| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 437885 = | 1568 (0.610) | 169 (0.080) | 90/204 | 18.0 | 12.2% | intergenic (‑189/+233) | JCVSYN2_01985/JCVSYN2_01990 | glycosyl transferase/ABC transporter permease |
| ? | CP016816 | = 437880 | 1174 (0.570) | intergenic (‑184/+238) | JCVSYN2_01985/JCVSYN2_01990 | glycosyl transferase/ABC transporter permease | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 808 total aligned reads displayed.
ATGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/438035‑437885‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑at‑‑at‑‑a‑‑tatata‑‑tatatatatatatCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < CP016816/437880‑437754 ATGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCA > 2:2373476/1‑128 TGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT > 2:1260193/1‑128 GTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A > 1:252206/1‑128 TTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTATAAATCTAAATTATT‑ACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATACAGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A > 1:1701724/1‑128 TTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT > 1:4380252/1‑128 AAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑T > 2:4211840/1‑128 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGCCCAACTCAGAGCTAAATTTCACAATTTTATGCTGATAGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TA > 2:4856351/1‑128 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TA > 1:816367/1‑128 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TA > 2:1147901/1‑128 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACAAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TA > 1:1007445/1‑128 AAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAATATCTAAATTATTAACTTAATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACACAGATCTAAATATCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TAT < 1:2160151/128‑1 AATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATAT < 1:40987/128‑1 ATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATTCTGATCTCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA > 1:2400065/1‑128 ATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCAACATTTTATGCTGATCTCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA > 1:1931002/1‑128 ATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAAATTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTAAACGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA > 2:495461/1‑128 ATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TA > 2:160200/1‑128 ATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TA > 1:3917077/1‑128 ATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTCATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TA > 2:2893835/1‑128 ATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACAAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TA > 1:4007071/1‑128 TTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTTCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TAT < 2:1790579/128‑1 TTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TAT > 1:300865/1‑128 ttAGTTTTAAAATATTAATAATCTATATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATAGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATA < 2:3965028/126‑1 TAAGTTTTAAAATATTAAAAATCT‑AATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATAT > 1:1510843/1‑128 TAAGATTTAAAATATTAAAAATCTAAATAATTAAATATATAAAATATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTAACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATA < 1:1352081/128‑1 aataTTTAAAATATTAAAAATCTAAATAATAAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAAAATAACACAAACTCAGATCTAAAAATCACCATTTTATGCTGAGCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATAT < 1:2763773/124‑1 AGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATA < 2:4779452/128‑1 GTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATAT > 2:2249565/1‑128 GTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAAATTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACAAACTCAGATCTAATTTTCGCAATTTTATGCTGAACGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATAT > 2:588726/1‑128 TTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGCCCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTAAGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATA > 2:671515/1‑128 TTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATAT > 1:203673/1‑128 TTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATAT > 2:907021/1‑128 TTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATATTATGCTTATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TAAAAATAT > 2:1206356/1‑128 TTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGAACAACTCAGATCTAAATTTCACAATTTTATGCTTATCGCTTACAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATAT > 1:1983693/1‑128 TTTAAAATATTAAAAATATAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTAAAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATAT < 2:73772/128‑1 TTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATA > 1:336292/1‑128 TTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATA > 1:1620555/1‑128 TAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAAATTTATAAACTATAAATAAAAACTAAAAATTTAAGACAAACTCAGATCTATATTTCTCCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATAT < 2:301045/128‑1 TAAAATATAAAAAATCTAAATTATTAAATTTATAAACTATATATAAAAAATACAAATTTAATACCAACTCAGATATAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATAT < 2:4693864/128‑1 AAAAAATTAAAAATCTAAATTATTAACATTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATA < 2:3260056/128‑1 AAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACAAACTCAGATCTAAATTTCACTATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATAT < 1:967144/128‑1 AAATATTAAAAATATAAATTATTAAATATATAAACTATATATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATAT < 2:2749478/128‑1 AAATATAAAAAATCTAAATAATTAACAATATAAACTATAAATAAAAACTACAAAATTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AG‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATAT < 1:543549/128‑1 AAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAATTAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAAC > 1:2706884/1‑128 AATCTAAATTCTTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCATCTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCT < 1:5515046/128‑1 ttTTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGAACAACTCATATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAAT < 1:62613/126‑1 TATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCAATAACTCTATAGTTAATAT > 1:1135212/1‑128 TTATAAACTCTATATAAAAACTAAAAATTTAAGACCATCTGAGATCTAAATATCACCATTTTATGGTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGT < 1:470079/128‑1 ATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATAT‑‑‑T‑TATATATATATCTTTAACTCTATAGGTAATATGGAGTTTTTT > 2:3095083/1‑128 TAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACACAGATCTAAATTTCACAATTTTATGCAGATCGCTTGAAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATAACATTAAAAATATAGGTAATATGGATTTTTT > 2:5058751/1‑128 CTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑ATACA‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTG > 1:1870364/1‑128 CTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATATTTATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTG < 1:4555986/128‑1 AAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGTTTTTTTCTTTGa > 1:5356419/1‑127 ATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTATATAGTTTATATTGATGTTTTTTGTTTGATT > 2:2010014/1‑128 aactcaAAATTTAAGACAAACACAGATATAAATTTCACAATTAAATGCTGATCGCTAGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTT < 1:2280023/122‑1 ACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCCCCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTTATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTA > 2:1952892/1‑128 AAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGTTAATATGGATGTTTTTGCTTTGATTCATTTCATAAA > 1:4624783/1‑128 aTTAATACCAACTGAGATCTAAATTTCACCATTTTTTGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑AATTATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAA < 2:3633178/127‑1 TTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGTTTTTTGCTTTGCTTAATATCATAAAATA > 1:1235329/1‑128 AAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTT > 1:1789364/1‑128 CCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTA < 1:5238318/128‑1 AGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCATACAT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGATATGCTTAATTTACTAAAATATATATTTTAAAA > 1:3500234/1‑128 GATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTATCTCTATAGGGATTATGGTGGTTTTTGCTTTGCTTCTTTTGCTAATATATTTTTTTTTTAAATA > 2:5418101/1‑128 tatatatttttaCATTTTATTCTGATCTCTTTCTT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACA < 2:3799261/116‑1 CATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCT < 2:4053099/128‑1 ATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCAGTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAAT < 2:4296381/128‑1 tattattaTGATCGCTTGTAT‑‑AT‑‑ATTTATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGCACGTTTTTGCTTTGCTTCA‑TTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAAATTTTATTTCTA < 1:3841050/120‑1 aAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTCTAGGTAATATGGAGGCTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAACTACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAA < 2:4531617/127‑1 CAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAA < 1:2893835/128‑1 AT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGTTAATATGGTGTTTTTTTCTTTGCTTCATTTCATAAAATATTTATTTTAAAAATAAAATTTTTATTTATAATATTTATTAAAAATTAAAa > 2:140446/1‑127 T‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATAAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATAAAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACT > 2:1680785/1‑128 AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTT < 1:2634697/128‑1 A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATTATTAAATCTATATGTAATATGGAGGTTTTTGATTTGCTTCATTTACTAAAATTTTTATTTTATAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTAC < 1:4315821/128‑1 A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATA‑TTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTATAATATTTATTAAAAATGAAACTTACA < 2:2110835/128‑1 A‑‑TATATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGATTTGCTTCATTTACTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTAC > 1:4498014/1‑128 ATATA‑‑TATATATATATATCTTTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTTATTTGATTCAATTCATAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTTATAAAAATGAAACTAACAt > 1:3630614/1‑127 ATATA‑‑TATATATATATATCATTATCTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTTCTTTGCTTCATTTACTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATATCTAAAATTTATTAAAAATTAAACTTACAA > 2:4104607/1‑128 aATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAAC < 2:4461306/127‑1 TATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGATTCATTTCATAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAAC > 2:790997/1‑128 ATA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACT > 1:4808761/1‑128 TA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTA < 1:3213444/128‑1 TA‑‑TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTA < 2:2481462/128‑1 ATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAA < 2:4378009/128‑1 ATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAA < 1:4209942/128‑1 TATATATATCATTAACTCTATATGTAATCTGGAGGTTTTTGATTTGCTTCATTTACTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAACTGAAACTTACAACTACAAAAA < 1:5146119/128‑1 TATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAA < 2:3182474/128‑1 TATATATATCAATAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAA < 2:2838709/128‑1 ATATATATCTTTAAATCTATTTGTAATATGGAGGTTTTTGATTTGCTTCATTTACTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAAT < 1:2489276/128‑1 ATATATATCATTAACTCTCTAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAAT < 1:5030984/128‑1 ATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAAT < 1:3121857/128‑1 ATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTAAAACTACAAAAAT > 2:3394582/1‑128 ATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTT < 2:3744145/38‑1 TATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATA < 1:3778740/128‑1 ATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAA < 1:4931028/128‑1 ATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAA < 2:5318918/128‑1 ATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGTTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGT < 2:5173186/128‑1 ATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGT < 1:1074983/128‑1 TATAATTAACTATTTAGGTAATATGGAGGTTTTTTCTTTTCTTCATTTCATAAAATATTTATTTTAAAAATAAAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTT < 2:3870816/128‑1 ATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGATTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTT < 2:3470718/128‑1 TCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < 2:146331/128‑1 TCATTAAATCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGATTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < 2:2634689/128‑1 ATGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑AT‑‑A‑‑TATATA‑‑TATATATATATAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/438035‑437885‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑at‑‑at‑‑a‑‑tatata‑‑tatatatatatatCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < CP016816/437880‑437754 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |