Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F43 I1 R1
|
60 |
76.0 |
3234326 |
98.3% |
3179342 |
146.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_002947_CJ‑RC |
4,768,342 |
C→T |
R90C (CGC→TGC) |
tpaK → |
probable terephthalate transporter, MFS superfamily protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_002947_CJ‑RC | 4,768,342 | 0 | C | T | 100.0%
| 188.2
/ NA
| 55 | R90C (CGC→TGC) | tpaK | probable terephthalate transporter, MFS superfamily protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (28/27); total (28/27) |
CATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGTGCCGCCGCGCCGAGTGCCATCGCA > NC_002947_CJ‑RC/4768203‑4768482
|
cATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGgatga > 3:295886/1‑149 (MQ=255)
tCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATc > 3:330381/1‑149 (MQ=255)
cATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCAc < 8:401038/147‑1 (MQ=255)
cATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCAc > 3:55662/1‑147 (MQ=255)
aTGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAg > 3:7843/1‑149 (MQ=255)
ggCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCCGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCa > 8:347861/1‑149 (MQ=255)
gcCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACgg > 4:93785/1‑149 (MQ=255)
cccACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGt > 4:151616/1‑148 (MQ=255)
cacaTCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCa > 1:262582/1‑148 (MQ=255)
cacaTCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCAt < 6:106620/149‑1 (MQ=255)
tCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTc < 8:203614/149‑1 (MQ=255)
aggagTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCTATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTc < 5:220755/149‑1 (MQ=255)
gCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTg > 2:85438/1‑149 (MQ=255)
gCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTg > 2:91272/1‑149 (MQ=255)
tCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTggcg < 3:193257/147‑1 (MQ=255)
gAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTggcggcgg > 2:94602/1‑149 (MQ=255)
aaaCAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCAGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTggcggcggc > 8:353025/1‑149 (MQ=255)
aaaCAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCACGCCGCTGTCCCACCGGTACGGCCACTGCCGGATTATCCACACCAGCCCGGACAGCTTCGCCCGCGGCACGTTggcggcggc > 2:55124/1‑149 (MQ=255)
aaCAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGcc < 2:262582/149‑1 (MQ=255)
aGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTgg < 4:55662/149‑1 (MQ=255)
ggTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGt < 5:167109/149‑1 (MQ=255)
cTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGTTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTcac < 8:44535/148‑1 (MQ=255)
gggCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAg < 8:306821/147‑1 (MQ=255)
ggCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAAc < 4:7843/149‑1 (MQ=255)
ggCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAAc > 4:111971/1‑149 (MQ=255)
ccATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGt > 8:171013/1‑148 (MQ=255)
ccATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTc < 6:206763/149‑1 (MQ=255)
aTCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCAc > 2:69146/1‑149 (MQ=255)
ttctCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCg > 1:156940/1‑148 (MQ=255)
ttctCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCg > 1:151501/1‑148 (MQ=255)
ccgccgCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACt > 4:379145/1‑148 (MQ=255)
cgccgcTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCAGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAAc < 1:348231/146‑1 (MQ=255)
cgccgcTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCAGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAAc < 3:170317/146‑1 (MQ=255)
ccgcTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATg < 2:162512/149‑1 (MQ=255)
ctcGCCGGGCTCATGGTCGGCTATCAGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCATCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGGCACCGAACTGATGGCGtt < 4:157522/149‑1 (MQ=255)
gCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGtt < 6:157660/146‑1 (MQ=255)
ccGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTgcgc < 3:41451/149‑1 (MQ=255)
ggTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCtt > 3:291479/1‑149 (MQ=255)
gTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTtc < 3:93785/149‑1 (MQ=255)
tctcATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCAGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTtca < 7:347861/149‑1 (MQ=255)
aTGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCAc > 7:334738/1‑149 (MQ=255)
tGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCAcc < 1:397293/149‑1 (MQ=255)
tATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATggg < 7:353025/149‑1 (MQ=255)
tCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATgggg < 6:260662/148‑1 (MQ=255)
gcgcTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCgg > 8:327502/1‑149 (MQ=255)
cgcTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGt > 4:218667/1‑149 (MQ=255)
gcTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGTg > 1:304776/1‑149 (MQ=255)
tcGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGTgccgc > 7:94302/1‑149 (MQ=255)
cgccgcTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGTgccgcc > 2:80638/1‑149 (MQ=255)
tCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGTGCCGCCGCGCCGa < 2:156940/148‑1 (MQ=255)
tCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGTGCCGCCGCGCCGa < 2:151501/148‑1 (MQ=255)
tCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGTGCCGCCGCGCCGAg < 3:379145/149‑1 (MQ=255)
aGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGTGCCGCCGCGCCGAGTGc > 3:366609/1‑148 (MQ=255)
ttCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGTGCCGCCGCGCCGAGTGCCATCg > 4:148926/1‑148 (MQ=255)
cGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGTGCCGCCGCGCCGAGTGCCATCGCa < 1:80638/148‑1 (MQ=255)
|
CATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGTGCCGCCGCGCCGAGTGCCATCGCA > NC_002947_CJ‑RC/4768203‑4768482
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGTGCCGCCGCGCCGAGTGCCATCGCACTGACGGG > NC_002947_CJ‑RC/4768194‑4768490
|
CACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGC > NB501016:282:H2V7GAFX2:3:21411:19320:14726/1‑151 (MQ=60)
GCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGAT > NB501016:282:H2V7GAFX2:2:21207:13473:3225/1‑151 (MQ=60)
ATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCC > NB501016:282:H2V7GAFX2:2:21301:18757:12004/1‑151 (MQ=60)
ACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACG > NB501016:282:H2V7GAFX2:2:11111:11374:1532/1‑149 (MQ=60)
CATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGCGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGC > NB501016:282:H2V7GAFX2:2:11102:15867:9593/1‑151 (MQ=60)
CCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCAT > NB501016:282:H2V7GAFX2:1:21110:24451:12853/1‑150 (MQ=60)
GAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCTATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCG < NB501016:282:H2V7GAFX2:3:21403:10701:18982/151‑1 (MQ=60)
GTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGG < NB501016:282:H2V7GAFX2:2:11310:24316:10409/149‑1 (MQ=60)
AGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTC < NB501016:282:H2V7GAFX2:3:11606:18045:9648/151‑1 (MQ=60)
CTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGA > NB501016:282:H2V7GAFX2:1:11302:1238:12432/1‑150 (MQ=60)
CTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGA > NB501016:282:H2V7GAFX2:1:11303:26839:12428/1‑150 (MQ=60)
TTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGagaagatgggcccgagcacctgtt > NB501016:282:H2V7GAFX2:2:11301:9996:3388/1‑127 (MQ=60)
CCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCAGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACT < NB501016:282:H2V7GAFX2:2:11306:3186:14660/148‑1 (MQ=60)
CCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCAGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACT < NB501016:282:H2V7GAFX2:1:21302:3475:8665/148‑1 (MQ=60)
GCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCT < NB501016:282:H2V7GAFX2:2:11108:11678:10502/151‑1 (MQ=60)
CGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTC > NB501016:282:H2V7GAFX2:2:21206:6724:7461/1‑151 (MQ=60)
GGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCA < NB501016:282:H2V7GAFX2:2:11205:9339:14216/151‑1 (MQ=60)
GTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCAGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCAT < NB501016:282:H2V7GAFX2:4:21512:21840:10254/151‑1 (MQ=60)
CATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACC > NB501016:282:H2V7GAFX2:4:21510:6760:6439/1‑151 (MQ=60)
ATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCG < NB501016:282:H2V7GAFX2:1:21312:7830:4675/151‑1 (MQ=60)
ATATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGTATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGG < NB501016:282:H2V7GAFX2:4:21601:7447:8137/151‑1 (MQ=60)
CGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGTGC > NB501016:282:H2V7GAFX2:1:21206:8600:5889/1‑151 (MQ=60)
CTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGTGCCGCC > NB501016:282:H2V7GAFX2:4:11504:9838:17889/1‑151 (MQ=60)
GTCCGAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGTGCCGCCGCGCCGAGT < NB501016:282:H2V7GAFX2:2:21310:5542:6011/151‑1 (MQ=60)
GAGCGGTTCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGTGCCGCCGCGCCGAGTGCC > NB501016:282:H2V7GAFX2:2:21308:11678:4143/1‑150 (MQ=60)
TCGGCCACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGTGCCGCCGCGCCGAGTGCCATCGCAC < NB501016:282:H2V7GAFX2:1:11202:23769:6157/150‑1 (MQ=60)
ACTGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGTGCCGCCGCGCCGAGTGCCATCGCACTGACGGG < NB501016:282:H2V7GAFX2:4:11606:26376:3186/151‑1 (MQ=60)
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CACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTTGGCGGCGGCCTGGTCACAGAACGTCACCGAACTGATGGCGTTGCGCTTCATCACCGGAATGGGGCTCGGTGCCGCCGCGCCGAGTGCCATCGCACTGACGGG > NC_002947_CJ‑RC/4768194‑4768490
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
