Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F210 I1 R1
|
4929 |
268.4 |
3907572 |
96.3% |
3762991 |
273.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
726,893 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 726,893 | 0 | A | T | 99.5%
| 467.4
/ NA
| 200 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (93/106); minor base G (1/0); total (94/106) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.70e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 726,894 | 0 | G | C | 99.5%
| 461.4
/ NA
| 200 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (94/104); total (94/106) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 726,895 | 0 | C | G | 99.5%
| 475.3
/ NA
| 200 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (93/106); total (94/106) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.70e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
CTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGAGCGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAAAGTATTACTCTGCCACTGGATGTGGCACAACAGATGATTAGCTATCCGGCGGTTGATGCCGCTGTGGCGAAGTTTGAGCAGGACTGGCAGG > CP042583/726615‑727172
|||
gcaaacaaggCATTAGCGCAGCGGGTAAAAAACGGCTGAGTGTTTTGTATCCCCAATGTCA‑GAGGACGAGGGGGGGTCAGGGGCGCTTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGAAGCGCTTAAGCTGAGTTCTATTATTGCGGCTATCGTGATGAAAGTTCCGGTGACCGCAGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGc < 2:1389618/280‑1 (MQ=255)
cTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCGGTCGGCGCTGGc > 1:1887869/1‑289 (MQ=255)
tAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTCAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATTTGGGCCAGCACAAGGGCCGCTGGCGGCCCTGGCa > 2:541242/1‑289 (MQ=255)
tcaaagcagtggcgcggcGGGTAAAAAACCGCATGAGATTGTGATTCCGCAACTTCAGGAAG‑CGATGGGCGCTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGt < 2:1854641/277‑1 (MQ=255)
cccAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGt < 1:112890/289‑1 (MQ=255)
cccAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGt < 1:1540183/289‑1 (MQ=255)
cAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGc > 1:445352/1‑289 (MQ=255)
aaGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCg > 1:766074/1‑289 (MQ=255)
atgaTCGCCGCGGGGTAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTACGCAACTTCATGAAG‑CGAGGGGCGGTCAGGGGCGTCTGGTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTGAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGa < 2:1553943/284‑1 (MQ=255)
aTCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATg > 2:916286/1‑289 (MQ=255)
tCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGaagttgt > 1:361032/1‑284 (MQ=255)
cgccgcGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGtt < 2:642694/289‑1 (MQ=255)
cgcagcGGGTAAAAAACCGCTGGAGGTTGTGCTTCCGCAACTTGATCAAG‑CGAGTGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGGGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGtt < 2:1951112/289‑1 (MQ=255)
ccgcAGGTAAAAAAGCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTCGCTGAAG‑CGATGTGCGGTCAGGGGCGTCTGTTGGCCCAGGTAATGGTTGACATTGCCGAAGGGAGGGTTAATGAAGCGCTTAAGCTTCGTGCTATTATTGAGGATATCGTGGTGGAAGTTCCGGTGACCGCCGGGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAGCCGAAGTATATGGCGCAGCACAAGAGCGGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTg < 2:1623932/288‑1 (MQ=255)
gcgGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTgcg > 1:1951112/1‑288 (MQ=255)
gcgGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTgcg > 1:1070668/1‑288 (MQ=255)
ggTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTCTTATTGCGGATATCGTGGTGACAGGTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCCGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACGAGCGCTGCTGTCGGCGCTGGCCCGGGCCGAATATCGTGCGCCt > 2:1282992/1‑288 (MQ=255)
ggTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCt < 2:1937199/288‑1 (MQ=255)
aaaaaaCCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACg < 2:1790051/289‑1 (MQ=255)
aCCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAAt < 1:1863343/289‑1 (MQ=255)
aCCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAAt < 1:916286/289‑1 (MQ=255)
tgtgCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCt < 2:36537/289‑1 (MQ=255)
tgtgCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTGAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCt < 1:1412718/289‑1 (MQ=255)
aaCTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTTTATTATTGCGGATTTCGGGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAg < 1:1900836/289‑1 (MQ=255)
aCTTGATGAGG‑CGATGGGCGGTAAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGc < 2:1252258/289‑1 (MQ=255)
aCTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGc < 2:1070668/289‑1 (MQ=255)
aCTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGc < 1:227368/289‑1 (MQ=255)
aTGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCAt > 1:293453/1‑289 (MQ=255)
tGAGG‑CGGTGGGCGGGCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCAtt < 2:1601421/289‑1 (MQ=255)
tGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCAtt < 1:181009/289‑1 (MQ=255)
tGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCAtt < 1:862180/289‑1 (MQ=255)
cGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGAGATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGa < 2:1883552/288‑1 (MQ=255)
gATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCCGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGCCGCGCTTAAGCTGCGCTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGCAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGTGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAATCGGACGGGATCCCGACGCTGGGAACCGCGGAATATTGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGTAGATGCGGAATTGGTTGCGCGTTACTCTATTCGTATTTAGGCTCAGGGCGGTacgcgcctgcagcgt > 2:815367/1‑275 (MQ=255)
gATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCCCAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTACTCGTATTGATGCCCAGGGCGGTCGCGGccgtcacac > 2:1637140/1‑280 (MQ=255)
ggggcggggcCGTCTGTTGGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAGGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGAc < 2:1011974/282‑1 (MQ=255)
cGGTCAGGGGCGTCTGGTTGCCCAGGTAATGGCGACCATTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGAc < 2:1927952/288‑1 (MQ=255)
tCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGtt > 1:1001537/1‑229 (MQ=255)
