Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
4926 |
296.4 |
4517418 |
96.8% |
4372860 |
264.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,808,128 |
3 bp→TCA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,808,128 | 0 | A | T | 100.0%
| 571.6
/ NA
| 236 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (119/117); total (119/117) |
| * | CP042583 | 1,808,129 | 0 | G | C | 100.0%
| 566.5
/ NA
| 236 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (119/117); total (119/117) |
| * | CP042583 | 1,808,130 | 0 | T | A | 100.0%
| 567.9
/ NA
| 236 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (119/117); total (119/117) |
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
GCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAACCGCGCCTTATATCTACGACGAATTGCAGGATCTCCCCTACCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCAAGTGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGAGTCCGAAAGATATGCTGAGTGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTGCGCTGGCTGACCTTTATATTTTTAAACGTGAACCGCGTTTTTTAGGGCCGCTGGTC > CP042583/1807848‑1808409
|||
cGGCCTCGATGGCTGGATGCGCTGGAAAACCGCGCCTTATTTCTACGACGAATTGCCGGATCTCCCCTACCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGtt < 2:462227/289‑1 (MQ=255)
cGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAACCGCGCCTTATATCTACGACGAATTGCAGGATCTCCCCTACCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGtt < 1:1741198/289‑1 (MQ=255)
aTCGCTGGATGAGCTGGAAAACCGCGCCTTATATCTACGACGAATTGCAGGATCTCCCCTACCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGAtt > 1:334308/1‑288 (MQ=255)
tGGATGAGCTGGAAAACCGCGCCTTATATCTACGACGAATTGCAGGATCTCCCCTACCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACg < 2:1588682/286‑1 (MQ=255)
tGGATGAGCTGGAAAACCGCGCCTTATATCTACGACGAATTGCAGGATCTCCCCTACCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACg > 1:1588682/1‑286 (MQ=255)
gCTGGAAAACCGCGCCTTATATCTACGACGAATTGCAGGATCTCCCCTACCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTc < 1:245240/288‑1 (MQ=255)
tGGAAAACCGCGCCTTATATCTACGACGAATTGCAGGATCTCCCCTACCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAAATATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGt < 1:584267/288‑1 (MQ=255)
aaaaCCGCGCCTTATATCTACGGCGAATTGCAGGATCTCCCCTACCGGCAGGGCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACg < 1:805257/288‑1 (MQ=255)
aaaaCCGCGCCTTATATCTACGACGAATTGCAGGATCTCCCCTACCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTAc > 1:892688/1‑287 (MQ=255)
aaaaCCGCGCCTTATATCTACGACGAATTGCAGGATCTCCCCTACCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACg < 1:100783/288‑1 (MQ=255)
ccGCGCCTTATATCTACGACGAATTGCAGGATCTCCCCTACCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGa > 1:1639699/1‑289 (MQ=255)
cgcCTTATATCTACGACGAATTGCAGGATCTCCCCTACCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGAtt > 1:116159/1‑288 (MQ=255)
acgacgAATTGCAGGATCTCCCCTACCGCCAGGCCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTac > 1:2129389/1‑289 (MQ=255)
aaTTGCAGGATCTCCCCTACCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCaa > 2:515531/1‑289 (MQ=255)
aTTGCAGGATCTCCCCTACCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCg < 2:936991/279‑1 (MQ=255)
aTTGCAGGATCTCCCCTACCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCaaa > 1:2068688/1‑289 (MQ=255)
ccccTACCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGa < 2:2220613/231‑1 (MQ=255)
aCCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGa > 1:313888/1‑289 (MQ=255)
ccGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGAt < 1:423452/289‑1 (MQ=255)
ccAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGAtt > 2:1039149/1‑287 (MQ=255)
ccAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTc > 1:2236148/1‑289 (MQ=255)
cAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAAAAGCAAAAAATTATCGTACTGGTGTAATTAATCAGTATGATCGCTAGCGCATTCAAGGAGCGAGTAATGCCTATAACATCTGTAAGGTAAATTAGCTATTCCTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAATATTTAATCTCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTGCGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTTGATACTAATGATTTCa < 2:1196515/289‑1 (MQ=255)
tgtgGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATc > 1:1446578/1‑289 (MQ=255)
tgCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCAccc < 2:865604/288‑1 (MQ=255)
gCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGc > 2:96405/1‑213 (MQ=255)
ggAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCCGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGtt > 2:1479178/1‑289 (MQ=255)
aaCAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGttt > 2:1857360/1‑288 (MQ=255)
aGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGa < 2:2002062/252‑1 (MQ=255)
aaTATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTga < 1:694223/289‑1 (MQ=255)
tattatCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTgagc < 1:1039149/289‑1 (MQ=255)
tattatCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTgagc < 1:1250430/289‑1 (MQ=255)
tattatCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTgagc < 1:1256583/289‑1 (MQ=255)
aattaatCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTgcg < 1:2185245/289‑1 (MQ=255)
attaatCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTgc > 1:705839/1‑287 (MQ=255)
tCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCattatt > 2:1289826/1‑241 (MQ=255)
tCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCattatt < 1:1289826/241‑1 (MQ=255)
tCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCat > 1:164746/1‑237 (MQ=255)
tCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCat > 1:1503202/1‑289 (MQ=255)
tattatCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGt < 1:1641808/201‑1 (MQ=255)
tattatCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGt > 2:1641808/1‑201 (MQ=255)
attatCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATggg < 2:705839/289‑1 (MQ=255)
cGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTc < 1:753157/289‑1 (MQ=255)
aCCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATtattat > 2:164873/1‑229 (MQ=255)
aCCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCaa > 2:2129956/1‑236 (MQ=255)
aCCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGATCGAGCATTATTTTTTTGGCTTCCTATGGGGATTCAgg > 2:1880977/1‑288 (MQ=255)
aCCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAgg > 1:1221423/1‑288 (MQ=255)
aCCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAg > 1:834994/1‑287 (MQ=255)
aCCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAg > 1:1665735/1‑287 (MQ=255)
aCCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGc < 2:892688/289‑1 (MQ=255)
cGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCaa > 2:427618/1‑234 (MQ=255)
cAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGtt < 1:1841738/289‑1 (MQ=255)
cAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGtt < 2:782123/289‑1 (MQ=255)
gCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCAACTGTGAGCGAGAATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGTTTAAGGACCAGTTTTATTCCg > 2:1841738/1‑289 (MQ=255)
cGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGt > 2:329612/1‑289 (MQ=255)
aTTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTa < 2:1923314/154‑1 (MQ=255)
aTTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTa > 1:1923314/1‑154 (MQ=255)
ataACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCaa < 1:386185/209‑1 (MQ=255)
ataACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCaa > 2:386185/1‑209 (MQ=255)
taACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCAccc < 1:433002/206‑1 (MQ=255)
taACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGGATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGaaa > 2:1829915/1‑289 (MQ=255)
taACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATg < 2:64930/250‑1 (MQ=255)
cGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGatat > 1:1937825/1‑288 (MQ=255)
cGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGatat > 2:1351422/1‑288 (MQ=255)
cGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGatat > 1:182216/1‑288 (MQ=255)
cGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGatat > 2:1646051/1‑288 (MQ=255)
cGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGatat > 1:2249910/1‑288 (MQ=255)
ggtaaggtaaATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGGGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGat < 2:438959/285‑1 (MQ=255)
ggtaaggtaaATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATg < 2:1503202/288‑1 (MQ=255)
ggtaaggtaaATGATCTATTACTGAGCGGCGATAACGAATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGatat < 2:338402/287‑1 (MQ=255)
aaggtaaATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTgt < 2:1937825/289‑2 (MQ=255)
tATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCg < 1:2143890/261‑1 (MQ=255)
tATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTa < 1:638673/254‑1 (MQ=255)
aTTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCaa < 1:1024345/184‑1 (MQ=255)
aTTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCaa > 2:1024345/1‑184 (MQ=255)
cTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTgt > 1:1899877/1‑270 (MQ=255)
aGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCCTTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGCGGTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGATGTCAGTAAGTATTCGTGAAttt > 2:1370166/1‑288 (MQ=255)
aGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTgcg > 1:1568764/1‑210 (MQ=255)
aGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTgcg < 2:1568764/210‑1 (MQ=255)
aGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATCTGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCATCTGAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAAttt > 1:2115071/1‑288 (MQ=255)
aGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAAttt > 2:2035850/1‑288 (MQ=255)
agctaTAACGCATTGCAAAGTTATAATGATCCGATGACCATGAGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCCTCAGCTATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACAAGCAAAGTATTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCAAACGTTTCCACAGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTgcc < 2:2163618/284‑1 (MQ=255)
gATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTgccgcc < 2:1221423/288‑1 (MQ=255)
gATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTgccgcc < 1:987649/288‑1 (MQ=255)
tGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTgc > 1:525031/1‑289 (MQ=255)
tGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGGGAATTTTCCGCCCGTTTCgggtc > 2:80839/1‑286 (MQ=255)
gCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTgcg < 2:2128337/289‑1 (MQ=255)
gCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTgcg < 1:96364/289‑1 (MQ=255)
tataATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAGGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTGCgctggct < 2:249175/288‑1 (MQ=255)
tataATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTGCgctggct < 1:2035850/288‑1 (MQ=255)
ccGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTGCGCTGGCTGACCTTtata > 2:1424691/1‑289 (MQ=255)
tGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTGCGCTGGCTGACCTTTATAtttt < 1:1424691/289‑1 (MQ=255)
aTGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCt > 2:568323/1‑189 (MQ=255)
tGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTCATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTGCGCTGGCTGACCTTTATATTTTTAAACg > 2:827734/1‑289 (MQ=255)
tAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTGCgctggc > 2:1252028/1‑256 (MQ=255)
ctgctgCTTTCGACCCATCAGTTTTTGTTCTCGATTACGCAGCTGTTCGTACGCTTGATGCCTTCGGGCGTACACGCAAAGTTTTGGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATAGGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTGCGCTGGCTGACCTTTATATTTTTAAACGTGAACCGCGTTTTTTAg < 2:1800146/288‑1 (MQ=255)
tgctgGTGTCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTGCGCTGGCTGACCTTTATCTTTTTAAACGTGAACCGCGTTTTTTAgg > 1:652481/1‑288 (MQ=255)
tgtCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTGCGCTGGCTGACCTTTATATTTTTAAACGTGAACCGCGTTTTTTAGGGCCGCt < 2:2068688/288‑1 (MQ=255)
tgtCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTGCGCTGGCTGACCTTTATATTTTTAAACGTGAACCGCGTTTTTTAGGGCCGCt < 1:1857360/288‑1 (MQ=255)
tCGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTGCGCTGGCTGACCTTTATATTTTTAAACGTGAACCGCGTTTTTTAGGGCCGCTGGt < 1:1379755/289‑1 (MQ=255)
cGACCCATCAGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTGCGCTGGCTGACCTTTATATTTTTAAACGTGAACCGCGTTTTTTAGGGCCGCTGGTc < 2:1774240/289‑1 (MQ=255)
|||
GCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAACCGCGCCTTATATCTACGACGAATTGCAGGATCTCCCCTACCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCAAGTGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGAGTCCGAAAGATATGCTGAGTGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTGCGCTGGCTGACCTTTATATTTTTAAACGTGAACCGCGTTTTTTAGGGCCGCTGGTC > CP042583/1807848‑1808409
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
