Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,788,675 |
A→C |
intergenic (+26/‑310) |
ygaQ → / → csiD |
uncharacterized protein; putative enzyme/carbon starvation protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,788,675 | 0 | A | C | 96.2%
| 797.1
/ 8.5
| 235 | intergenic (+26/‑310) | ygaQ/csiD | uncharacterized protein; putative enzyme/carbon starvation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/5); new base C (109/117); total (113/122) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
ATATCAATATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAAAACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGTTCTCTAATGTT > NC_000913/2788576‑2788769
|
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cAATATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACgg > 1:4360755/1‑100 (MQ=255)
cAATATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACgg > 1:3347572/1‑100 (MQ=255)
cAATATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACgg < 1:2992229/100‑1 (MQ=255)
cAATATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACgg > 1:2252719/1‑100 (MQ=255)
aaTATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTATTGTTATATCTGCCACGATAACACggg > 2:364770/1‑100 (MQ=255)
aaTATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACggg < 1:39532/100‑1 (MQ=255)
aaTATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACggg > 1:3686346/1‑100 (MQ=255)
aaTATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAAAACggg < 1:3872927/100‑1 (MQ=255)
tatTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGc < 1:324574/100‑1 (MQ=255)
tatTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGc < 1:2869803/100‑1 (MQ=255)
ttCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAg > 1:4158/1‑100 (MQ=255)
tCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGa < 2:791079/100‑1 (MQ=255)
tCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGa > 1:382272/1‑100 (MQ=255)
ccTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGat > 2:3021044/1‑100 (MQ=255)
ccTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGat > 1:1550525/1‑100 (MQ=255)
gggCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGataat < 2:1485841/100‑1 (MQ=255)
gggCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGataat > 1:4868172/1‑100 (MQ=255)
gCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAatat > 2:2802953/1‑100 (MQ=255)
gCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAatat < 2:2102888/100‑1 (MQ=255)
cGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATAGCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATg < 2:1441350/100‑1 (MQ=255)
cGTAGCGATCTTATTTTAGTGAAAACAGTAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGTTTTATCGGGGCAGatataaca < 2:1778695/100‑6 (MQ=25)
gTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCACTATTTCTAATTTAATGTTATATCTGCTCCGATAACACGTGGCAGATAATATgt < 2:5139375/100‑1 (MQ=255)
tAGTGCTCTTCTTATAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAAATATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGCGCTGATAATATgtt > 2:1314948/1‑100 (MQ=255)
gcgcTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGGGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATgttta > 1:1420831/1‑100 (MQ=255)
gcgcTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATgttta > 1:1861207/1‑100 (MQ=255)
gcgcTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATgttta > 2:2367436/1‑100 (MQ=255)
gcTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATgtttagt < 1:742051/100‑1 (MQ=255)
ctctTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATgtttagtt < 1:1447803/100‑1 (MQ=255)
tcttctTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATgtttagttt > 1:2485401/1‑100 (MQ=255)
cttcttTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATgtttagttta > 2:1695566/1‑100 (MQ=255)
cttcttTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATgtttagttta > 1:592339/1‑100 (MQ=255)
ttcttTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAAAACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTAc < 1:623886/100‑1 (MQ=255)
tgttttAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGATCTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACt < 1:5087354/98‑1 (MQ=255)
cttTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTa > 1:3431635/1‑100 (MQ=255)
tttAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAAc > 2:4523617/1‑100 (MQ=255)
tAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACgg > 1:1160697/1‑100 (MQ=255)
aGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGt > 1:3452355/1‑100 (MQ=255)
aaCAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCAtttt > 1:4078477/1‑100 (MQ=255)
aaCAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCAtttt < 1:5214608/100‑1 (MQ=255)
cAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGc < 1:540474/100‑1 (MQ=255)
aGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCa < 1:2759919/100‑1 (MQ=255)
ggAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAg < 1:4538910/100‑1 (MQ=255)
agaACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGTCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTg < 2:1498121/100‑1 (MQ=255)
gaACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGa > 1:5162951/1‑100 (MQ=255)
gaACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGa > 1:4042248/1‑100 (MQ=255)
gaACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGa > 1:5469776/1‑100 (MQ=255)
aaCCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGaa > 2:3672725/1‑100 (MQ=255)
aCCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAg > 1:873757/1‑100 (MQ=255)
cgccgAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGcc < 2:1187509/100‑1 (MQ=255)
nccgAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAAAACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCa > 2:4381932/2‑100 (MQ=255)
gccgAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCa > 2:2773075/1‑100 (MQ=255)
ccgAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCAt > 1:3066155/1‑100 (MQ=255)
cgAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCAtt < 1:786398/100‑1 (MQ=255)
gAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCAttt < 1:686342/100‑1 (MQ=255)
aCTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTAc < 1:3409593/100‑1 (MQ=255)
aCTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTAc > 1:290813/1‑100 (MQ=255)
aTCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGt > 2:1001398/1‑100 (MQ=255)
tctcTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGtt > 2:3586254/1‑100 (MQ=255)
tctATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGtttt > 1:1102476/1‑100 (MQ=255)
tATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGtttttt > 1:2042104/1‑100 (MQ=255)
tATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGtttttt > 1:2041140/1‑100 (MQ=255)
aTTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTa > 1:4297013/1‑100 (MQ=255)
aTTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTa < 2:4090794/100‑1 (MQ=255)
aTTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTa < 1:1715523/100‑1 (MQ=255)
ttATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATc > 2:5249659/1‑100 (MQ=255)
ttATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATc > 2:4299103/1‑100 (MQ=255)
tataATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCg > 2:1851699/1‑100 (MQ=255)
aaTTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGAcc < 2:3234165/100‑1 (MQ=255)
aaTTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGAcc < 2:2416665/100‑1 (MQ=255)
aaTTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATACGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGAcc < 1:1506853/100‑1 (MQ=255)
aTTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCa < 2:3979436/100‑1 (MQ=255)
aTTTAATGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCa < 1:5560914/100‑1 (MQ=255)
tGTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAAt > 1:1079620/1‑100 (MQ=255)
gTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATc < 1:2278141/100‑1 (MQ=255)
gTTATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATc > 2:3408450/1‑100 (MQ=255)
ttATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCt < 2:833750/100‑1 (MQ=255)
ttATATCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCt < 2:3316421/100‑1 (MQ=255)
tattatCTGCCCCGTGTTATCGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATGTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGCTAATCt > 2:1564406/4‑100 (MQ=37)
tataTCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTg > 2:1124690/1‑100 (MQ=255)
tataTCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTg < 1:4001531/100‑1 (MQ=255)
atatCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGt < 1:92173/100‑1 (MQ=255)
tatCTGCCCCGTGTTATCGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACAAGATAATCTGtt > 2:3144525/1‑100 (MQ=255)
tatCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGtt < 2:3293257/100‑1 (MQ=255)
tatCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGtt < 1:371186/100‑1 (MQ=255)
tatCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGtt < 2:1977418/100‑1 (MQ=255)
tatCTGCCCCGATAAAACGGGGCAGATGAGATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTgct > 2:5466807/1‑98 (MQ=255)
catCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGtt < 2:2637208/99‑1 (MQ=255)
tCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTTACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGTtct < 2:2251048/100‑1 (MQ=255)
tCTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGTtct < 1:47416/100‑1 (MQ=255)
cTGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACAGTCATTTTGCAGTAAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGTtctc < 2:2460771/100‑1 (MQ=255)
tGCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGTTctct < 2:5179718/100‑1 (MQ=255)
gCCCCGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGTTCTCTa > 2:639066/1‑100 (MQ=255)
gCCCCGATAAAACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGTTCTCTa < 1:1212726/100‑1 (MQ=255)
ccccGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGTTCTCTaa > 1:2162447/1‑100 (MQ=255)
ccccGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTAACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGTTCTCTaa > 2:5419768/1‑100 (MQ=255)
cccGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGTTCTCTAAt > 2:4717729/1‑100 (MQ=255)
ccGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGTTCTCTAATg > 1:1654831/1‑100 (MQ=255)
cGATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGTTCTCGAATGt < 2:4169355/100‑1 (MQ=255)
gATAACACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGTTCTCTAATGtt < 2:4799509/100‑1 (MQ=255)
|
ATATCAATATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAAAACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGTTCTCTAATGTT > NC_000913/2788576‑2788769
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
