Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F84 I10 R1
|
267 |
426.1 |
13521957 |
97.0% |
13116298 |
150.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,240,423 |
C→T |
G160G (GGC→GGT) |
sstT → |
sodium:serine/threonine symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,240,423 | 0 | C | T | 97.2%
| 1179.7
/ 14.3
| 368 | G160G (GGC→GGT) | sstT | sodium:serine/threonine symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/7); new base T (140/213); total (144/224) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.46e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.78e-01 |
Only 100 of 370 total aligned reads displayed.
ATTTATCCAGTAGCGCGGGTGATATTTCGCCGCCGTCAGGCATTGTCGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTC > NC_000913/3240275‑3240570
|
aTTTATCCAGTAGCGCGGGTGATATTTCGCCGCCGTCAGGCATTGTCGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGttt > 5:1297615/1‑151 (MQ=255)
ttATCCAGTAGCGCGGGTGATATTTCGCCGCCGTCAGGCATTGTCGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTc < 6:1273006/150‑1 (MQ=255)
ccAGTAGCGCGGGTGATATTTCGCCGCCGTCAGGCATTGTCGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACt < 3:1392808/151‑1 (MQ=255)
cAGTAGCGCGGGTGATATTTCGCCGCCGTCAGGCATTGTCGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTg < 4:175441/151‑1 (MQ=255)
gTAGCGCGGGTGATATTTCGCCGCCGTCAGGCATTGTCGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCg > 4:1049026/1‑151 (MQ=255)
ccgcgGGTGATATTTCGCCGCCGTCTGGGATTGTCGAAGTGATGCGGGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCATCGGTTTCGCACTGCGTCa < 6:1395805/150‑1 (MQ=255)
cgcgGGTGATATTTCGCCGCCGTCAGGCATTGTCGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCAc > 3:941999/1‑151 (MQ=255)
gcgGGTGATATTTCGCCGCCGTCAGGCATTGTCGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACg < 2:1037917/151‑1 (MQ=255)
gTGATATTTCGCCGCCGTCAGGCATTGTCGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTa > 2:562513/1‑150 (MQ=255)
gATATTTCGCCGCCGTCAGGCATTGTCGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAAc < 3:1217563/150‑1 (MQ=255)
cgccgcCGTCAGGCATTGTCGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGaccac < 3:543448/151‑1 (MQ=255)
gccgccGTCAGGCATTGTCGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGaccacc > 4:916/1‑151 (MQ=255)
cgccgTCAGGCATTGTCGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCaa < 2:1284032/151‑1 (MQ=255)
gTCAGGCATTGTCGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAAc < 7:619355/151‑1 (MQ=255)
cAGGCATTGTCGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCt < 2:695013/151‑1 (MQ=255)
aGGCATTGTCGAAGTGATGCGCGGGGTTGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGGCTGGGTTTCGCAATGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTg < 3:1077984/151‑1 (MQ=255)
ggCATTGTCGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTgg < 1:383260/151‑1 (MQ=255)
gTCGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACg > 8:369410/1‑151 (MQ=255)
gTCGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACg > 5:877327/1‑151 (MQ=255)
cGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGat < 7:851113/151‑1 (MQ=255)
gAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGat > 1:90779/1‑150 (MQ=255)
aaGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCGCGGTAACGAGACCACCAAAACCCTGGTTAACGatat > 5:1168738/1‑151 (MQ=255)
aaGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGatat < 2:1441243/151‑1 (MQ=255)
aGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATg < 7:1425825/151‑1 (MQ=255)
gTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGt < 3:678149/151‑1 (MQ=255)
gATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCg < 6:233961/151‑1 (MQ=255)
cgcgGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATg > 8:828230/1‑151 (MQ=255)
gcgGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGc > 4:1583786/1‑151 (MQ=255)
gcgGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGc < 1:1386631/151‑1 (MQ=255)
gcgGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGc < 1:1684286/151‑1 (MQ=255)
cgGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGcc < 5:1051954/151‑1 (MQ=255)
gCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGtt < 7:397392/151‑1 (MQ=255)
gCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGtt < 7:1183499/151‑1 (MQ=255)
tGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTAc > 7:448062/1‑151 (MQ=255)
ggTAATGAGCATGGTTTCCTACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTCACGAGACCACCAACAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTa < 1:1159513/149‑1 (MQ=255)
gTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCt < 7:1042287/151‑1 (MQ=255)
aaTGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCttt > 1:731736/1‑151 (MQ=255)
gAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATg < 5:698310/151‑1 (MQ=255)
gAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATg < 5:795704/151‑1 (MQ=255)
gAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATg > 1:32642/1‑151 (MQ=255)
gAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTAt < 5:1594512/150‑1 (MQ=255)
gCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAAt < 7:179410/134‑1 (MQ=255)
tGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGa > 3:1154954/1‑150 (MQ=255)
gggttCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATTGTGaa < 6:532643/147‑1 (MQ=255)
ggTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGAGCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGaaa < 4:984327/151‑1 (MQ=255)
ttCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTg > 2:1666072/1‑151 (MQ=255)
ttCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGA‑TCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGCTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCGTTATGGTGAAACTgg > 4:1460958/1‑151 (MQ=255)
cAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTc < 3:715190/151‑1 (MQ=255)
cAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTc < 3:377581/151‑1 (MQ=255)
aaCCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTc > 2:502462/1‑150 (MQ=255)
aaCCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCa < 8:725644/151‑1 (MQ=255)
ccccATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCAtt > 3:1664109/1‑151 (MQ=255)
ccccATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCAtt > 8:1533268/1‑151 (MQ=255)
cccATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCAttc > 1:1483806/1‑151 (MQ=255)
cccATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCAttc < 6:828877/151‑1 (MQ=255)
cccATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCAtt > 8:52937/1‑150 (MQ=255)
cccATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGCCAttc > 4:1340196/1‑151 (MQ=255)
ccATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCAttcg > 1:1005097/1‑151 (MQ=255)
cGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCAttcgcttc < 6:694009/151‑1 (MQ=255)
cGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCAttcgctt < 7:1209337/150‑1 (MQ=255)
cGACGCCCTGCTGAAACGTAACTACATCGGGAATCTCGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATCCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCAttcgctt > 1:422634/1‑150 (MQ=255)
gACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCAttcgcttcg > 1:1076942/1‑151 (MQ=255)
aCGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCAttcgcttcgc < 6:167541/151‑1 (MQ=255)
cgcgCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCa < 4:1084401/151‑1 (MQ=255)
cgcTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCAcc < 5:592857/151‑1 (MQ=255)
cgcTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCAcc > 6:1367560/1‑151 (MQ=255)
gctgctGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTCCGTCACGGTAACGACCCCACAAAAAACATGGTAAACCAAATGTCGAATGCCGTTACATTTATGTTTAAACTGTTCAtacgattccaacc > 2:949316/1‑145 (MQ=255)
gctgAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGAtt < 3:1514904/151‑1 (MQ=255)
aaaGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTa < 8:596122/151‑1 (MQ=255)
ggTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTAttt < 5:322404/151‑1 (MQ=255)
gTACCTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTAtttt < 3:397678/151‑1 (MQ=255)
aaCTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTAttttt < 7:29957/150‑1 (MQ=255)
aaCTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTg < 1:585618/151‑1 (MQ=255)
aCTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTgg < 8:1397184/151‑1 (MQ=255)
tACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGc > 2:789213/1‑151 (MQ=255)
aCATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGc < 5:1674920/150‑1 (MQ=255)
aCATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGACTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTTGTTAACGATATGTAGAATGCCGTTACCTTTTTGGTAAAAAAAGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTATTtggat > 5:1360757/1‑149 (MQ=255)
aCATCGGGATTCTGGTGCGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGATTGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCt < 6:1129292/151‑1 (MQ=255)
cATCGGGATTCTGTTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCTCGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTg < 2:268329/151‑1 (MQ=255)
cGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGt < 5:502978/150‑1 (MQ=255)
cGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGt < 8:1123863/150‑1 (MQ=255)
cGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGt < 6:668603/150‑1 (MQ=255)
gggATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGttt < 3:987265/151‑1 (MQ=255)
ggATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTttc < 6:1585755/151‑1 (MQ=255)
ggATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGGTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTttc < 4:513695/151‑1 (MQ=255)
ggTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTa < 4:269295/149‑1 (MQ=255)
ggTGTGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTAcc < 4:351580/151‑1 (MQ=255)
gtgtGGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTAccc > 1:824716/1‑151 (MQ=255)
gtgGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCTAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCt < 3:1453004/150‑1 (MQ=255)
gtgGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTg < 8:193704/151‑1 (MQ=255)
gtgGGCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGGCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTg < 1:25117/151‑1 (MQ=255)
ggCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCa < 5:39378/151‑1 (MQ=255)
gCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCaa < 2:1462932/151‑1 (MQ=255)
gCGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGGAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCaa < 5:459113/151‑1 (MQ=255)
cGATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAac > 4:1181264/1‑151 (MQ=255)
gATCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAacc > 6:407128/1‑151 (MQ=255)
aTCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGTGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAacc > 2:736460/1‑150 (MQ=255)
tCGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAaccac > 4:197565/1‑151 (MQ=255)
cGGCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAaccacc > 4:868182/1‑151 (MQ=255)
ggCCTCGGTTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTCGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCg > 8:1040300/1‑151 (MQ=255)
|
ATTTATCCAGTAGCGCGGGTGATATTTCGCCGCCGTCAGGCATTGTCGAAGTGATGCGCGGGCTGGTAATGAGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTC > NC_000913/3240275‑3240570
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
