 2:617426/100‑1 (MQ=255) cccATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTggaag < 1:2815032/100‑1 (MQ=255) cccATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTggaag > 1:4163915/1‑100 (MQ=255) cccATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTggaag < 1:634651/100‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aTTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTTTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAAt > 2:4014137/1‑98 (MQ=255) aCAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTAc < 1:3191245/99‑1 (MQ=255) | CATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTAC > NC_000913_3_bme_pgi/617967‑618164 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |