Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F84 I10 R1
|
267 |
426.1 |
13521957 |
97.0% |
13116298 |
150.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,647,677 |
C→T |
intergenic (+26/+28) |
gor → / ← dinQ |
glutathione oxidoreductase/UV‑inducible membrane toxin, DinQ‑AgrB type I toxin‑antitoxin system |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,647,677 | 0 | C | T | 96.1%
| 1320.7
/ 27.0
| 412 | intergenic (+26/+28) | gor/dinQ | glutathione oxidoreductase/UV‑inducible membrane toxin, DinQ‑AgrB type I toxin‑antitoxin system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/12); new base T (200/192); total (206/206) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.11e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.73e-01 |
Only 100 of 421 total aligned reads displayed.
GGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGCTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCGATGGAGTGAGAATGCATCCGCT > NC_000913/3647529‑3647826
|
aTGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCtt > 8:1341313/1‑150 (MQ=255)
ggACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAg < 3:1201113/150‑1 (MQ=255)
ggACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAg < 8:1420642/150‑1 (MQ=255)
aaaTGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCtt > 3:524270/1‑150 (MQ=255)
gTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAAtt < 1:740807/150‑1 (MQ=255)
tGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTAc < 3:291538/150‑1 (MQ=255)
tGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTAc < 5:1294473/150‑1 (MQ=255)
gCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGt < 1:541446/151‑1 (MQ=255)
gCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGt < 1:1048635/151‑1 (MQ=255)
aGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGttt > 7:562793/1‑151 (MQ=255)
ggCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTcc < 3:1527590/151‑1 (MQ=255)
ggCTTCGCGGGGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGGCGCCATTCACCCCACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTcc < 2:946431/151‑1 (MQ=255)
ttCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCt > 5:290534/1‑151 (MQ=255)
gcgGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATc < 1:707742/151‑1 (MQ=255)
gcgGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATc > 7:1173291/1‑151 (MQ=255)
cgGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCa < 6:232448/151‑1 (MQ=255)
ggTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATc > 2:682158/1‑149 (MQ=255)
gTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGt < 8:1465008/151‑1 (MQ=255)
ggCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTc > 8:513125/1‑151 (MQ=255)
ggcTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGCTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAg < 8:21582/150‑1 (MQ=255)
cTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGa > 5:714273/1‑150 (MQ=255)
tGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGa > 6:1410294/1‑149 (MQ=255)
tGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGa > 6:1256512/1‑149 (MQ=255)
gAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGaa < 5:1183531/149‑1 (MQ=255)
gAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGaa < 7:992672/149‑1 (MQ=255)
gAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGaa < 3:997693/149‑1 (MQ=255)
gAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGAAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGc < 8:1203115/151‑1 (MQ=255)
gAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCA‑CCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGc < 7:842613/150‑1 (MQ=255)
aaGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCt < 6:724921/151‑1 (MQ=255)
gATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTg > 5:60844/1‑150 (MQ=255)
gATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGa < 2:1091823/151‑1 (MQ=255)
gATGGGGGCAAACAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGAGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGATATCAGTTAAGAAGCTg > 4:408086/1‑150 (MQ=255)
aaCCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGaa > 6:1198726/1‑149 (MQ=255)
aaCCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAg < 4:1581432/151‑1 (MQ=255)
cAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCGTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCgg > 4:1243156/1‑151 (MQ=255)
aaaaaGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGAt < 1:1246952/151‑1 (MQ=255)
aaaaGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATc < 2:1162295/151‑1 (MQ=255)
aaaaGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATc < 1:194553/151‑1 (MQ=255)
aaaGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATc > 2:1303995/1‑150 (MQ=255)
aaGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATc > 5:1479639/1‑149 (MQ=255)
ataCTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCGAACTGCGGCAGAAGAGCTCGTGACAATGCGTTTAATGTTAAAGTGCTATGAGTAGTGTGGTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGt < 5:538949/149‑1 (MQ=255)
aGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGt < 7:1041975/151‑1 (MQ=255)
aCTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTc < 7:205917/151‑1 (MQ=255)
tCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTcc > 6:1086757/1‑149 (MQ=255)
aCAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCcagc > 5:170062/1‑149 (MQ=255)
cAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCagcagc > 6:1549498/1‑151 (MQ=255)
aaTACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGCTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAgcg < 4:602657/151‑1 (MQ=255)
aaTACCGTCGCCATTCACCCAACCGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAgcg < 3:363885/151‑1 (MQ=255)
aTACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAgcgc < 2:171613/151‑1 (MQ=255)
aCCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCaa < 1:963511/151‑1 (MQ=255)
cGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAAtt < 7:1485454/151‑1 (MQ=255)
cGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAAtt > 4:952929/1‑151 (MQ=255)
cGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAAtt > 7:770258/1‑151 (MQ=255)
cGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTaa < 1:487720/150‑1 (MQ=255)
cGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTAGTGACAATGAGTTAAATGTTAAACGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCTGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAAc < 1:892530/151‑1 (MQ=255)
gCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACg < 5:955708/151‑1 (MQ=255)
ccATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGc < 5:219740/151‑1 (MQ=255)
ccATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATCTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCGTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATAACTTCAGAAGCTGAAGCAGCAACCGGATCAGTACCCGCAGCGCAATTACCGc > 8:283635/1‑151 (MQ=255)
aTTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGccc > 8:426649/1‑151 (MQ=255)
cACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCt > 4:876116/1‑150 (MQ=255)
cccAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGcccca > 2:35664/1‑147 (MQ=255)
cccAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGCTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGa < 7:1297862/151‑1 (MQ=255)
ccAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGa > 8:1669746/1‑150 (MQ=255)
ggcggcAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACgatg > 5:1008001/1‑151 (MQ=255)
gcggcAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACgatga < 6:627531/151‑1 (MQ=255)
agaagaGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCt > 7:376145/1‑151 (MQ=255)
agaagaGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCt < 3:1332262/151‑1 (MQ=255)
agaagaGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCt < 2:549211/151‑1 (MQ=255)
agTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTatc > 3:1079652/1‑151 (MQ=255)
aCAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCAccc > 8:1566351/1‑151 (MQ=255)
aaTGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGt > 4:268680/1‑151 (MQ=255)
tGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGttt > 8:837045/1‑151 (MQ=255)
gCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGACGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGttt < 8:1273390/150‑1 (MQ=255)
gCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGtttt > 4:1311520/1‑151 (MQ=255)
aaTGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTCGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCAt < 8:1161204/151‑1 (MQ=255)
aaTGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCAt > 2:851283/1‑151 (MQ=255)
aaTGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGGGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCAt < 3:78744/151‑1 (MQ=255)
aTGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATg > 8:604079/1‑151 (MQ=255)
aTGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATg > 4:1487210/1‑151 (MQ=255)
tGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGc > 4:756/1‑151 (MQ=255)
gTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCg > 2:791733/1‑151 (MQ=255)
gTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCg > 8:349364/1‑151 (MQ=255)
tAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCGAt > 3:621591/1‑151 (MQ=255)
tAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCGAt > 1:357367/1‑151 (MQ=255)
aaaGGGCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCGATg > 6:1370382/1‑151 (MQ=255)
ggCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCGATGGAGt < 3:199366/151‑1 (MQ=255)
gCTAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGCTGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCGATGGAGTg > 7:1557386/1‑151 (MQ=255)
tAAGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCGATGGAGTg > 4:1163769/1‑149 (MQ=255)
aaGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCCGCGCAAATAACGCCCCTAGAACGCTGATTGGTTTATCACTCACCCGTTTTCTCCATGCGATGGAGTg > 1:1579086/1‑148 (MQ=255)
aaGAGTAGTGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCGATGGAGTgag < 5:383405/150‑1 (MQ=255)
agtagtGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCGATGGAGTGAGAATg > 7:281042/1‑151 (MQ=255)
gtagtGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCGATGGAGTGAGAATGc > 7:650826/1‑151 (MQ=255)
gtagtGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCGATGGAGTGAGAATGc > 2:463385/1‑151 (MQ=255)
tagtGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCGATGGAGTGAGAATGc > 7:1626869/1‑150 (MQ=255)
agtGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCGATGGAGTGAGAATGCa < 8:1028343/150‑1 (MQ=255)
agtGTGTTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCGATGGAGTGAGAATGCa < 6:405554/150‑1 (MQ=255)
agtGTGCTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCGATGGAGTGAGAATGCAt < 1:1433636/151‑1 (MQ=255)
gtgtTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCGATGGAGTGAGAATGCATCCg > 4:355175/1‑151 (MQ=255)
gtgtTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCGATGGAGTGAGAATGCATCCg > 8:671820/1‑151 (MQ=255)
gCTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCGATGGAGTGAGAATGCATCCGCt < 3:1635862/151‑1 (MQ=255)
|
GGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGCTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGCTGAAGCAGAAAGCGGATCAGTTCCAGCAGCGCAATTAACGCCCCTAGAACGATGATTGCTTTATCAATCACCCGTTTTCTCCATGCGATGGAGTGAGAATGCATCCGCT > NC_000913/3647529‑3647826
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
