Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I2 R1
|
121 |
82.0 |
2593086 |
97.7% |
2533445 |
150.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
755,804 |
A→G |
D82G (GAC→GGC) |
sdhD → |
succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 755,804 | 0 | A | G | 98.6%
| 243.9
/ ‑3.8
| 71 | D82G (GAC→GGC) | sdhD | succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (35/35); total (35/36) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.96e-01 |
GTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAATTTGATGCAGTTGTGATTGGTGCC > NC_000913/755663‑755951
|
gTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTa > 1:936865/1‑150 (MQ=255)
tCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTGCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCGCCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAAcc < 2:1061957/148‑1 (MQ=255)
cGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTg < 2:1129074/151‑1 (MQ=255)
gCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGCCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGCGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATACCTGGATCGGCATGTGGCAGTTGTTGACCGGCTACGTTAAACAGCTg > 1:698556/1‑150 (MQ=255)
tACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGc > 1:97443/1‑150 (MQ=255)
aCCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGc < 2:54918/149‑1 (MQ=255)
aCCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCt < 1:1046005/150‑1 (MQ=255)
ccAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCttt > 2:873395/1‑151 (MQ=255)
cAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTg > 1:1177959/1‑151 (MQ=255)
aGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTgc < 2:349511/151‑1 (MQ=255)
gTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTgcg < 2:249860/151‑1 (MQ=255)
gCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCt < 1:142284/151‑1 (MQ=255)
cGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCt > 1:740/1‑150 (MQ=255)
cGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTg < 2:338301/151‑1 (MQ=255)
aGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGAt < 2:160266/151‑1 (MQ=255)
gCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGAtg > 2:464023/1‑151 (MQ=255)
gCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGAtg < 1:619520/151‑1 (MQ=255)
gCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGAtg > 2:773452/1‑151 (MQ=255)
atGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAAc < 2:1163077/150‑1 (MQ=255)
aaGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGt < 2:245113/151‑1 (MQ=255)
tGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTg > 2:280410/1‑151 (MQ=255)
ggATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGAtt < 1:550967/149‑1 (MQ=255)
cGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGtt < 2:508131/151‑1 (MQ=255)
ttcttcGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCa < 1:380990/150‑1 (MQ=255)
ccTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTggtggt > 2:470976/1‑151 (MQ=255)
ccTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTggtggt < 1:656670/151‑1 (MQ=255)
ctctGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGtt > 2:517128/1‑151 (MQ=255)
ctGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGttt > 2:995447/1‑150 (MQ=255)
ctGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGttt > 1:991603/1‑150 (MQ=255)
gCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTa < 2:225617/149‑1 (MQ=255)
gCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACg > 1:1209049/1‑151 (MQ=255)
cACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGAtt < 2:1266959/151‑1 (MQ=255)
aaGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATgg > 2:511649/1‑151 (MQ=255)
aGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGTTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGa < 1:998326/151‑1 (MQ=255)
tgtTCACCCTGCTGGCGCTGTGTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGTTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTTGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGAtt > 1:73510/1‑151 (MQ=255)
cACCCTGCTGGAGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTAGtt < 2:517358/151‑1 (MQ=255)
ccTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtg < 2:845881/151‑1 (MQ=255)
ctgctgGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtgg > 1:612949/1‑151 (MQ=255)
gctgGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtggtg > 2:384083/1‑151 (MQ=255)
ctgGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtggtgt > 2:578127/1‑151 (MQ=255)
tgGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtggtgtg > 1:423638/1‑151 (MQ=255)
tgGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgcggtgtg > 2:162410/1‑151 (MQ=255)
ggCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtggtgtgg < 2:756390/151‑1 (MQ=255)
ggCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtggtgtgg < 1:785040/151‑1 (MQ=255)
tGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGgtgt > 1:599714/1‑151 (MQ=255)
tGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGgtg > 1:1217555/1‑150 (MQ=255)
gTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGgtgtg > 2:1143446/1‑151 (MQ=255)
gTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGgtgt < 2:279699/150‑1 (MQ=255)
ttttCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGgtgtg > 1:724870/1‑150 (MQ=255)
tttCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGgtgtgt < 2:130806/150‑1 (MQ=255)
cTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGtgatg > 2:1156525/1‑151 (MQ=255)
aTCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGtgatga < 1:661925/150‑1 (MQ=255)
aTCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGtgatga < 2:155022/150‑1 (MQ=255)
aTCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGtgatg < 1:730466/149‑1 (MQ=255)
aTCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGtgat < 2:698592/148‑1 (MQ=255)
aTCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGtgat < 2:974267/148‑1 (MQ=255)
gATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGc > 1:93665/1‑151 (MQ=255)
aTCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGcc > 1:378179/1‑151 (MQ=255)
tCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGcc > 2:866287/1‑150 (MQ=255)
aTGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTc > 2:142820/1‑151 (MQ=255)
gCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCa < 1:49018/150‑1 (MQ=255)
ccTGGATCTGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCa < 1:530584/149‑1 (MQ=255)
ccTGGAGCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTc > 1:178851/1‑148 (MQ=255)
ggATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGaa < 1:745566/151‑1 (MQ=255)
tCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAAttt > 2:313390/1‑151 (MQ=255)
ggCATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAATTTGa < 2:613336/151‑1 (MQ=255)
cATGTGGCAGGTGTTGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAATTTGATg < 2:984671/151‑1 (MQ=255)
tGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAATTTGATGCAGTTGTGATTGGt > 2:630578/1‑151 (MQ=255)
tGACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAATTTGATGCAGTTGTGATTGGt > 1:263784/1‑151 (MQ=255)
gACCGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAATTTGATGCAGTTGTGATTGGTg > 2:1178723/1‑151 (MQ=255)
ccGGCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAATTTGATGCAGTTGTGATTGGTGcc < 2:336371/151‑1 (MQ=255)
|
GTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAATTTGATGCAGTTGTGATTGGTGCC > NC_000913/755663‑755951
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
