Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A28 F34 I0 R2
|
628 |
183.5 |
6829102 |
98.0% |
6692519 |
139.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,009,733 |
C→T |
7.3% |
intergenic (+21/‑88) |
yedF → / → yedK |
putative TusA family sulfurtransferase/DUF159 family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,009,733 | 0 | C | T | 7.3%
| 529.1
/ 21.1
| 165 | intergenic (+21/‑88) | yedF/yedK | putative TusA family sulfurtransferase/DUF159 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (78/75); new base T (6/6); total (84/81) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 |
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
TCCTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTTCTCGCGGAAG > NC_000913/2009585‑2009881
|
tCCTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGAcc > 4:634093/1‑149 (MQ=255)
cTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCca > 1:1251516/1‑149 (MQ=255)
cTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCca > 4:1649572/1‑149 (MQ=255)
cTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCca > 3:645504/1‑149 (MQ=255)
ggAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCcaca > 4:282816/1‑149 (MQ=255)
aGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCg > 4:225729/1‑149 (MQ=255)
gtggtgAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCgg < 3:1649572/149‑1 (MQ=255)
gtgAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑aa < 4:1319617/149‑1 (MQ=255)
aGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACAt < 2:1070944/149‑1 (MQ=255)
gCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATc < 3:634093/149‑1 (MQ=255)
cGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCGTTCCCGCTGTGGGTCACAGCGGG‑aatgagg < 2:523807/149‑6 (MQ=255)
cGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCg > 1:1414759/1‑149 (MQ=255)
gACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGt < 3:1496043/149‑1 (MQ=255)
cGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCttt > 1:905188/1‑149 (MQ=255)
cGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCttt < 4:1087685/149‑1 (MQ=255)
gCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTg > 3:1039959/1‑149 (MQ=255)
gCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTg < 4:110826/149‑1 (MQ=255)
cAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCttt > 2:724194/1‑147 (MQ=255)
cGATCAATAATATCCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATca < 4:1629664/149‑1 (MQ=255)
gATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATcac > 1:1143970/1‑149 (MQ=255)
cAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATa < 4:411053/149‑1 (MQ=255)
aataatATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGTTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTAATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAg > 3:902359/1‑149 (MQ=255)
aataatATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATcaca < 3:364022/146‑1 (MQ=255)
aataatATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAg > 3:1612770/1‑149 (MQ=255)
ataataTTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGa < 2:1087711/149‑1 (MQ=255)
ataataTTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGa > 3:1343051/1‑149 (MQ=255)
aataTTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGAtt < 4:767303/149‑1 (MQ=255)
aataTTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGAtt > 4:1584886/1‑149 (MQ=255)
tatTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGAtttt > 4:1123621/1‑149 (MQ=255)
tatTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGAtttt > 3:858296/1‑149 (MQ=255)
ttCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTAc > 3:409636/1‑149 (MQ=255)
gtCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTCATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTAc > 4:1093275/2‑149 (MQ=255)
ccACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTAccc < 3:1526572/149‑1 (MQ=255)
cACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATc > 2:1372924/1‑119 (MQ=255)
cACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑g > 1:420053/1‑149 (MQ=255)
aCTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑Gc > 4:823634/1‑149 (MQ=255)
gTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTa > 1:979773/1‑149 (MQ=255)
gTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTa > 1:400246/1‑149 (MQ=255)
aaTCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGAtttt < 3:123967/130‑1 (MQ=255)
aaTCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGAtttt > 4:123967/1‑130 (MQ=255)
aaTCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTAtt > 1:654735/1‑149 (MQ=255)
tCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCt > 1:46775/1‑149 (MQ=255)
cACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCtt < 3:665908/149‑1 (MQ=255)
aCGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCttt > 2:377955/1‑149 (MQ=255)
aCGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCttt > 1:656954/1‑149 (MQ=255)
aCGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCttt > 1:1302625/1‑149 (MQ=255)
aCGGTGCTTGATTTTCAACAAAGCGGGCCGAACAATCGTTAATTTAATCCGAAGTAATCCCTTATTCCCGCTGTGGCCCCCAGCGGGAAACACCTTTA‑CTTTGTATCACCTTGATTTTACCCGGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTAt < 2:1143970/149‑1 (MQ=255)
ggTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGAt > 1:567991/1‑149 (MQ=255)
cTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCa < 2:1495468/149‑1 (MQ=255)
tGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCag > 1:133893/1‑149 (MQ=255)
ggATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCagg < 1:807359/149‑1 (MQ=255)
gATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTAt > 4:248684/1‑139 (MQ=255)
gATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTAt < 3:248684/139‑1 (MQ=255)
gATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCagga > 2:1643862/1‑149 (MQ=255)
tatTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCaggagg < 4:662021/149‑1 (MQ=255)
atTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGt < 1:1351312/149‑1 (MQ=255)
tCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTa > 2:237308/1‑105 (MQ=255)
aGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCt > 4:1344978/1‑149 (MQ=255)
aGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCt < 3:90053/149‑1 (MQ=255)
gCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGTGGTTTCTa > 1:621981/1‑149 (MQ=255)
cAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTAt < 2:1638295/149‑1 (MQ=255)
aaGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTAtg > 3:619089/1‑149 (MQ=255)
aGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTAtgt < 4:409636/149‑1 (MQ=255)
gACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCagga > 2:361201/1‑137 (MQ=255)
gACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCagga < 1:361201/137‑1 (MQ=255)
aCGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCGGTATGATCTCAGGAGGTTTCTAtgtgt < 3:1088720/149‑1 (MQ=255)
aCGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTAtgtgt < 2:905188/149‑1 (MQ=255)
gggCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGTG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTgg > 4:1413004/1‑149 (MQ=255)
aCCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCtt < 3:1325969/149‑1 (MQ=255)
aTTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGc > 4:901351/1‑149 (MQ=255)
aTTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGc > 1:1035489/1‑149 (MQ=255)
ttCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTAtgt > 3:240794/1‑135 (MQ=255)
ttCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGcc < 2:567991/149‑1 (MQ=255)
tCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGccc > 1:176897/1‑149 (MQ=255)
tttAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCtt > 3:503414/1‑99 (MQ=255)
aaTTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCaaa < 1:1133136/149‑1 (MQ=255)
aGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCTAATCCCAAACGCGt < 3:1413004/149‑1 (MQ=255)
aGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGt > 1:909742/1‑149 (MQ=255)
aGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGaa < 1:138727/149‑1 (MQ=255)
tAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGt < 2:422167/144‑1 (MQ=255)
tAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGa < 4:357816/149‑1 (MQ=255)
aTCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGAtt > 3:833713/1‑149 (MQ=255)
tCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCaa > 2:646656/1‑129 (MQ=255)
tCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTa > 1:1169199/1‑149 (MQ=255)
ccTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGaa > 4:640504/1‑142 (MQ=255)
cTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCt > 4:1226439/1‑149 (MQ=255)
tCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCtt < 4:759728/149‑1 (MQ=255)
gttCCCGCTGTGGGTCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTgc > 2:1518522/2‑149 (MQ=255)
aTTCCCTCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCGTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCATTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTgc < 3:1123621/149‑1 (MQ=255)
aTTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTgc < 2:941375/149‑1 (MQ=255)
ttCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGt < 2:1077345/134‑1 (MQ=255)
ttCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGt > 1:1077345/1‑134 (MQ=255)
tCCCGCTGTGGGTCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTgcgc > 4:370688/1‑149 (MQ=255)
cccGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCt > 2:1152599/1‑149 (MQ=255)
ccGCTGTGGGTCACAGCGGG‑AATATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCtt > 1:646737/1‑149 (MQ=255)
ccGCTGTGGGTCACAGCGGG‑AACATCGCTACCTTTGTATCACATAGCTTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGc < 2:1229763/110‑1 (MQ=255)
cGCTGTGACCCCCAGCGGG‑AACCTCGTTACCTTTGTATCACCTAGATTTTTCCC‑GCCCCCACCCCTTTTCCTTTCAGTATGATCTCAAGAGGTTTCTATGTGTGGAAGGTTTGCCCAATCCCCAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTtc < 4:566822/149‑1 (MQ=255)
gtgACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑ACCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTTCTcgc < 2:1414759/149‑1 (MQ=255)
ccACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCagga > 3:989255/1‑81 (MQ=255)
ccACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTTCTCGCGGAAg > 3:555210/1‑149 (MQ=255)
|
TCCTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTTCTCGCGGAAG > NC_000913/2009585‑2009881
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
