Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I1 R1
|
144 |
141.8 |
4677362 |
93.6% |
4378010 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,602,739 |
A→G |
T308A (ACC→GCC) |
hyfB → |
hydrogenase 4, membrane subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,602,739 | 0 | A | G | 99.1%
| 412.1
/ ‑6.4
| 111 | T308A (ACC→GCC) | hyfB | hydrogenase 4, membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (62/47); total (62/49) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.36e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
CCTGAAAGTAGCGATGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTACCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCAAAGGGCTGCTATTT > NC_000913/2602591‑2602885
|
ccTGAAAGTAGCGATGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGcc > 3:152506/1‑151 (MQ=255)
tGAAAGTAGCGATGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCg > 1:1694776/1‑150 (MQ=255)
aaGTAGCGATGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCg > 2:96336/1‑150 (MQ=255)
aaGTAGCGATGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACCGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCg > 1:1057907/1‑150 (MQ=255)
aGTAGCGATGGATCTGCTGGCGCACACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGGGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCg > 2:41718/1‑149 (MQ=255)
gTAGCGATGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGaaa < 1:179275/151‑1 (MQ=255)
tAGCGATGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGaaa > 1:475321/1‑150 (MQ=255)
cGATGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGt < 1:677050/151‑1 (MQ=255)
gATGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACg > 2:147181/1‑149 (MQ=255)
aTGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCg < 2:1650864/151‑1 (MQ=255)
ggATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGc < 3:42459/151‑1 (MQ=255)
gATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGc > 2:1198470/1‑150 (MQ=255)
aTCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCat > 2:399023/1‑151 (MQ=255)
aTCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCat > 1:469724/1‑151 (MQ=255)
aTCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCat > 1:1078439/1‑151 (MQ=255)
tgctgGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGAGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGGCGAAAACGGCGGCatta > 4:366746/1‑150 (MQ=255)
gctgGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCattatt > 1:1168437/1‑151 (MQ=255)
gctgGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCattat < 2:918574/150‑1 (MQ=255)
gctgGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCatt < 1:511793/148‑1 (MQ=255)
ggCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTAtttt < 2:32020/150‑1 (MQ=255)
ggCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTAtttt < 1:183779/150‑1 (MQ=255)
gcAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTg < 2:1386594/151‑1 (MQ=255)
cAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTgg < 2:1302962/151‑1 (MQ=255)
aaaCGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGc > 2:1468279/1‑151 (MQ=255)
aaaCGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGc > 2:763777/1‑151 (MQ=255)
aaCGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCa < 2:1295932/151‑1 (MQ=255)
gggTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGt < 3:355337/150‑1 (MQ=255)
ggTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCg < 1:3709/151‑1 (MQ=255)
ggTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCg < 1:1144124/151‑1 (MQ=255)
gTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCgg > 4:206799/1‑151 (MQ=255)
gTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCgg > 2:614129/1‑151 (MQ=255)
tttGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCgg > 2:1373455/1‑150 (MQ=255)
tttGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCgg > 1:1534703/1‑150 (MQ=255)
ttGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAATCGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAACCGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGgt < 1:379135/150‑1 (MQ=255)
ttGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGgtg > 1:583067/1‑151 (MQ=255)
tGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGgtgt > 3:215696/1‑151 (MQ=255)
gCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGtgtg < 2:830011/151‑1 (MQ=255)
ccTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTgg < 2:1047288/151‑1 (MQ=255)
ccTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTgg > 1:255132/1‑151 (MQ=255)
ctctGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTgg > 1:1415629/1‑150 (MQ=255)
tgtgGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCgct > 1:37177/1‑149 (MQ=255)
ggtggGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTACTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATggt < 2:829615/151‑1 (MQ=255)
ggggCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATggtcg < 2:1587580/150‑1 (MQ=255)
gggAATTCCGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCACGGGAGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAATGGCTGATGGGCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGTATTATTTTGCTGGCAGTGGGTGTGGCGAGggtgg > 1:1612808/1‑147 (MQ=255)
tCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTc > 2:1368889/1‑150 (MQ=255)
tGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGc > 2:928948/1‑150 (MQ=255)
gATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCa < 2:168320/150‑1 (MQ=255)
ggCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGAc > 3:276843/1‑151 (MQ=255)
gCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGAcc > 2:1457363/1‑151 (MQ=255)
gATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCg > 2:475616/1‑151 (MQ=255)
tCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCgct > 1:1479477/1‑151 (MQ=255)
gcgcAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCgctgct > 2:418064/1‑151 (MQ=255)
aaTCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCAcc > 2:1229952/1‑151 (MQ=255)
aaTCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCAcc > 2:1736491/1‑151 (MQ=255)
tCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACt > 2:1111730/1‑151 (MQ=255)
ccTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGAc < 2:1457033/149‑1 (MQ=255)
ccTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACt < 2:565064/150‑1 (MQ=255)
tGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCt > 4:378148/1‑151 (MQ=255)
gggCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCt < 2:979450/150‑1 (MQ=255)
gggCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTc < 1:52298/151‑1 (MQ=255)
gggCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTc < 2:1612079/151‑1 (MQ=255)
gggCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGACCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCTATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTc < 1:1212550/151‑1 (MQ=255)
gCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCgg > 2:439761/1‑151 (MQ=255)
cGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGgc < 1:1484363/151‑1 (MQ=255)
gCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCa < 1:94029/151‑1 (MQ=255)
gCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCa < 1:1183675/151‑1 (MQ=255)
atatGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTg < 2:1065375/151‑1 (MQ=255)
gcgcTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCTGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGttt < 2:622501/150‑1 (MQ=255)
gcgcTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGttt < 2:1286364/150‑1 (MQ=255)
gcgcTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTc > 3:284323/1‑151 (MQ=255)
cgcTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCa < 2:469798/151‑1 (MQ=255)
gcTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCAt < 2:26988/151‑1 (MQ=255)
tGGCGGAACAGGATATCAAAGGGCTGCTGGCCTGGCGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCAACGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCt > 1:71485/1‑151 (MQ=255)
tGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCt > 2:569467/1‑151 (MQ=255)
aaCTGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTTCCGTCGAAATCGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGTTGTGTCGATGGTCGGTCTGTCCCTCCCCGACCCGCTGCTCACCGTGCTTCGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTct < 4:140670/150‑2 (MQ=255)
aCAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAAc < 1:136393/151‑1 (MQ=255)
cAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAAcc > 1:1070681/1‑151 (MQ=255)
aGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAAcc > 1:1539086/1‑150 (MQ=255)
aGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCa < 2:784725/151‑1 (MQ=255)
ggATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCAt < 1:1205989/151‑1 (MQ=255)
gATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATg < 1:1248604/151‑1 (MQ=255)
atCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATgcgc > 3:588208/1‑151 (MQ=255)
atCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATgcgc < 3:250512/151‑1 (MQ=255)
aaaCGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGt > 3:210804/1‑151 (MQ=255)
aaCGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGtt < 2:834129/151‑1 (MQ=255)
tggCTGCTGGCCTAGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTc > 4:368100/2‑150 (MQ=255)
ggCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGGAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGCTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGTGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTc > 1:1494159/1‑149 (MQ=255)
ggCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCaa < 2:1028628/151‑1 (MQ=255)
ggCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCa > 2:1412549/1‑150 (MQ=255)
ggCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCa > 3:584343/1‑150 (MQ=255)
tgctgGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCAAAgg > 2:17019/1‑151 (MQ=255)
gctgGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCAAAggg < 1:1652534/151‑1 (MQ=255)
tgGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCAAAGGgct > 3:528009/1‑151 (MQ=255)
gCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCAAAGGgctgc > 3:72546/1‑151 (MQ=255)
ccTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCAAAGGgctgct > 2:1131126/1‑151 (MQ=255)
cTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCAAAGGgctgct > 1:293660/1‑150 (MQ=255)
tGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCAAAGGGCTGCTAt > 1:834500/1‑151 (MQ=255)
ggAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCAAAGGGCTGCTAtt > 1:396630/1‑151 (MQ=255)
ggAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCAAAGGGCTGCTAtt > 2:189108/1‑151 (MQ=255)
gAGTACCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGCCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTTTCACTCCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTCGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCAAAGGGCTGCTAtta < 1:1142521/151‑2 (MQ=255)
|
CCTGAAAGTAGCGATGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTACCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCAAAGGGCTGCTATTT > NC_000913/2602591‑2602885
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
