Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F84 I10 R1
|
267 |
426.1 |
13521957 |
97.0% |
13116298 |
150.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,175,827 |
C→T |
noncoding (74/76 nt) |
thrT → |
tRNA‑Thr |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,175,827 | 0 | C | T | 95.3%
| 1522.5
/ 41.5
| 471 | noncoding (74/76 nt) | thrT | tRNA‑Thr |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (9/13); new base T (183/265); total (192/279) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
Only 100 of 476 total aligned reads displayed.
ATCGTATAATGGCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGAACGTACAAAAC > NC_000913/4175679‑4175974
|
tCGTATAATGGCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGcatcac > 1:316013/1‑151 (MQ=255)
cGTATAATGGCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGcatcac < 8:161351/150‑1 (MQ=255)
cGTATAATGGCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCAct < 1:578941/151‑1 (MQ=255)
gTATAATGGCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCActt > 1:1064931/1‑151 (MQ=255)
tataATGGCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCActtc > 3:765019/1‑151 (MQ=255)
cgtaATGGCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCActt < 4:1112261/148‑1 (MQ=255)
ataATGGCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCActtct > 1:843458/1‑151 (MQ=255)
ataTGGCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCActtctt < 5:1576898/149‑1 (MQ=255)
tGGCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTtc > 3:335546/1‑151 (MQ=255)
ggCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTtct < 5:1239831/151‑1 (MQ=255)
tATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTctcct > 8:805149/1‑151 (MQ=255)
tATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTctcct > 1:1513826/1‑151 (MQ=255)
aTTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGTGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTctcct < 8:463022/150‑1 (MQ=255)
aTTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCGAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTctcc < 4:670194/149‑1 (MQ=255)
aTTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTctcctc < 1:1233838/151‑1 (MQ=255)
ttACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTAtcctcc > 1:1374040/1‑151 (MQ=255)
tACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTccc > 2:1594041/1‑151 (MQ=255)
aCCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTccc < 6:686523/150‑1 (MQ=255)
aCCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCt < 3:1241726/151‑1 (MQ=255)
cAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCATCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGttt < 4:1228914/151‑1 (MQ=255)
cAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGt < 2:316947/149‑1 (MQ=255)
ccTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGtttttt > 6:864550/1‑151 (MQ=255)
ccTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGtttttt < 3:248920/151‑1 (MQ=255)
tCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTcc < 1:716358/150‑1 (MQ=255)
tCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTc < 6:1622430/149‑1 (MQ=255)
ccAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCt < 3:391107/150‑1 (MQ=255)
cAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTc > 7:562613/1‑151 (MQ=255)
aaGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCt < 7:8485/151‑1 (MQ=255)
tgatgaTGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGttt > 5:664873/1‑151 (MQ=255)
gatgatGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGttt < 8:1163508/150‑1 (MQ=255)
atgatgCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTAt < 2:175297/151‑1 (MQ=255)
gatgCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTAtt < 7:1153798/150‑1 (MQ=255)
gatgCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTAtt < 8:1432368/150‑1 (MQ=255)
gggTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTc > 6:1680403/1‑151 (MQ=255)
gggTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTc < 2:351975/151‑1 (MQ=255)
gggTGCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTc < 7:150742/151‑1 (MQ=255)
gatCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCGCAGGTGGTAGAGCGCACCCGTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCCCCACTTCTTTTCTCCTCCCTGGTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTcaa < 2:1457604/149‑1 (MQ=255)
ttCCCGCTGCGCGCTGCATGATGTGGTGATATAGCTCTGTTGGTAGAGCGCACCCTTGCTAAGGGTGAGGTCTGGAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCATCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTGATCAAGt < 8:314129/150‑1 (MQ=25)
tCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCg > 6:1201297/1‑151 (MQ=255)
cGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGc < 2:609234/151‑1 (MQ=255)
cGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGc < 8:1019597/151‑1 (MQ=255)
tCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTg > 8:667750/1‑151 (MQ=255)
tCCAAGATGTCATGATATATCTCAGTTGGTAGAGCGCACCATTCGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGATTCTTACTATCAGAATCACTAATTTTCTCCTCCATGTTTTTTCATTCTATTTATTTAATTCAACAAGACGGTAATGTTGCCTg > 2:683034/1‑151 (MQ=19)
ccAAGATGTGCTGATATAGGTGAGTTGGTAGTGCGCAGCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTg < 4:826344/150‑1 (MQ=255)
ccAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGTCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCt < 5:457794/149‑1 (MQ=255)
gCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATgtgg > 5:981793/1‑151 (MQ=255)
gATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATgtggtg > 8:939806/1‑150 (MQ=255)
gATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATgtggtg > 6:1485011/1‑150 (MQ=255)
gATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGa < 3:1543097/151‑1 (MQ=255)
gATATAGCGCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGACTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATgtggtg < 2:127461/150‑1 (MQ=255)
ataGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGatat < 1:456905/151‑1 (MQ=255)
taGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATc > 3:1072933/1‑151 (MQ=255)
taGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTATCCTCCCTGTTTTTTACTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGatat > 1:1011331/1‑150 (MQ=255)
aGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTTGTGATATCa < 7:404922/151‑1 (MQ=255)
aGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCa < 6:1059273/151‑1 (MQ=255)
gCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCAc < 2:1152499/151‑1 (MQ=255)
gCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCAc < 3:1657809/151‑1 (MQ=255)
gCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGGTGATGTGGTGATATCAc > 4:1491998/1‑151 (MQ=255)
cAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCg > 3:717203/1‑150 (MQ=255)
aGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCTTGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGAt > 3:1289183/1‑151 (MQ=255)
gTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGAtt < 3:555162/151‑1 (MQ=255)
gTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGAtt > 5:134954/1‑151 (MQ=255)
gTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGAtt < 7:921050/151‑1 (MQ=255)
tGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGAttt < 4:454476/150‑1 (MQ=255)
ggTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTa < 7:199892/150‑1 (MQ=255)
ggTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTAt > 7:1244208/1‑151 (MQ=255)
agagCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATcc < 8:1280106/150‑1 (MQ=255)
agCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCgtg < 1:1581992/151‑1 (MQ=255)
cACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCtt > 7:1472167/1‑151 (MQ=255)
aCCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTTCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCtt > 1:222026/1‑150 (MQ=255)
ccTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCAGTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCtt > 5:1010265/1‑148 (MQ=255)
ttGGTAAGGGTGAGGTCGGCTGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTTTCAGTGTCTTAGAgg > 7:614163/1‑151 (MQ=255)
tGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCTTCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAgg < 6:399155/150‑1 (MQ=255)
tGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAggg > 8:562170/1‑151 (MQ=255)
aaGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTGTCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTAGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGaaa < 5:1055951/150‑3 (MQ=255)
aaGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACaa < 7:1065674/151‑1 (MQ=255)
aGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAAt < 5:34796/151‑1 (MQ=255)
aGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAAt < 3:1337136/151‑1 (MQ=255)
gggTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATc < 2:520798/151‑1 (MQ=255)
ggTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCg < 5:841406/151‑1 (MQ=255)
cGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATGACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTa > 2:729059/1‑150 (MQ=255)
tgCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATTTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTaa > 4:349091/2‑150 (MQ=255)
gCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAg < 6:30135/151‑1 (MQ=255)
gCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAg < 4:274690/151‑1 (MQ=255)
aGTTCGACTCTGCCTATCAGCATCTCTTCTTTTCTCCTCCATGTTTTTTCGTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGTATGTTGGCTGGTTGATGTGGTGATATCACGGATTTATCGGTGTCTTAGAGTGACAATCGTTGTGTAAAGaa < 4:138415/151‑1 (MQ=255)
aGTTCGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATACAACAACTCGGGCATGTTGCCTGGTAGAAGTGGAGATATCACCGATTTATCACTCTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGa > 6:1360637/1‑150 (MQ=255)
cGAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAg < 8:1073537/150‑1 (MQ=255)
gAATCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGtt > 8:247627/1‑151 (MQ=255)
aaTCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGttt > 7:1385565/1‑151 (MQ=255)
aaTCTGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGCCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGttt < 6:523978/151‑1 (MQ=255)
atGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTTTTTTTTCCTTGTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGTCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCAGTGTCTTAGAGGTACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGaa < 3:1002413/150‑1 (MQ=255)
tGCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGAAc > 5:1491205/1‑151 (MQ=255)
gCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTg < 4:1636990/147‑1 (MQ=255)
gCCTATCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGa < 5:240286/148‑1 (MQ=255)
aTCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGAACGTa < 6:4374/149‑1 (MQ=255)
aTCAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGAACGTACa < 5:1407812/151‑1 (MQ=255)
cAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGAACGTACaa > 2:852466/1‑150 (MQ=255)
cAGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGAACGTACaa > 2:1010543/1‑150 (MQ=255)
aGCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGAACGTACaaaa < 4:1039974/151‑1 (MQ=255)
gCATCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGAACGTACAAAAc < 2:1061214/151‑1 (MQ=255)
|
ATCGTATAATGGCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGATATCACCGATTTATCCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTCTAAAGAAAAGTTTGAACGTACAAAAC > NC_000913/4175679‑4175974
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
