| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4037260 = | 0 (0.000) | 11 (0.140) +GTATTCTACGGCTGAACCATGTAATGGTAGGTCTG |
6/210 | 3.0 | 25.3% | noncoding (1/76 nt) | alaT | tRNA‑Ala |
| ? | NC_000913 | = 4175818 | 87 (0.810) | noncoding (65/76 nt) | thrT | tRNA‑Thr | |||||
CATCGTATAATGGCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAA > NC_000913/4175678‑4175957 | cATCGTATAATGGCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGcc > 2:44814/1‑141 (MQ=255)cATCGTATAATGGCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGcc > 2:45020/1‑141 (MQ=255) tCGTATAATGGCAATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTa < 2:1931593/141‑1 (MQ=255) tGGCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGcacc > 2:1510154/1‑141 (MQ=255) tGGCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGcacc > 2:1510305/1‑141 (MQ=255) ggCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGcacca > 2:1841451/1‑141 (MQ=255) ggCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGcacca > 2:521097/1‑141 (MQ=255) gCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGcaccac > 2:1746171/1‑141 (MQ=255) gCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGcaccac < 1:1747056/141‑1 (MQ=255) tATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCActt > 2:1193628/1‑141 (MQ=255) tATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCGTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCActt > 2:1451629/1‑141 (MQ=255) ttCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTccc > 1:447561/1‑141 (MQ=255) ttCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGAGTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTccc < 1:526380/141‑1 (MQ=255) tCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCt > 1:797163/1‑141 (MQ=255) tCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCt > 1:263330/1‑141 (MQ=255) cTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGttttt > 1:1045739/1‑141 (MQ=255) gatgatGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTc > 2:112298/1‑141 (MQ=255) cGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGt > 1:1251033/1‑141 (MQ=255) cccGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTc > 1:1656038/1‑141 (MQ=255) cccGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTc > 1:1656034/1‑141 (MQ=255) ccGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAATGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTca > 1:682753/1‑141 (MQ=255) ccGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAATGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTca > 1:682710/1‑141 (MQ=255) ccGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTca > 1:1263211/1‑141 (MQ=255) ccGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTca > 1:1482676/1‑141 (MQ=255) ccGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTca > 1:45915/1‑141 (MQ=255) ccGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTca > 1:1774268/1‑141 (MQ=255) ccGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTca > 1:1614424/1‑141 (MQ=255) tGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGTTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTcaacaa < 2:386926/141‑1 (MQ=255) gCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAg > 1:483682/1‑141 (MQ=255) gCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTGTATTGCATTCAACAAGTCgg > 1:6113/1‑141 (MQ=255) cAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCAt < 2:668546/141‑1 (MQ=255) atttgagtgCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCAt > 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gCTGATAGAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTg < 2:1227753/141‑1 (MQ=255) tctgtagctcAGTTGGTTAGAGCGCACCCCTGATACGGGTGAGGTCGGCAGCTCAAATCTGCCcagacctaccattacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcagg > 1:547349‑M2/5‑63 (MQ=255) cTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATgtgg < 1:330788/141‑1 (MQ=255) tCAGTTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCAAATCTGCCcagacctaccattacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtctgc > 2:78582‑M2/1‑55 (MQ=255) tCAGTTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCAAATCTGCCcagacctaccattacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtctgc > 2:78679‑M2/1‑55 (MQ=255) tCAGTTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCAAATCTGCCcagacctaccattacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtctgc > 2:1848642‑M2/1‑55 (MQ=255) gTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGat > 1:248201/1‑141 (MQ=255) gTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGat > 1:248204/1‑141 (MQ=255) tggtt‑agagCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCAAATCTGCCcagacctaccattacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtcagcggttc > 1:530626‑M2/5‑50 (MQ=255) tt‑aGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCAAATCTGCCcagacctaccattacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtcagcggttcgat < 1:1363712‑M2/140‑95 (MQ=255) t‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCAc > 1:100828/1‑141 (MQ=255) 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2:1057444/1‑141 (MQ=255) tCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTc > 2:1057626/1‑141 (MQ=255) tCTGCCcagacctaccattacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccaccatctctgtagtgattaaataaaaaa > 2:1664013‑M2/1‑6 (MQ=255) tCTGCCcagacctaccattacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccaccatctctgtagtgattaaataaaaaa > 2:1662491‑M2/1‑6 (MQ=255) tCTGCCcagacctaccattacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccaccatctctgtagtgattaaataaaaaa > 2:1661623‑M2/1‑6 (MQ=255) gCCTATCAGCACCCCTTCTTTTCTCCTCCCTGTTGTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGaaa > 2:1713527/1‑141 (MQ=255) gCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGaaa > 1:9263/1‑141 (MQ=255) gCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGaaa > 2:933837/1‑141 (MQ=255) gCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGaaa > 2:931023/1‑141 (MQ=255) gCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGaaa > 2:1542011/1‑141 (MQ=255) gCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGaaa > 1:1677607/1‑141 (MQ=255) gCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGaaa > 2:712096/1‑141 (MQ=255) gCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGaaa > 1:1884891/1‑141 (MQ=255) gCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGaaa > 2:165042/1‑141 (MQ=255) gCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGaaa > 2:1713509/1‑141 (MQ=255) gCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGaaa > 1:458909/1‑141 (MQ=255) gCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGaaa > 1:457170/1‑141 (MQ=255) gCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGaaa > 1:334325/1‑141 (MQ=255) gCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTG‑TTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGaaaa > 2:187005/1‑141 (MQ=255) | CATCGTATAATGGCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGT‑AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAA > NC_000913/4175678‑4175957 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |