Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A25 F36 I0 R2
|
1302 |
104.9 |
4551290 |
96.3% |
4382892 |
111.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,020,841 |
G→A |
5.5% |
R252H (CGC→CAC) |
fliM → |
flagellar motor switching and energizing component |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,020,841 | 0 | G | A | 5.5%
| 245.0
/ 4.3
| 73 | R252H (CGC→CAC) | fliM | flagellar motor switching and energizing component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/34); new base A (2/2); total (37/36) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.11e-01 |
TGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTC > NC_000913/2020703‑2020983
|
tgGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCa > 2:648100/1‑142 (MQ=255)
tgGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCa < 1:648100/142‑1 (MQ=255)
ggAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTgcag > 4:576994/1‑148 (MQ=255)
gagaTTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTgcagc > 4:930541/1‑148 (MQ=255)
aTTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCAt < 3:580608/147‑1 (MQ=255)
aTTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCAt > 4:580608/1‑147 (MQ=255)
ttGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTc < 1:33117/148‑1 (MQ=255)
tGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGt < 3:909280/130‑1 (MQ=255)
tGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGt > 4:909280/1‑130 (MQ=255)
ccGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACagctggagct < 3:930541/148‑1 (MQ=255)
gCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGt < 3:576994/148‑1 (MQ=255)
aaTTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACagctggagct > 3:421892/1‑142 (MQ=255)
aaTTTAATATCTGCCTGCCATCCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACagctggagct < 4:421892/142‑1 (MQ=255)
atCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTg > 4:478902/1‑148 (MQ=255)
atCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGt < 2:744294/113‑1 (MQ=255)
atCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGt > 1:744294/1‑113 (MQ=255)
ctgcctgcCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGt < 2:707474/135‑1 (MQ=255)
ctgcctgcCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGt > 1:707474/1‑135 (MQ=255)
gccATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACtt < 4:352177/138‑1 (MQ=255)
gccATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACtt > 3:352177/1‑138 (MQ=255)
aTTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGGACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAAc < 4:828499/133‑1 (MQ=255)
aTTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGGACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAAc > 3:828499/1‑133 (MQ=255)
aTTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCg > 2:1053805/1‑148 (MQ=255)
ttCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATAtctc > 2:11969/1‑146 (MQ=255)
ttCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATAtctc < 1:11969/146‑1 (MQ=255)
tCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCt < 3:478902/148‑1 (MQ=255)
cGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCg > 2:956390/1‑148 (MQ=255)
ccGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGa > 1:278977/1‑148 (MQ=255)
gAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAAc < 2:278977/148‑1 (MQ=255)
gAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAAc < 1:1053805/148‑1 (MQ=255)
aaTTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGata < 3:841272/117‑1 (MQ=255)
aaTTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGata > 4:841272/1‑117 (MQ=255)
aTTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTgc < 3:735648/77‑1 (MQ=255)
aTTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTgc > 4:735648/1‑77 (MQ=255)
tgGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCAt > 2:36460/1‑77 (MQ=255)
tgGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCAt < 1:36460/77‑1 (MQ=255)
ttAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCgg > 4:656101/1‑148 (MQ=255)
tAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAAc < 4:576749/137‑1 (MQ=255)
tAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAAc > 3:576749/1‑137 (MQ=255)
cccGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCAt < 4:1109844/70‑1 (MQ=255)
cccGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCAt > 3:1109844/1‑70 (MQ=255)
gccgcTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTc < 1:956390/148‑1 (MQ=255)
tGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGcc < 3:656101/148‑1 (MQ=255)
ggAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGat < 4:48878/94‑1 (MQ=255)
ggAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGat > 3:48878/1‑94 (MQ=255)
cgcgTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGcc < 3:981293/139‑1 (MQ=255)
cgcgTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGcc > 4:981293/1‑139 (MQ=255)
tGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTaaa > 2:521221/1‑108 (MQ=255)
tGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTaaa < 1:521221/108‑1 (MQ=255)
tGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTc > 1:1068920/1‑127 (MQ=255)
tGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTc < 2:1068920/127‑1 (MQ=255)
gATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGaaaaa > 2:891516/1‑138 (MQ=255)
gATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGaaaaa < 1:891516/138‑1 (MQ=255)
tCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGAtt > 3:353732/1‑97 (MQ=255)
tCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGAtt < 4:353732/97‑1 (MQ=255)
cAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGa > 1:133329/1‑140 (MQ=255)
cAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGa < 2:133329/140‑1 (MQ=255)
gAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACg > 1:4461/1‑116 (MQ=255)
gAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACg < 2:4461/116‑1 (MQ=255)
gcgcGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAGAACTGAACCCCGGCGACGTcc > 1:848464/1‑113 (MQ=255)
gcgcGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTcc < 2:848464/113‑1 (MQ=255)
aTAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGAt < 3:1134435/82‑1 (MQ=255)
aTAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGAt < 3:10066/82‑1 (MQ=255)
aTAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGAt > 4:10066/1‑82 (MQ=255)
aTAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGAt > 4:1134435/1‑82 (MQ=255)
aTAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGa > 1:1070729/1‑148 (MQ=255)
aaCCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATg < 1:711086/142‑1 (MQ=255)
aaCCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATg > 2:711086/1‑142 (MQ=255)
ccTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAAc > 2:151380/1‑91 (MQ=255)
ccTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAAc < 1:151380/91‑1 (MQ=255)
ggTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTg < 1:603525/103‑1 (MQ=255)
ggTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTg > 2:603525/1‑103 (MQ=255)
ggTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTc > 2:504945/1‑148 (MQ=255)
cgcCAGGTGCAGCACTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGaaaa > 4:467840/1‑110 (MQ=255)
cgcCAGGTGCAGCACTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGaaaa < 3:467840/110‑1 (MQ=255)
|
TGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTC > NC_000913/2020703‑2020983
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
