Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F191 I1 R1
|
67 |
105.9 |
5535243 |
92.7% |
5131170 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,549,792 |
(C)6→5 |
coding (279/2085 nt) |
malQ ← |
4‑alpha‑glucanotransferase (amylomaltase) |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,549,787 | 0 | C | . | 97.5%
| 356.2
/ 2.2
| 83 | coding (284/2085 nt) | malQ | 4‑alpha‑glucanotransferase (amylomaltase) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base . (50/29); total (52/31) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCATTTTTTTG > NC_000913/3549688‑3549882
|
ggggCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGc > 1:1539443/1‑100 (MQ=255)
ggggCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGc > 2:1442594/1‑100 (MQ=255)
gggCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGcc < 2:2417309/100‑1 (MQ=255)
gggCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGcc > 2:2115572/1‑100 (MQ=255)
ggCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGccc < 2:2635568/100‑1 (MQ=255)
gCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGcccc < 1:1089024/100‑1 (MQ=255)
cAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGcccccgtt > 1:1198948/1‑97 (MQ=255)
cACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACAt > 2:1966449/1‑100 (MQ=255)
cACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACAt > 1:1727165/1‑100 (MQ=255)
aCCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATg > 1:246121/1‑100 (MQ=255)
aCCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATg < 1:1425271/100‑1 (MQ=255)
aCCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATg > 1:1492930/1‑100 (MQ=255)
cccGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATgg > 2:1088658/1‑100 (MQ=255)
gCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCtt < 1:567102/100‑1 (MQ=255)
taTGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTg < 1:175345/99‑1 (MQ=255)
aaTGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTg < 2:178143/100‑1 (MQ=255)
aaTGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTg < 2:350762/100‑1 (MQ=255)
aaTGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTg < 2:467304/100‑1 (MQ=255)
aTGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTga > 2:175342/1‑99 (MQ=255)
tGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGt < 2:817324/99‑1 (MQ=255)
tGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTa > 1:2304729/1‑100 (MQ=255)
gcgcgcgcTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTAc > 1:279984/1‑100 (MQ=255)
cgcgcgcTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACt > 2:1367312/1‑100 (MQ=255)
cgcTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGt < 2:1346936/100‑1 (MQ=255)
tcgtcCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCcttc < 2:213792/100‑1 (MQ=255)
gtcCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAGCGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCcttctt < 1:2023252/100‑1 (MQ=255)
gtcCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCcttctt > 1:1039241/1‑100 (MQ=255)
gtcCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCcttctt < 2:335864/100‑1 (MQ=255)
tcCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCttcttc < 2:1358841/100‑1 (MQ=255)
tcCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCttcttc > 1:2738727/1‑100 (MQ=255)
tcCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCttcttc < 1:1219515/100‑1 (MQ=255)
gggTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCggtg > 1:177677/1‑100 (MQ=255)
gggTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCggtg > 2:1926174/1‑100 (MQ=255)
ggTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCggtgg > 1:1995666/1‑100 (MQ=255)
ggTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCggtgg > 1:1995657/1‑100 (MQ=255)
gtaaGTCTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCggtgg < 1:403945/97‑1 (MQ=255)
gTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTT‑ACCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCggtggt > 2:2045257/1‑100 (MQ=255)
gTGAGTGGCAGCGTGTGATAACCTGCCGGCAGCTTCGACGGTAGATTGAGCGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCggtgg < 2:179492/99‑1 (MQ=255)
gAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTca > 2:225337/1‑100 (MQ=255)
aGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTcag < 1:1500855/100‑1 (MQ=255)
aGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTcag > 1:1761990/1‑100 (MQ=255)
tgtCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTcagca > 2:820085/1‑100 (MQ=255)
cAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCagcagc > 2:173742/1‑100 (MQ=255)
cAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGcagcc > 2:1775326/1‑100 (MQ=255)
cAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGcagcc > 2:2534589/1‑100 (MQ=255)
cAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGcagcc > 2:2534429/1‑100 (MQ=255)
cGTGTGATAACCTTCCGGCAGGTGCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCATTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGcagccagc < 2:980532/100‑1 (MQ=255)
gATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTatat > 1:1496949/1‑100 (MQ=255)
aTAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGC‑TTGGCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATAtt < 1:1317507/100‑1 (MQ=255)
tAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCGCCGTTACATGGCCTTTGTAGTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTc > 2:1510946/1‑100 (MQ=255)
aaCCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTcg > 1:1878543/1‑100 (MQ=255)
aaCCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTcg < 1:311022/100‑1 (MQ=255)
aaCCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTcg > 2:517433/1‑100 (MQ=255)
aCCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTcgc < 1:1367321/100‑1 (MQ=255)
ccTTCCGGCGGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGTTATATTcgcc < 2:1155320/100‑1 (MQ=255)
ccTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTcgcc > 2:779531/1‑100 (MQ=255)
cTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTcgccg < 2:1727151/100‑1 (MQ=255)
cTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTcgccg > 1:298780/1‑100 (MQ=255)
ttCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTcgccgc < 1:2723933/100‑1 (MQ=255)
ccGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTg > 1:2578576/1‑100 (MQ=255)
ccGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTg > 1:2183570/1‑100 (MQ=255)
cGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTGCTGCGTTCCTTCTTCGGTAGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGc < 1:946174/100‑1 (MQ=255)
ggCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGcc > 2:1693804/1‑100 (MQ=255)
ggCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGcc > 2:822290/1‑100 (MQ=255)
ggCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTCCTTCGGTGGTCAGCAGCCCGCTATATTCGCCGCTGcc > 2:479972/1‑100 (MQ=255)
gCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGccc > 2:2270813/1‑100 (MQ=255)
cAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCt < 2:2738708/100‑1 (MQ=255)
gCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTcc > 1:1186687/1‑100 (MQ=255)
cgtcgtggGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACGGGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGTTATATTcgcc < 2:1155464/87‑1 (MQ=255)
cTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTcca < 1:825324/100‑1 (MQ=255)
tcgtcgGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTccacc > 1:142138/1‑100 (MQ=255)
cgtcgGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTccacca < 1:2300621/100‑1 (MQ=255)
cgGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTccaccacca > 2:2359349/1‑100 (MQ=255)
ngTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCAt > 2:941069/2‑100 (MQ=255)
ggTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCTGTGGTCAGCATCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCAt > 2:2586565/1‑100 (MQ=255)
ggTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCAt < 1:1772130/100‑1 (MQ=255)
ggTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCAt > 1:500911/1‑100 (MQ=255)
ggTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCAt > 2:940360/1‑100 (MQ=255)
ggTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCAt > 2:654055/1‑100 (MQ=255)
ggTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGACAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTccaccacca > 2:2586180/1‑99 (MQ=255)
gTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATc > 2:215954/1‑100 (MQ=255)
gATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGc > 1:1813503/1‑100 (MQ=255)
aTTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCa > 1:629559/1‑100 (MQ=255)
aTTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGACGCTGCCATCCACCACCATCGGCa > 1:918104/1‑100 (MQ=255)
aTTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTCCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCa > 1:748552/1‑100 (MQ=255)
ttGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCAt > 2:1424257/1‑100 (MQ=255)
aaCGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCAtttt > 2:2492188/1‑100 (MQ=255)
aaCGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCAtttt > 1:1884858/1‑100 (MQ=255)
cTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCATTTTTTTg < 2:177674/100‑1 (MQ=255)
cTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCATTTTTTTg < 1:2115589/100‑1 (MQ=255)
|
GGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCATTTTTTTG > NC_000913/3549688‑3549882
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
