Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F84 I10 R1
|
267 |
426.1 |
13521957 |
97.0% |
13116298 |
150.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,510,609 |
C→T |
P327L (CCG→CTG) |
yfeO → |
putative ion channel protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,510,609 | 0 | C | T | 96.1%
| 1202.8
/ 20.0
| 362 | P327L (CCG→CTG) | yfeO | putative ion channel protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (6/8); new base T (176/172); total (182/180) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.98e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 362 total aligned reads displayed.
TTTCGCTGTTTAAAGGGCTGGATGAGATGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCCGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACACGCGATGGCTGGTTAAGTCTTTTTATGGCGGCAGT > NC_000913/2510462‑2510756
|
tttCGCTGTTTAAAGGGCTGGATGAGATGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGc > 4:1083027/1‑151 (MQ=255)
cGCTGTTTAAAGGGCTGGATGAGATGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAgt < 7:1565162/151‑1 (MQ=255)
gCTGTTTAAAGGGCTGGATGAGATGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAgtg > 8:913033/1‑151 (MQ=255)
gCTGTTTAAAGGGCTGGATGAGATGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAgtg < 6:962903/151‑1 (MQ=255)
tGTTTAAAGGGCTGGATGAGATGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGtt > 4:255498/1‑151 (MQ=255)
ggTTTAAAGGGCTGGATGAGATGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGtt < 6:63072/150‑1 (MQ=255)
tttAAAGGGCTGGATGAGATGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTg > 3:1191730/1‑151 (MQ=255)
tAAAGGGCTGGATGAGATGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGt < 5:458906/150‑1 (MQ=255)
tAAAGGGCTGGATGAGATGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCATGGCAGTGTTTGTc > 7:1449387/1‑151 (MQ=255)
aaaGGGCTGGATGAGATGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCg < 4:946061/151‑1 (MQ=255)
aaaGGGCTGGATGAGATGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCg < 8:1148307/151‑1 (MQ=255)
aaGGGCTGGAGGAGATGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGGCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCgg < 4:215827/151‑1 (MQ=255)
aGGGCTGGATGAGATGCAGCAGATGGTGTCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGc < 4:610528/151‑1 (MQ=255)
gCTGGATGAGATGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTg < 1:213393/151‑1 (MQ=255)
tGAGATGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCAtt > 8:304978/1‑150 (MQ=255)
gaTGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAggg < 1:1156205/151‑1 (MQ=255)
gaTGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAggg < 2:340932/151‑1 (MQ=255)
aTGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGt > 4:504343/1‑151 (MQ=255)
tGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGtt > 3:901853/1‑151 (MQ=255)
agcagATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGAt > 6:745684/1‑151 (MQ=255)
tggtggCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGAtgctgc > 4:1419377/1‑150 (MQ=255)
tggtggCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGAtgctgc > 2:1245492/1‑150 (MQ=255)
ggtggCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCa < 5:1548944/150‑1 (MQ=255)
ggtggCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCAt > 4:861652/1‑151 (MQ=255)
ggaggCAAATCAGGCTTTGAGGACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAACCTTGCCGCCCGGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCTAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTCGCATTAGGGGGGATGCTGCAt < 6:1451854/148‑1 (MQ=255)
gtggCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCAtt > 6:1030061/1‑150 (MQ=255)
gtggCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATg < 2:1146674/151‑1 (MQ=255)
gtggCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATg > 7:1634482/1‑151 (MQ=255)
tggCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATg > 5:713519/1‑150 (MQ=255)
ggCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAACCTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGGTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATg > 7:1311427/1‑149 (MQ=255)
cAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCa < 1:324579/151‑1 (MQ=255)
cAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCCGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCa < 7:630530/151‑1 (MQ=255)
cAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGtt < 3:1003389/150‑1 (MQ=255)
aGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTcc > 6:875582/1‑151 (MQ=255)
aGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTcc > 8:1037361/1‑151 (MQ=255)
gCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCccg > 3:815875/1‑151 (MQ=255)
gCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCccg < 7:48475/151‑1 (MQ=255)
cTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCccgc > 3:520639/1‑151 (MQ=255)
cTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCccgc > 3:1476393/1‑151 (MQ=255)
cAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTa < 1:1521452/151‑1 (MQ=255)
cACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTAcc > 2:1064972/1‑150 (MQ=255)
cACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTAcc > 3:269054/1‑150 (MQ=255)
cACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTAcc > 8:1423173/1‑150 (MQ=255)
aCCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAg < 8:618712/151‑1 (MQ=255)
ccAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGc > 5:376563/1‑151 (MQ=255)
cAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGt > 3:306067/1‑99 (MQ=255)
cAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCg > 5:809279/1‑151 (MQ=255)
cAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCg < 8:1614088/151‑1 (MQ=255)
cGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCa < 8:1342169/151‑1 (MQ=255)
gATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCa > 2:205103/1‑150 (MQ=255)
ttACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAAt > 7:1235007/1‑150 (MQ=255)
tACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATa < 1:926711/150‑1 (MQ=255)
tACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATa < 7:676366/150‑1 (MQ=255)
aCTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAAc < 8:1684928/151‑1 (MQ=255)
aCTTTTTGCTGGCGGTAACTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATaa < 8:438991/150‑1 (MQ=255)
tttttGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCg > 3:1238712/1‑151 (MQ=255)
ttttGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAAcc < 5:94208/149‑1 (MQ=255)
tGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTc > 5:1267367/1‑151 (MQ=255)
tGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTg > 1:1297696/1‑151 (MQ=255)
ggCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGGTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTgc < 3:1522580/151‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGGCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTg < 1:1056520/150‑1 (MQ=255)
cGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTgcgc < 8:129053/151‑1 (MQ=255)
gTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTa < 8:552960/151‑1 (MQ=255)
gTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAAACGTTACTTGCGCt > 1:640264/1‑150 (MQ=255)
tAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATtct < 7:328112/150‑1 (MQ=255)
aaaCTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATtctc < 1:1007362/150‑1 (MQ=255)
aaaCTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATtctc < 4:424601/150‑1 (MQ=255)
aaaCTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATtctc < 5:1414551/150‑1 (MQ=255)
aaCTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCgg > 7:20837/1‑151 (MQ=255)
aaCTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCCCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCgg < 3:1604609/151‑1 (MQ=255)
gccgccCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCCGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATc < 1:1647506/150‑1 (MQ=255)
cgccCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTg > 6:498332/1‑151 (MQ=255)
cTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCtgg > 2:876551/1‑151 (MQ=255)
tGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCtggt > 2:636472/1‑151 (MQ=255)
ggTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCtgg < 2:1381722/149‑1 (MQ=255)
gTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTATCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCtggtgg > 8:1666731/1‑151 (MQ=255)
tCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTggtggt > 1:436443/1‑151 (MQ=255)
gTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTaa < 5:330957/151‑1 (MQ=255)
gTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTaa < 2:1291385/151‑1 (MQ=255)
gctgcCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAacac < 5:1382320/151‑1 (MQ=255)
gctgcCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAaca < 7:27883/150‑1 (MQ=255)
gccgccAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACAcgcg < 1:951579/151‑1 (MQ=255)
gccAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACACGCGATg < 7:8936/151‑1 (MQ=255)
gccAGTGGCTGGCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGGTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTGCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACACGCGATg < 4:67935/151‑1 (MQ=255)
ccAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACACGCGATgg > 5:270224/1‑151 (MQ=255)
ccAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACACGCGATgg > 1:732532/1‑151 (MQ=255)
ccAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGGTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACACGCGATgg < 2:962147/151‑1 (MQ=255)
cAGTGGCTTTCGCGGGGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACACGCGATGGc < 2:1448220/151‑1 (MQ=255)
ggCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACACGCGATGGCTGGt < 6:437665/151‑1 (MQ=255)
ggtctaaTCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCATCGGCAATAACCGTTTCTTGCGATATTCTCGGCATCGTGCTGTTGGTAACACGCGATGGCTGGTTAAGTCttttt < 4:1592642/145‑1 (MQ=255)
gggCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACACGCGATGGCTGGTTAAGTCTTTTTa < 8:739565/151‑1 (MQ=255)
gggCGAATCTTCCCGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACACGCGATGGCTGGTTAAGTCTTTTTa < 6:1242055/151‑1 (MQ=255)
ggCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGTCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACACGCGATGGCTGGTTAAGTCTTTTTAt < 8:1215892/151‑1 (MQ=255)
ggCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACACGCGATGGCTGGTTAAGTCTTTTTAt < 6:945077/151‑1 (MQ=255)
gCGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGGGGATGCTGCATGCGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACACGCGATGGCTGGTTAAGTCTTTTTATg < 6:342052/151‑1 (MQ=255)
cGAATCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACACGCGATGGCTGGTTAAGTCTTTTTATgg > 3:1374376/1‑151 (MQ=255)
aaTCTTCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACACGCGATGGCTGGTTAAGTCTTTTTATggcg < 5:1102448/151‑1 (MQ=255)
aaTCTTCCCGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACACGCGATGGCTGGTTAAGTCTTTTTATggcg < 6:1638013/151‑1 (MQ=255)
gttCCTGGCAGTGTTCGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACACGCGATGGCTGGTTAAGTCTTTTTATGGCGGCa < 5:591263/150‑1 (MQ=255)
tCCTGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACACGCGATGGCTGGTTAAGTCTTTTTATggcgg < 6:1687680/147‑1 (MQ=255)
|
TTTCGCTGTTTAAAGGGCTGGATGAGATGCAGCAGATGGTGGCAAATCAGGCTTTCAGCACCAGCGATTACTTTTTGCTGGCGGTAATTAAACTTGCCGCCCTGGTCGTTGCTGCCGCCAGTGGCTTTCGCGGTGGGCGAATCTTCCCGGCAGTGTTTGTCGGCGTGGCATTAGGGTTGATGCTGCATGAGCACGTTCCCGCCGTACCAGCGGCAATAACCGTTTCTTGCGCTATTCTCGGCATCGTGCTGGTGGTAACACGCGATGGCTGGTTAAGTCTTTTTATGGCGGCAGT > NC_000913/2510462‑2510756
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
