Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F84 I10 R1
|
267 |
426.1 |
13521957 |
97.0% |
13116298 |
150.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,278,488 |
C→T |
P4S (CCA→TCA) |
ghxP → |
guanine/hypoxanthine permease, high affinity; guanine/hypoxanthine:H+ symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,278,488 | 0 | C | T | 97.1%
| 1375.7
/ 18.3
| 411 | P4S (CCA→TCA) | ghxP | guanine/hypoxanthine permease, high affinity; guanine/hypoxanthine:H+ symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/8); new base T (229/168); total (234/177) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.37e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.08e-01 |
Only 100 of 416 total aligned reads displayed.
GTATGCGCGGAGCTAAACGTTTGCTTTTTTGCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGCCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAG > NC_000913/4278339‑4278635
|
aTGCGCGGAGCTAAACGTTTGCTTTTTTGCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCa < 8:1646423/150‑1 (MQ=255)
aGCTAAACGTTTGCTTTTTTGCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGt > 6:264843/1‑151 (MQ=255)
tAAACGTTTGCTTTTTTGCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTAcc > 4:62422/1‑151 (MQ=255)
aaaCGTTTGCTTTTTTGCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTAc < 2:903845/149‑1 (MQ=255)
aaaCGTTTGCTTTTTTGCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACcg < 6:1061190/151‑1 (MQ=255)
aaCGTTTGCTTTTTTGCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACcgg < 4:1154869/151‑1 (MQ=255)
cGTTTGCTTTTTTGCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACcggcg > 4:370304/1‑151 (MQ=255)
cGTTTGCTTTTTTGCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACcggcg > 2:1109587/1‑151 (MQ=255)
gTTTGCTTTTTTGCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCCCGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACcggcgg > 1:982980/1‑151 (MQ=255)
gCTTTTTTGCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATACCGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGCCGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTCCGTCATCAGCGCGTACCGGAGGTTcc > 5:845529/1‑150 (MQ=255)
gCTTTTTTGCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTc > 4:419043/1‑150 (MQ=255)
gCTTTTTTGCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCa < 7:371327/151‑1 (MQ=255)
tttttGCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCAc < 7:92391/149‑1 (MQ=255)
tttGCGACGCAGCAAATTGTGGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCg < 5:1551946/150‑1 (MQ=255)
tttGCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCg < 5:737482/150‑1 (MQ=255)
tttGCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCg < 7:531190/150‑1 (MQ=255)
ttGCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCCCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTCCGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGAc > 6:1200946/1‑151 (MQ=255)
tGCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACg > 4:1358058/1‑151 (MQ=255)
gCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGc > 8:825619/1‑151 (MQ=255)
gCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGc < 5:928033/151‑1 (MQ=255)
gACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCt > 7:1083314/1‑151 (MQ=255)
gACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCt > 3:730867/1‑151 (MQ=255)
caAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTAGGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTaa < 6:659561/151‑1 (MQ=255)
caAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTaa < 8:143650/151‑1 (MQ=255)
aaaTTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTaa > 3:807635/1‑150 (MQ=255)
gTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACTTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAAttt > 1:1660988/1‑150 (MQ=255)
gTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAAttt < 2:733763/150‑1 (MQ=255)
tCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTc > 5:1412381/1‑150 (MQ=255)
cGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTTAAATTTcac > 4:802611/1‑151 (MQ=255)
aCCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGt < 7:1510848/151‑1 (MQ=255)
ggAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGaa < 5:1344127/151‑1 (MQ=255)
ggAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATCTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGCTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGa > 3:1152902/1‑150 (MQ=255)
aGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTTCGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGc < 3:1539957/151‑1 (MQ=255)
gCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCa < 4:1556518/151‑1 (MQ=255)
aGGAAGATAACGTTTCTCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACAGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAATATTTCACAACGTGGAAGAACt > 2:205250/1‑151 (MQ=255)
ggAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTg < 7:732187/151‑1 (MQ=255)
ggAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTg < 2:155601/151‑1 (MQ=255)
aaGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTc > 7:283772/1‑151 (MQ=255)
aaGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTAAAAATTTCACAACGTGGAAGCAGTGTc > 1:675779/1‑151 (MQ=255)
aaCGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGtt > 1:1126932/1‑149 (MQ=255)
aCGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTc > 5:319563/1‑149 (MQ=255)
aCGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTc > 2:970885/1‑149 (MQ=255)
gTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAgg > 2:1443389/1‑150 (MQ=255)
gTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGa < 8:699376/151‑1 (MQ=255)
tttCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGa > 8:919505/1‑150 (MQ=255)
tCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAg < 3:1314733/150‑1 (MQ=255)
cGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGt < 6:1619988/150‑1 (MQ=255)
cGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTg > 8:1173702/1‑151 (MQ=255)
cTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGTGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGt > 3:1113973/1‑151 (MQ=255)
tGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGtt > 1:1025119/1‑151 (MQ=255)
ggCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTg < 6:829786/151‑1 (MQ=255)
gCAGGGGATTGTCCTCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATGAGCGCGTACCGGCGGGTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGc < 3:895114/151‑1 (MQ=255)
gCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGc > 1:734778/1‑151 (MQ=255)
aGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGCCGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCg > 1:275994/1‑151 (MQ=255)
ggggATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCgg < 5:1455044/151‑1 (MQ=255)
ggATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGt < 1:1471017/151‑1 (MQ=255)
gATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGtt < 3:946807/151‑1 (MQ=255)
aTTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTa < 1:635460/151‑1 (MQ=255)
tGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTaac > 8:1515056/1‑151 (MQ=255)
gTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTaaca < 8:245048/151‑1 (MQ=255)
gTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTaaca < 4:977609/151‑1 (MQ=255)
gTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTaac > 4:870996/1‑150 (MQ=255)
tCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTaaca > 1:153666/1‑150 (MQ=255)
gCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGt < 3:1551785/151‑1 (MQ=255)
cACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGCGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGATCACTCGACGCCTGGTTTAAAAATTCACAACGTGGAAGCACTCTCCGTCAGCAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGttt > 5:543841/1‑151 (MQ=255)
aCGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTc > 2:1132903/1‑151 (MQ=255)
cGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCt > 5:95505/1‑151 (MQ=255)
gCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTg < 7:1231119/151‑1 (MQ=255)
ccATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTg < 6:524072/150‑1 (MQ=255)
cATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTgg < 3:1032823/151‑1 (MQ=255)
cATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTACACTCGACGCCTGGTATAAAATATCACAACGTGGAAGCACTGTCAGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGATAACAACGTTTCTgg > 1:573831/1‑151 (MQ=255)
aTCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGc > 2:1306972/1‑151 (MQ=255)
tGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGc < 8:1340881/147‑1 (MQ=255)
tGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATg > 7:587670/1‑151 (MQ=255)
gAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCt > 3:669896/1‑151 (MQ=255)
aaaaTTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCt > 3:1460988/1‑150 (MQ=255)
aaaTTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTAc < 2:518499/151‑1 (MQ=255)
aaTTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACt < 7:1331314/151‑1 (MQ=255)
aTTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTc > 3:183518/1‑151 (MQ=255)
aTTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTc > 1:399518/1‑151 (MQ=255)
tAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCgg > 2:631979/1‑151 (MQ=255)
aaaCTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTTAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCgg < 5:1124332/150‑1 (MQ=255)
aaaCTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGt > 3:221037/1‑151 (MQ=255)
aCTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTc > 1:1295486/1‑150 (MQ=255)
ctgaGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCTGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAAAGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGTTCAt < 6:998998/146‑1 (MQ=255)
tcAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGCCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCAtcgt > 1:1582619/1‑151 (MQ=255)
tcACGGGATGTTTTCTTATGTCTACCTCATCAGCGCGTACCGGCGGATCACTGGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTCACCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGCTAAACAACCTTTCTGGCGATGGTCTACTCGCTCAtcct > 2:42171/1‑149 (MQ=255)
aGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCAtcgtcg < 1:829303/151‑1 (MQ=255)
ggggATGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATcgtcgt < 5:221399/151‑1 (MQ=255)
aTGTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTcc > 5:1219811/1‑150 (MQ=255)
gTTTTCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAgg > 6:1523005/1‑151 (MQ=255)
ttCTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTa < 6:1385039/150‑1 (MQ=255)
cTTATGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTATCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGt > 4:1441474/1‑151 (MQ=255)
aTGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTg < 3:428034/150‑1 (MQ=255)
aTGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTg < 4:1637073/150‑1 (MQ=255)
tGTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTggg > 3:364380/1‑151 (MQ=255)
gTCTACGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCAGTCAGGAAGTGGTTGCAGGGTTAACAACCTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGATGGGt > 4:1187519/1‑151 (MQ=255)
aCGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCCGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAg < 8:455642/151‑1 (MQ=255)
aCGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGGTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTaa < 8:74170/149‑1 (MQ=255)
aCGTCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAACCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCCTCGTTCCAGGTATGTTGGGTaaac > 3:542186/1‑150 (MQ=255)
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GTATGCGCGGAGCTAAACGTTTGCTTTTTTGCGACGCAGCAAATTGTCGCAAACCTGGAGCAGGAAGATAACGTTTCGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGCCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAG > NC_000913/4278339‑4278635
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
