Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F73 I2 R1
|
76 |
833.2 |
37290668 |
99.4% |
37066923 |
136.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
AE015451_phaM1 |
1,884,295 |
(A)8→7 |
intergenic (‑628/‑323) |
PP_1691 CDS (conserved protein of unknown function) ← / → PP_1692 CDS (conserved protein of unknown function) |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | AE015451_phaM1 | 1,884,288 | 0 | A | . | 99.7%
| 4681.2
/ 4.3
| 890 | intergenic (‑621/‑330) | PP_1691 CDS (conserved protein of unknown function)/PP_1692 CDS (conserved protein of unknown function) | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/1); new base . (339/547); total (341/549) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.62e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 959 total aligned reads displayed.
CGTCCGATGTGCCCTTTTCGTGCACCCAAATGGAGGTTTATGGTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATGAAAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGTTATCCACAGGAACTGTGGATTGTCCCGAGCGC > AE015451_phaM1/1884152‑1884420
|
cGATGTGCCCTTTTCGTGCACCCAAATGGAGGTTTATGGTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTNGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATGaaaaa < 1:17986121/137‑1 (MQ=255)
cGATGTGCCCTTTTCGTGCACCCAAATGGAGGTTTATGGTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATGaaaaa > 2:9037622/1‑137 (MQ=255)
cGATGTGCCCTTTTCGTGCACCCAAATGGAGGTTTATGGTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATGaaaaa > 2:16059649/1‑137 (MQ=255)
gATGTGCCCTTTTCGTGCACCCAAATGGAGGTTTATGGTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATGaaaaaa < 2:2751288/137‑1 (MQ=255)
ttCGTGCACCCAAATGGAGGTTTATGGTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTAttttt < 1:16559964/137‑1 (MQ=255)
tCGTGCACCCAAATGGAGGTTTATGGTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTa < 1:3884880/137‑1 (MQ=255)
cGTGCACCCAAATGGAGGTTTATGGTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGAGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAg > 2:12043306/1‑137 (MQ=255)
ccAAATGGAGGTTTATGGTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGa > 1:11171070/1‑137 (MQ=255)
ccAAATGGAGGTTTATGGTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGa > 2:3991003/1‑137 (MQ=255)
aaaTGGAGGTTTATGGTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGaaa > 1:10927446/1‑137 (MQ=255)
aTGGAGGTTTATGGTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGaaaaa < 2:15734090/137‑1 (MQ=255)
tGGAGGTTTATGGTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGaaaaaa < 1:6272336/137‑1 (MQ=255)
tGGAGGTTTATGGTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAAGGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGaaaaaa < 1:12552024/137‑1 (MQ=255)
gAGGTTTATGGTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATc < 2:18343389/137‑1 (MQ=255)
tATGGTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGt > 2:9556924/1‑137 (MQ=255)
tATGGTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGt > 1:14354796/1‑137 (MQ=255)
tATGGTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGt > 2:74923/1‑137 (MQ=255)
ggTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTg > 1:16396186/1‑137 (MQ=255)
aCTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCaa < 1:8518359/137‑1 (MQ=255)
aCTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCaa > 1:13884958/1‑137 (MQ=255)
ttGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAg > 2:1951405/1‑137 (MQ=255)
ttGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAg > 2:7001556/1‑137 (MQ=255)
cacaTTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGccccc > 1:5113186/1‑137 (MQ=255)
cacaTTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGccccc > 1:13644450/1‑137 (MQ=255)
caTTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCAt < 1:4046892/137‑1 (MQ=255)
ttCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCAttt < 2:13086393/137‑1 (MQ=255)
tCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTc < 1:8140495/137‑1 (MQ=255)
tCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTc < 2:3759728/137‑1 (MQ=255)
tCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTc < 1:1821169/137‑1 (MQ=255)
tCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTc < 1:16994256/137‑1 (MQ=255)
tCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTc < 2:11041342/137‑1 (MQ=255)
tCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTc < 1:2454041/137‑1 (MQ=255)
tCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTc < 1:4360076/137‑1 (MQ=255)
tCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGGGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTc < 2:8812104/137‑1 (MQ=255)
gggCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACg > 2:12438659/1‑137 (MQ=255)
gggCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACg > 2:9307772/1‑137 (MQ=255)
gCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACggg < 1:5898836/137‑1 (MQ=255)
cAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACgggg < 1:1999901/137‑1 (MQ=255)
gcgcTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGt < 1:3137981/137‑1 (MQ=255)
gcgcTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGt < 2:13994812/137‑1 (MQ=255)
gcgcTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGt < 2:14431810/137‑1 (MQ=255)
gcgcTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGt < 2:118013/137‑1 (MQ=255)
gcgcTTGTAACGGCTCGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGt < 2:4734800/137‑1 (MQ=255)
gcTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCATCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTGTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGttt < 2:557178/137‑1 (MQ=255)
gcTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGttt < 2:5936941/137‑1 (MQ=255)
gcTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGttt < 2:11373606/137‑1 (MQ=255)
gcTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGttt < 2:14755687/137‑1 (MQ=255)
gcTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGttt < 2:16831788/137‑1 (MQ=255)
gcTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGttt < 1:925855/137‑1 (MQ=255)
gcTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGttt < 2:3445198/137‑1 (MQ=255)
cTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTg > 1:15026499/1‑137 (MQ=255)
cTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTg > 1:1160865/1‑137 (MQ=255)
cTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTg > 1:7408861/1‑137 (MQ=255)
gTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAgg < 1:16742474/137‑1 (MQ=255)
gTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAgg < 2:8351969/137‑1 (MQ=255)
gTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAgg < 2:11572388/137‑1 (MQ=255)
tAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAggg < 1:10001694/137‑1 (MQ=255)
tAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAggg < 1:14104838/137‑1 (MQ=255)
gCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATg < 2:13734905/137‑1 (MQ=255)
gCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATg < 2:15361203/137‑1 (MQ=255)
gCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATg < 1:460456/137‑1 (MQ=255)
gCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGAATGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATg < 2:5798969/137‑1 (MQ=255)
ttGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATgag < 1:8852079/137‑1 (MQ=255)
gCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAgg < 2:6608226/137‑1 (MQ=255)
aaCACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAgggg > 2:12788767/1‑137 (MQ=255)
aaCACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAgggg > 1:174139/1‑137 (MQ=255)
acacCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAggggg > 1:10111553/1‑137 (MQ=255)
accaccCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGtt < 2:10644009/137‑1 (MQ=255)
caccCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGt < 2:6227837/137‑1 (MQ=255)
caccCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGt > 1:10624271/1‑137 (MQ=255)
caccCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGt < 1:8763654/137‑1 (MQ=255)
agcagcCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCAcc < 2:17389116/137‑1 (MQ=255)
gcagcCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTTGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGATAGGGAGTTGTCCACCg < 2:7876479/137‑1 (MQ=255)
gcagcCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAANATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCg > 1:16071110/1‑137 (MQ=255)
gcagcCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTCTGAGGGGGGGTTGTCCACCg > 2:5078914/1‑137 (MQ=255)
ccTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCGAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGtt > 1:674127/1‑137 (MQ=255)
ccTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGtt > 1:5577093/1‑137 (MQ=255)
ccTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGtt > 1:2180265/1‑137 (MQ=255)
ccTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGtt > 1:716059/1‑137 (MQ=255)
cGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGTTATc < 1:3502776/137‑1 (MQ=255)
ccAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGTTATCca > 1:1033265/1‑137 (MQ=255)
ccAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGTTATCca < 1:11986475/137‑1 (MQ=255)
aTGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGTTATCCACAg < 1:7640661/137‑1 (MQ=255)
aTGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGTTATCCACAg < 1:1344947/137‑1 (MQ=255)
aTGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGTTATCCACAg < 1:12183383/137‑1 (MQ=255)
taCTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGTTGAAAAAATCGTCATTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGTGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGTTATCCACAGGAACtgt < 1:13116056/136‑1 (MQ=255)
gACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGTTATCCACAGGAACtgt < 2:8963438/137‑1 (MQ=255)
gACTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGTTATCCACAGGAACtgt < 1:9793787/137‑1 (MQ=255)
cTGCGTGGTTAAGTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGTTATCCACAGGAACTGTgg > 1:15590405/1‑137 (MQ=255)
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GTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGTTATCCACAGGAATTGTGGATTGTCCCGAGCGCTTGCTCTAGCAC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:2148:23391:17525/151‑1 (MQ=60)
GTCAATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGTTATCCACAGGAACTGTGGATTGTCCCGAGCGCTTGCTCTAGCAC < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1221:3265:17349/151‑1 (MQ=60)
ATG‑AAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGTTATCCACAGGAACTGTGGATTGTCCCGAGCGCTTGCTCTAGCACGGGC > LH00941:114:22FVMWLT1:2:1156:50738:26108/1‑151 (MQ=60)
tgAAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGTTATCCACAGGAACTGTGGATTGTCCCGAGCGCTTGCTCTAGCACGGGCG < LH00941:114:22FVMWLT1:2:1266:12214:25099/149‑1 (MQ=60)
GAAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGTTATCCACAGGAACTGTGGATTGTCCCGAGCGCTTGCTCTAGCACGGGCGT > LH00941:114:22FVMWLT1:2:1148:25268:21737/1‑151 (MQ=60)
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CAAATGCCGTCCGATGTGCCCTTTTCGTGCACCCAAATGGAGGTTTATGGTGCACTTGTTCACATTCGGGGCAGCGCTTGTAACGGCTTGGCAACACCACCCAGCAGCCTCGCCAATGCCTTGACTGCGTGGTTAAGTCAATGAAAAAAAACACTATTTTTAGCTGGTGAAAAAATCGTCAGTTTGACCAAAGCCCCCATTTCACGGGGGTTTGAGGGGTATGAGAGGGGGTTGTCCACCGAGTTATCCACAGGAACTGTGGATTGTCCCGAGCGCTTGCTCTAGCACGGGCGTGCCAGCA > AE015451_phaM1/1884145‑1884445
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
