| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_hsa_pgi | = 4222777 | 1356 (14.510) | 67 (0.750) | 22/282 | 3.8 | 5.0% | intergenic (‑290/+27) | arpA/iclR | ankyrin repeat protein/transcriptional repressor |
| ? | NC_000913_3_hsa_pgi | = 4222785 | 1267 (14.230) | intergenic (‑298/+19) | arpA/iclR | ankyrin repeat protein/transcriptional repressor | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1350 total aligned reads displayed.
TGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACTCGGTCACGCGGTCATCGGTAATACGTGAAATCGGTCCGGAAATAGAAATTGCGGCAAACGGTTCA > NC_000913_3_hsa_pgi/4222637‑4222933 | gTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGTTTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCct < 1:1103126/149‑1 (MQ=255) ttAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATAAACTAATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTATATTGCAAATCAGGTATGATGGGCTTAATATTGCatc > 2:1044203/1‑149 (MQ=255) aataatTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGATATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTATg > 2:791333/1‑149 (MQ=255) ataatTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGc < 1:1390191/149‑1 (MQ=255) ataatTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGc > 1:1264/1‑149 (MQ=255) aatTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGccc > 2:1485271/1‑149 (MQ=255) gTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTAAATAAAAGTGTGTAAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAAAGCCATTAACACACACCCTTATTCTATTGCCACTCATGTATGATGGGCATAATATTGCCTCTGCCCGCCAGa > 2:822591/1‑149 (MQ=255) tGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGaa > 2:765327/1‑149 (MQ=255) ggTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGaaa > 1:971899/1‑149 (MQ=255) gTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGaaaa > 1:491030/1‑149 (MQ=255) tttGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGaaaaa < 1:107633/149‑1 (MQ=255) tttGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATAGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGaaaaa < 1:762892/149‑1 (MQ=255) tttGATGTTTAAAAATAATGCTGAGGTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGACAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGaaaaa < 2:174015/149‑1 (MQ=255) tGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGt < 1:1485271/149‑1 (MQ=255) taTGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGGGTGAAGAGTATGACATAACGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTc < 1:32379/148‑1 (MQ=255) gATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTc < 1:1305589/149‑1 (MQ=255) gTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAACGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAgc < 2:463914/149‑1 (MQ=255) tttAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAgcg > 1:640513/1‑149 (MQ=255) 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gCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGTATTTCACCGTACGCCAGCGTCACATCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACTCGGTCACGCGGTCATCGGTAATACGTGAAATCGGTCCGGAAATAGAAATTGCg < 1:1462762/149‑1 (MQ=255) gCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACTCGGTCACGCGGTCATCGGTAATACGTGAAATCGGTCCGGAAATAGAAATTGCg > 2:9706/1‑149 (MQ=255) gCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACTCGGTCACGCGGTCATCGGTAATACGTGAAATCGGTCCGGAAATAGAAATTGCg > 2:1515380/1‑149 (MQ=255) gCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACTCGGTCACGCGGTCATCGGTAATACGTGAAATCGGTCCGGAAATAGAAATTGCg < 1:244678/149‑1 (MQ=255) cAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCCCCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACTCGGTCCCGCGGTCATCGGTAATACGTGAAATCGGTCCGTAAATAGAAATTGCgg > 2:236135/1‑149 (MQ=255) cAGAATATTGCCTCTGCCCCCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCTTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCCCCATCGCGCCAAACTCGGTCACGCGGTCATCGGTAATACGTGAAATCGGTCCGGAAATAGAAATTGCgg > 1:942600/1‑149 (MQ=255) atTGCCTCTGCCCGCCAG‑AAAAGTCCGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACTCGGTCACGCGGTCCTCGGGAATACGTGAAATCGGGCCGGAAATAGAAATTGCGGCAAACgg > 1:1000864/1‑149 (MQ=255) ttGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACTCGGTCACGCGGTCATCGGTAATACGTGAAATCGGTCCGGAAATAGAAATTGCGGCAAACgg > 1:218153/1‑149 (MQ=255) tGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCTCCATCGCGCCAAACTCGGTCACGCGGTCATCGGTAATACGTGAAATCGGTCCGGAAATAGAAATTGCGGCAAACGGt < 1:740341/149‑1 (MQ=255) tGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACTCGGTCACGCGGTCATCGGTAATACGTGAAATCGGTCCGGAAATAGAAATTGCGGCAAACGGt > 2:883/1‑149 (MQ=255) ccTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCTCCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTGAATCACCATCGCGCCAAACTCGGTCACGCGGTCAGCGGTAATACGTGAAATCGGTCCGGAAATAGTAATTGCGGCAAACGGATc > 2:1451871/1‑149 (MQ=255) ctctGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGAACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACTCGGTCACGCGGTCATCGGTAATACGTGAAATCGGTCCGGATATAGAAATTGCGGCTAACGGTTCa > 2:126883/1‑149 (MQ=255) | TGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACTCGGTCACGCGGTCATCGGTAATACGTGAAATCGGTCCGGAAATAGAAATTGCGGCAAACGGTTCA > NC_000913_3_hsa_pgi/4222637‑4222933 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |