Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F212 I1 R1
|
174 |
80.0 |
3892211 |
96.7% |
3763768 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,648,042 |
T→C |
intergenic (‑254/‑486) |
dinQ ← / → arsR |
UV‑inducible membrane toxin, DinQ‑AgrB type I toxin‑antitoxin system/arsenical resistance operon transcriptional repressor; autorepressor |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,648,042 | 0 | T | C | 96.7%
| 316.7
/ ‑0.8
| 93 | intergenic (‑254/‑486) | dinQ/arsR | UV‑inducible membrane toxin, DinQ‑AgrB type I toxin‑antitoxin system/arsenical resistance operon transcriptional repressor; autorepressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/2); new base C (45/44); total (47/46) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.65e-01 |
ATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGT > NC_000913/3647946‑3648138
|
aTGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATg > 1:781237/1‑100 (MQ=255)
tGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATgg < 1:463817/100‑1 (MQ=255)
gcATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTAt > 1:1743866/1‑100 (MQ=255)
gcATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCACGGTAt > 2:1211499/1‑100 (MQ=255)
aTTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTa < 2:396565/100‑1 (MQ=255)
aTTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACCGGATATTCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTa < 1:1307301/100‑1 (MQ=255)
ttGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAg < 1:452879/100‑1 (MQ=255)
tGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGc < 1:87847/100‑1 (MQ=255)
tGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGc < 2:1070919/100‑1 (MQ=255)
gCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCa > 2:1524706/1‑100 (MQ=255)
gCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCa < 1:433313/100‑1 (MQ=255)
gCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCa > 2:1661407/1‑100 (MQ=255)
gCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCa < 2:787689/100‑1 (MQ=255)
cAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCAtt > 1:991591/1‑100 (MQ=255)
cAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGAATGGTATTAGCAtt > 2:380461/1‑100 (MQ=255)
cAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGAGAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATTGTATTAGCAtt < 1:839193/100‑1 (MQ=255)
gTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATg < 2:557756/100‑1 (MQ=255)
tGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGc < 2:645284/100‑1 (MQ=255)
cgatcttCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTa < 2:599267/94‑1 (MQ=255)
aaTGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATGCGTTa < 2:26852/100‑1 (MQ=255)
aaTGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTa < 2:205166/100‑1 (MQ=255)
aaTGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTa < 1:1137048/100‑1 (MQ=255)
gCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAgat < 1:1503846/100‑1 (MQ=255)
ccTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAgatg > 2:1395850/1‑100 (MQ=255)
ccTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAgatg > 2:1395957/1‑100 (MQ=255)
tCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCCTGGTATTAGCATTGATGCGTTAgatgat > 1:1684504/1‑100 (MQ=255)
tCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTaagatcg > 1:599265/1‑94 (MQ=255)
cAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGatgatg > 2:948285/1‑100 (MQ=255)
cAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGatgatg < 1:415462/100‑1 (MQ=255)
cAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGatgatg > 1:113989/1‑100 (MQ=255)
cAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGatgatg < 1:1118200/100‑1 (MQ=255)
cAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGatgatg < 1:147454/100‑1 (MQ=255)
agagCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATgg < 1:1701624/100‑1 (MQ=255)
agagCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATgg < 2:124347/100‑1 (MQ=255)
agagCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATgg < 2:255252/100‑1 (MQ=255)
agagCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATgg < 1:259699/100‑1 (MQ=255)
tcTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTa < 2:558536/99‑1 (MQ=255)
gCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTa < 1:1139603/100‑1 (MQ=255)
tAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTAtc > 2:248598/1‑100 (MQ=255)
tAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTGGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTAtc < 1:1885378/100‑1 (MQ=255)
aaCTGTAGAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTAtc < 1:942000/99‑1 (MQ=255)
aaCTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTaaga > 1:558534/1‑97 (MQ=255)
aaCTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTAtct > 2:1784495/1‑100 (MQ=255)
aaCTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTAtct < 2:1477594/100‑1 (MQ=255)
aCTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTAtctc < 2:1693475/100‑1 (MQ=255)
tGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGTATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCAc > 2:511279/1‑100 (MQ=255)
tGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCAc < 1:39471/100‑1 (MQ=255)
tGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCAc < 1:1593647/100‑1 (MQ=255)
tGGATAATCATACAGTACATGCAGGTCATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCAc > 2:1186749/1‑100 (MQ=255)
ggATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACt > 1:609425/1‑100 (MQ=255)
ggATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACt > 1:1361536/1‑100 (MQ=255)
aTAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTcc > 2:1703236/1‑100 (MQ=255)
aTCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGt > 1:1223516/1‑100 (MQ=255)
tCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTc > 1:90559/1‑100 (MQ=255)
cATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCa > 1:1517062/1‑100 (MQ=255)
aCAGTACATGCAGGTTATAAACCCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCagag < 2:1074211/100‑1 (MQ=255)
cAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGc > 1:301239/1‑100 (MQ=255)
aGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGcc > 2:1936339/1‑100 (MQ=255)
tGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAAc > 2:1098659/1‑100 (MQ=255)
gCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACt > 2:1056304/1‑100 (MQ=255)
cAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTc > 1:1852122/1‑100 (MQ=255)
aGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCa < 1:1108152/100‑1 (MQ=255)
gTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAgg < 2:1743877/100‑1 (MQ=255)
taAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTg > 2:628937/1‑100 (MQ=255)
taAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTg > 2:215050/1‑100 (MQ=255)
taAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTg > 1:514108/1‑100 (MQ=255)
aaaaCCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTTATGCTTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCATAGCCACCAACTCAGGGCTgg > 1:646791/1‑100 (MQ=38)
aaaaCCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTgg < 1:1524698/100‑1 (MQ=255)
aaaCCAGCACGTGCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGa > 2:1278442/1‑100 (MQ=255)
aaaCCAGCACGTCCTTTCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGa < 1:1872640/100‑1 (MQ=255)
aaaCCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGa > 1:379075/1‑100 (MQ=255)
aaaCCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGa > 1:1932905/1‑100 (MQ=255)
aCCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGaaa > 1:1708808/1‑100 (MQ=255)
ccAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAg < 2:631736/100‑1 (MQ=255)
ccAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAg < 1:830283/100‑1 (MQ=255)
cAGCACGTCCTTGCATTAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTCGTTGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGaaan < 1:425269/99‑2 (MQ=37)
aGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTa > 2:1103523/1‑100 (MQ=255)
gCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTaa < 1:1355729/100‑1 (MQ=255)
ccTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAAc < 2:380442/99‑1 (MQ=255)
ccTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAAcc > 1:132326/1‑100 (MQ=255)
ccTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAAcc > 2:44491/1‑100 (MQ=255)
ccTTGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATATCACTCCAGTCAGAGCCACCAACACAGGGCTGGAAAGTAAAAAAcc < 1:1061979/100‑1 (MQ=255)
tGCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGAc > 2:575944/1‑100 (MQ=255)
gCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACg > 1:694123/1‑100 (MQ=255)
gCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCACCTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACg < 2:1359520/100‑1 (MQ=255)
gCAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACg > 1:927292/1‑100 (MQ=255)
cAATAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGc > 1:980160/1‑100 (MQ=255)
aTAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCaa < 2:465869/100‑1 (MQ=255)
aTAGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCaa < 2:1361544/100‑1 (MQ=255)
aGTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAg < 1:1703225/100‑1 (MQ=255)
gTTTCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGt > 1:1074056/1‑100 (MQ=255)
tttCAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAgac > 1:1183468/1‑98 (MQ=255)
cAGCATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGt > 1:1496175/1‑100 (MQ=255)
|
ATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGT > NC_000913/3647946‑3648138
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
