Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F50 I3 R1
|
105 |
107.9 |
3491495 |
95.1% |
3320411 |
150.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
783,506 |
C→T |
A114V (GCG→GTG) |
pnuC → |
nicotinamide riboside transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 783,506 | 0 | C | T | 99.0%
| 356.3
/ ‑4.2
| 96 | A114V (GCG→GTG) | pnuC | nicotinamide riboside transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (47/48); total (48/48) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.92e-01 |
TTCAGCTGTATGCCAGCCTGCTATTACAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGCGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGATGCCTGAACTGCAACCGGACGCTTTCCCGTTCTGGG > NC_000913/783359‑783652
|
ttCAGCTGTATGCCAGCCTGCTATTACAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTtggtgg > 2:120671/1‑150 (MQ=255)
tCAGCTGTATGCCAGCCTGCTATTACAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGtt > 2:1234885/1‑151 (MQ=255)
aGCTGTATGCCAGCCTGCTATTACAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTg < 2:734170/151‑1 (MQ=255)
gCTGTATGCCAGCCTGCTATTACAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGc > 4:277170/1‑151 (MQ=255)
cTGTATGCCAGCCTGCTATTACAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCg > 1:991202/1‑151 (MQ=255)
tGTATGCCAGCCTGCTATTACAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCgt > 3:421837/1‑151 (MQ=255)
gTATGCCAGCCTGCTATTACAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCgtt < 3:130111/151‑1 (MQ=255)
gTATGCCAGCCTGCTATTACAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCgt < 3:238369/150‑1 (MQ=255)
gTATGCCAGCCTGCTATTACAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCgt < 2:414463/150‑1 (MQ=255)
tATGCCAGCCTGCTATTACAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCgttg > 4:437126/1‑151 (MQ=255)
ccAGCCTGCTATTACAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTc < 1:6344/151‑1 (MQ=255)
gCCTGCTATTACAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGa < 2:307520/150‑1 (MQ=255)
cTGCTATTACAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGAtt > 3:221481/1‑150 (MQ=255)
gCTATTACAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTg < 3:393574/149‑1 (MQ=255)
aTTACAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCtg < 1:845670/151‑1 (MQ=255)
aCAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCtgatg > 4:30417/1‑151 (MQ=255)
aCAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCtgatg > 1:996936/1‑151 (MQ=255)
aCAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCtgatg < 1:1198481/151‑1 (MQ=255)
aCAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCtgat < 2:274858/150‑1 (MQ=255)
aCAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCtgat < 1:625091/150‑1 (MQ=255)
cAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCCCTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCtgatg > 4:359573/1‑150 (MQ=255)
aGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGAc < 3:192222/151‑1 (MQ=255)
aGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGAc > 4:246158/1‑151 (MQ=255)
ggTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTTGATTGGTCTGATGACg > 1:994935/1‑151 (MQ=255)
ggTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACg > 2:599554/1‑151 (MQ=255)
ggTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACg > 4:99963/1‑151 (MQ=255)
gtTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGt < 1:14788/150‑1 (MQ=255)
tttCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTAtt < 3:231527/150‑1 (MQ=255)
ttCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTAttt > 2:172735/1‑150 (MQ=255)
ttGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCa < 2:633606/150‑1 (MQ=255)
ttGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCa < 3:247450/150‑1 (MQ=255)
gCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATc < 4:459080/151‑1 (MQ=255)
ccGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGCATGAGGCGGAGTTGAAAATTCGATGGTTGCCCTTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATcc < 2:274445/151‑1 (MQ=255)
ccGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATcc > 1:1273017/1‑151 (MQ=255)
cgcgAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCg > 2:893058/1‑151 (MQ=255)
cgcgAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCg < 2:435911/151‑1 (MQ=255)
gcgAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCgg < 1:1225133/151‑1 (MQ=255)
cgAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCgg > 2:166039/1‑150 (MQ=255)
cgAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGgt < 4:54024/151‑1 (MQ=255)
aaTATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGgtgt < 4:122667/151‑1 (MQ=255)
aaTATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGgtgt > 4:158027/1‑151 (MQ=255)
aaTATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGgtgt < 1:1238924/151‑1 (MQ=255)
aaTATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGgtgt > 1:333678/1‑151 (MQ=255)
atatTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGCGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGtt > 2:1104291/1‑151 (MQ=255)
atTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTg < 2:1050697/151‑1 (MQ=255)
atTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTg > 1:543609/1‑151 (MQ=255)
ttACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGc > 3:42647/1‑150 (MQ=255)
ttACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGc > 1:879136/1‑150 (MQ=255)
ttACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGc < 1:961322/150‑1 (MQ=255)
aCGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCAtt > 2:997181/1‑151 (MQ=255)
cGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCAttt > 3:171832/1‑151 (MQ=255)
cGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCAttt > 2:97643/1‑151 (MQ=255)
ggTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCAtttt < 2:854555/151‑1 (MQ=255)
gTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCAttttt < 2:267890/151‑1 (MQ=255)
gTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCAtttt > 1:779034/1‑150 (MQ=255)
ggTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGAc > 1:417099/1‑151 (MQ=255)
aTGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCcg < 1:80208/151‑1 (MQ=255)
gCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTTGTTTGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTTTTTGCATTTTTGACCcgc < 2:443108/150‑1 (MQ=255)
cGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGt > 1:819910/1‑151 (MQ=255)
gTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTg > 1:841362/1‑151 (MQ=255)
cgcgACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAg < 2:994740/150‑1 (MQ=255)
cgACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTc > 1:758641/1‑150 (MQ=255)
gACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCAt < 1:437819/151‑1 (MQ=255)
gACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCAt < 4:458883/151‑1 (MQ=255)
ccAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCAt < 4:315873/151‑1 (MQ=255)
cAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATg > 4:454152/1‑151 (MQ=255)
cAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATg > 2:333581/1‑151 (MQ=255)
aGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGc < 1:698880/151‑1 (MQ=255)
gTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGc > 1:1210936/1‑150 (MQ=255)
gTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCa < 4:306565/151‑1 (MQ=255)
gTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCa < 1:265075/151‑1 (MQ=255)
gAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGc > 2:721698/1‑150 (MQ=255)
gAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCa < 4:168167/151‑1 (MQ=255)
cGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCAtt > 2:6642/1‑150 (MQ=255)
gCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGAt < 1:243667/151‑1 (MQ=255)
cGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGAtt > 3:166835/1‑151 (MQ=255)
cGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGAtt > 4:410740/1‑151 (MQ=255)
ggAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTa < 2:177170/151‑1 (MQ=255)
aaaaTTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTtg < 2:996740/151‑1 (MQ=255)
aaaaTTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTtg > 2:983119/1‑151 (MQ=255)
aaaTTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTtgt < 2:279954/151‑1 (MQ=255)
tCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGAt < 4:7658/150‑1 (MQ=255)
tCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGATg > 2:1092329/1‑151 (MQ=255)
cTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGATGCCt > 3:413425/1‑151 (MQ=255)
gTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGATGCCTGaa < 2:665239/151‑1 (MQ=255)
tGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGATGCCTGAACt > 2:585066/1‑151 (MQ=255)
cATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGATGCCTGAACTGc > 1:135687/1‑150 (MQ=255)
ccGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGATGCCTGAACTGCAACCgg > 1:302554/1‑151 (MQ=255)
cGAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGATGCCTGAACTGCAACCgg > 1:443647/1‑150 (MQ=255)
gAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGATGCCTGAACTGCAACCGGAc > 1:1001519/1‑151 (MQ=255)
gAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGATGCCTGAACTGCAACCGGAc < 2:878960/151‑1 (MQ=255)
gAAGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGATGCCTGAACTGCAACCGGAc > 2:266/1‑151 (MQ=255)
aaGGCACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGATGCCTGAACTGCAACCGGAc < 4:351272/150‑1 (MQ=255)
cACTCAGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGATGCCTGAACTGCAACCGGACGCttt < 1:87371/151‑1 (MQ=255)
aGCTGGTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGATGCCTGAACTGCAACCGGACGCTTTCCCGt < 1:551264/151‑1 (MQ=255)
cgTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGATGCCTGAACTGCAACCGGACGCTTTCCCGTTCTg > 2:160168/2‑151 (MQ=255)
gTTGGTGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGATGCCTGAACTGCAACCGGACGCTTTCCCGTTCTgg < 1:339498/151‑1 (MQ=255)
tggtggTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGATGCCTGAACTGCAACCGGACGCTTTCCCGTTCTggg > 1:448540/1‑150 (MQ=255)
tggtggTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGATGCCTGAACTGCAACCGGACGCTTTCCCGTTCTgga < 2:721863/150‑2 (MQ=255)
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TTCAGCTGTATGCCAGCCTGCTATTACAGGTGTTTTTCTTTGCCGCGAATATTTACGGTTGGTATGCGTGGTCGCGACAAACCAGTCAGAACGAGGCGGAGTTGAAAATTCGCTGGTTGCCATTGCCGAAGGCACTCAGCTGGTTGGCGGTTTGCGTTGTTTCGATTGGTCTGATGACGGTATTTATCAATCCGGTGTTTGCATTTTTGACCCGCGTGGCAGTCATGATCATGCAAGCATTAGGATTACAGGTTGTGATGCCTGAACTGCAACCGGACGCTTTCCCGTTCTGGG > NC_000913/783359‑783652
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
