Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F48 I1 R1
|
58 |
71.3 |
3054194 |
98.3% |
3002272 |
146.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_002947_CJ‑RC |
4,635,852 |
A→C |
V4G (GTC→GGC) |
uvrY ← |
BarA/UvrY two‑componenent system response regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_002947_CJ‑RC | 4,635,852 | 0 | A | C | 100.0%
| 205.5
/ NA
| 58 | V4G (GTC→GGC) | uvrY | BarA/UvrY two‑componenent system response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (28/30); total (28/30) |
TCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGGGCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGACCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACTGACGTTCGACAGTAAGCGGCCGCACTATTTGCCGGGGCTTG > NC_002947_CJ‑RC/4635706‑4635995
|
tcAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGGGCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCC‑TGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGcccc < 4:250999/149‑1 (MQ=255)
gCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGGGCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCt > 6:339582/1‑148 (MQ=255)
cacaACGTCCGGTTTCAGCTCCCGGGCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTaa > 6:79627/1‑149 (MQ=255)
aCGTCCGGTTTCAGCTCCCGGGCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCaa < 6:364325/149‑1 (MQ=255)
cGGTTTCAGCTCCCGGGCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGcaca < 8:149895/149‑1 (MQ=255)
cGGTTTCAGCTCCCGGGCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGcaca < 8:304684/149‑1 (MQ=255)
tttCAGCTCCCGGGCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAg < 4:299662/142‑1 (MQ=255)
tttCAGCTCCCGGGCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAg > 3:299662/1‑142 (MQ=255)
tttCAGCTCCCGGGCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCacacac < 3:269644/149‑1 (MQ=255)
aGCTCCCGGGCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGAGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCg > 1:252864/1‑149 (MQ=255)
cAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGc > 5:226795/1‑148 (MQ=255)
gTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGAt > 6:296459/1‑149 (MQ=255)
gTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGAt > 4:349185/1‑149 (MQ=255)
tttCAGTGCCAACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGAtt < 5:119096/149‑1 (MQ=255)
cAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTgg < 1:318432/148‑1 (MQ=255)
gTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATc < 3:349185/149‑1 (MQ=255)
gTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATc > 6:84187/1‑149 (MQ=255)
gCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCt > 3:242490/1‑148 (MQ=255)
ccGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCtt > 2:16822/1‑148 (MQ=255)
gAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACa < 2:115554/149‑1 (MQ=255)
tctcCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATAGGATCCCGCCACCTTAaaaaaa > 3:9190/1‑149 (MQ=255)
tcCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAAtt > 8:49881/1‑149 (MQ=255)
ccTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAAtttt > 3:336377/1‑149 (MQ=255)
ccTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAAtttt > 2:43660/1‑149 (MQ=255)
ccTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAAtt < 4:128231/147‑1 (MQ=255)
ccTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGACAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAAtt < 4:152503/147‑1 (MQ=255)
cTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAAttttt < 2:252864/149‑1 (MQ=255)
acccaccACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTc < 7:78475/147‑1 (MQ=255)
accaccTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTg > 2:325678/1‑149 (MQ=255)
accTGCAGGCCGTCGATGTCGGCAAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCAACTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTAACGGTGGGc > 7:148747/1‑149 (MQ=255)
cGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCAtt < 5:84187/149‑1 (MQ=255)
tCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGc < 2:326161/149‑1 (MQ=255)
tGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGcttcc < 6:65652/149‑1 (MQ=255)
tGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGcttcc < 5:79627/149‑1 (MQ=255)
gTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTAGCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGcttcc < 6:235931/148‑1 (MQ=255)
tCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGcttcctt < 4:339415/149‑1 (MQ=255)
tCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGcttcctt < 5:128071/149‑1 (MQ=255)
ggCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGcttcctt > 7:193325/1‑147 (MQ=255)
ggCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCa < 5:296459/149‑1 (MQ=255)
ccAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGa < 8:98589/149‑1 (MQ=255)
aaCATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGaaa < 8:169197/149‑1 (MQ=255)
aaCATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGaaa > 7:146949/1‑149 (MQ=255)
cATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGAGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAAc > 3:34090/1‑148 (MQ=255)
cGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACt > 4:218022/1‑148 (MQ=255)
gtAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACTGACg > 2:348035/1‑149 (MQ=255)
aTACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACTGACGTTc < 5:229918/149‑1 (MQ=255)
aCCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACTGACGTTCGa > 4:283416/1‑149 (MQ=255)
ccGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACTGACGTTCGa < 3:28493/148‑1 (MQ=255)
ccGGTTCATACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCACCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACTGACGTTCGa < 6:374135/148‑1 (MQ=255)
aGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAAACAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACTGACGTTCGACAGAAAGCGGCCg < 4:173007/149‑1 (MQ=255)
cGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACTGACGTTCGACAGTAAGCGGCCGCAc > 3:220177/1‑148 (MQ=255)
gTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACTGACGTTCGACAGTAAGCGGCCGCACTa > 3:64141/1‑149 (MQ=255)
tGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACTGACGTTCGACAGTAAGCGGCCGCACTAt > 4:245814/1‑149 (MQ=255)
atcatcGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACTGACGTTCGACAGTAAGCGGCCGCACTAttt > 1:176360/1‑149 (MQ=255)
atcagcGACCACTAAGCCCCTAATCAACCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGACCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAACCGACTGACGTTCGACAGTAAGCGGCCGCACTAttt < 4:85048/149‑1 (MQ=255)
atcGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACTGACGTTCGACAGTAAGCGGCCGCACTATTTGcc > 7:285706/1‑149 (MQ=255)
tcGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACTGACGTTCGACAGTAAGCGGCCGCACTATTTGCCg < 6:226795/149‑1 (MQ=255)
gACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACTGACGTTCGACAGTAAGCGGCCGCACTATTTGCCggg > 3:33426/1‑149 (MQ=255)
cTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACTGACGTTCGACAGTAAGCGGCCGCACTATTTGCCGGGGCTTg < 4:87712/149‑1 (MQ=255)
|
TCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGGGCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGACCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACTGACGTTCGACAGTAAGCGGCCGCACTATTTGCCGGGGCTTG > NC_002947_CJ‑RC/4635706‑4635995
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCCATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGGGCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGACCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACTGACGTTCGACAGTAAGCGGCCGCACTATTTGCCGGGGCTTGGCG > NC_002947_CJ‑RC/4635702‑4635998
|
TCCATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGGGCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGC > NB501016:282:H2V7GAFX2:2:21307:8419:9038/1‑151 (MQ=60)
GTTTCAGCTCCCGGGCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACC < NB501016:282:H2V7GAFX2:2:21205:20596:15309/151‑1 (MQ=60)
GTTTCAGCTCCCGGGCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGC > NB501016:282:H2V7GAFX2:2:21211:14255:8741/1‑144 (MQ=60)
CAGCTCCCGGGCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGAGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGT > NB501016:282:H2V7GAFX2:1:21111:6786:7719/1‑151 (MQ=60)
CCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCG > NB501016:282:H2V7GAFX2:3:21407:18839:11338/1‑150 (MQ=60)
GTTTCAGTGCCAACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTG < NB501016:282:H2V7GAFX2:3:11511:13128:11861/151‑1 (MQ=60)
TCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGA < NB501016:282:H2V7GAFX2:1:21211:3568:17839/150‑1 (MQ=60)
AGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCC < NB501016:282:H2V7GAFX2:2:21309:17974:4262/151‑1 (MQ=60)
CGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTT > NB501016:282:H2V7GAFX2:2:21110:17228:12329/1‑150 (MQ=60)
ATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATAGGATCCCGCCACCTTAAAAAAAT > NB501016:282:H2V7GAFX2:2:11102:2023:16704/1‑151 (MQ=60)
CCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTT > NB501016:282:H2V7GAFX2:2:21306:21521:17643/1‑151 (MQ=60)
CACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCA < NB501016:282:H2V7GAFX2:4:11502:2569:18250/149‑1 (MQ=60)
CACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCAAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCAACTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTAACGGTGGGCC > NB501016:282:H2V7GAFX2:4:11603:18761:15480/1‑151 (MQ=60)
CCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTG < NB501016:282:H2V7GAFX2:3:11505:20899:5617/151‑1 (MQ=60)
ATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCT < NB501016:282:H2V7GAFX2:3:11504:26787:9502/151‑1 (MQ=60)
GTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTC < NB501016:282:H2V7GAFX2:3:11601:8183:5029/151‑1 (MQ=60)
CGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAG < NB501016:282:H2V7GAFX2:3:21509:2553:6944/151‑1 (MQ=60)
CGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTC > NB501016:282:H2V7GAFX2:4:11612:23524:4486/1‑149 (MQ=60)
CAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAAC > NB501016:282:H2V7GAFX2:4:11603:4422:8797/1‑151 (MQ=60)
ACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGAGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACG > NB501016:282:H2V7GAFX2:2:11107:2326:12680/1‑150 (MQ=60)
AATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGCCCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACTGACGTTCG < NB501016:282:H2V7GAFX2:3:21408:15391:4416/151‑1 (MQ=60)
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TCCATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGGGCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTACCAGATCGTGATCATCGACCACTAAGACCCTAATCAAGCACACACCTCGTCAGCAGGGCGATTGGATCCCGCCACCTTAACAAAATTTTTCACGGTGGGCCTAACGCATTGCTTCCTTCAGAAACGACTGACGTTCGACAGTAAGCGGCCGCACTATTTGCCGGGGCTTGGCG > NC_002947_CJ‑RC/4635702‑4635998
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
