Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F84 I10 R1
|
267 |
426.1 |
13521957 |
97.0% |
13116298 |
150.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,524,184 |
C→T |
A438A (GCC→GCT) |
mrcA → |
penicillin‑binding protein 1a, murein transglycosylase and transpeptidase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,524,184 | 0 | C | T | 95.6%
| 1260.3
/ 31.7
| 388 | A438A (GCC→GCT) | mrcA | penicillin‑binding protein 1a, murein transglycosylase and transpeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (6/11); new base T (164/205); total (170/218) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.19e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.72e-01 |
Only 100 of 388 total aligned reads displayed.
TCAGCAAGGACCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCCGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATAAAGGTCTGACGCTGGCAAGTATGTTGAAC > NC_000913/3524037‑3524331
|
cAGCAAGGACCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGtt < 5:606713/150‑1 (MQ=255)
cAGCAAGGACCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGtt > 2:779259/1‑150 (MQ=255)
cAGCAAGGACCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGt < 4:218358/149‑1 (MQ=255)
cAGCAAGGACCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGt < 3:684033/149‑1 (MQ=255)
cAGCAAGGACCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTa < 3:156845/151‑1 (MQ=255)
gCAAGGACCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATg < 5:368756/151‑1 (MQ=255)
cAAGGACCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATgg < 6:868124/151‑1 (MQ=255)
aGGCCCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGACGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGCCGCGGGTGTCGATCCATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGgcg > 3:405119/1‑151 (MQ=255)
aCCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTg < 6:1630975/151‑1 (MQ=255)
gACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTc < 5:1403037/151‑1 (MQ=255)
aCGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCg > 8:716773/1‑151 (MQ=255)
aCGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCCGTTATGGCGCTGGTCg < 4:28974/151‑1 (MQ=255)
gccgcGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGATCTCGGGGCTGGTGTCGATCAATCCGCTAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGt < 6:941255/151‑1 (MQ=255)
cgcgTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTgg < 4:1635671/151‑1 (MQ=255)
cgcgTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTgg < 7:1165036/151‑1 (MQ=255)
cgcgTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTgg > 6:1049925/1‑151 (MQ=255)
cgcgTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTgg < 5:655631/151‑1 (MQ=255)
tAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCttt > 5:502936/1‑151 (MQ=255)
aaaGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTg < 7:498724/151‑1 (MQ=255)
aaaGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTg < 5:1142371/151‑1 (MQ=255)
aaaGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTCGTCTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGCTCGGTGGCTTTg > 7:138735/1‑151 (MQ=255)
gTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCCTGGTGGCTGGCACAAGTGCCGCAAGAGACCTCGGCGCTGCTGTCGATCAATCCGCAAAACGCTGCTGTTATGCCGCAGGGCGGTGGCTTTGAtt > 8:52696/1‑151 (MQ=255)
gACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGAttt < 4:1434671/150‑1 (MQ=255)
gACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGAttt < 3:991182/150‑1 (MQ=255)
gACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCCGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTc < 4:1072791/151‑1 (MQ=255)
aCCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTc > 7:1286802/1‑150 (MQ=255)
aCCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCa < 4:587689/151‑1 (MQ=255)
ccGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCa > 6:1494665/1‑150 (MQ=255)
cGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAAt > 1:455891/1‑151 (MQ=255)
gTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCaga < 1:129279/151‑1 (MQ=255)
gTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCCGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCag < 7:597388/150‑1 (MQ=255)
gCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGc < 5:173342/148‑1 (MQ=255)
cAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGt < 2:445191/151‑1 (MQ=255)
aaCGGGTCAGCAAATCTGGTTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCCGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTCGATTGCATTTAAAACACAGCAAGttt > 3:1003801/1‑151 (MQ=255)
cAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCGGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACcgcg < 4:871429/151‑1 (MQ=255)
cAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACcgcg < 6:1314283/151‑1 (MQ=255)
aGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCgcgc > 7:938421/1‑151 (MQ=255)
cAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGcc > 1:316210/1‑150 (MQ=255)
tCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCAccc > 7:1647085/1‑150 (MQ=255)
gggTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCa < 8:618545/148‑1 (MQ=255)
gggTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAg < 7:1459813/149‑1 (MQ=255)
gggTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAg < 8:1399210/149‑1 (MQ=255)
gTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGctc > 6:454833/1‑149 (MQ=255)
tCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACt < 1:222387/150‑1 (MQ=255)
tCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACt < 1:898769/150‑1 (MQ=255)
tCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACt < 4:1266058/150‑1 (MQ=255)
cGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCCGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGc < 4:1541230/151‑1 (MQ=255)
gTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGAGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCg > 8:1441762/1‑151 (MQ=255)
aGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTc > 6:1215695/1‑150 (MQ=255)
aGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTc > 6:1115916/1‑150 (MQ=255)
aGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTc > 1:1226147/1‑150 (MQ=255)
aGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCa < 3:790627/151‑1 (MQ=255)
tGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGt < 8:27107/150‑1 (MQ=255)
tGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTg > 6:183306/1‑151 (MQ=255)
tGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTg > 3:877247/1‑151 (MQ=255)
gCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGCTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTCGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTggg > 8:1668040/1‑151 (MQ=255)
cGATGCATGGTGGCTGGCACTAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGt < 1:564804/151‑1 (MQ=255)
gATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGtt > 1:1453843/1‑151 (MQ=255)
aTGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAAc > 6:1010599/1‑151 (MQ=255)
aTGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAAc < 3:518126/151‑1 (MQ=255)
aTGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAAc < 8:1049399/151‑1 (MQ=255)
ggtggCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACAt < 1:159068/151‑1 (MQ=255)
ggtggCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACAt > 2:357668/1‑151 (MQ=255)
tggctggcACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATc > 5:851746/1‑150 (MQ=255)
ggctggcACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCaa < 2:1507857/151‑1 (MQ=255)
ggctggcACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCa < 8:341716/150‑1 (MQ=255)
gggcACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAAcc < 1:134406/150‑1 (MQ=255)
ggcACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGCTCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCTCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCACACCg > 4:436088/1‑151 (MQ=255)
ggcACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAAcc < 4:1667847/150‑1 (MQ=255)
cacaAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGtt < 3:1092162/151‑1 (MQ=255)
acaAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGAACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGtt > 2:612499/1‑150 (MQ=255)
tGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCctct > 7:1239010/1‑150 (MQ=255)
ccGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTaca < 8:1580265/151‑1 (MQ=255)
cGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTacac < 2:1682216/151‑1 (MQ=255)
aaGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTCCCATTGATTTAAATCACAGCAAGTTTAACCTCGTCAACCAGGGACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTacaaccc > 1:716004/1‑147 (MQ=255)
aGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGTGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACcgcg < 1:1079276/151‑1 (MQ=255)
aGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACcgcg > 3:1414346/1‑151 (MQ=255)
aGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGGGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACcgcg < 3:1191805/151‑1 (MQ=255)
gAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCgcggc < 4:753220/150‑1 (MQ=255)
aCTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGAt > 2:1112135/1‑151 (MQ=255)
cgcTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATa > 7:376178/1‑150 (MQ=255)
cgcTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATa > 6:285928/1‑150 (MQ=255)
cgcTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATCGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAACCAGTTCCTCTCCACGGCGGCGATGGaga > 2:1179514/1‑148 (MQ=255)
cgcTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCCGGTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATaa < 4:1344420/151‑1 (MQ=255)
gcTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCgcgg > 5:411120/1‑140 (MQ=255)
gcTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATaaa < 7:1573997/151‑1 (MQ=255)
gcTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATaaa < 3:1270687/151‑1 (MQ=255)
ggggtCGATCAATCCGCAAACCGGTGCGGGTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATAAAg < 4:985998/146‑1 (MQ=255)
gtgtCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATAAAGGTc < 3:1310687/151‑1 (MQ=255)
gtCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATAAAGGTCTg < 4:636999/151‑1 (MQ=255)
gtCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATAAAGGTCTg < 4:1500696/151‑1 (MQ=255)
gtCGATCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATAAAGGTCTg > 2:1382586/1‑151 (MQ=255)
aTCAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATAAAGGTCTGACGc < 7:237321/151‑1 (MQ=255)
cAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATAAAGGTCTGACGCt < 7:751410/150‑1 (MQ=255)
cAATCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATAAAGGTCTGACGCt < 6:1363289/150‑1 (MQ=255)
aaTCCGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATAAAGGTCTGACGCTgg < 7:1668991/151‑1 (MQ=255)
ccGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATAAAGGTCTGACGCTGGCa < 7:321479/150‑1 (MQ=255)
ccGCAAAACGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATAAAGGTCTGACGCTGGCa < 2:1583283/150‑1 (MQ=255)
aaaaCGGTGCTGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATAAAGGTCTGACGCTGGCAAGTAt < 5:1461208/151‑1 (MQ=255)
ggTGCTGTTAAGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATAAAGGTCTGACGCTGGCAAGTATGTTg > 5:1529253/1‑150 (MQ=255)
|
TCAGCAAGGACCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCCGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGCAAGTTTAACCGCGCCACCCAGGCACTGCGTCAGGTGGGTTCCAACATCAAACCGTTCCTCTACACCGCGGCGATGGATAAAGGTCTGACGCTGGCAAGTATGTTGAAC > NC_000913/3524037‑3524331
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
