Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F84 I10 R1
|
267 |
426.1 |
13521957 |
97.0% |
13116298 |
150.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,433,459 |
C→T |
G189D (GGC→GAC) |
qorB ← |
NAD(P)H:quinone oxidoreductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,433,459 | 0 | C | T | 98.1%
| 1454.3
/ 7.8
| 430 | G189D (GGC→GAC) | qorB | NAD(P)H:quinone oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/5); new base T (221/198); total (224/206) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.73e-01 |
Only 100 of 430 total aligned reads displayed.
GTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGAGGTAGTTTTCGCTGT > NC_000913/4433311‑4433606
|
gTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCt < 7:110314/151‑1 (MQ=255)
cGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTc < 3:990359/151‑1 (MQ=255)
cGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTc > 4:776821/1‑151 (MQ=255)
gggCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCg < 4:40066/151‑1 (MQ=255)
gCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTg < 2:1542199/151‑1 (MQ=255)
cAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGa < 4:467322/151‑1 (MQ=255)
ccGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCgg > 7:1199335/1‑151 (MQ=255)
cGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGc > 5:1327087/1‑151 (MQ=255)
gACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGATTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGACGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCAGCCACTTCTTAAACCTATTCTTCGTGACCggat > 1:1670937/1‑149 (MQ=255)
ttCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTa > 8:103276/1‑150 (MQ=255)
ttCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTa < 8:336354/150‑1 (MQ=255)
gTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCAc < 5:356115/151‑1 (MQ=255)
gCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCAcgc > 2:1335048/1‑151 (MQ=255)
cgcgGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGt < 7:798042/151‑1 (MQ=255)
cggcgAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGc > 8:618657/1‑151 (MQ=255)
gcgAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCg < 3:1335100/151‑1 (MQ=255)
cgAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGc < 3:872271/151‑1 (MQ=255)
gAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGc > 8:723678/1‑150 (MQ=255)
gAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCa < 1:489033/151‑1 (MQ=255)
gAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCa < 6:1061905/151‑1 (MQ=255)
cGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGc > 1:1547692/1‑151 (MQ=255)
ggCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGcc > 6:818961/1‑151 (MQ=255)
ggCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGcc > 7:338874/1‑151 (MQ=255)
ttCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGc > 6:1306759/1‑150 (MQ=255)
ttCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGc > 2:1554894/1‑150 (MQ=255)
tCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCAt > 5:631232/1‑151 (MQ=255)
tCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCAt > 3:307444/1‑151 (MQ=255)
cTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAAt > 8:1418158/1‑151 (MQ=255)
cTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGAACTGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTTCCGCATAAt > 1:628209/1‑151 (MQ=255)
gcAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATc < 7:1017643/150‑1 (MQ=255)
cAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATc < 1:1003679/150‑1 (MQ=255)
ttttGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGccc > 3:129635/1‑151 (MQ=255)
ttttGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGccc > 5:976522/1‑151 (MQ=255)
tttGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGccc < 6:455549/150‑1 (MQ=255)
tttGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCcg > 8:1190200/1‑151 (MQ=255)
gATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGt < 7:1333834/151‑1 (MQ=255)
gATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGt < 4:619678/151‑1 (MQ=255)
aGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTg < 6:954312/150‑1 (MQ=255)
ggTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCt > 1:1478419/1‑151 (MQ=255)
ggTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCt < 5:765450/151‑1 (MQ=255)
gTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTg > 7:592977/1‑151 (MQ=255)
gTAACCTGTTTGCCGCTCTGTGTGGTCAGCTCTGCCGCTAAGTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCGGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTg < 2:297206/151‑1 (MQ=255)
aaCCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGGCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGa < 4:1216090/150‑1 (MQ=255)
ccTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGc < 5:1188637/151‑1 (MQ=255)
tGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGTCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCg > 4:917888/1‑150 (MQ=255)
ttGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGAttt > 5:1537277/1‑151 (MQ=255)
tGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGAttt < 2:1273651/150‑1 (MQ=255)
tGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGAttt < 5:1053084/150‑1 (MQ=255)
ccGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGc < 3:825427/151‑1 (MQ=255)
ccGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGc > 4:694037/1‑151 (MQ=255)
gCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCGAGGCACTATCGCGCGCCAGTTCGTAAACGTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCa < 2:40847/151‑1 (MQ=255)
tctGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATc > 6:1208078/1‑151 (MQ=255)
gTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATcgcc > 7:1579039/1‑151 (MQ=255)
gTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATcgc < 5:22716/150‑1 (MQ=255)
gTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATcg < 8:844814/149‑1 (MQ=255)
gTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATcg < 4:116236/149‑1 (MQ=255)
gTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATc < 8:1361056/148‑1 (MQ=255)
gTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATc < 2:921081/148‑1 (MQ=255)
ttGGGCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATcgccc < 4:167807/150‑1 (MQ=255)
ggTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATcgcccgcc > 1:401443/1‑151 (MQ=255)
tCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCcgccgc > 5:542154/1‑151 (MQ=255)
cAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCcgccgc > 8:1704820/1‑150 (MQ=255)
aGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCAc < 3:467823/151‑1 (MQ=255)
gCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCAcc > 4:1300554/1‑151 (MQ=255)
ctGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCg < 2:1664297/149‑1 (MQ=255)
tGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGAt > 4:1529628/1‑150 (MQ=255)
gCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATaa < 1:832993/151‑1 (MQ=255)
ccGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATaa > 2:655635/1‑150 (MQ=255)
cGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAAt > 3:1041386/1‑151 (MQ=255)
gCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATa < 6:602705/151‑1 (MQ=255)
tAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACg > 1:1084053/1‑151 (MQ=255)
aaCTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGc > 1:1266737/1‑151 (MQ=255)
aaCTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGc > 4:828337/1‑151 (MQ=255)
gtgtCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCgt < 8:1528845/150‑1 (MQ=255)
gtgtCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGGGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCgt < 4:143759/150‑1 (MQ=255)
cAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTcc > 6:1559614/1‑151 (MQ=255)
cGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGt > 7:46162/1‑151 (MQ=255)
ccAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGAGAAATACGCCGTGTTCCAGtgct > 1:195756/1‑151 (MQ=255)
cAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGtgctg < 6:182893/151‑1 (MQ=255)
aGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGtgctgc < 6:1445527/151‑1 (MQ=255)
aGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGtgctgc < 2:1162406/151‑1 (MQ=255)
aGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGtgccgc < 3:1645018/151‑1 (MQ=255)
gctcTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCg < 7:670011/148‑1 (MQ=255)
gCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCg > 7:19526/1‑151 (MQ=255)
gCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCg < 5:809883/151‑1 (MQ=255)
cACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCgg < 4:1071719/151‑1 (MQ=255)
cACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCgg > 3:11259/1‑151 (MQ=255)
aCTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCggg > 8:387329/1‑151 (MQ=255)
aCTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCggg < 7:887502/151‑1 (MQ=255)
tATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGgc > 1:865472/1‑151 (MQ=255)
aTCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCgggg < 6:1131111/149‑1 (MQ=255)
cgcccgccAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCt < 3:1545953/151‑1 (MQ=255)
cgcccgccAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCt > 5:1440325/1‑151 (MQ=255)
gcccgccAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTg < 3:1387353/151‑1 (MQ=255)
cccgccAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTgg > 7:758947/1‑151 (MQ=255)
ccAGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGAg < 2:510352/151‑1 (MQ=255)
aGTTCGTAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGAGGt > 1:1359224/1‑151 (MQ=255)
tAAACCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGAGGTAGtttt > 3:544844/1‑151 (MQ=255)
aaaCCTTGTCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGAGGTAGTTTTc > 5:49089/1‑151 (MQ=255)
aaCCTTGTCTTCGGGACCGGCTGCGCTACTCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATCATCTGCCCGCGGTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGAGGTAGTTTTCg < 1:945195/151‑1 (MQ=255)
|
GTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGAGGTAGTTTTCGCTGT > NC_000913/4433311‑4433606
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
