Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
157 |
93.7 |
2947622 |
98.1% |
2891617 |
150.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
611,255 |
C→T |
A414T (GCT→ACT) |
fepA ← |
ferrienterobactin outer membrane transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 611,255 | 0 | C | T | 99.0%
| 381.5
/ ‑4.5
| 98 | A414T (GCT→ACT) | fepA | ferrienterobactin outer membrane transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (53/44); total (54/44) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01 |
TATTGCCGACAATACTGTGATGATCGAAACGCAGCCCCGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGCGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAAATCAATCGGCAGGTTAACTTCGCTGTGCAGCATCACGTCAT > NC_000913/611108‑611401
|
tATTGCCGACAATACTGTGATGATCGAAACGCAGCCCCGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAgtgc < 1:789451/150‑1 (MQ=255)
gCCGACAATACTGTGATGATCGAAACGCAGCCCCGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCAcc < 1:535510/150‑1 (MQ=255)
ccGACAATACTGTGATGATCGAAACGCAGCCCCGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCgg < 1:199398/151‑1 (MQ=255)
aCAATACTGTGATGATCGAAACGCAGCCCCGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTAt > 1:525370/1‑151 (MQ=255)
cAATACTGTGATGATCGAAACGCAGCCCCGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTAtt < 1:1074460/151‑1 (MQ=255)
aaTACTGTGATGATCGAAACGCAGCCCCGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTc < 1:958439/151‑1 (MQ=255)
aTACTGTGATGATCGAAACGCAGCCCCGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCg > 2:188157/1‑151 (MQ=255)
gatgatCGAAACGCAGCCCCGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGt > 1:714963/1‑151 (MQ=255)
atgatCGAAACGCAGCCCCGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTc < 1:90398/151‑1 (MQ=255)
gatCGAAACGCAGCCCCGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAg < 2:1408198/151‑1 (MQ=255)
atCGAAACGCAGCCCCGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGt < 1:258474/151‑1 (MQ=255)
tCGAAACGCAGCCCCGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTg > 1:623085/1‑151 (MQ=255)
gAAACGCAGCCCCGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGcc > 1:312934/1‑151 (MQ=255)
aaCGCAGCCCCGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTg < 2:835492/151‑1 (MQ=255)
gCAGCCCCGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGgt < 2:532096/151‑1 (MQ=255)
aGCCCCGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGgtgt > 2:405499/1‑151 (MQ=255)
gCCCCGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGtt > 1:1176997/1‑151 (MQ=255)
ccgcGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTg < 1:361536/148‑1 (MQ=255)
cGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGaa < 1:925386/151‑1 (MQ=255)
cGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGa > 1:1411163/1‑150 (MQ=255)
cGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGa > 2:918798/1‑150 (MQ=255)
cGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACtt > 2:864903/1‑151 (MQ=255)
cGTTACGATGGTGCTGCCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTGGAATACGGGCTACGTTCGGTGTTACTCACGGCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTg < 2:1174311/145‑1 (MQ=255)
aCGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAg < 2:1053992/150‑1 (MQ=255)
gATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTcc > 2:313181/1‑151 (MQ=255)
gATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTcc < 1:1222783/151‑1 (MQ=255)
aTGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCt > 1:820666/1‑151 (MQ=255)
ggTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCtt < 1:1415250/150‑1 (MQ=255)
tGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATcc > 1:1425065/1‑150 (MQ=255)
tGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCg > 1:486539/1‑151 (MQ=255)
gtcagtcaGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGt < 2:919566/151‑1 (MQ=255)
agtcagCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGc > 1:101377/1‑151 (MQ=255)
agtcagCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGc > 1:1100351/1‑151 (MQ=255)
gtcagCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCt > 2:473932/1‑151 (MQ=255)
tcagCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCt > 2:456314/1‑150 (MQ=255)
agCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGAt < 1:918885/151‑1 (MQ=255)
cATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCAc > 2:620884/1‑151 (MQ=255)
tgttgtTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTc > 2:573746/1‑151 (MQ=255)
gttgttTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTc > 1:1158254/1‑150 (MQ=255)
tgttTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCg < 1:1359729/150‑1 (MQ=255)
gttTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGt > 1:1361030/1‑150 (MQ=255)
tCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTAc > 2:184273/1‑148 (MQ=255)
cGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTAccc > 2:1419887/1‑149 (MQ=255)
cGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCcag < 1:188181/151‑1 (MQ=255)
cGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCca < 2:687118/150‑1 (MQ=255)
cAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCcagcgt > 2:437207/1‑151 (MQ=255)
cAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCcagcgt > 2:1195280/1‑151 (MQ=255)
aCAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCcagcgtc > 1:247852/1‑149 (MQ=255)
cAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCcagcgtcagc > 1:182895/1‑151 (MQ=255)
cAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCcagcgtcagc < 2:1057910/151‑1 (MQ=255)
gCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCcagcgtcagcgt > 1:1419516/1‑151 (MQ=255)
gCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCcagcgtcagcgt > 2:426702/1‑151 (MQ=255)
cGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCagcgtcagcgtc < 2:1137403/151‑1 (MQ=255)
cGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCagcgtcagcgtc > 1:1156352/1‑151 (MQ=255)
gagaAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCt < 1:1055388/151‑1 (MQ=255)
agaAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTg < 1:864991/151‑1 (MQ=255)
gaAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTgg > 1:481326/1‑151 (MQ=255)
gaAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTgg > 2:1455092/1‑151 (MQ=255)
aaaTTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGtt > 1:846553/1‑151 (MQ=255)
aaTTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGtt > 1:298884/1‑150 (MQ=255)
tttCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAAc > 1:1326739/1‑151 (MQ=255)
ttCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACg > 2:1009148/1‑151 (MQ=255)
gCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGa < 1:537892/148‑1 (MQ=255)
gCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAg < 2:717528/149‑1 (MQ=255)
tttGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGaaa < 1:789960/150‑1 (MQ=255)
tttGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGa < 2:312896/148‑1 (MQ=255)
ttGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAaat < 1:1449106/150‑1 (MQ=255)
tGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAaatc > 1:139983/1‑150 (MQ=255)
gAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAaatca > 1:1399346/1‑150 (MQ=255)
gAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAaatca > 2:246025/1‑150 (MQ=255)
aaTACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAaatcaat > 1:286821/1‑151 (MQ=255)
aaTACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAaatcaat > 1:380952/1‑151 (MQ=255)
aCGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAAATCAATCgg > 2:1439563/1‑151 (MQ=255)
aCGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAAATCAATCgg > 2:239804/1‑151 (MQ=255)
gggCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAAATCAATCGGc > 2:920815/1‑150 (MQ=255)
gggCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAAATCAATCGGCa < 2:239377/151‑1 (MQ=255)
ggCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAAATCAATCGGCAg < 2:1043037/151‑1 (MQ=255)
gCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAAATCAATCGGCAgg < 2:1344521/151‑1 (MQ=255)
aCGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAAATCAATCGGCAGGt < 1:681072/149‑1 (MQ=255)
cggtcggtGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAAATCAATCGGCAGGTTa > 2:1327837/1‑150 (MQ=255)
ggtcggtGGTACTCACGCCATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAAATCAATCGGCAGGTTaa > 1:700657/1‑150 (MQ=255)
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ccATCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAAATCAATCGGCAGGTTAACTTCGCTGTGCAGCATCa < 1:898910/151‑1 (MQ=255)
aTCAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAAATCAATCGGCAGGTTAACTTCGCTGTGCAGCATCACg > 2:708764/1‑151 (MQ=255)
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cAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAAATCAATCGGCAGGTTAACTTCGCTGTGCAGCATCACGtc > 2:930598/1‑151 (MQ=255)
cAATAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAAATCAATCGGCAGGTTAACTTCGCTGTGCAGCATCACGtc > 2:954227/1‑151 (MQ=255)
aTAGTGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAAATCAATCGGCAGGTTAACTTCGCTGTGCAGCATCACGtcat < 2:1255441/151‑1 (MQ=255)
|
TATTGCCGACAATACTGTGATGATCGAAACGCAGCCCCGGCGTTACGATGGTGCTGTCAGTCAGCTCCATGTTGTTTTCGGCAAACAGCGAGAAAATTTCTGCTTTTGAATACGGGCTACGGTCGGTGGTACTCACGCCATCAATAGCGCCACCGGTATTCGTTCCGGTCAGTGCCTGGGTGTTGGAACTTAAGTCCTTCATCCGTTGCTGATTCCACTCCGTACCCAGCGTCAGCGTCTGGTTAACGAGGAAATCAATCGGCAGGTTAACTTCGCTGTGCAGCATCACGTCAT > NC_000913/611108‑611401
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
