Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.

ALE, Flask, Isolate	Predicted Mutations	Mean Coverage	Total Reads	Percent Mapped	Mapped Reads	Average Read Length
A5 F28 I2 R1	721	0.0	1472758	54.8%	807071	56.1

BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,982,118	G→A	G77R (GGG→AGG)	yecG →	universal stress protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,982,118	0	G	A	100.0%	117.3 / NA	43	G77R (GGG→AGG)	yecG	universal stress protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (36/7); total (36/7)

GCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTA > W3110S.gb/1982072‑1982149

gCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACa                  <  1:919636/62‑1 (MQ=255)

gCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACa                  <  1:27179/62‑1 (MQ=255)

gCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACa                  <  1:220488/62‑1 (MQ=255)

gCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACa                  <  1:328217/62‑1 (MQ=255)

gCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACa                  <  1:466983/62‑1 (MQ=255)

gCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACa                  <  1:458179/62‑1 (MQ=255)

  aTGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACa                  <  1:1227462/60‑1 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGATGTTTATTGCCTa  >  1:1404391/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCt   >  1:31387/1‑61 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:612146/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:327596/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:331319/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:431803/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:449873/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:285589/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:622407/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:62379/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:670621/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:684120/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:684503/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:770679/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:831805/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:948905/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:1277316/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:1101955/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:1113274/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:1153647/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:1165215/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:1171043/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:1268378/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:127389/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:1075409/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:1278695/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:1299253/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:1301875/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:1367009/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:1397550/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:151032/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:154732/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:157382/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTAGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:82181/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGCTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTa  >  1:340929/1‑62 (MQ=255)

                aGCTTTATTGATAAGTTAATTCAGGATGCGAGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTa         >  1:918609/1‑55 (MQ=255)

GCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTA > W3110S.gb/1982072‑1982149

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 21 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 36 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`

N/A