Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F50 I1 R1
|
121 |
119.5 |
3777739 |
97.6% |
3687073 |
150.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,646,854 |
C→T |
intergenic (+117/+320) |
flxA → / ← intK |
Qin prophage; uncharacterized protein/pseudogene, integrase fragment, Qin prophage;Phage or Prophage Related |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,646,854 | 0 | C | T | 100.0%
| 362.4
/ NA
| 91 | intergenic (+117/+320) | flxA/intK | Qin prophage; uncharacterized protein/pseudogene, integrase fragment, Qin prophage;Phage or Prophage Related |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (51/40); total (51/40) |
ATACCGCTGGCACCATTGATATTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAG > NC_000913/1646706‑1647000
|
aTACCGCTGGCACCATTGATATTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGc < 1:89153/151‑1 (MQ=255)
aTACCGCTGGCACCATTGATATTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGc > 3:206430/1‑151 (MQ=255)
tACCGCTGGCACCATTGATATTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGc > 2:827892/1‑150 (MQ=255)
tACCGCTGGCACCATT‑ATATTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCAc > 2:551679/1‑151 (MQ=255)
aCCGCTGGCACCATTGATATTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCa < 4:259378/150‑1 (MQ=255)
gCTGGCACCATTGATATTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTcc > 4:463944/1‑151 (MQ=255)
gCTGGCACCATTGATATTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTcc > 2:1208579/1‑151 (MQ=255)
gCACCATTGATATTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAAt < 3:42656/151‑1 (MQ=255)
cACCATTGATATTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAAtt < 3:218825/151‑1 (MQ=255)
cACCATTGATATTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAAtt > 3:1227368/1‑151 (MQ=255)
tGATATTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCt > 3:872622/1‑150 (MQ=255)
gATATTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTAt < 4:192539/151‑1 (MQ=255)
gATATTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTAt < 3:555594/151‑1 (MQ=255)
atatTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTAtt > 3:889187/1‑151 (MQ=255)
atatTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTAtt > 2:1277948/1‑151 (MQ=255)
tatTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTAttt > 2:153611/1‑151 (MQ=255)
atTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTAttt > 3:816637/1‑150 (MQ=255)
cTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGcc > 2:1317841/1‑150 (MQ=255)
aaGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACg < 1:225631/151‑1 (MQ=255)
gTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAg < 3:740706/151‑1 (MQ=255)
cAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGttt > 3:1405515/1‑150 (MQ=255)
cAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTa < 4:342126/151‑1 (MQ=255)
gTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGa < 3:874104/151‑1 (MQ=255)
aTTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACa < 2:1343125/151‑1 (MQ=255)
gtgGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAAc < 4:359051/150‑1 (MQ=255)
cATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGAt < 3:1140442/149‑1 (MQ=255)
cATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCa < 2:806035/151‑1 (MQ=255)
ggCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTa > 2:361890/1‑150 (MQ=255)
tttCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTg < 3:1297789/150‑1 (MQ=255)
tttCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTg < 3:502099/150‑1 (MQ=255)
tCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCa < 1:11309/150‑1 (MQ=255)
tCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTAttt > 2:480193/1‑151 (MQ=255)
cAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTc > 3:870306/1‑151 (MQ=255)
aGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCt > 3:365719/1‑151 (MQ=255)
aGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCt > 3:257987/1‑151 (MQ=255)
aGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCt < 2:889150/151‑1 (MQ=255)
gCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTg < 2:247464/151‑1 (MQ=255)
ccTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCTCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGt > 4:309568/1‑151 (MQ=255)
cTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGt > 2:86264/1‑150 (MQ=255)
tttCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAg < 2:60784/150‑1 (MQ=255)
ttCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTc > 3:121962/1‑151 (MQ=255)
ttCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTc > 2:475009/1‑151 (MQ=255)
tCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTc > 2:93913/1‑150 (MQ=255)
tCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTc > 3:206962/1‑150 (MQ=255)
tttAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACt > 3:114736/1‑151 (MQ=255)
ttAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCa < 3:1362384/148‑1 (MQ=255)
tAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACttt > 3:577069/1‑151 (MQ=255)
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aGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTtgt > 1:391197/1‑151 (MQ=255)
cATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTggg > 3:1034099/1‑151 (MQ=255)
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tattatCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTgggg > 4:428812/1‑150 (MQ=255)
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atCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAg < 3:790792/150‑1 (MQ=255)
atCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGt > 2:200203/1‑151 (MQ=255)
cTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTcc > 1:343623/1‑151 (MQ=255)
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tGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCcac < 2:206401/150‑1 (MQ=255)
gTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCcaca < 2:645939/150‑1 (MQ=255)
gTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCcaca < 3:480228/150‑1 (MQ=255)
tATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACaa > 4:350242/1‑150 (MQ=255)
aTCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACaaaa < 2:357028/151‑1 (MQ=255)
aTCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACaaa > 1:380039/1‑150 (MQ=255)
aTCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACaaa > 2:334854/1‑150 (MQ=255)
aTCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACaaa > 2:358324/1‑150 (MQ=255)
cATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACt > 3:1083303/1‑151 (MQ=255)
cATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACt < 2:206933/151‑1 (MQ=255)
ttCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGcc > 3:1298265/1‑151 (MQ=255)
tGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAAc > 2:678288/1‑151 (MQ=255)
tGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAAc > 2:1186935/1‑151 (MQ=255)
tAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAAtt > 4:77783/1‑90 (MQ=255)
tAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAAtt < 1:77783/90‑1 (MQ=255)
aGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTcc > 2:578565/1‑151 (MQ=255)
aGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTcc < 2:816603/151‑1 (MQ=255)
tAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGct > 2:1282955/1‑151 (MQ=255)
tAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGct > 2:960767/1‑151 (MQ=255)
tAACATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGc < 2:1405444/150‑1 (MQ=255)
aaCATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGctt < 2:872587/151‑1 (MQ=255)
aaCATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGct < 3:1317912/150‑1 (MQ=255)
aCATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGcttc < 3:1208640/151‑1 (MQ=255)
aCATTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGcttc > 1:368292/1‑151 (MQ=255)
aTTACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGcttctt < 2:716708/151‑1 (MQ=255)
ttACAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTg > 4:323402/1‑151 (MQ=255)
aCAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGct < 3:904630/151‑1 (MQ=255)
cAAGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGctc < 2:121947/151‑1 (MQ=255)
aaGATATAAGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGctct < 3:864798/151‑1 (MQ=255)
aGTAATGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGAc > 2:902954/1‑151 (MQ=255)
aaTGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACAtt > 2:1221782/1‑151 (MQ=255)
aaTGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACAtt > 4:54507/1‑151 (MQ=255)
aaTGGATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACAt < 3:781152/150‑1 (MQ=255)
ggATGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAg < 3:551710/150‑1 (MQ=255)
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ATACCGCTGGCACCATTGATATTTACGTCTAAGTGACAGCCGTATTGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAG > NC_000913/1646706‑1647000
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
