Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F84 I10 R1
|
267 |
426.1 |
13521957 |
97.0% |
13116298 |
150.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,384,808 |
C→T |
K305K (AAG→AAA) |
yfbK ← |
Von Willebrand factor domain putative lipoprotein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,384,808 | 0 | C | T | 94.9%
| 1381.9
/ 43.4
| 432 | K305K (AAG→AAA) | yfbK | Von Willebrand factor domain putative lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (12/10); new base T (225/184); total (238/194) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.22e-01 |
Only 100 of 439 total aligned reads displayed.
TATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTC > NC_000913/2384660‑2384955
|
tATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCttt > 5:101828/1‑151 (MQ=255)
aTTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGCGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTtc > 1:360230/1‑151 (MQ=255)
ccACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACGAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGAGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGc > 6:83588/1‑151 (MQ=255)
ccACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCTATTGATGCCGCCATTAATAAACCCTTTCGTCGc > 1:1037459/1‑151 (MQ=255)
ccACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGc < 1:627976/151‑1 (MQ=255)
cGCCAACCGTCGACAGAGTATCACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCATTCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTTGCTAATAAAATGGGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCctg < 3:1442275/151‑1 (MQ=255)
aaaCGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCctgctg > 6:1255879/1‑150 (MQ=255)
aaaCGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCctgctg > 7:298416/1‑150 (MQ=255)
aaaCGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATCCCCCCCTTAATAAACCCTTTCGACGCctgctg > 2:242656/1‑150 (MQ=255)
cGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATaa < 8:778609/151‑1 (MQ=255)
cGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATGAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGcc < 1:1367046/151‑1 (MQ=255)
cGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGcc < 1:1159405/151‑1 (MQ=255)
cGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGcc < 6:1143846/151‑1 (MQ=255)
cGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGcc < 4:1113716/151‑1 (MQ=255)
gACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGcc > 4:1418030/1‑150 (MQ=255)
gACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCa < 5:918934/151‑1 (MQ=255)
cAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGt < 7:421730/151‑1 (MQ=255)
aaCACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTCATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAACTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGc < 5:696296/151‑1 (MQ=255)
ccAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCgg > 1:46925/1‑151 (MQ=255)
ccAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCgg > 6:179309/1‑151 (MQ=255)
ccAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCAACGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCACgg > 2:985990/1‑151 (MQ=255)
aCTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCAcc > 5:1227059/1‑151 (MQ=255)
cTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCg > 8:1129404/1‑151 (MQ=255)
tCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGc > 6:686740/1‑151 (MQ=255)
gtGTTTTTTGACCATTGATTGAATCGATTTTCGATCGTCAATGCCAACTTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCCCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTg < 4:1190197/150‑1 (MQ=255)
gTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTg < 3:397439/149‑1 (MQ=255)
ttttttGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGt > 3:527526/1‑150 (MQ=255)
ttttttGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGt > 6:1340234/1‑150 (MQ=255)
ttGACCTTTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTg < 2:316980/150‑1 (MQ=255)
tGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGcc > 1:1554714/1‑151 (MQ=255)
gACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCt < 8:1265593/151‑1 (MQ=255)
gACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCt < 8:1542235/151‑1 (MQ=255)
aCCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCtt < 5:587781/151‑1 (MQ=255)
tGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGc < 5:82403/150‑1 (MQ=255)
cAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATcc > 6:1526067/1‑149 (MQ=255)
cAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATcc > 7:783965/1‑149 (MQ=255)
cAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCa < 4:846034/150‑1 (MQ=255)
aaTCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGc > 8:376069/1‑151 (MQ=255)
aaTCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCATTCGGCATCCAGc > 2:1568141/1‑151 (MQ=255)
tCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCg > 7:834495/1‑150 (MQ=255)
cGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGa > 8:1024169/1‑150 (MQ=255)
cGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGa < 5:503703/150‑1 (MQ=255)
cGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGaa < 2:1358765/151‑1 (MQ=255)
gATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAAt > 6:626784/1‑151 (MQ=255)
gATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAAt > 8:504459/1‑151 (MQ=255)
aTTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATc < 2:839446/151‑1 (MQ=255)
ggATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAAtt < 8:1635070/150‑1 (MQ=255)
ggATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTg < 4:481045/151‑1 (MQ=255)
aTCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCg > 4:222447/1‑151 (MQ=255)
cGTCAATGCCAACGTTAAAGTCCCCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGc > 7:17345/1‑151 (MQ=255)
cGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGCCATCCAGCGAATCAATTCCgcc > 2:621648/1‑149 (MQ=255)
cAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCAtt < 3:775030/151‑1 (MQ=255)
cAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCAt < 2:1149288/150‑1 (MQ=255)
aaTGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTa < 7:1483757/151‑1 (MQ=255)
gCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAAtt > 8:269995/1‑151 (MQ=255)
gCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAAtt < 3:1123078/151‑1 (MQ=255)
cAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTc > 1:286536/1‑151 (MQ=255)
aaCGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTcc > 1:906916/1‑151 (MQ=255)
aCGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCg < 4:648956/151‑1 (MQ=255)
ggTTAAAGTGACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCCAATGATGCCGCCCTTAATAAAACCATTAGTCGCCAGCAGAAAAGCCAGTTACAGCCCGGCACCGCCAATGGTACATCCTTCCGCATCCACCGAATCAAATTCGGCATTAAattaccc > 1:536612/2‑147 (MQ=255)
cGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGc > 2:1631603/1‑151 (MQ=255)
cGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGc > 1:236520/1‑151 (MQ=255)
aaGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTAt < 6:919216/151‑1 (MQ=255)
aGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATg < 3:1195637/151‑1 (MQ=255)
aGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCAACGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATg > 2:408999/1‑151 (MQ=255)
tCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGAc > 3:17671/1‑151 (MQ=255)
tCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGAc > 6:1434646/1‑151 (MQ=255)
tCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGAc > 4:1551707/1‑151 (MQ=255)
aCCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTc > 8:696952/1‑151 (MQ=255)
aCCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTc > 7:110133/1‑151 (MQ=255)
aCCGTCAGTGGCTAATAAAATCCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTc < 6:501779/151‑1 (MQ=255)
cGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTccc > 4:575214/1‑151 (MQ=255)
cAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCgg < 6:1043229/150‑1 (MQ=255)
cAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGga < 4:1231347/151‑1 (MQ=255)
aGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCgg > 7:687275/1‑149 (MQ=255)
aGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCgg > 5:1175987/1‑149 (MQ=255)
aGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGgag < 8:179548/151‑1 (MQ=255)
aGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGgag < 8:1419765/151‑1 (MQ=255)
aGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATACAGCGAATCAATTGCTGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCggtg > 2:1520838/1‑149 (MQ=255)
gCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAg < 4:1526433/151‑1 (MQ=255)
cTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGAt > 3:308075/1‑148 (MQ=255)
ataaAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGATgg > 6:449732/1‑151 (MQ=255)
ataaAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAgg > 5:1516487/1‑151 (MQ=255)
ataaAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAgg < 7:1539663/151‑1 (MQ=255)
ataaAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAgg > 5:1307473/1‑151 (MQ=255)
aaaTTCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTTGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGgcaa < 3:981943/151‑1 (MQ=255)
aaaTGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGgcaa < 1:1221166/151‑1 (MQ=255)
aaTGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGgcaat > 1:71508/1‑151 (MQ=255)
tGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGgcaatgc > 5:254075/1‑151 (MQ=255)
gCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGgcaatgca < 6:1628393/151‑1 (MQ=255)
gATGCAGCCCTTAATAAAACCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGAAAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTTGTACTTCCTTCGGCATCCAGAGAATCAATTGCTGCAGTAATTTACGCCTTATGACGACCGGAGATAGAAGGCAATGCAATGCgg > 6:39541/1‑151 (MQ=255)
aTGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACggg > 2:126890/1‑151 (MQ=255)
tGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGCCAATGCAATACggg > 5:1417388/1‑150 (MQ=255)
gccgccCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGa < 4:362198/150‑1 (MQ=255)
ccgccCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGt > 3:1603924/1‑151 (MQ=255)
cgccCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTc > 2:727214/1‑151 (MQ=255)
cccTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGc < 6:1695906/151‑1 (MQ=255)
ccTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGcc > 6:244984/1‑151 (MQ=255)
taataaACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAg < 6:367009/150‑1 (MQ=255)
aaCCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAgg < 5:359254/151‑1 (MQ=255)
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TATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTC > NC_000913/2384660‑2384955
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
