Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F73 I2 R1
|
76 |
833.2 |
37290668 |
99.4% |
37066923 |
136.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
AE015451_phaM1 |
6,011,161 |
T→C |
intergenic (+90/+20) |
xpt CDS (Xanthine phosphoribosyltransferase) → / ← PP_5266 CDS (putative acetyl‑CoA hydrolase family protein) |
–/– |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | AE015451_phaM1 | 6,011,161 | 0 | T | C | 100.0%
| 1689.2
/ NA
| 430 | intergenic (+90/+20) | xpt CDS (Xanthine phosphoribosyltransferase)/PP_5266 CDS (putative acetyl‑CoA hydrolase family protein) | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (310/120); total (310/120) |
Only 100 of 430 total aligned reads displayed.
TGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGC > AE015451_phaM1/6011031‑6011292
|
tGAAGTCGTTGGAAGGTGGGGTGGTCAGTTCCATAGAAGAAACGCGACACTTGCTTCGCGGGCACGCCCGCCCCAACAGGTGCAGAACAGGTCTAGAACGCTGTGCCGTACTTGG‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAt < 1:15442326/137‑1 (MQ=25)
gtcgtgggAAGGGGGTGGGTTAAGCTTCATCGAAGAAATGCGACACCTGTTTCGCGGGCACACCCGCTCCCACGGGTGCAGCACGGTTCTCGAACGCTGTGCCGTACTTGT‑GGGAGTGGGCGTGCCCGCGAATGGcc < 1:16272515/131‑1 (MQ=255)
gTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGTTCTCGAACGTTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGcc < 2:16999332/137‑1 (MQ=255)
gTCGCGGGAAGGTGGTGTGGTCAGTTCCGTCGAATAAACGCGACACCTTTTTCGCGGGCGCGCCCGCTCACACGGGTGCAGCACAGGTTTAGAACGCGGTGCCGTACTTGG‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGcc < 1:18027004/137‑1 (MQ=25)
gTCGCGGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAAGAAACGCGACACCTGTTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACGGGTGCAGCACAGGTCTCGAACTTTGTTCCGTACCTGG‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGcc < 1:4388956/137‑1 (MQ=37)
tCGCTGGAAGGTGTTGGGGTCATTTTCATTGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGACACGCCCGCTCCCACAGTTACAACACAGGTCTCCAACGCTGTGCCGCACCTTT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCg < 1:10529872/137‑1 (MQ=25)
gCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCTCTCCCACAGGTGTAGCACAGGTCTCGAACGCTGTTTCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGGATGGCcaca > 2:8569782/1‑137 (MQ=37)
tggtgtggtCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTa < 2:18460425/137‑1 (MQ=255)
ggtCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCACTTCCACCGAGTCCGAACCGATTTCTAACACTTTTCCATCCCTTT‑TGGAGGGGGCGTGCCCTCTAATTGTCGCAACCCCTTTTTCTTGt > 1:9431468/1‑137 (MQ=255)
tCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCACTCCCACAAGTGCAGCACAAGTCTCAACCGCTGCGCCACACCTTT‑GGGAACGAGCATGCCCGCGCATTGCCGCAACCCGTTTCTCTGGTTg > 2:17884070/1‑137 (MQ=255)
ttCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGGAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGTCGTACCCGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCACGAATGGCCGCAACCCTTTTCTCTGGTTgccgcc > 2:11920149/1‑137 (MQ=38)
ttCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCACGAATGGCCGCAAACCTTTTATCTGGTTgtcgcc > 2:18568154/1‑137 (MQ=255)
aTCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCCGT‑GGGAACGGGCGTGGCCACGAATGGTCGCAACCCTTTTCCCTGGTTGCCGCCAGc > 2:8960886/1‑137 (MQ=37)
cGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGCAGCACAGGTATAGAACGCTGTGTCATACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGGCCGCGAATGGCCGAAAACCTTTTATCTGGTTGTAGCCAGccc > 2:13320850/1‑137 (MQ=37)
gAATAAACGCGACACCTGCTTCGTGGGCACGCCCGCTCCCACGGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGG‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGcccc < 1:10194189/137‑1 (MQ=255)
gAATAAACGCGACACCTGCTGCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGTTCTCAAACGCTGTACCGTACCTGT‑GGGAGTNGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGcccc < 1:15705488/137‑1 (MQ=38)
gAATAAACGCGACACCGGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCGGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGcccc < 2:18127681/137‑1 (MQ=255)
aaTAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCAAACGCGGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCg < 1:2149640/137‑1 (MQ=255)
aCGTGACACCTGTTTTGCGGGCACGCCCGCTCCCACGTGTGCAGCACAGGTCTCGAACGTTGTGCTGTACTTGT‑GGGAGTGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaac < 1:4803294/137‑1 (MQ=38)
aCGCGACACCTGCTTCGCGGGTACGCCCTCTCCCAAAAGTGTAGCACAGGTCTCTAACACTGTGCCGTACCTTT‑GGGAGCAGGCTTGCCCGCTAATGGTCTCAACCCCTTTGTCTGGTTGGCGCCAGCCCCGCcacc > 2:10397631/1‑135 (MQ=255)
cgACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAATGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaacaac < 2:11138085/137‑1 (MQ=255)
gACACCTTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaacaaca < 2:3569192/137‑1 (MQ=255)
acgccTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAACACATGTCTCAAACGTTTTTCTGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaacaacaa < 1:784169/134‑1 (MQ=25)
cacCTGTTTCGTGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCGGTGCCGTACTTGG‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAg < 2:7196569/137‑1 (MQ=38)
gcgGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTaaa < 1:8083925/137‑1 (MQ=255)
gcgGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTaaa < 1:3677786/137‑1 (MQ=255)
acgGACACACCCACCCCCACGGTTGCAGCACGGTCCTCGAACGCTGTTCCGTACCGTT‑GGGAGCGGCCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTaaa < 1:4900882/136‑1 (MQ=255)
cgGGAACGCCCGCTCCAAGAGTGGCAGCAAAGTTTTCGAACGTTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAg < 1:11079076/137‑1 (MQ=37)
acccGCTCCAACAGGTGTAGCACAGTTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTtcttct < 2:6653677/136‑1 (MQ=39)
caGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGCACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGTTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTg < 2:12598144/137‑1 (MQ=255)
ggTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCg < 2:1440570/137‑1 (MQ=255)
cagcaAAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTg < 1:17123213/137‑1 (MQ=255)
agcaCAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGc > 1:12785/1‑137 (MQ=255)
gcaCAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCGGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcc > 2:6246441/1‑137 (MQ=255)
cacaGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc > 2:17509517/1‑137 (MQ=255)
cacaGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc > 2:5492375/1‑137 (MQ=255)
acaGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcccc > 2:16136501/1‑137 (MQ=255)
acaGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcccc > 1:351049/1‑137 (MQ=255)
aGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCaa > 2:11727156/1‑137 (MQ=255)
gTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGTGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACt > 2:2303265/1‑137 (MQ=255)
tctcGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGTGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTg < 2:1124335/137‑1 (MQ=255)
tcGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGc > 1:17897366/1‑137 (MQ=255)
tcGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAg > 2:8032211/1‑102 (MQ=255)
tcGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCa > 2:12938080/1‑137 (MQ=255)
tcGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCa > 1:11203369/1‑137 (MQ=255)
tcGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCa > 1:13315993/1‑137 (MQ=255)
tcGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCa > 2:16413131/1‑137 (MQ=255)
tcGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCa > 2:15851512/1‑137 (MQ=255)
tcGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCa > 2:15565103/1‑137 (MQ=255)
tcGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCa > 2:4437325/1‑137 (MQ=255)
tcGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCa > 1:3185869/1‑137 (MQ=255)
tcGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCa > 2:7091030/1‑137 (MQ=255)
tcGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCa > 1:6961523/1‑137 (MQ=255)
tcGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCa > 1:6259266/1‑137 (MQ=255)
tcGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCa > 1:9975475/1‑137 (MQ=255)
cGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGc > 1:11887738/1‑137 (MQ=255)
gCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGcc > 2:7963660/1‑137 (MQ=255)
tgtgCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGcccc > 1:759564/1‑137 (MQ=255)
gtgCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCa < 1:5703823/137‑1 (MQ=255)
tgCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAg > 2:5207757/1‑137 (MQ=255)
tgCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAg > 2:10170447/1‑137 (MQ=255)
tgCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAg > 1:18309173/1‑137 (MQ=255)
tgCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAg > 1:13780504/1‑137 (MQ=255)
tgCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAg > 2:17303398/1‑137 (MQ=255)
tgCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAg > 2:2692951/1‑137 (MQ=255)
gCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAgg > 2:7427502/1‑137 (MQ=255)
ccGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGt < 2:1268198/137‑1 (MQ=255)
ccGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGt < 2:16640676/137‑1 (MQ=255)
ccGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGt < 2:7590764/137‑1 (MQ=255)
ccGCACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGt < 1:11615191/137‑1 (MQ=255)
cGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTg > 1:14645050/1‑137 (MQ=255)
cGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTg > 2:3003641/1‑137 (MQ=255)
cGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTg > 2:13912642/1‑137 (MQ=255)
ccgt‑gGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCATTTTATCTAGTTGCCGCCAGCCCCGCCAAAAACAAGCGCTGGTAAAGTTCGCCTTTAAGCCCCTGCGGCCGCCCCAACTGCATCCGACCCAAGTGGCttt > 2:5816978/3‑137 (MQ=255)
tgt‑gGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTc < 1:8499293/137‑1 (MQ=255)
ggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTACGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc > 1:18498273/1‑137 (MQ=255)
ggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc > 2:10684202/1‑137 (MQ=255)
ggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc > 2:6048503/1‑137 (MQ=255)
ggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc > 1:10841965/1‑137 (MQ=255)
ggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc > 1:16642146/1‑137 (MQ=255)
ggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc > 1:2578251/1‑137 (MQ=255)
ggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc > 1:2821349/1‑137 (MQ=255)
ggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc > 1:3992456/1‑137 (MQ=255)
ggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc > 1:5262527/1‑137 (MQ=255)
ggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc > 1:6590547/1‑137 (MQ=255)
ggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc > 1:9788577/1‑137 (MQ=255)
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TGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑GGGAGCGGGCGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCC‑‑TTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAG‑CCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATCCAACGC > AE015451_phaM1/6011031‑6011309
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |