Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F11 I4 R1
|
74 |
758.2 |
33768536 |
99.3% |
33532156 |
136.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
AE015451_phaM1 |
1,713,060 |
A→G |
T2A (ACC→GCC) |
tsaB CDS (endopeptidase) → |
|
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | AE015451_phaM1 | 1,713,060 | 0 | A | G | 99.8%
| 2414.7
/ ‑5.4
| 594 | T2A (ACC→GCC) | tsaB CDS (endopeptidase) | |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (347/246); total (347/247) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.16e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 598 total aligned reads displayed.
ACGCACCTCGACAACGGCCCGCTTGCGGGCCGTTGTCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGACCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCGCATGCATGCCCAGAAGCTGCTGCCGATGATCAAGCAAC > AE015451_phaM1/1712929‑1713192
|
aCGCACCTCGACAACGGCCCGCTTGCGGGCCGTTGTCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGgccacc < 1:14825159/137‑1 (MQ=255)
cGCACCTCGACAACGGCCCGCTTGCGGGCCGTTGTCGTTTGTATGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCAccc < 2:185905/137‑1 (MQ=255)
cGCACCTCGACAACGGCCCGCTTGCGGGCCGTTGTCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCAccc < 1:1696895/137‑1 (MQ=255)
cGCACCTCGACAACGGCCCGCTTGCGGGCCGTTGTCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCAccc < 1:13161643/137‑1 (MQ=255)
gCACCTCGACAACGGCCCGCTTGCGGGCCGTTGTCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCct < 2:5593676/137‑1 (MQ=255)
cTCGACAACGGCCCGTTTGCGGGCCGTTGTCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCctgctg < 2:5736673/137‑1 (MQ=255)
cTCGACAACGGCCCGCTTGCGGGCCGTTGTCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCctgctt < 1:4168194/137‑2 (MQ=255)
cTCGACAACGGCCCGCTTGCGGGCCGTTGTCGTTGGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCATGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCCCTCTTTTTCATTCGCACCGGGATACCCGTTCGATGGCCACCctgctg < 1:6957510/137‑1 (MQ=255)
tCGACAACGGCCCGCTTGCGGGCCGTTGTCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTgg < 1:4898032/137‑1 (MQ=255)
ggCCCGCTTGCGGGCCGTTGTCGTTTGTAGGCCGCCCAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATATTGCCGCTCTTTTTCCTTCGCCCCTTGATACCCGCTCGATGGCCAACCTCCTGGCCCTGGac > 2:3291348/1‑136 (MQ=255)
ggCCCGCTTGCGGGCCGTTGTCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGAt > 2:7543610/1‑137 (MQ=255)
gCCCGCTTGCGGGCCGTTGTCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATa < 2:1385305/137‑1 (MQ=255)
cccGCTTGCGGGCCGTTGTCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATAc > 1:15390366/1‑137 (MQ=255)
cGCTTTCGGGCCGTTGTCGTTTTTCGGCCGCACCGCGCCCCCTCCGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCCTTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTTGCCCTGGATACCg > 2:4208240/1‑137 (MQ=255)
cGCTTGCGGGCCGTTGTCGTTTGTAGGCCGCCCAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCAACCTGCTGGCCCTGGATCCCg > 2:6274667/1‑137 (MQ=255)
cGCTTGCGGGCCGTTGTCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCAACCTGCTGGCCCTGGATACCg > 2:7164520/1‑137 (MQ=255)
cTTGCGGGCCGTTGTCGTTTTTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCGTGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTCTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGcc < 2:14886443/137‑1 (MQ=255)
cTTGCGGGCCGTTGTCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGcc < 1:11682150/137‑1 (MQ=255)
ttGCGGGCCGTTGTCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCa > 2:1337469/1‑137 (MQ=255)
ggCCGTTGTCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGaa > 2:9549684/1‑137 (MQ=255)
tCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTc > 1:7849794/1‑137 (MQ=255)
tCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTc > 1:4113140/1‑137 (MQ=255)
tCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTc > 2:3920162/1‑137 (MQ=255)
tCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCATTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTc > 2:8680702/1‑137 (MQ=255)
gTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCg < 2:10657383/137‑1 (MQ=255)
gTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCg < 1:102337/137‑1 (MQ=255)
tttGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGt < 2:3663471/137‑1 (MQ=255)
ttGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTc < 1:13840143/137‑1 (MQ=255)
ttGGAGGCTGCACAGCGCCCCCTTAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCTGCTCGTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGGTGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCTAAGCCTGTTCCGTc < 2:5425979/137‑1 (MQ=255)
aGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCgcgc > 2:2060600/1‑137 (MQ=255)
aGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCgcgc > 2:14215442/1‑137 (MQ=255)
cGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCgctgct < 1:11254101/137‑1 (MQ=255)
gCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGctgctg > 1:9658906/1‑137 (MQ=255)
gCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGctgctg > 2:9824356/1‑137 (MQ=255)
aGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATg > 2:15641724/1‑137 (MQ=255)
aGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATg > 2:16428077/1‑137 (MQ=255)
aGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATg > 2:2417403/1‑137 (MQ=255)
aGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATg < 2:5960302/137‑1 (MQ=255)
aGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCAACGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATg > 2:3120865/1‑137 (MQ=255)
ccccTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTTGCACCTGGATACCCGTTTGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGACGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGc > 2:15144449/1‑137 (MQ=255)
cAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGt < 1:16645671/137‑1 (MQ=255)
cAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGt < 1:16530485/137‑1 (MQ=255)
cAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGt > 1:16116389/1‑137 (MQ=255)
gACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGAc < 2:16020733/137‑1 (MQ=255)
acacAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGAcc < 1:12388041/137‑1 (MQ=255)
acacAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGAcc < 1:865348/137‑1 (MQ=255)
acacAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGAcc < 1:15713243/137‑1 (MQ=255)
acacAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGAcc < 1:10352994/137‑1 (MQ=255)
cacaACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGCTACCCGTTCGACGGCCACCCTGATGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCa > 2:12073660/1‑137 (MQ=255)
aCGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCa < 1:622410/137‑1 (MQ=255)
aCGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCa < 2:7894350/137‑1 (MQ=255)
cgccgcTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTcgcg < 2:12827789/107‑1 (MQ=255)
cgccgcTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCAc > 1:14461558/1‑137 (MQ=255)
gccgcTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACt > 2:4468148/1‑137 (MQ=255)
gccgcTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACt > 1:10760195/1‑137 (MQ=255)
cgcTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTAc > 2:1174671/1‑137 (MQ=255)
gctgctgctCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACg > 1:11928590/1‑137 (MQ=255)
tgctCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTg > 2:9290670/1‑137 (MQ=255)
tgctCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTg < 1:459490/137‑1 (MQ=255)
tGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGCTCGATGGCCACCCTGCTGGCACTGGATACCACCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCgca > 2:8378556/1‑137 (MQ=255)
ctctTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTgg > 2:2755805/1‑48 (MQ=255)
ctctTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCGTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCgcatgcat > 1:14194352/1‑137 (MQ=255)
ctctTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGAcc > 2:8901448/1‑107 (MQ=255)
ctctTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGAcc < 1:8901448/107‑1 (MQ=255)
ctctTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCgcatgcat > 1:10046942/1‑137 (MQ=255)
ctctTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCgcatgcat > 1:5796489/1‑137 (MQ=255)
ctctTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCgcatgcat > 1:6492430/1‑137 (MQ=255)
ctctTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCgcatgcat > 2:657600/1‑137 (MQ=255)
ctctTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCgcatgcat > 1:3075268/1‑137 (MQ=255)
ctctTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCgcatgcat > 2:5237876/1‑137 (MQ=255)
ctctTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCgcatgcat > 1:1370025/1‑137 (MQ=255)
ctctTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCgcatgcat > 1:16426718/1‑137 (MQ=255)
ctctTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCgcatgcat > 2:2233762/1‑137 (MQ=255)
ctctTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCgcatgcat > 2:16164357/1‑137 (MQ=255)
ctTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGGTCCCGCGCatgcatgc < 1:7310903/137‑1 (MQ=255)
tttttCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCGCATGCATGcc > 1:3297973/1‑137 (MQ=255)
tttttCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCGCATGCATGcc > 2:14572672/1‑137 (MQ=255)
tttttCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCGCATGCATGcc > 1:2191722/1‑137 (MQ=255)
tttttCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCGCATGCATGcc > 1:7035187/1‑137 (MQ=255)
tttttCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCGCATGCATGcc > 1:12781375/1‑137 (MQ=255)
tttCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCAccc > 1:9332460/1‑37 (MQ=255)
tttCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCGCATGCATGCCCa > 1:12651633/1‑137 (MQ=255)
tttCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCGCATGCATGCCCa > 2:11258803/1‑137 (MQ=255)
tttCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCGCATGCATGCCCa > 2:2617926/1‑137 (MQ=255)
tttCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCGCATGCATGCCCa > 1:15018726/1‑137 (MQ=255)
aTTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACTAGGTGATCCCGCGCATGCATGCCCAGAAg < 2:16684265/137‑1 (MQ=255)
aTTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCGCATGCATGCCCAGAAg < 1:7564851/137‑1 (MQ=255)
aTTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCGCATGCATGCCCAGAAg < 2:2877411/137‑1 (MQ=255)
aTTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCGCATGCATGCCCAGAAg < 1:192415/137‑1 (MQ=255)
aCCTGGATACCCGTTCGATGGCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCGCATGCATGCCCAGAAGctgctg < 1:8496505/137‑1 (MQ=255)
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GCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCGCATGCATGCCCAGAAGCTGCTGCCGATGATCAAGCAACTGCTGGCCGACTCTGGCG < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2156:52079:8190/151‑1 (MQ=60)
GCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCGCATGCATGCCCAGAAGCTGCTGCCGATGATCAAGCAACTGCTGGCCGACTCTGGCG < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1138:8008:22553/151‑1 (MQ=60)
GCCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCGCATGCATGCCCAGAAGCTGCTGCCGATGATCAAGCAACTGCTGGCCGACTCTGGCG < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2213:36482:16244/151‑1 (MQ=60)
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GAGCTGATCCGGCGCCTGACGCACCTCGACAACGGCCCGCTTGCGGGCCGTTGTCGTTTGTAGGCCGCACAGCGCCCCCTCAGGACACAACGCCGCTGCTGCTCTATACTGCCGCTCTTTTTCATTCGCACCTGGATACCCGTTCGATGACCACCCTGCTGGCCCTGGATACCGCCACCGAAGCCTGTTCCGTCGCGCTGCTGCATGACGGCAAGGTGACCAGCCACTACGAGGTGATCCCGCGCATGCATGCCCAGAAGCTGCTGCCGATGATCAAGCAACTGCTGGCCGACTCTGGCG > AE015451_phaM1/1712911‑1713210
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
