Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F50 I1 R1
|
15 |
106.9 |
3315624 |
99.1% |
3285783 |
150.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,257,602 |
A→T |
N163I (AAT→ATT) |
lexA → |
transcriptional repressor of SOS regulon |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,257,602 | 0 | A | T | 97.9%
| 371.2
/ ‑0.8
| 96 | N163I (AAT→ATT) | lexA | transcriptional repressor of SOS regulon |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base T (46/48); total (47/49) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.93e-01 |
GCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCAATAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTATTCGCAACGGCGACTGGCTGTAACATATCTCTGAGACCGCGATGCCGCC > NC_000913/4257455‑4257749
|
gcgTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGCTGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTa > 3:267295/1‑150 (MQ=255)
gcgTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTaa < 3:879539/151‑1 (MQ=255)
cgTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTaaa < 2:5999/151‑1 (MQ=255)
cgTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTaa > 3:257078/1‑150 (MQ=255)
gTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAg < 2:553580/151‑1 (MQ=255)
cAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTc < 2:1463720/151‑1 (MQ=255)
aGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCg < 3:272868/151‑1 (MQ=255)
gCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGa < 2:1604201/151‑1 (MQ=255)
cGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGa > 2:1398678/1‑150 (MQ=255)
gggATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAAc < 3:79091/151‑1 (MQ=255)
ggATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACt > 3:1350608/1‑151 (MQ=255)
gTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTg > 2:765619/1‑151 (MQ=255)
gTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCAATAAAGTCGAACTGTTg < 2:295365/151‑1 (MQ=255)
cGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGc < 3:723588/150‑1 (MQ=255)
cGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGc < 3:1166460/150‑1 (MQ=255)
gATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCGGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGcc < 3:1163121/150‑1 (MQ=255)
gATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCa < 3:7350/151‑1 (MQ=255)
aTGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGcc > 4:10387/1‑149 (MQ=255)
gAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGa < 3:1569247/150‑1 (MQ=255)
gAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGa > 3:721978/1‑150 (MQ=255)
aaaGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGaa > 2:1399348/1‑150 (MQ=255)
aGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGaaaa > 3:183226/1‑150 (MQ=255)
gATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATa < 2:600672/151‑1 (MQ=255)
atCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCg > 2:897931/1‑151 (MQ=255)
atCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCg > 2:1161899/1‑151 (MQ=255)
gCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGtt > 2:1185483/1‑151 (MQ=255)
atggatggTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAAc < 2:318068/151‑1 (MQ=255)
atggTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAAt < 2:754965/151‑1 (MQ=255)
gACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCg < 3:321287/151‑1 (MQ=255)
aCTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGt > 2:1197384/1‑151 (MQ=255)
tGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTg > 2:301518/1‑150 (MQ=255)
cTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGAcc > 3:983393/1‑151 (MQ=255)
cTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGAcc > 2:1446975/1‑151 (MQ=255)
tGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCt > 2:1046097/1‑151 (MQ=255)
tGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCt > 2:1145235/1‑151 (MQ=255)
cAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCg < 3:959534/151‑1 (MQ=255)
cAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCg < 3:820767/151‑1 (MQ=255)
cAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCg < 3:271784/151‑1 (MQ=255)
cAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCg > 2:1632495/1‑151 (MQ=255)
aGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGt < 2:329408/151‑1 (MQ=255)
tGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTc > 2:1163829/1‑150 (MQ=255)
tGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTc > 3:1213945/1‑150 (MQ=255)
gCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTca < 3:1206442/150‑1 (MQ=255)
gCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTca < 2:569699/150‑1 (MQ=255)
aaaaCTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTcagc > 3:278222/1‑148 (MQ=255)
aaaaCTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCaga < 2:381426/151‑1 (MQ=255)
aaaCTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAACAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTcagcag > 3:3830/1‑149 (MQ=255)
cAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCtt < 3:516499/149‑1 (MQ=255)
cAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTc < 3:257838/150‑1 (MQ=255)
aGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCAc < 3:220959/151‑1 (MQ=255)
aGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCAc > 2:871899/1‑151 (MQ=255)
ggATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCAcc > 2:387727/1‑151 (MQ=255)
ggATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCAcc < 3:109492/151‑1 (MQ=255)
gATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCAcc > 2:1606242/1‑150 (MQ=255)
gATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCAcc > 2:1099684/1‑150 (MQ=255)
gTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTg < 2:1470661/151‑1 (MQ=255)
aCGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGa < 2:330503/150‑1 (MQ=255)
gTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAgg < 3:705022/151‑1 (MQ=255)
aaCGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGc < 2:217751/151‑1 (MQ=255)
aCGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCt > 3:638801/1‑151 (MQ=255)
ggTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTgg < 2:1230158/151‑1 (MQ=255)
cAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCgg > 3:659964/1‑151 (MQ=255)
cAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCg < 3:889690/150‑1 (MQ=255)
aGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑t > 2:631692/1‑151 (MQ=255)
ggTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑tt > 2:414200/1‑151 (MQ=255)
cGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTgg < 2:257095/150‑1 (MQ=255)
ttGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGGATTgggg > 3:23136/1‑151 (MQ=255)
ttGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTgggg > 3:1193322/1‑150 (MQ=255)
tCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTAt > 2:188186/1‑151 (MQ=255)
cGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTAt < 2:1009038/150‑1 (MQ=255)
gCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGGTAt > 2:1260045/1‑149 (MQ=255)
cACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTTTTCg > 3:116110/1‑151 (MQ=255)
cACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTATTCg < 2:210695/151‑1 (MQ=255)
aCGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGGTATTCg > 2:448182/1‑150 (MQ=255)
gTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTAtt > 3:1339395/1‑146 (MQ=255)
gatgaCGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTATTCGCAACGGCg < 2:1443986/151‑1 (MQ=255)
gatgaCGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTATTCGCAACGGCg < 2:116114/151‑1 (MQ=255)
gaCGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTATTCGCAACGGCGACt < 2:1085726/151‑1 (MQ=255)
aCGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTATTCGCAACGGCGACTg < 3:1185376/151‑1 (MQ=255)
aGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTATTCGCAACGGCGACTGGCTg < 2:148951/151‑1 (MQ=255)
aGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCAATAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGGTATTCGCAACGGCGACTgg > 3:376975/1‑148 (MQ=255)
tACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGGTATTCGCAACGGCGACTGGCTGTa > 3:1133448/1‑150 (MQ=255)
aCCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTATTAGCCACGGCGACTGGCTGTaa > 3:1147811/1‑150 (MQ=255)
gTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTATTCGCAACGGCGACTGGCTGTAACata < 2:1433463/151‑1 (MQ=255)
gTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTATTCGCAACGGCGACTGGCTGTAACata < 2:1320421/151‑1 (MQ=255)
tAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGGTATTCGCAACGGCGACTGGCTGTAACata > 2:951879/1‑149 (MQ=255)
gcgcCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTATTCGCAACGGCGACTGGCTGTAACATATctct > 2:317670/1‑151 (MQ=255)
cgcCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTATTCGCAACGGCGACTGGCTGTAAAATATctct > 2:1615658/1‑150 (MQ=255)
gcCTGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTATTCGCAACGGCGACTGGCTGTAACATATCTCTga < 2:183237/151‑1 (MQ=255)
tGAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTTGGGGTATTTGCAACGGCGACCGGCTGTTAAATAtct > 3:572849/1‑144 (MQ=255)
gAAAAAACAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTATTCGCAACGGCGACTGGCTGTAACATATCTCTGAGAcc < 3:875872/151‑1 (MQ=255)
aaaCAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGGTATTCGCAACGGCGACTGGCTGTAACATATCTCTGAGACcgcg > 2:458436/1‑150 (MQ=255)
aaCAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTATTCGCAACGGCGACTGGCTGTAACATATCTCTGAGACCGCGAt < 3:897874/151‑1 (MQ=255)
cAGGGCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTATTCGCAACGGCGACTGGCTGTAACATATCTCTGAGACCGCGATgc < 2:1407694/151‑1 (MQ=255)
gCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTATTCGCAACGGCGACTGGCTGTAACATATCTCTGAGACCGCGATgccgcc < 2:926579/151‑1 (MQ=255)
gCATTAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTATTCGCAACGGCGACTGGCCGTAACATATCTCTGAGACCGCGATgccgcc > 2:1642313/1‑151 (MQ=255)
|
GCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAAAAACAGGGCAATAAAGTCGAACTGTTGCCAGAAAATAGCGAGTTTAAACCAATTGTCGTTGACCTTCGTCAGCAGAGCTTCACCATTGAAGGGCTGGCGG‑TTGGGGTTATTCGCAACGGCGACTGGCTGTAACATATCTCTGAGACCGCGATGCCGCC > NC_000913/4257455‑4257749
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
