Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F50 I1 R1
|
141 |
76.7 |
2402765 |
98.4% |
2364320 |
150.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,901,862 |
T→C |
intergenic (‑277/‑186) |
yoaE ← / → manX |
putative membrane protein/conserved protein/fused mannose‑specific PTS enzymes: IIA component/IIB component |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,901,862 | 0 | T | C | 100.0%
| 335.6
/ NA
| 85 | intergenic (‑277/‑186) | yoaE/manX | putative membrane protein/conserved protein/fused mannose‑specific PTS enzymes: IIA component/IIB component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (40/45); total (40/45) |
GTCGGTGACGATCCATACTGCGGGCTACTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATTTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGAATCGATTCGATTGTGGACGACGATTCAAAAATACATCTG > NC_000913/1901716‑1902009
|
gTCGGTGACGATCCATACTGCGGGCTACTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTg < 1:1197107/151‑1 (MQ=255)
cGGTGACGATCCATACTGCGGGCTACTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCt > 1:1075524/1‑151 (MQ=255)
tGACGATCCATACTGCGGGCTACTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAAt > 1:768407/1‑151 (MQ=255)
gACGATCTATACTGCGGGCTACTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATc < 2:195008/151‑1 (MQ=255)
aCGATCCATACTGCGGGCTACTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCg > 2:944964/1‑151 (MQ=255)
aTCCATACTGCGGGCTACTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGaa > 1:161502/1‑150 (MQ=255)
cATACTGCGGGCTACTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGtt < 1:706298/151‑1 (MQ=255)
cATACTGCGGGCTACTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTGTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGtt < 2:309015/151‑1 (MQ=255)
aTACTGCGGGCTACTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGtt > 1:805352/1‑150 (MQ=255)
aCTGCGGGCTACTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTaaa < 2:467910/151‑1 (MQ=255)
gCGGGCTACTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAAt < 2:720099/149‑1 (MQ=255)
ggCTACTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACgg > 2:43201/1‑151 (MQ=255)
aCTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGAt < 2:738163/149‑1 (MQ=255)
aCTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGAt < 1:471619/149‑1 (MQ=255)
aCTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATc < 2:726722/150‑1 (MQ=255)
aCTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCt < 2:525098/151‑1 (MQ=255)
aCTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCt < 1:155003/151‑1 (MQ=255)
aCTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCt > 2:14986/1‑151 (MQ=255)
tGCCCTGTACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTtc > 2:123591/1‑151 (MQ=255)
gCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCtt < 1:580767/149‑1 (MQ=255)
gCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCtt < 1:692193/149‑1 (MQ=255)
gCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCtt < 2:472881/149‑1 (MQ=255)
gCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTtca < 2:866311/151‑1 (MQ=255)
gCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTtc > 1:768776/1‑150 (MQ=255)
ataCTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATcaca < 2:1034665/151‑1 (MQ=255)
taCTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACAt > 1:115907/1‑151 (MQ=255)
tCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATaa > 1:670828/1‑150 (MQ=255)
ccATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATaaaa < 2:1074159/151‑1 (MQ=255)
tGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAaata > 1:590991/1‑150 (MQ=255)
gttgttAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAAtt < 1:836721/151‑1 (MQ=255)
tgttAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAAttt < 2:640225/150‑1 (MQ=255)
gttAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAAtttt < 1:411593/150‑1 (MQ=255)
gttAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAAtttt < 2:1195684/150‑1 (MQ=255)
tAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAAtttttt < 2:1041970/150‑1 (MQ=255)
aaaCGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTc < 1:944944/150‑1 (MQ=255)
aaaCGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCg > 1:769766/1‑151 (MQ=255)
aaaCGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCg < 1:99590/151‑1 (MQ=255)
aaCGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCg > 1:894613/1‑150 (MQ=255)
aaCGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGa < 2:945230/151‑1 (MQ=255)
aCGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGat < 1:890879/151‑1 (MQ=255)
aGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTa < 2:990249/151‑1 (MQ=255)
aGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTa < 1:308489/151‑1 (MQ=255)
aGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCGTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTa < 2:464347/151‑1 (MQ=255)
aaCATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAaaat > 1:88751/1‑150 (MQ=255)
tatCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATc > 2:529889/1‑151 (MQ=255)
atCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATcg > 2:507320/1‑151 (MQ=255)
cAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATcgc < 1:750784/150‑1 (MQ=255)
cAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATcgc < 1:555267/150‑1 (MQ=255)
gagaCGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGaa < 1:610867/151‑1 (MQ=255)
aCGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACg > 1:351380/1‑151 (MQ=255)
gCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCa < 1:327754/151‑1 (MQ=255)
ccTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGc > 2:1054457/1‑149 (MQ=255)
tttGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGtttt > 2:262414/1‑151 (MQ=255)
ttGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGttttt > 2:441732/1‑151 (MQ=255)
ttGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGtttt < 1:556373/150‑1 (MQ=255)
tGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTg > 2:369428/1‑151 (MQ=255)
ggCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTg < 1:302617/150‑1 (MQ=255)
cAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGtt > 1:1043809/1‑151 (MQ=255)
aaaGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTg < 2:969410/151‑1 (MQ=255)
aGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTa < 2:274043/151‑1 (MQ=255)
gATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGt > 2:1084545/1‑149 (MQ=255)
gATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAg < 1:934716/151‑1 (MQ=255)
aTTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGc > 1:788655/1‑151 (MQ=255)
ttACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGccc > 2:490241/1‑151 (MQ=255)
aCCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCt < 1:658577/150‑1 (MQ=255)
tccttTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCt > 2:388436/1‑151 (MQ=255)
tttGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGa > 2:1016859/1‑150 (MQ=255)
tGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGAAtc > 1:38000/1‑151 (MQ=255)
tGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGAAtc > 1:710259/1‑151 (MQ=255)
cAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGAAtcg > 1:111098/1‑150 (MQ=255)
aCGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGAAtcgattc > 2:566943/1‑151 (MQ=255)
aCAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGAATCGATTCGATTGTgg > 1:1178208/1‑150 (MQ=255)
aCAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGAATCGATTCGATTGTGga < 1:364051/151‑1 (MQ=255)
cAAGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGAATCGATTCGATTGTGgac > 2:715600/1‑151 (MQ=255)
aaGGATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGAATCGATTCGATTGTGgacg > 2:748923/1‑151 (MQ=255)
ggATATTTTACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGAATCGATTCGATTGTGgacgac < 1:397921/151‑1 (MQ=255)
tttACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGAATCGATTCGATTGTGGACGACGATTc < 1:425295/150‑1 (MQ=255)
tttACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGAATCGATTCGATTGTGGACGACGATTc > 2:77728/1‑150 (MQ=255)
ttACCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGAATCGATTCGATTGTGGACGACGATTCa < 2:884704/150‑1 (MQ=255)
aCCTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGAATCGATTCGATTGTGGACGACGATTCaaaa < 2:597705/151‑1 (MQ=255)
ccTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGAATCGATTCGATTGTGGACGACGATTCaaaa > 1:854849/1‑150 (MQ=255)
ccTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGCTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGAATCGATTCGATTGTGGACGACGATTCaaaa > 1:254477/1‑150 (MQ=255)
cTTTCGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTAATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTATAGGTTGTAGCCCTTATCTGAATCGATTCGATTGTGGACGACGATTCaa < 2:1074461/147‑1 (MQ=255)
cGAAATCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGAATCGATTCGATTGTGGACGACGATTCAAAAATACAt > 2:760661/1‑151 (MQ=255)
aaTCTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGAATCGATTCGATTGTGGACGACGATTCAAAAATACATCTg > 1:164554/1‑151 (MQ=255)
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GTCGGTGACGATCCATACTGCGGGCTACTGCCCTATACTCCATGGTTGTTAAACGGGAGTTAAACATATCAGAGACGCCTCTGATTTGGCAAAGATTTACCTTCCTTTGCAAACGAATGTGACAAGGATATTTTACCTTTCGAAATTTCTGCTAATCGAAAGTTAAATTACGGATCTTCATCACATAAAATAATTTTTTCGATATCTAAAATAAATCGCGAAACGCAGGGGTTTTTGGTTGTAGCCCTTATCTGAATCGATTCGATTGTGGACGACGATTCAAAAATACATCTG > NC_000913/1901716‑1902009
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
