Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
4926 |
296.4 |
4517418 |
96.8% |
4372860 |
264.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
755,224 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 755,224 | 0 | A | T | 99.6%
| 541.9
/ ‑6.0
| 231 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (107/122); minor base C (1/0); total (109/122) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.70e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 |
| * | CP042583 | 755,225 | 0 | G | C | 98.7%
| 533.4
/ NA
| 231 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/1); new base C (107/121); total (109/122) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.03e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 755,226 | 0 | C | G | 98.7%
| 541.6
/ ‑5.3
| 231 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); new base G (107/121); total (109/122) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.03e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
TGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGAGCGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TAGCCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTGAACGGCGGGCGAAAGAGGGCGATTTTCGTTCCAATTTGCA > CP042583/754947‑755504
|||
tGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑gatga < 1:1739885/288‑1 (MQ=255)
tGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAg > 1:239984/1‑285 (MQ=255)
tGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAg < 2:239984/285‑1 (MQ=255)
cTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GCTGATACCAGCGATTTAATCg > 1:903480/1‑289 (MQ=255)
ttCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGAc < 1:1374851/289‑1 (MQ=255)
gtCTTTCTCCATGACCATAAATCCTGCGGCGTCTTCTCTTACCTACAAAGGCCGAAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCGGCGTATTGGCACCGCCATTACCTGTTATGGGACGGCGGCACTGGGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGAc < 2:1186428/288‑1 (MQ=255)
gCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGt < 1:597691/289‑1 (MQ=255)
gCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGt < 1:1806900/289‑1 (MQ=255)
gCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGt < 1:876765/289‑1 (MQ=255)
ccATACATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTGGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATc < 1:726084/271‑1 (MQ=255)
aTAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTgcgc < 2:581304/289‑1 (MQ=255)
ctCCTGAGGCGTCTTTTATTCACTACAAGGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAAGCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCt < 2:1415025/288‑1 (MQ=255)
tGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCtggtg > 1:2132302/1‑289 (MQ=255)
gcggcgTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGAc < 1:85513/264‑1 (MQ=255)
cggcgTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCGggtggt > 1:788143/1‑289 (MQ=255)
cggcgTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATGTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCtggtgg > 1:542692/1‑288 (MQ=255)
tcttctATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGAc < 1:1882036/258‑1 (MQ=255)
cACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAg < 2:1536286/289‑1 (MQ=255)
aCTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTTACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCCCGGGCATTGCGCC‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAACCGACATTGTCGGTGGTTCGCCCCTGGTGGTCAAGTTTGTTGAAg > 2:2059132/1‑288 (MQ=255)
tACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAg > 2:1716861/1‑233 (MQ=255)
tACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAg < 1:1716861/233‑1 (MQ=255)
tACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTACTCGACACGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGGCAAGTTGGTGGAAGGc > 2:2217932/1‑288 (MQ=255)
tACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTTGTCAAGGTGGTTGCAGGc > 2:300437/1‑288 (MQ=255)
cAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACg < 1:1192851/289‑1 (MQ=255)
aaGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCGCGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCa < 1:835845/289‑1 (MQ=255)
aaGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCa < 1:2149277/289‑1 (MQ=255)
aGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAg > 2:1066614/1‑289 (MQ=255)
ccGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑T‑GCGCGCGATGCTACCAGCGACTTAATCGAAATGGTCGGTGTGGCGCCGCTCGTGGGCAAGGTGGTTGAAGACACGACGGGa > 2:1363817/1‑289 (MQ=255)
gCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAAt > 1:2227761/1‑289 (MQ=255)
agtgaccctgtgttGACGCGGTGATCCAGCGCATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGAGGGCGGCAGTGCTCACGTTCGAGACGCTGGGGAGCTATCCTCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCTTGACAAATTGAGTTCCATGTAACTGCGGGGCGGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTGACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAAt < 2:2073282/274‑1 (MQ=255)
aCCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGcgtc > 1:621180/1‑289 (MQ=255)
aCCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGcgtc > 1:1291960/1‑289 (MQ=255)
ccATTTTGCGTCAGTGTTCCGCGGTATTGGAACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGGGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTg < 2:978518/289‑1 (MQ=255)
cATTTTGACGCGGGGATCCCGCGCATTGGCCCCTCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGc < 2:2132302/289‑1 (MQ=255)
tttGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCCAGGTGGTTGAAGGCACGCAGGGCATTGGCGGCGTGCttg > 2:398100/1‑287 (MQ=255)
tttGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCGGGGAATGGGCGTCGTGCTgg > 2:883895/1‑289 (MQ=255)
ttGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGc < 2:1008666/289‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGga < 1:1910049/288‑1 (MQ=255)
gCATTGATCCGCGGTATTGGCACGGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGGGCGAGTTCGCGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGgaga < 2:954601/289‑1 (MQ=255)
aGTGATCCCGCGTATTGGCCCCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGCGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGCTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGTGCCTCGACCTGCCTGTCCCGGGCATGGCTCACTCGCCC‑‑GAGGATACCAGCGATTTAATCTACCAGGCTCGTGGCGCGCCGCTGGTGGTCAAGCTAGGTGAAGGCGCGCAGGGCATCGGCGTGGTGCTGCCGgagtcc > 2:2009567/1‑286 (MQ=255)
aTCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAgg > 1:1003205/1‑251 (MQ=255)
ccGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTTCCTGTCACGGGCATTGCCCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCGGCTGGCCACGTCGGTTGAAGTCAAGCAGGGAAGTGGCGTCGTGCTGGGGGAGAcgcgcccgt > 2:1643539/1‑284 (MQ=255)
cgTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCACTGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCACCTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGcggaccagggg > 1:1069035/1‑279 (MQ=255)
cACGGCCTTTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGGGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTGGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGc < 2:864586/289‑1 (MQ=255)
cccGCCATTCCCTTTTATGGGCCGGCGGCACTGCGCCAGTTCGGGAGGCTGGGGAGCCATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGCCAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGc < 2:1314340/287‑1 (MQ=255)
aCCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCg > 1:14042/1‑289 (MQ=255)
gtacccTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCGGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCGCAATTAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGGCAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTg < 2:498606/285‑1 (MQ=255)
tACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGAc > 1:1772694/1‑289 (MQ=255)
tttATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGGGATTGACGCttt > 1:1253897/1‑289 (MQ=255)
atggagcggcggCACTGCGCCCGGTCGGGATGCTGGGGGGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCcg < 2:1394967/283‑1 (MQ=255)
acgggCCGGGGGCCCTGCGCCAGTGCGCGATGGTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCcg < 2:542692/287‑1 (MQ=255)
gACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGcgt > 1:1313638/1‑234 (MQ=255)
cggcggCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GAGGATACCAGCGATTTAATCGACATGGGCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGGAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCCTCAGGCGGCGGGACGCGTGATTGCCGTCTTCcgcgct > 2:382752/1‑285 (MQ=255)
ggcggcACTGCGCCAGTTAGAGATGCTGGGGAGCTATCCACTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGAGTGACAAATTGCGTTCCATGCGACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGTA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAAATGACATGGTCGGTGGTGCGACGCTGGTGGTCAAGTCGGTTGTAGGCACGCAg < 1:2013634/220‑1 (MQ=255)
ggcACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGaa < 1:178593/288‑1 (MQ=255)
gcACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCGTTCCGCGGt > 2:1933567/1‑282 (MQ=255)
aCTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAAcgc < 1:382752/288‑1 (MQ=255)
tGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATc > 2:757918/1‑161 (MQ=255)
tGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGc < 2:1870335/257‑1 (MQ=255)
tGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCa < 2:455367/289‑1 (MQ=255)
cAGTTCGAGTTGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTc < 1:1933936/289‑1 (MQ=255)
cGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCACGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAATCGTGAGTTACGCTTTCCGCCGGCTGAACGCGCACATTCGGGt > 2:1502224/1‑288 (MQ=255)
gaggTGCTGGGGGGCTATCCGCCCAATGAGTCGGTCGCCCTTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTg < 2:2227761/288‑1 (MQ=255)
agaTGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTg < 1:1361857/287‑1 (MQ=255)
tgttGGGGAGCATTCCGTTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGGGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGGGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGa < 2:1772694/286‑1 (MQ=255)
tGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGa < 1:1330539/289‑1 (MQ=255)
tGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGa < 1:1066614/289‑1 (MQ=255)
gCTGGGGTGTTAGCTGCTCACTGGGTCGGTCGCCGTTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGGCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGa < 2:1253897/288‑1 (MQ=255)
gCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGaa < 2:621180/289‑1 (MQ=255)
gCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGGCGGTCGCCGTTGGCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGa < 2:1291960/288‑1 (MQ=255)
gacaggAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGa < 1:25386/283‑1 (MQ=255)
tCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAagag > 1:678377/1‑289 (MQ=255)
tCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCTGAAAGCGTGGTTGCCGCTTGCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCGGGGGCCGGGATAAATCAAAGCgggcct > 2:25386/1‑285 (MQ=255)
tCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCa < 1:1410629/289‑1 (MQ=255)
atgagtcggTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAgg < 1:2093816/281‑1 (MQ=255)
agtcgggcGCCATTGCCCGGGCGGGGGACAAATTGCGTTCCATGAAACGGCTGGCGCGTAAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGGGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGt < 2:870615/281‑1 (MQ=255)
tcggTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGa > 2:1828120/4‑263 (MQ=255)
ggTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGat > 2:821186/2‑289 (MQ=255)
cGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATc < 1:184415/289‑1 (MQ=255)
cagtGCGCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCg < 1:475162/285‑1 (MQ=255)
cATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCg < 2:1126012/288‑1 (MQ=255)
ttGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAAcgc > 1:1616885/1‑235 (MQ=255)
gcgcGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGgttg > 1:451386/1‑289 (MQ=255)
gcgcGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGgttg > 1:1572453/1‑289 (MQ=255)
gcgcGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATACGCGCTGTCTGgttg > 1:1102208/1‑289 (MQ=255)
ggggggcAAGTTGCGTACCATGCAAGTGCTGGCGCGTCAGGGCATGGACCGGCCAGTCACGGGCATTGCGAA‑TTGGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAAGCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGgttgt < 2:934785/282‑1 (MQ=255)
gggTGACCAAGTGCGTTCCAGGCAACGACGGGCGCGTCAGGGCATCGGCCTGCCTGTCACGGGCAGTGGGCG‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGGGCCGCGGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGGGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGgttgt < 2:1684395/286‑1 (MQ=255)
tGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTc > 1:1638871/1‑230 (MQ=255)
ttCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGt > 2:1785491/1‑93 (MQ=255)
tGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGTGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGt > 1:839164/1‑246 (MQ=255)
tGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGTGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGt < 2:839164/246‑1 (MQ=255)
tGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGc > 1:1169313/1‑289 (MQ=255)
ctgctgGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTg > 2:1514779/1‑289 (MQ=255)
ctgGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTTCGATTGaa > 1:967007/1‑288 (MQ=255)
cGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGGGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCGGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTGAACGGCGGGCGAAAGGGGGc > 1:1477218/1‑289 (MQ=255)
aCCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTGAACGGCGGGCGAAAGAGGGCGa > 1:131911/1‑289 (MQ=255)
tgcctgTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTGAACGGCGGGCGAAAGAGGGCGAttt < 2:1622305/289‑1 (MQ=255)
tGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGt > 2:188821/1‑214 (MQ=255)
tGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTGAACGGCGGGCGAAAGAGGGGGATTTTCGTTCCAATTTGCa > 1:1129235/1‑288 (MQ=255)
tGCGCA‑TTCGCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTGAACGGCGGGCGAAAGAGGGCGATTTTCGTTCCAATTTGCa > 1:517808/1‑288 (MQ=255)
|||
TGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGAGCGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TAGCCCG‑GATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTGAACGGCGGGCGAAAGAGGGCGATTTTCGTTCCAATTTGCA > CP042583/754947‑755504
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A