Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F50 I3 R1
|
105 |
107.9 |
3491495 |
95.1% |
3320411 |
150.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
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position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,954,322 |
T→C |
L294P (CTG→CCG) |
cmoB → |
tRNA (cmo5U34)‑carboxymethyltransferase, carboxy‑SAM‑dependent |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,954,322 | 0 | T | C | 99.0%
| 335.0
/ NA
| 98 | L294P (CTG→CCG) | cmoB | tRNA (cmo5U34)‑carboxymethyltransferase, carboxy‑SAM‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (50/47); total (51/47) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CAAATGCGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCTGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAA > NC_000913/1954174‑1954464
|
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aaTGCGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGcc < 1:260706/151‑1 (MQ=255)
aaTGCGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGcc < 2:910442/151‑1 (MQ=255)
aTGCGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCgccggccg > 1:171810/1‑151 (MQ=255)
tGCGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCgccggccg > 2:1160263/1‑150 (MQ=255)
tGCGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCgccggccg > 2:80732/1‑150 (MQ=255)
cGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCTGGCCGAtt > 1:866572/1‑151 (MQ=255)
cGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGAtt > 1:1116764/1‑151 (MQ=255)
tAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTc > 1:1215467/1‑151 (MQ=255)
gTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTc < 4:159533/150‑1 (MQ=255)
gTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTc < 1:148358/150‑1 (MQ=255)
gTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTc < 1:1102911/150‑1 (MQ=255)
tATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGAcc > 2:878066/1‑151 (MQ=255)
tttCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGAccc > 1:67508/1‑150 (MQ=255)
ttCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCcac > 2:560268/1‑151 (MQ=255)
ttCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCcac > 4:444572/1‑151 (MQ=255)
ttCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCcac > 3:181675/1‑151 (MQ=255)
cATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACAt > 2:526543/1‑151 (MQ=255)
cATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACAt > 1:837451/1‑151 (MQ=255)
cccTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGAt > 1:1061454/1‑151 (MQ=255)
cgcgCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGt > 2:1278163/1‑151 (MQ=255)
gcgctggcgctgAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCggg > 2:574545/1‑149 (MQ=255)
gcgctggcgctgAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGt > 1:18309/1‑150 (MQ=255)
ggcgctgAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTaaaa < 1:327290/149‑1 (MQ=255)
ggcgctgAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACg > 3:104344/1‑151 (MQ=255)
gcgctgAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACgg > 2:820138/1‑151 (MQ=255)
gctgAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAGCGGTg < 2:157342/151‑1 (MQ=255)
tgAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTgg > 4:19312/1‑150 (MQ=255)
gAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGa < 1:779695/150‑1 (MQ=255)
aaaaCTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAgg > 3:344685/1‑151 (MQ=255)
aaCTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGtt < 4:181677/151‑1 (MQ=255)
ggCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTAt < 1:134337/149‑1 (MQ=255)
ggCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATcc > 1:436377/1‑151 (MQ=255)
ggCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATcc < 2:333255/151‑1 (MQ=255)
cTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCgg > 1:654928/1‑151 (MQ=255)
cTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCg < 2:535699/150‑1 (MQ=255)
aagaagTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCAc < 2:286835/151‑1 (MQ=255)
gaagTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCt > 2:930375/1‑151 (MQ=255)
gaagTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCt < 2:1098676/151‑1 (MQ=255)
tgtgGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAAc > 2:970641/1‑151 (MQ=255)
tgtgGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAAc > 1:1186910/1‑151 (MQ=255)
gtgGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAAcg < 1:758877/151‑1 (MQ=255)
tgGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAAcgc > 4:246383/1‑151 (MQ=255)
ggTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAAcgcg < 3:352171/151‑1 (MQ=255)
ggTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAAcgcg < 3:37962/151‑1 (MQ=255)
ttttGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAAcgcgcg > 2:981833/1‑151 (MQ=255)
ttttGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAAcgcgcg > 1:230036/1‑151 (MQ=255)
ttttGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAAcgcgcg > 3:235592/1‑151 (MQ=255)
ttttGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAAcgcg < 2:509299/149‑1 (MQ=255)
tttGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAAcgcgcg < 4:443791/150‑1 (MQ=255)
ttGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCgg < 3:347746/150‑1 (MQ=255)
ttGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGt > 2:563210/1‑151 (MQ=255)
tGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTg > 1:594209/1‑151 (MQ=255)
tAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCt > 2:121083/1‑151 (MQ=255)
tAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCt > 3:227703/1‑151 (MQ=255)
aGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTg < 4:115499/151‑1 (MQ=255)
gATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGa < 2:643327/151‑1 (MQ=255)
atatCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGAt < 1:479608/151‑1 (MQ=255)
ccGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTgc < 2:543578/150‑1 (MQ=255)
cGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTgcgc > 2:755509/1‑151 (MQ=255)
cGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTgcgc > 1:1090704/1‑151 (MQ=255)
aTTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTgcgcgc > 1:351647/1‑150 (MQ=255)
aTTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGGTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTgcgcgc > 3:69270/1‑150 (MQ=255)
ttGTGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGCTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTgcgcgc > 2:1217508/1‑149 (MQ=255)
ttGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCa > 2:1176562/1‑150 (MQ=255)
gCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCaa < 2:599604/149‑1 (MQ=255)
cGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGcc > 2:1253434/1‑151 (MQ=255)
gATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGt > 2:1280370/1‑151 (MQ=255)
aTGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGt > 2:636643/1‑150 (MQ=255)
tgAGCGTTACCCCCACAGAGAACCAGGGACGCACCGAATGTATGGTTACCGAATCGCCGGCGGATTTCCCCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGAAAGGTTATCCGGCACCTAACCGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTaaa < 1:982026/150‑1 (MQ=255)
aGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGt > 1:486735/1‑151 (MQ=255)
gCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTCCCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGTTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAg < 3:81692/148‑1 (MQ=255)
gCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGt < 3:313173/150‑1 (MQ=255)
gTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTg > 1:1278743/1‑151 (MQ=255)
caccacAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTAtt < 4:283250/151‑1 (MQ=255)
accacAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTAtt > 1:854656/1‑150 (MQ=255)
ccacAGAAGAGCAGCGACGCCCCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTCCCTCGACCCACATGTTCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTAc < 1:996367/151‑1 (MQ=255)
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agaagaGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGc < 2:547757/150‑1 (MQ=255)
agaagaGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGc < 1:421441/150‑1 (MQ=255)
aagaGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCgg > 2:101923/1‑151 (MQ=255)
agagCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGACAGGTATTACTGCCg > 3:276833/1‑149 (MQ=255)
agcagcGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATg < 1:721568/151‑1 (MQ=255)
gcagcGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATg < 4:113202/150‑1 (MQ=255)
cagcGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATgcg < 4:39619/151‑1 (MQ=255)
agcGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATgcg < 1:970838/150‑1 (MQ=255)
gcgcCGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGTTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATgcgg < 3:103784/150‑1 (MQ=255)
gACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATgcggcg < 2:486649/150‑1 (MQ=255)
gACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGAGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGCATTACTGCCGGATgcggcg > 2:1000277/1‑150 (MQ=255)
cACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCTCCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATGCGGCGTGaa < 2:42783/150‑1 (MQ=255)
tggatggTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTAt > 1:1158157/1‑151 (MQ=255)
ggatggTTCCCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGACCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCCCCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTAt < 1:246827/150‑1 (MQ=255)
tggTTACCGAATCGCCGGCCGATTTCCCCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCg < 1:941649/150‑1 (MQ=255)
ttcccgatgcGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCgg < 1:95157/139‑1 (MQ=255)
aCCGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTAc > 2:1005099/1‑151 (MQ=255)
ccGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACa < 1:684833/151‑1 (MQ=255)
ccGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTACCCGGCACCAAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACa < 2:241069/151‑1 (MQ=255)
cGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACa > 3:101362/1‑150 (MQ=255)
cGAATCGCCGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACa > 2:201350/1‑150 (MQ=255)
cGAATCGCCGGCCGATTTCCCCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACaa < 2:1124384/151‑1 (MQ=255)
|
CAAATGCGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCTGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAA > NC_000913/1954174‑1954464
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
