Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F84 I10 R1
|
267 |
426.1 |
13521957 |
97.0% |
13116298 |
150.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,571,280 |
C→T |
E99K (GAG→AAG) |
yjiR ← |
putative DNA‑binding transcriptional regulator/putative aminotransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,571,280 | 0 | C | T | 96.8%
| 1266.8
/ 19.9
| 378 | E99K (GAG→AAG) | yjiR | putative DNA‑binding transcriptional regulator/putative aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (9/3); new base T (187/179); total (196/182) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.43e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.97e-01 |
Only 100 of 380 total aligned reads displayed.
CTGACCGGCTAACAAGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTCCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGTGATGAGCTTCATCGTCTCC > NC_000913/4571131‑4571425
|
ggACCGGCTAACAAGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCa < 1:1624591/150‑1 (MQ=255)
gACCGGCTAACAAGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAg < 2:601196/151‑1 (MQ=255)
gCTAACAAGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCatat > 2:223324/1‑151 (MQ=255)
cTAACAAGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATc > 7:987905/1‑151 (MQ=255)
aaCAAGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCa < 1:763078/151‑1 (MQ=255)
aaGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCa < 6:671668/151‑1 (MQ=255)
aaGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGAGCCTTCAGAATATCCAGc > 7:1662221/1‑150 (MQ=255)
aGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTCTCGCTATCCGCCTTCAGCATATCCAGCAc > 6:778378/1‑151 (MQ=255)
gcATAACCGAGAACGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCt < 2:429822/150‑1 (MQ=255)
gaTAACCGAGAACGGTTTGCAGTTTATGCTGGAACACCCGGCTTAGCTGGCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCt < 4:1475592/149‑1 (MQ=255)
tAACCGAGAACGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGAt > 5:121137/1‑151 (MQ=255)
aaCCGAGAACGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGAt < 6:1271848/150‑1 (MQ=255)
aaCCGAGAACGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATAT‑CAGCACCTGATc < 8:53058/150‑1 (MQ=255)
cGAGAACGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCa < 3:1202632/151‑1 (MQ=255)
gaACGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTg > 2:78697/1‑151 (MQ=255)
aaCGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTgg > 4:468891/1‑151 (MQ=255)
aCGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTCCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTggg > 4:235600/1‑151 (MQ=255)
cGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGt < 8:233661/151‑1 (MQ=255)
ggTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGt > 3:58657/1‑150 (MQ=255)
ggTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTa < 4:1589057/151‑1 (MQ=255)
tttGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAAt > 4:1224147/1‑151 (MQ=255)
gCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAAttt < 7:66576/150‑1 (MQ=255)
gCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAAttt < 8:387955/150‑1 (MQ=255)
gCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTc < 6:1084414/151‑1 (MQ=255)
gATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCAc > 6:1491374/1‑151 (MQ=255)
aTTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTAAGAATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCAcc > 7:691247/1‑151 (MQ=255)
aTGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCgg < 3:406923/150‑1 (MQ=255)
tgctgcACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGgc > 3:1036243/1‑151 (MQ=255)
gctgcACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGgc < 3:919785/150‑1 (MQ=255)
tgcACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCt > 6:819650/1‑151 (MQ=255)
ggcACCACCCGCCTTAGCTCCCGCCACCGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACAGCGGGTGTCCTTTTGCTTAACGCAACATTGTAACTGTCGCTATGCGCCTTCACCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGTTAATTTCCACGGGGCGCt < 6:1014921/150‑1 (MQ=255)
gcACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTg < 7:1070774/151‑1 (MQ=255)
caccacCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGc < 8:1573810/151‑1 (MQ=255)
ccaccCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCAc > 5:945624/1‑151 (MQ=255)
ccaccCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCAc > 5:581598/1‑151 (MQ=255)
ccaccCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCAc > 3:877840/1‑151 (MQ=255)
caccCGGCTTAGCTCCCGGCAGCGCGGTTTCAGGCTCGGCGCTTCGTCATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAAGAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCAcc < 1:1008868/151‑1 (MQ=255)
caccCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCAcc > 4:1268095/1‑151 (MQ=255)
caccCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCAcc > 5:643664/1‑151 (MQ=255)
accCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCg > 7:736035/1‑151 (MQ=255)
accCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCg > 1:152166/1‑151 (MQ=255)
accCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCg > 5:1364425/1‑151 (MQ=255)
ccGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGa < 8:448792/151‑1 (MQ=255)
cGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTCTGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACAGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGAc < 3:1642837/151‑1 (MQ=255)
tAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTc > 3:150005/1‑151 (MQ=255)
gCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCAAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCAt > 7:1265715/1‑151 (MQ=255)
tCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGGCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATcg > 6:1625344/1‑151 (MQ=255)
cccGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATcgg < 2:340435/151‑1 (MQ=255)
cGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATcggcg > 2:1439687/1‑151 (MQ=255)
gCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATcggcgg < 7:102184/151‑1 (MQ=255)
caGCGGTTTCAGCCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACt < 8:609971/151‑1 (MQ=255)
aGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTg > 8:1230277/1‑151 (MQ=255)
cGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTggc < 2:1146235/151‑1 (MQ=255)
cGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTggc < 2:1270694/151‑1 (MQ=255)
ggTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTggcg < 6:500501/151‑1 (MQ=255)
cAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTg < 3:306442/150‑1 (MQ=255)
aGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTggg < 7:1129570/151‑1 (MQ=255)
cgcTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGt < 5:350258/151‑1 (MQ=255)
gcTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGtt < 6:1222006/151‑1 (MQ=255)
cATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGAc > 7:390400/1‑151 (MQ=255)
cATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGACTGGGCTTTACGTTGTGCGAc > 1:341622/1‑151 (MQ=255)
tCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACa > 5:1143714/1‑150 (MQ=255)
gCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAAccc < 5:25463/151‑1 (MQ=255)
gCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAAccc > 5:749361/1‑151 (MQ=255)
gCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTCCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAAccc > 1:1556169/1‑151 (MQ=255)
cTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCg > 4:876481/1‑151 (MQ=255)
ttttGCTTAACGGATCAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCg > 4:988640/1‑150 (MQ=255)
ttttGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGGTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCg > 7:54098/1‑150 (MQ=255)
ttttGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCg > 5:951652/1‑150 (MQ=255)
tttGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCg < 2:955434/149‑1 (MQ=255)
tttGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGa > 1:899859/1‑150 (MQ=255)
ttGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAAc > 3:1370777/1‑151 (MQ=255)
tGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAAcg > 4:399247/1‑151 (MQ=255)
gCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAAcgc > 6:1193115/1‑151 (MQ=255)
gCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGCTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAAcgc > 5:446313/1‑151 (MQ=255)
ttAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCgg > 5:1497229/1‑151 (MQ=255)
tAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCgg < 1:1066994/150‑1 (MQ=255)
aaCGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCt < 7:278685/151‑1 (MQ=255)
ggAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCg > 3:1169155/1‑151 (MQ=255)
gAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCgg > 7:470708/1‑151 (MQ=255)
gAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTCCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTAAGTTGTGCGACAAAATACCCAGAACGCGGCTCCgg > 1:1665565/1‑151 (MQ=255)
aCAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAg < 4:1121905/151‑1 (MQ=255)
cAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGt < 1:1204974/151‑1 (MQ=255)
cAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGt < 3:457741/151‑1 (MQ=255)
cAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGt < 2:469383/151‑1 (MQ=255)
aaTGGAACTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCAGCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGtg < 6:863461/151‑1 (MQ=255)
aCTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGTGATGAGc > 1:398157/1‑151 (MQ=255)
aCTGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGTGATGAGc > 3:690642/1‑151 (MQ=255)
tGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGTGATGAGCtt > 1:691877/1‑151 (MQ=255)
tGTCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGTGATGAGCtt > 7:1548705/1‑151 (MQ=255)
tCGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGTGATGAGCTTc > 7:839015/1‑150 (MQ=255)
cGCTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGTGATGAGCTTCAt < 7:1219121/151‑1 (MQ=255)
cTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGTGATGAGCTTCATCg > 8:1048687/1‑151 (MQ=255)
cTATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGTGATGAGCTTCATCg > 6:229940/1‑151 (MQ=255)
tATGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGTGATGAGCTTCATCgg > 1:984541/1‑150 (MQ=255)
tATGCGCCTCCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGTGATGAGCTTCATCGt > 8:1156895/1‑151 (MQ=255)
aTGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGTGATGAGCTTCATCg < 5:1628131/149‑1 (MQ=255)
aTGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGTGATGAGCTTCATCGtc > 5:827404/1‑151 (MQ=255)
aTGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGTGATGAGCTTCATCGtc < 7:1428576/151‑1 (MQ=255)
tGCGCCTTCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGTGATGAGCTTCATCGtct > 8:1455628/1‑151 (MQ=255)
|
CTGACCGGCTAACAAGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTCCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGTGATGAGCTTCATCGTCTCC > NC_000913/4571131‑4571425
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
