Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
4926 |
296.4 |
4517418 |
96.8% |
4372860 |
264.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
828,582 |
3 bp→TCA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 828,582 | 0 | A | T | 99.7%
| 691.3
/ NA
| 291 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (142/147); minor base C (1/0); total (143/148) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.93e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
| * | CP042583 | 828,583 | 0 | G | C | 99.7%
| 694.0
/ NA
| 291 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (142/148); minor base T (1/0); total (143/148) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.91e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 828,584 | 0 | T | A | 99.7%
| 693.8
/ NA
| 291 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (142/148); minor base C (1/0); total (143/148) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.91e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 291 total aligned reads displayed.
TGCAACTGGGAATCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCAGCTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTAAGTTTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGTGGGCAACAACTGATTATCCCCTGGCTCCACTGGCATAATCTTGAACCG > CP042583/828304‑828863
|||
tGCAACTGGGAATCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTcccc < 1:1483429/289‑1 (MQ=255)
tGCAACTGGGAATCAAACTTCGGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTcccc < 1:622977/289‑1 (MQ=255)
gCAACTGGTATTCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCCCGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCa < 1:1748814/289‑1 (MQ=255)
gCAACTGGGAATCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCa < 1:992785/289‑1 (MQ=255)
tGGGAATCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCACGGGGTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGt > 2:1256845/1‑288 (MQ=255)
tGGGAATCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTAGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGtt < 2:239007/289‑1 (MQ=255)
ggAATCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCt > 2:1965333/1‑289 (MQ=255)
ggAATCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGGTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGCTGGCAATGGCTATCATTTTCCACTTTGTTCt > 2:1931358/1‑289 (MQ=255)
aTCACCTTTCTGCTTATGCCCTTGTAATTCGTCATTTTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCTAATCTATTTGCAATTCCATTGGTGACATTTATCGCGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTAc < 2:1558864/289‑1 (MQ=255)
aTCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCCTATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTAc < 1:1499780/289‑1 (MQ=255)
aTCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTTATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTAc < 1:1007501/289‑1 (MQ=255)
gCCCGTGCAAATCGTCATCTTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACCTTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCCCCGCGATGGTTGTGCCTTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTAGGGTTTCTTGCCGACCGGCCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGTGTTAAAGCGTTTGCCGGACGGGTGGATCCACATTGCTGACTGGTGGCAATGGCTACTCTTTTGCCCAGTGTTCTTCCTGGTGGTTTGGCGATTa > 2:1508151/1‑289 (MQ=255)
tGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTcc > 2:1418631/1‑254 (MQ=255)
tGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCa < 1:938256/257‑1 (MQ=255)
tGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACg > 1:1559840/1‑288 (MQ=255)
aTCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGc > 2:2061503/1‑289 (MQ=255)
ttCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGcc < 2:1176335/289‑1 (MQ=255)
ttCATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGcc < 1:1285804/289‑1 (MQ=255)
cATGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCa > 1:760610/1‑288 (MQ=255)
tGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATGACGGTGCCGTTGATCCTCGACGCGATGGTTGGGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTGATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCa < 1:1091007/289‑1 (MQ=255)
tGGCATTAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGt > 2:1981009/1‑281 (MQ=255)
ttAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGcc < 2:530115/280‑1 (MQ=255)
ttAGTCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGcc > 1:530115/1‑280 (MQ=255)
tCTGACCTCGTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTg > 1:416514/1‑274 (MQ=255)
acctcgtttATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATgg < 1:1264349/240‑1 (MQ=255)
acctcgtttATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACg < 1:11042/250‑1 (MQ=255)
aaTCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTg < 1:1948099/274‑1 (MQ=255)
ttAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGc < 2:1876348/289‑1 (MQ=255)
ttAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTGGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGTCGAACGTTTCCCGCACTGTGTGTGGCTGGAGGTTTGCttggttgctgg > 2:1305154/1‑278 (MQ=255)
ttCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCtgtg > 1:2168458/1‑289 (MQ=255)
cTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTTCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAATGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTTGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCaa < 1:1166699/289‑1 (MQ=255)
gTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGcc < 1:1682748/236‑1 (MQ=255)
tGAAATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCTGGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAAc < 2:1689079/288‑1 (MQ=255)
gcGTTGTTTCTCTGCGCGATGGTTTGGCATTTAAGCGGGCCGTTTATCCTGGGGCCAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGc < 2:363826/288‑1 (MQ=255)
ccGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCt > 1:1423251/1‑241 (MQ=255)
tttagtcttcaccgcGATTGTTGTGCATTTGATCTGCTCTGTAATCCGTGAGAAAGGGTTTTGGTTTCTTGGCTGCCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGTCTGAAGGGTCGATCAACTTTGATGAATGTTGGCAATGGCTAGCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGTTTGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAg < 2:1265766/278‑1 (MQ=255)
ttGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATTGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTTCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAACTCTCGACCTGACGAGTGGCAg > 2:2001723/1‑288 (MQ=255)
ttGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCa > 2:685966/1‑287 (MQ=255)
ccTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTAc > 1:795418/1‑289 (MQ=255)
cgccgcGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCt < 1:2059125/249‑1 (MQ=255)
gTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGc > 1:2255577/1‑268 (MQ=255)
gTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGc < 2:2255577/268‑1 (MQ=255)
gCATTTAGGCGGTCCGTTAATCCTGTGGCAAGGGTTTTGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGGGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCa < 2:1445692/288‑1 (MQ=255)
gCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCa < 1:1928102/288‑1 (MQ=255)
gCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCa < 1:1899240/288‑1 (MQ=255)
tttAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAggg < 2:795418/289‑1 (MQ=255)
aaGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGGCGTCCATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTg > 2:309146/1‑289 (MQ=255)
aaGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGGGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTTTGGCAAAAACCCCGACCTGACGAGTGGCATCGTTACATGCTTGATGGCGGGCCAGGGCTg > 2:1365185/1‑289 (MQ=255)
cGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCt > 2:838879/1‑267 (MQ=255)
ggCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCaa < 1:2230925/288‑1 (MQ=255)
ggCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCaa < 2:2168458/288‑1 (MQ=255)
ggCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCaa < 1:2981/288‑1 (MQ=255)
gCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGt < 1:398377/248‑1 (MQ=255)
gCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGt > 2:398377/1‑248 (MQ=255)
ttAATCCTGGGGCAAGGGTTATGGTTTCTTTCCGGCCGGTCTTTGGCTTTACGTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTTGTTCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGa < 2:2197019/289‑1 (MQ=255)
ttAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGa > 1:1032095/1‑289 (MQ=255)
ggAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGa > 1:1842993/1‑289 (MQ=255)
aGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCa > 1:321732/1‑262 (MQ=255)
aGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACACCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCATGGGCTGGCCAGGGGGAGTGCCAGaatgggg > 2:57690/1‑284 (MQ=255)
aTGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGGACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGGGATAGCCATAACCGGCAAAGCg > 2:933569/1‑289 (MQ=255)
tGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGa < 1:1984178/289‑1 (MQ=255)
tCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTTCTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCGCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCAAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGATTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATtc > 1:1376248/1‑287 (MQ=255)
tCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCTACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCGAGGGCTGGCAAAGGGGATAGGCCGAAACGGCAAAGCGGTtc > 1:56322/1‑287 (MQ=255)
tCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTAc < 2:992772/229‑1 (MQ=255)
cTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATg < 1:1826718/104‑1 (MQ=255)
cTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGc > 1:1131324/1‑232 (MQ=255)
cTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGc < 2:1131324/232‑1 (MQ=255)
cGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCTAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCCACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCGAGGGCTGGGAATGGTGATAGCCGGAACCGGCAAAggagttccccaatac > 2:622088/1‑275 (MQ=255)
gACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGaca < 1:873855/289‑1 (MQ=255)
aCCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATTGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTTGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGAAAAGCGAGTCGCCATAacac > 2:720510/1‑289 (MQ=255)
aCCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATGTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTTGCAGCTGTACATTCTTGAGGCCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCATAAACGGCAAAGAGATGCTCTATTacaa > 2:429217/1‑288 (MQ=255)
tCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGa < 1:1325448/288‑1 (MQ=255)
ggCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCCCTATGACACAGGActggcc < 1:972184/289‑1 (MQ=255)
ttACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAATGGCTGGCATGGGGGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGActggcctgg > 2:2230740/1‑288 (MQ=255)
tACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAATGGCTGGCAATGGTGATAGGCAGAAACGGCAAAGCGAATCTCTATGACACAGGActggcctggc > 1:689351/1‑288 (MQ=255)
tACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGActggcctgg > 1:1976135/1‑287 (MQ=255)
tACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGAACCAGGActggcacggc > 2:63390/1‑283 (MQ=255)
tCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGCGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGACAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCCAAGCGATTCTCACAGACACAGGCATGGCCGGGCCTGagag > 2:1067463/1‑286 (MQ=255)
cTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGtt > 2:1811592/1‑78 (MQ=255)
cTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGtt < 1:1811592/78‑1 (MQ=255)
tAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGGTAGTgg > 1:1233307/1‑289 (MQ=255)
tttGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGTGGGcaacaa > 2:1832839/1‑289 (MQ=255)
ggATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTa < 2:1145584/232‑1 (MQ=255)
ggATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTa > 1:1145584/1‑232 (MQ=255)
ggATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACCCAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGGGGGCAAAAACGGATTAAccccgg > 2:481511/1‑287 (MQ=255)
cAACATTGCTGAATTTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGTGGGCAACAACTGATTATCCCCTGGCTc < 1:481511/289‑1 (MQ=255)
cATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGTGGGCAACAACTGATTATCCCCTgg > 1:708371/1‑283 (MQ=255)
cTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTAc < 1:2111713/158‑1 (MQ=255)
cTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTAc > 2:2111713/1‑158 (MQ=255)
cTGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTCACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCGCTATGACAC‑GGGCTGGCCTGGCCTGAATGGGATAGTGGGCAACAACTGATTATCCCCTGGCTCCACCGGCAt > 1:346786/1‑289 (MQ=255)
tGAATGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGTGGGCAACAACTGATTATCCCCTGGCTCCACTGGCa < 2:2130980/288‑1 (MQ=255)
tGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGTGGGCAACAACTGATTATCCCCTGGCTCCACTGGCATaa > 1:2018589/1‑287 (MQ=255)
tGTTGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGTGGGCAACAACTGATTATCCCCTGGCTCCACTGGCATaa > 2:1008180/1‑287 (MQ=255)
tGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTa < 1:1187422/212‑1 (MQ=255)
tGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGa > 2:5504/1‑222 (MQ=255)
tGGCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGGGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGTGGGCAAAAACTGATTATCCCCTGGCTCCCTCGGCCTAACCTTg > 2:1229505/1‑289 (MQ=255)
ggCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAAtgtgtgt < 2:165313/82‑1 (MQ=255)
ggCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGAc < 2:944777/129‑1 (MQ=255)
gCAATGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGTGGGCAACAACTGATTATCCCCTGGCTCCACTGGCATAATCTTGaa > 1:2136851/1‑289 (MQ=255)
aTGGCTATCATTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGTGGGCAACAACTGATTATCCCCTGGCTCCACTGGCATAATCTTGAACCg > 1:63458/1‑289 (MQ=255)
|||
TGCAACTGGGAATCACACTTCTGCTTATGCCCGTGCAAATCGTCATATTTCATGGCATTAGTCTGACCAGCTTTATTGCAAATCTATTAGCAATTCCCTTGGTGACATTTATCACGGTTCCGTTGATCCTCGCCGCGATGGTTGTGCATTTAAGCGGGCCGTTAATCCTGGAGCAAGGGTTATGGTTTCTTGCCGACCGGTCTTTGGCTTTACTTTTCTGGGGGTTAAAGAGTTTGCCGGAAGGGTGGATCAACATTGCTGAATGTTGGCAATGGCTAAGTTTTTCCCCATGGTTCTTACTGGTGGTATGGCGATTAAACGCCTGGCGAACGTTGCCAGCAATGTGTGTGGCTGGAGGCTTGCTGATGTGCTGGCCGCTGTGGCAAAAACCTCGACCTGACGAGTGGCAGCTGTACATGCTTGATGTCGGGCAAGGGCTGGCAATGGTGATAGCCAGAAACGGCAAAGCGATTCTCTATGACACAGGACTGGCCTGGCCTGAAGGGGATAGTGGGCAACAACTGATTATCCCCTGGCTCCACTGGCATAATCTTGAACCG > CP042583/828304‑828863
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
