Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F11 I4 R1
|
73 |
908.3 |
39027734 |
99.3% |
38754539 |
136.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
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position |
mutation |
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gene |
description |
| MC JC |
AE015451_phaM1 |
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Δ4,582 bp |
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[gcvP‑II CDS (glycine dehydrogenase)]–[gcvT‑II CDS (aminomethyltransferase)] |
[gcvP‑II CDS (glycine dehydrogenase)], gcvH‑II CDS (glycine cleavage system H protein 2), [gcvT‑II CDS (aminomethyltransferase)] |
|
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start |
end |
size |
←reads |
reads→ |
gene |
description |
|---|
| * |
* |
÷ |
AE015451_phaM1 |
5918836 |
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[0] 1004 |
[gcvP‑II CDS (glycine dehydrogenase)]–[gcvT‑II CDS (aminomethyltransferase)] |
[gcvP‑II CDS (glycine dehydrogenase)],gcvH‑II CDS (glycine cleavage system H protein 2),[gcvT‑II CDS (aminomethyltransferase)] |
|
| |
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position |
reads (cov) |
reads (cov) |
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skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
AE015451_phaM1 |
= 5918835 | 0 (0.000) | 1004 (1.100) |
133/270 |
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100% |
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gcvP‑II CDS (glycine dehydrogenase) |
|
| ? | AE015451_phaM1 |
5923418 = |
0 (0.000) | coding (3/1083 nt) |
gcvT‑II CDS (aminomethyltransferase) |
|
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 314 total aligned reads displayed.
AATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATCCAACGC > AE015451_phaM1/6011016‑6011309
|
AGTCGCTGGCCCGGGGGAATTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCATCTTCATCGAATAAACGCTACACCTGCTTCGCGGGCACTCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACTTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAA < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1253:51968:15363/151‑1 (MQ=60)
CTGGCCTGGGGGAATTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAAGAAACGCGACACTTGCTTCGTGGGCACGCCCGTTCCCACGGGTGCAGCACAGGCCTCGAACGTTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1246:1721:2537/151‑1 (MQ=60)
gggtgaattcgtgggaggggGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGCCACCTGCGTCGCGGACACTCCCGCCCCCACAGGTGCAGCACGGGTCTCAAACGCTGTGCTGTACTTTTGGGAGCGGCCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1102:26350:20920/131‑1 (MQ=60)
TGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCGTCGAATAAACGTGACACCTGCTTCACGGGCACGCCCGCTCCAACAGGTGCAGCACAGGTCTTGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTT < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1145:10273:22185/151‑1 (MQ=60)
aggttgtgggaggggggtgtggtcggtttcggggaggaaatgcgacacttgttttgggggcattcctgctcccatgggtgcagcacggtttTCGAACGTTGTGCTGCACCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTA < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1236:24085:7101/60‑1 (MQ=23)
aagtcgtgggagggtggggtggtaagtttcatggagcaaacgagacacttgtttcgtgggaacgcccgctccaacggggaaagaaaagttctggaacgtggtgctggactTGTGGGAGTGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTA < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1236:24076:7085/41‑1 (MQ=39)
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tctgttggaagttggtttggtcaccttcattggataactgctACACCTGCTTCTCGGGCACGCCCGCTCCCCCGGGTGCCGCACGGTTCTCGAACGCTTTTCCGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2266:43462:10976/109‑1 (MQ=50)
gttgtggggggtggggggggtagGCTTCATAGAAGAAACGCGACACTTGCTTCGTGGGAACGCCCGCTCCAAAGGGGGAAGCACAGTTCTGGAACGTTGTCCCGTACCTGTGGGAGTGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1221:5299:14691/128‑1 (MQ=34)
gttgtgggaagggggggggggaagtttcatagaagAAACGCGACACTTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCAACGGGGGCAGAACGGGTCTAGAACGTTGTGCTGTACCGGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1234:37592:25628/116‑1 (MQ=48)
gtggtggggggggggtgtgggcggtttcagagaagAAACGCGACACTTGCTTTGTGGGCAAACCCGCTTCCACGGGGGCAGCACATTTCTCGAACGTTGTGCCGTACCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2157:6658:2633/116‑1 (MQ=34)
GTTGCTGGAAGGTGGGGGGGTAAGCTTCATCGAAGAAACGCGACACCTGTTGCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGAACGGTTCTCGAATGCTGTGCCGTACTGGTGGGAGTGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1142:26350:11312/151‑1 (MQ=60)
GTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACTCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2142:48843:9247/151‑1 (MQ=60)
GGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCTCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAG > LH00941:114:22FVMWLT1:2:2128:37906:23354/1‑151 (MQ=60)
GGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCTCGGGCACGCCCGCTCCCACAAGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAG > LH00941:114:22FVMWLT1:2:1128:39884:13970/1‑151 (MQ=60)
CGGCTTCATCGAATAAACTCTACACCTGTTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGTTGCGGCACAGTTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCA < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1122:47539:25339/151‑1 (MQ=60)
CAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGAGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACGGGTCTCGAACGTTGTGCCGTACTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCA < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2143:31906:5339/151‑1 (MQ=60)
TAATCGAAGAAACGCGACACTTGTTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGCAGAACAGGTCTCGAGTGTTGGTCCGTACTTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAAC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1254:25416:20584/151‑1 (MQ=60)
gaagaaacgggacattggtgttgagggcacacccgcccccacgggggaagaacggttctgGAACGCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCG < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1118:9478:13122/91‑1 (MQ=60)
GAATAAACGCTACCCCTTCTTCGCGGGCACGCCCACTCCCACATTTGCAGCACATTCCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCG < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2210:32304:7533/151‑1 (MQ=60)
GAATAAACGCGACACCTGTTTTGCGGACAACCCCACTCCCACGGGTGAAACACAGTTCTCGAACGTTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCG < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2210:32313:7517/151‑1 (MQ=60)
GAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGNAACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCG < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2267:42824:15283/151‑1 (MQ=60)
GAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTTTCGAACGTTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCG < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2265:17687:18982/151‑1 (MQ=60)
GAAGAAACGCGACACCTTCTTCGCGGGCACGCCCTCTCCCACGGGTGCGGCACAGTTTTCGAACACTGTGCCGTACCTTTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCG < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2123:20257:26572/151‑1 (MQ=60)
GAAGAAACGCGACACCTGTTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGAAGCACGGGTCTCGAACGTTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCG < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1232:44868:27245/151‑1 (MQ=60)
aagtGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACGGGTGAAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTA < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1156:50646:6348/147‑1 (MQ=60)
CCGCGACACTTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCAACATGTGCAACACAGGTCTCGAACACTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTA < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1227:1444:8206/151‑1 (MQ=60)
CGCGACACCGGTTTCGCGGGCACGCCCACTCCCACAGGTGCAGCACAGTTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAA < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2112:28883:19479/151‑1 (MQ=60)
CGCGAAACCGGTTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACGGGTGAAAAACAGGTCTAGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAA < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1242:29743:27085/151‑1 (MQ=60)
ggaaattgttgtcgggggaaccccctctccaaagggggggacaaggttttagaacttggttctgccctttTGGGAGCGGCCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1246:8137:6124/81‑1 (MQ=60)
cgacacttgttttgtGGGCACGCCCGCTCCCACGGGGGCAGCAAAGTTCTCGAACGTTGTCCCGTACTTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2161:7277:4763/136‑1 (MQ=60)
CGACACCTGTTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGAACAGGTCTCGAACGCTTTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2147:12704:15283/151‑1 (MQ=60)
caccgttTTCGCGGGCACCCCCGCTCCAAAGGGTGAAGCACAGGCCTCGAACGCTGGGCCGTACTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1114:10624:8510/144‑1 (MQ=60)
CACCGGTTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCAAGGGTGCAGCACAGTTCTCGAACGTTGTGCCGTACCTGGGGGAGTGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1114:10633:8526/151‑1 (MQ=60)
CTGTTTCGCGGACACACCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTTGAACGCTGTGCCGGACCGGTGGGAGTGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2102:41345:24987/151‑1 (MQ=60)
GCTTCGCGGGCACTCCCTCCCCCACGGGTGAAGCACGGTTCTCGAACGTTGTGCCGTACTTGGGGGAGTGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTT < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1106:50378:3930/151‑1 (MQ=60)
GCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGTTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTT < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2166:15829:10704/151‑1 (MQ=60)
GCGGGCATGCCCGCTCCCACGGGTGCAGCACAGTTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2130:18584:8430/151‑1 (MQ=60)
tggaCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1208:4495:2249/147‑1 (MQ=60)
cgggcaaaccggctccaacgggtacagcgaagttctgaaacgttgtgctggactTGTGGGAGTGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTTTTTAAGCC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2105:22550:24074/97‑1 (MQ=60)
CGTGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2229:43897:23322/151‑1 (MQ=60)
CGGGCACGCCCTCTCCCACATTTGCAACACAGGTCTCGACCCCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1104:34106:8478/151‑1 (MQ=60)
GGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACCGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAAAAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCC > LH00941:114:22FVMWLT1:2:1244:43675:19255/1‑151 (MQ=60)
ACGCCCGCTCCCACATGTGCAGCACGGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2205:34079:11408/151‑1 (MQ=60)
GCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGTTCTCGAACGCTGTGCCGGACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGG < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1133:48455:5532/151‑1 (MQ=60)
CGCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGC > LH00941:114:22FVMWLT1:2:1213:21330:24267/1‑151 (MQ=60)
CGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTG > LH00941:114:22FVMWLT1:2:2136:34911:5900/1‑151 (MQ=60)
CGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTG > LH00941:114:22FVMWLT1:2:1218:46901:11937/1‑151 (MQ=60)
GCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGAGGCTGC > LH00941:114:22FVMWLT1:2:2144:33505:23962/1‑151 (MQ=60)
CTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCC > LH00941:114:22FVMWLT1:2:2214:5789:7085/1‑151 (MQ=60)
CTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCC > LH00941:114:22FVMWLT1:2:2113:21191:8206/1‑151 (MQ=60)
CTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCC > LH00941:114:22FVMWLT1:2:2161:8008:8430/1‑151 (MQ=60)
CTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2150:25629:22521/151‑1 (MQ=60)
CCNACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCC > LH00941:114:22FVMWLT1:2:1260:3524:1048/1‑151 (MQ=60)
CCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCC > LH00941:114:22FVMWLT1:2:1234:9274:23754/1‑151 (MQ=60)
CCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCC > LH00941:114:22FVMWLT1:2:2250:19878:8750/1‑151 (MQ=60)
CCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCC > LH00941:114:22FVMWLT1:2:2121:12159:19271/1‑151 (MQ=60)
CCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCC > LH00941:114:22FVMWLT1:2:2121:16411:20520/1‑151 (MQ=60)
CCCACAGGTGCAGAACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCC > LH00941:114:22FVMWLT1:2:2263:21191:29247/1‑151 (MQ=60)
agggggcagaagaggtttaGAACGTTGTGCCGTACCTGGGGGAGTGGGCGTGCCCGTGACTGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACT < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1259:11669:10576/132‑1 (MQ=60)
CAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACT > LH00941:114:22FVMWLT1:2:1124:33311:20103/1‑151 (MQ=60)
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
