Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F418 I3 R1
|
16 |
172.0 |
8631016 |
94.8% |
8182203 |
99.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,400,051 |
T→G |
E346A (GAA→GCA) |
mreB ← |
cell wall structural complex MreBCD, actin‑like component MreB |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,400,051 | 0 | T | G | 96.5%
| 501.4
/ 5.8
| 146 | E346A (GAA→GCA) | mreB | cell wall structural complex MreBCD, actin‑like component MreB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/3); new base G (68/71); total (72/74) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.68e-01 |
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
GCCACGGCTAAAAATTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTTCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACT > NC_000913/3399955‑3400146
|
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ccACGGCTAAAAATTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAACCAGACACTTCCCCTGCCTGCATTCGATTACTCTgcgc > 2:3566048/1‑99 (MQ=255)
ccACGGCTAAAAATTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTgcgc > 1:326763/1‑99 (MQ=255)
ccACGGCTAAAAATTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACACACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTgcgc > 2:2465350/1‑99 (MQ=255)
ccACGGCTAAAAATTGGCTTCATAAGTTATACGTATTCTCGTATCAGACCAGTCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTgcgc > 1:4354099/1‑99 (MQ=255)
cACGGCTAAAAATTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCCGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCt < 2:3362400/99‑1 (MQ=255)
ggCTAAAAATTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGaa < 1:3520488/99‑1 (MQ=255)
ggCTAAAAATTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGaa < 1:3118329/99‑1 (MQ=255)
ggCTAAAAATTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGaa < 2:2649318/99‑1 (MQ=255)
ggCTAAAAATTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAAACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGaa > 1:825246/1‑99 (MQ=255)
tAAAAATTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAg > 1:2728537/1‑99 (MQ=255)
tAAAAATTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATAACTCTGCGCTGAACAg > 1:4010960/1‑99 (MQ=255)
aaaaaTGGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCGCGTATCAGACCAGTCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAgg < 1:2162623/99‑1 (MQ=255)
aaaaTTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGt < 1:2508826/99‑1 (MQ=255)
aaTTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTcg < 1:2068839/99‑1 (MQ=255)
aaTTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTcg < 1:3366696/99‑1 (MQ=255)
aaTTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTcg < 1:2381562/99‑1 (MQ=255)
aTTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTcgc < 1:148370/99‑1 (MQ=255)
tGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTcgccg < 2:914536/99‑1 (MQ=255)
gCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCgccgcc > 2:4130420/1‑99 (MQ=255)
cTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCTCCTGCCTGCATCCGATTAATCTGCGCTGAACAGGTCGccgacg > 2:161991/1‑99 (MQ=255)
cTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGccgccg < 1:1535187/99‑1 (MQ=255)
ttCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGt > 2:1557978/1‑99 (MQ=255)
cATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGc < 1:2208325/99‑1 (MQ=255)
cATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGc > 1:1993652/1‑99 (MQ=255)
cATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGc < 1:1695554/99‑1 (MQ=255)
cATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGc < 2:3474399/99‑1 (MQ=255)
aTAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACGCTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTTCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCa > 1:3888113/1‑99 (MQ=255)
aTAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCa > 2:4152542/1‑99 (MQ=255)
tAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCAt > 1:2594497/1‑99 (MQ=255)
gTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTc < 1:4124847/99‑1 (MQ=255)
tATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTTCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGa < 2:2172097/99‑1 (MQ=255)
aTGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGAt > 1:2005704/1‑99 (MQ=255)
tGCGTATTCGCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACGCTGCCCCTGCCTGGATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATc < 2:2253825/99‑1 (MQ=255)
gCGTATTCGCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCa > 1:4239061/1‑99 (MQ=255)
cGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCAt > 2:1719948/1‑99 (MQ=255)
cGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCAt > 2:2036676/1‑99 (MQ=255)
gTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCAtt > 1:3741246/1‑99 (MQ=255)
gTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCAtt < 2:3870725/99‑1 (MQ=255)
aTTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTc > 2:467438/1‑99 (MQ=255)
aTTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTc > 2:3554392/1‑99 (MQ=255)
ctcGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAg < 1:2859443/99‑1 (MQ=255)
tcGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAgc > 2:1954359/1‑99 (MQ=255)
tcGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAgc > 1:3785588/1‑99 (MQ=255)
gTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAgcgc > 1:2223141/1‑99 (MQ=255)
tATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCt < 1:3842220/99‑1 (MQ=255)
aTCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTACGTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCtt > 2:4168555/1‑99 (MQ=255)
tCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCCATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCttt < 1:915863/99‑1 (MQ=255)
cAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTTCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTg < 1:109322/99‑1 (MQ=255)
gACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTgcc > 2:2579363/1‑99 (MQ=255)
gACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTgcc > 2:1891131/1‑99 (MQ=255)
aCCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCGCTGCCTGCATCCGATTACTCAGCGCTCAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTgcag > 2:4257181/1‑97 (MQ=255)
aCCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTgccg > 1:2503883/1‑99 (MQ=255)
aCCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCGGCGCTTAACAGGTCGCCGCCTTGCATTTCGATCATTTCCATCGCTTTgccg > 2:2789186/1‑99 (MQ=255)
caggcaggGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCCTCCGATTACTCTCCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTgccgcc > 2:2408842/1‑99 (MQ=255)
caggcaggGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTgccgcc > 2:626570/1‑99 (MQ=255)
ggTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACcgcgc < 2:1859476/99‑1 (MQ=255)
ggTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAAAAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACcgccc > 2:4247917/1‑97 (MQ=255)
gTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCTATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACcgcgcg > 1:1466038/1‑99 (MQ=255)
gTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACcgcgcg < 1:1537481/99‑1 (MQ=255)
tAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCgcgcgc < 2:255762/99‑1 (MQ=255)
tAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCgcgcgc > 1:608890/1‑99 (MQ=255)
aGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCcacac > 2:1438982/1‑99 (MQ=255)
aGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCcacac > 2:3940113/1‑99 (MQ=255)
gACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCcacaca > 2:2374469/1‑99 (MQ=255)
acacTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAg < 1:4032681/99‑1 (MQ=255)
acacTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAg < 1:2793659/99‑1 (MQ=255)
acTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATGTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGt > 2:3600876/1‑99 (MQ=255)
ttCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCa > 1:2891345/1‑99 (MQ=255)
ttCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCa > 2:2483986/1‑99 (MQ=255)
ttCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATCTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTcc > 2:3445215/1‑98 (MQ=255)
ccccTGCCTGCATCCGATTACTCTTCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGc > 2:3697784/1‑99 (MQ=255)
ccccTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGc < 1:2866616/99‑1 (MQ=255)
cccTGCCTGCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCg > 1:2072668/1‑99 (MQ=255)
cctgcctgCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCgg < 2:3596629/99‑1 (MQ=255)
cctgcctgCATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCgg < 1:2780968/99‑1 (MQ=255)
gcctgcATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTc < 2:3062859/99‑1 (MQ=255)
gcctgcATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTc > 1:3945151/1‑99 (MQ=255)
cctgcATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCt > 1:1065866/1‑99 (MQ=255)
ctgcATACGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCtt < 2:1009885/99‑1 (MQ=255)
tgcATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTc < 1:4064585/99‑1 (MQ=255)
gcATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCa < 1:2314159/99‑1 (MQ=255)
cATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAg < 1:299979/99‑1 (MQ=255)
cATCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAg > 1:2205632/1‑99 (MQ=255)
aTCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGc < 1:3652071/99‑1 (MQ=255)
aTCCGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGc < 1:4196445/99‑1 (MQ=255)
ccGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGcaa < 2:1552196/99‑1 (MQ=255)
cGATTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGcaac < 1:3501027/99‑1 (MQ=255)
aTTACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCGTGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGcaacaa < 2:3717134/99‑1 (MQ=255)
ttgctctGCGCTCAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCGTCAGCaacaac < 2:3358751/96‑1 (MQ=255)
ttACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCaacaac < 1:1941661/99‑1 (MQ=255)
tACTCTGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACg > 1:4204451/1‑99 (MQ=255)
ctctGCGCTGAACAGTTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGAc > 2:4127806/1‑99 (MQ=255)
ctctGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGAc > 1:1315263/1‑99 (MQ=255)
ctctGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGAc > 1:1211464/1‑99 (MQ=255)
ctctGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGAc < 1:2947761/99‑1 (MQ=255)
ctctGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGAc < 2:3085959/99‑1 (MQ=255)
tctGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACt > 1:991011/1‑99 (MQ=255)
tctGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACt > 1:2891889/1‑99 (MQ=255)
tctGCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACt > 1:3219051/1‑99 (MQ=255)
|
GCCACGGCTAAAAATTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTTCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACT > NC_000913/3399955‑3400146
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
