Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F50 I3 R1
|
16 |
99.9 |
3128093 |
98.5% |
3081171 |
150.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,267,294 |
G→T |
intergenic (‑229/‑86) |
tdcA ← / → tdcR |
tdc operon transcriptional activator/L‑threonine dehydratase operon activator protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,267,294 | 0 | G | T | 99.0%
| 364.5
/ NA
| 97 | intergenic (‑229/‑86) | tdcA/tdcR | tdc operon transcriptional activator/L‑threonine dehydratase operon activator protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (43/53); minor base C (1/0); total (44/53) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.54e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AACTTTCAATACTTTCCAGAGTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCGTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTCAGTGATAAATAATGCGGC > NC_000913/3267149‑3267438
|
aaCTTTCAATACTTTCCAGAGTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTAt < 2:1528353/150‑1 (MQ=255)
aCTTTCAATACTTTCCAGAGTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTAtgt < 1:489160/151‑1 (MQ=255)
ttCAATACTTTCCAGAGTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTAtgtg < 2:501307/149‑1 (MQ=255)
ttCAATACTTTCCAGAGTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGt > 1:302029/1‑151 (MQ=255)
tCAATACTTTCCAGAGTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTgg > 1:9835/1‑149 (MQ=255)
tCAATACTTTCCAGAGTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGt < 2:1128882/150‑1 (MQ=255)
cAATACTTTCCAGAGTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGtt < 1:357048/150‑1 (MQ=255)
cAATACTTTCCAGAGTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTa < 2:43121/151‑1 (MQ=255)
aTACTTTCCAGAGTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAAt > 1:183580/1‑151 (MQ=255)
aTACTTTCCAGAGTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAAt < 2:1529408/151‑1 (MQ=255)
aCTTTCCAGAGTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATa < 1:649271/150‑1 (MQ=255)
aCTTTCCAGAGTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATAc > 2:311955/1‑151 (MQ=255)
ttCCAGAGTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACaa < 2:188269/150‑1 (MQ=255)
ttCCAGAGTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACaa < 1:1316375/150‑1 (MQ=255)
tCCAGAGTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACaaa < 2:40998/150‑1 (MQ=255)
ccAGAGTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACaaaaa < 2:1234415/151‑1 (MQ=255)
cAGAGTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACaaaaaa < 1:901049/151‑1 (MQ=255)
agagTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAg < 1:352529/151‑1 (MQ=255)
agagTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTC‑AAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAgg > 2:1323124/1‑151 (MQ=255)
agTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAggg < 2:1008857/151‑1 (MQ=255)
aTCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGc < 1:49934/150‑1 (MQ=255)
aTCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCt > 2:767236/1‑151 (MQ=255)
gTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTgag < 2:961752/151‑1 (MQ=255)
tattaCAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGAc > 1:353701/1‑151 (MQ=255)
attaCAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGAcc > 2:1216177/1‑151 (MQ=255)
attaCAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGAcc > 2:1548718/1‑151 (MQ=255)
ttaCAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGAcc > 1:926883/1‑150 (MQ=255)
taCAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCat > 1:954680/1‑151 (MQ=255)
aCAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCat < 1:677863/150‑1 (MQ=255)
aCAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCat < 2:769233/150‑1 (MQ=255)
cAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCatat < 1:521281/151‑1 (MQ=255)
aaTTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATAtt > 1:1267090/1‑151 (MQ=255)
aTTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATAttt > 2:810794/1‑151 (MQ=255)
tAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTc > 2:456945/1‑150 (MQ=255)
aaaTACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCa < 1:605092/150‑1 (MQ=255)
aCCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCa < 2:1561125/150‑1 (MQ=255)
tttAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAAtt > 2:51389/1‑150 (MQ=255)
tAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTAcc > 1:740689/1‑151 (MQ=255)
atatCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCgg > 2:856742/1‑150 (MQ=255)
atatCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCgg > 1:1095142/1‑150 (MQ=255)
atatCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCgg > 2:666022/1‑150 (MQ=255)
atCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGAt > 2:60069/1‑150 (MQ=255)
atCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATa < 2:885772/151‑1 (MQ=255)
caacaaGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAAt > 1:1296873/1‑151 (MQ=255)
caacaaGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAAt < 1:619772/151‑1 (MQ=255)
aacaaGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAAtt > 2:1451742/1‑151 (MQ=255)
aacaaGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAAtt > 2:283691/1‑151 (MQ=255)
aacaaGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTC‑AAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTa < 1:880855/151‑1 (MQ=255)
aaGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTAc > 1:1065465/1‑150 (MQ=255)
gTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAg < 2:147929/151‑1 (MQ=255)
aaaGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGc > 1:483028/1‑150 (MQ=255)
aaaGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCa < 2:12787/151‑1 (MQ=255)
ataAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAAtt < 1:582485/151‑1 (MQ=255)
ataAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAAt < 1:1383547/150‑1 (MQ=255)
ataAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACAATATTTCAAGCAATTACAGGATAATTACCAGGCAAAAtt > 2:1371862/1‑151 (MQ=255)
taAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAAttt > 1:1448941/1‑151 (MQ=255)
aaaaaTCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTg < 1:538830/151‑1 (MQ=255)
aaaaaTCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTg > 1:272137/1‑151 (MQ=255)
aaaaaTCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTg < 1:770371/151‑1 (MQ=255)
aGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTaaa < 1:540295/151‑1 (MQ=255)
cATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAAtt < 1:1206359/151‑1 (MQ=255)
cATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAAtt > 2:763397/1‑151 (MQ=255)
cATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAAtt < 2:470055/151‑1 (MQ=255)
aTAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAAtt < 2:1262728/150‑1 (MQ=255)
aaaCCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTaa < 1:1345720/151‑1 (MQ=255)
aaCCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAAt > 1:1467690/1‑151 (MQ=255)
aCCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATg < 2:484013/151‑1 (MQ=255)
gATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGc < 2:608815/149‑1 (MQ=255)
gATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCaa < 1:165086/151‑1 (MQ=255)
tttttGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATAGCGTTAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGGGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAg > 1:262857/1‑150 (MQ=255)
ttttGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGt < 2:133812/150‑1 (MQ=255)
tttGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGtt < 2:179233/150‑1 (MQ=255)
tttGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGtt < 2:96712/150‑1 (MQ=255)
tttGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTtc > 1:496566/1‑151 (MQ=255)
tGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTtctc > 1:836529/1‑151 (MQ=255)
gTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTtctc < 1:1092931/150‑1 (MQ=255)
gTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTtctc < 1:1312108/150‑1 (MQ=255)
cAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCaa > 2:499959/1‑150 (MQ=255)
aaaaaaaaTGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAAt > 1:1533298/1‑151 (MQ=255)
aaaaaaaTGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAAtt < 1:273850/151‑1 (MQ=255)
aaaaaTGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAAtttt < 2:1267931/151‑1 (MQ=255)
aaaTGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTttat < 2:906011/151‑1 (MQ=255)
aacgagggggATAACCATATTTTATGGCGCTAACATCATTACTTCTGTGGTTGATACAAAAAAGGGGCTGAGGCCATATTTCAAACAATTACCGGATAATTACCAGGCAACAGTTGAATTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAAtttttt > 1:1421532/7‑148 (MQ=255)
ggggATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTataaat < 2:1443538/151‑1 (MQ=255)
gATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTataaataa > 2:1402771/1‑150 (MQ=255)
tatTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTc > 2:1552995/1‑151 (MQ=255)
tatTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTc > 1:307114/1‑151 (MQ=255)
atTTTATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTc > 2:2034/1‑150 (MQ=255)
ttATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGGTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTCAGt < 2:1103353/150‑1 (MQ=255)
tATGGCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTCAGTg > 2:151/1‑150 (MQ=255)
tATGGCGACATCATCCTTTTTTATGTGGTTGATACGCAGATCTGGCTGAGTCCATATTTCAAGCAATTAATGGATAGTAACCAGGCAATGTTTGATTTAAATTTAATGAGCAAGTTATTAACTATAATTGTAAATTAATCAttttttg > 1:128243/1‑145 (MQ=255)
ggCGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTCAGTGata < 1:1185410/150‑1 (MQ=255)
cGATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTCAGTGataaat > 2:865979/1‑151 (MQ=255)
gATAACATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAGATAAACCATTTTCAGTGataaata < 2:961895/151‑1 (MQ=255)
aaCATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTCAGTGATAAATAATg < 1:311906/151‑1 (MQ=255)
aaCATCATTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTCAGTGATAAATAATg < 2:695513/151‑1 (MQ=255)
catTCTTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTCAGTGATAAATAATGCGGc > 2:1361810/1‑150 (MQ=255)
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AACTTTCAATACTTTCCAGAGTATCGTTATTACAATTAAATACCTTTAAATATCAACAAGTTAAAGTATAAAAATCAGCATAAACCCTGATTTTTGTCAAAAAAAATGACGGGGATAACCATATTTTATGGCGATAACATCATTCGTTATGTGGTTAATACAAAAAAGGGGCTGAGACCATATTTCAAGCAATTACCGGATAATTACCAGGCAAAATTTGAGTTAAATTTAATGAGCAAGTTCTCAAATTTTATTATAAATAAACCATTTTCAGTGATAAATAATGCGGC > NC_000913/3267149‑3267438
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
