Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F125 I0 R1
|
65 |
108.6 |
5319566 |
96.1% |
5112102 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,183,345:1 |
+T |
20.2% |
intergenic (+22/+468) |
zupT → / ← ribB |
zinc transporter/3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,183,345 | 1 | . | T | 20.2%
| 333.0
/ 101.8
| 114 | intergenic (+22/+468) | zupT/ribB | zinc transporter/3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (56/35); new base T (12/11); total (68/46) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.79e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.74e-02 |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
CCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCA > NC_000913/3183247‑3183441
|
ccAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑g < 1:1658388/100‑1 (MQ=255)
ccAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑g < 1:1587861/100‑1 (MQ=255)
aacTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑gcg > 1:1789904/3‑100 (MQ=255)
gCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑gcgc > 2:2386399/1‑100 (MQ=255)
gCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑gcgc > 2:921469/1‑100 (MQ=255)
tGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATgg > 2:2603417/1‑100 (MQ=255)
tGGCGTACTATGTAGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATgg < 2:1799949/100‑1 (MQ=255)
ggCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGa > 1:1142816/1‑100 (MQ=255)
ggCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGa > 2:424724/1‑100 (MQ=255)
tACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAAc < 2:1384627/100‑1 (MQ=255)
tACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAAc < 2:1333914/100‑1 (MQ=255)
aCTATGTGGAATGTCAGTGATGTTATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACt < 1:323559/100‑1 (MQ=38)
cTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACtt > 1:2175091/1‑100 (MQ=255)
tATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCATAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTc < 2:1281038/100‑1 (MQ=39)
tATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTc < 1:2231070/100‑1 (MQ=39)
tATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTc < 1:1127405/100‑1 (MQ=39)
tATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACtt < 2:851308/99‑1 (MQ=255)
tATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTc < 1:811823/100‑1 (MQ=255)
ttgtgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCt < 2:1087141/99‑1 (MQ=38)
aTGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGGAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCt > 1:1977985/1‑100 (MQ=255)
aTGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCt > 1:1880777/1‑100 (MQ=255)
tgtgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCta > 1:1087151/1‑99 (MQ=38)
tgtgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTg > 1:1232746/1‑100 (MQ=255)
gtgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGc > 1:2520786/1‑100 (MQ=255)
gtgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGc > 1:2159382/1‑100 (MQ=255)
tgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTgat < 2:1147597/100‑3 (MQ=38)
tgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTgat < 1:1747293/100‑3 (MQ=38)
tgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGcc > 1:720590/1‑100 (MQ=255)
ggAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCa < 2:1306802/100‑1 (MQ=255)
ggAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCa > 1:2121249/1‑100 (MQ=255)
gAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCa < 2:1819511/99‑1 (MQ=255)
aTGTTAGTGATTGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCTGGAATTGGTTGAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCt < 1:2183702/100‑1 (MQ=255)
tCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTgatgttgttt < 1:356108/100‑10 (MQ=25)
cAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCAc > 2:597106/1‑100 (MQ=255)
aGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGTTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACg < 1:464012/100‑1 (MQ=255)
gTGATGGGGTTCAGTTTAGTGCTGATACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAATTGTCAA‑GCGCATGGACAACtcatacca > 2:2544106/1‑84 (MQ=255)
gATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGaaa > 1:247232/1‑100 (MQ=255)
ggATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCt > 1:1547235/1‑100 (MQ=255)
tttAGTGCTGCTACAATCGTCGTTAATTGGTTAAAAACAATATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTAc < 1:2344188/100‑1 (MQ=255)
tttAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTAc > 1:2370895/1‑100 (MQ=255)
aGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGTAGTTGTCCA‑ACGCATGGACAACTTCTGCCAGCTACACAAAAGCCGGATTCGACCtt > 1:2386180/1‑100 (MQ=255)
gctgctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGATTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTc > 1:2265365/1‑100 (MQ=255)
ctgctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCg < 1:1030331/100‑1 (MQ=255)
ctgctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCg < 1:57978/100‑1 (MQ=255)
ctgctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCg < 1:1164233/100‑1 (MQ=255)
gctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGc < 2:1166988/100‑1 (MQ=255)
gctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGc > 2:1683193/1‑100 (MQ=255)
tACAAACGGCGGGAATTTGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTg < 2:2265337/100‑1 (MQ=255)
tACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGGAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTg < 2:1977967/100‑1 (MQ=255)
tACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTg < 2:1587252/100‑1 (MQ=255)
tACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTg > 1:1206690/1‑100 (MQ=255)
cAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAACCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtc > 1:1193241/1‑100 (MQ=255)
aaCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGAAAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctc > 2:2342196/1‑100 (MQ=255)
actgcgtGAATTTGTTAAAAACAACATCAGAAGTTTTCCA‑GCGCATTGACAACTTCTGCCAGCTTCACAAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctc < 2:549224/96‑1 (MQ=255)
ggcgtGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctcttc < 1:1874513/100‑1 (MQ=255)
ggcggGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCTAGCTTCACGAAAGCATTATTCTACATTTTCGCCTGtctct > 1:1543133/1‑98 (MQ=255)
ggcggGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctcttc > 2:1930420/1‑100 (MQ=255)
ggcggGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctcttc < 1:921478/100‑1 (MQ=255)
ggcggGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctcttc < 1:2553583/100‑1 (MQ=255)
cggGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGATAACTTCTGCCAGCTTCTCTAAAGCCTTATTCTTCTTTTTCGGCTGtctgttctc < 2:1264957/100‑1 (MQ=255)
cggGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctcttctc > 2:1118022/1‑100 (MQ=255)
gggAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctcttctct < 1:597110/100‑1 (MQ=255)
ggAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTtctctc > 2:535165/1‑100 (MQ=255)
ggAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTtctctc > 1:1380435/1‑100 (MQ=255)
gAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCg < 1:1809943/100‑1 (MQ=255)
ttGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTAc > 2:2092495/1‑100 (MQ=255)
ggTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTg > 2:957329/1‑100 (MQ=255)
ggTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTg > 2:398075/1‑100 (MQ=255)
ggTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTACTGCCCGATTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACt > 2:2366101/1‑99 (MQ=255)
gTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGt > 2:975487/1‑100 (MQ=255)
ttAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGtt > 2:600603/1‑100 (MQ=255)
gatctgctggcAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTaa < 2:409550/90‑1 (MQ=25)
gatctgctggcAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTaa < 2:789995/90‑1 (MQ=25)
aaaaCAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTaa > 1:2305006/1‑100 (MQ=255)
aaaaCAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTaa < 1:1850073/100‑1 (MQ=255)
aaaCAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAg < 2:4286/100‑1 (MQ=255)
gaagctggcAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGt > 1:240369/9‑100 (MQ=25)
aacaacATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTATACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGt > 1:152621/1‑100 (MQ=255)
caacaTCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTATACCTTTTCGGCTGTATATTCTCTCGTACTGTTTAAGTAt > 1:539108/1‑100 (MQ=255)
gctggcAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTTACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGTCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTaaagatc > 1:790003/6‑95 (MQ=25)
ctggcAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAttt > 2:1135713/5‑100 (MQ=37)
tggcAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTg > 1:842975/4‑100 (MQ=38)
ggcAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGt > 1:1664019/3‑100 (MQ=38)
ggcAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGt > 1:2100523/3‑100 (MQ=38)
aTCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGt > 1:1708609/1‑100 (MQ=255)
aTCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGt > 2:438003/1‑100 (MQ=255)
aTCAGAAGTTGTCAA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCGTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGt > 2:1637349/1‑100 (MQ=255)
tCAGAAGTTGTCCA‑GTGCATGGACAACTTCTGCTAGCTTCCCGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGt < 1:1550985/99‑1 (MQ=255)
tCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGtt > 2:1021775/1‑100 (MQ=255)
cAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTc > 1:2092691/1‑100 (MQ=255)
cAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTc > 1:2494488/1‑100 (MQ=255)
aGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTcc < 2:247230/100‑1 (MQ=255)
gAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCcg < 2:53818/100‑1 (MQ=255)
aGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCcgcg > 1:1927412/1‑100 (MQ=39)
aGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCcgcg > 1:1741722/1‑100 (MQ=39)
ttGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCt < 1:1227433/100‑1 (MQ=255)
tGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCtt > 1:166336/1‑100 (MQ=255)
gTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTc > 2:240969/1‑100 (MQ=255)
tCCA‑GCGCATTGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTGCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCa < 1:106705/100‑1 (MQ=255)
tCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCa > 2:116140/1‑100 (MQ=255)
|
CCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCA > NC_000913/3183247‑3183441
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