ggCGTCTGTTTGACCAGGTCAAGGCTACCACTGCCGAAGGGAGGGTTAATGCTGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTAGTGGGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACAGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGGACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTac < 2:474178/288‑1 (MQ=255)
ttgtgttGCCAAGGTAATGGGTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTGCTATTATTGCGGATATCGTAGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGCGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCa < 2:826328/283‑1 (MQ=255)
cTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑Gt > 1:1489260/1‑289 (MQ=255)
cTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAAGATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGTATTCAGACTGGGACCGACTTACACCA‑Gt > 1:951133/1‑289 (MQ=255)
gTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTa < 1:1053989/289‑1 (MQ=255)
ggTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGCTATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGACGACGGGCTGGCAGCTATTATGATGTTAACAGCGGAAGGGATTCAGACGCTGGGAACAGCGGTATATGGCGTAGCACAAGCGCTGTTGTCGGACCTGGAAGGTGGGGGATATGTTGGGCCGTACTTTAATCGTATGTATGCTCAGGGCGGTAGAGGCCTTGCGACTGTGACCGCATTATCCCA‑GTTATTGAAAat > 2:1525737/1‑288 (MQ=255)
aTGGCTAACACTGGAGTAGGGATTGTTAATGACGCGCTTAAGGTGCGATCTATTATGGAGGATATCGTGGGGAAAGTTCCGGTGAACGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCGGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAatgcatg < 2:1140158/289‑1 (MQ=255)
ccACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCt < 1:1731890/203‑1 (MQ=255)
ccACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCt > 2:1731890/1‑203 (MQ=255)
ccACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGAc > 1:1460696/1‑253 (MQ=255)
ccACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGAc < 2:1460696/253‑1 (MQ=255)
ccACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCa > 1:1875137/1‑289 (MQ=255)
ccACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGACAGGTGCGGAATATGGTGCGCCTTAAGTTAATCGTATTGATTCTGCGGGCTGTAGCGGCATGCCGGCTGTGGCCGACATACACCA‑GTTAGTTAAGATGCATGcgccgcc > 2:43463/1‑288 (MQ=255)
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gCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGa > 2:718390/1‑289 (MQ=255)
aGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGt > 1:1295789/1‑288 (MQ=255)
caggTTAATGAGGCGCTTAAGCTGGGTTTTATTATGGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTgg < 2:738614/287‑1 (MQ=255)
ggTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGCTTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGGGCGGAATATGTTGCGCCTTCCGTTAATCGTATTCATGCCCAGGGCGGTAGCGGCCTTCAGACTGTGACCGACTTA‑ACCACGTTATTGAAAATTCATGCCCCGCCGGCCAAAGTGcggcc > 2:1565677/1‑284 (MQ=255)
ggTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCa > 1:1324922/1‑289 (MQ=255)
tAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCg < 1:1333175/289‑1 (MQ=255)
cgcTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCaa > 1:1535015/1‑289 (MQ=255)
gcTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGGCTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCCGGCGAAAGTGCTGGCAGTCGGTTTCaaa > 2:232270/1‑289 (MQ=255)
gcTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCaaa > 1:369809/1‑289 (MQ=255)
ttGGGGGTATGGTGGTGAAGTTTCCGGTGGCCGCCGAGGGGCGGGCAGATATTAAGAGGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGCCGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGAAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGa < 2:786953/289‑1 (MQ=255)
ttGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGa < 1:1581857/289‑1 (MQ=255)
cGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTc > 1:1767695/1‑276 (MQ=255)
cGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTc < 2:1767695/276‑1 (MQ=255)
gATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCt > 1:874337/1‑289 (MQ=255)
tatCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTacac < 1:487560/208‑1 (MQ=255)
tggtgAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGAc > 2:1674598/1‑193 (MQ=255)
tggtgAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGAc < 1:1674598/193‑1 (MQ=255)
ggtgAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCa > 1:1163852/1‑289 (MQ=255)
gtgAAAGTTCCGGTGACCGCCGGGGGACTTGCAGATATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGAGTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCa < 2:766074/288‑1 (MQ=255)
ccGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGACAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTCGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGCCAGGCGCTGCACTGCTTACTGCCACGACGTGaa > 2:1142398/1‑288 (MQ=255)
tGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGAc < 2:1040869/178‑1 (MQ=255)
cgccgAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTAct < 1:1776653/289‑1 (MQ=255)
ggCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGcc > 1:569899/1‑286 (MQ=255)
cTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTgg > 1:243116/1‑289 (MQ=255)
tATTAAGATGTTAAGAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGa > 1:1033406/1‑155 (MQ=255)
tATTAAGATGTGAAAAGAGGAAGGGCTGGCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGAAGCACAAGGGCGGCGGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAAGATGTTGCGCCGTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACGGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTGGATGTgg < 2:199913/287‑1 (MQ=255)
tGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACAA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTGGATGTGGCACAACAg < 1:541242/287‑1 (MQ=255)
gTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGGTTCATGGCAGGTAGTGAATCAATTACTCTGCAACTGGACGTGGCACAACAgga > 2:6937/1‑286 (MQ=255)
gTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTGGATGGTGCCCAACAgatg > 2:1821938/1‑289 (MQ=255)
ttAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCg > 1:75081/1‑201 (MQ=255)
cGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGACGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACt > 1:1244901/1‑144 (MQ=255)
cGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGACGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACt < 2:1244901/144‑1 (MQ=255)
gAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTGGAtg > 2:88684/1‑265 (MQ=255)
gAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTGGAtg < 1:88684/265‑1 (MQ=255)
aaGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTGGATGTGGCACAACAGATGATTAGCTATc < 1:1821938/288‑1 (MQ=255)
aggttcaggggCTGGGAACAGCGGTATATGGCGAAGCACAAGGGCTGCTGTAGGCGCTGGCAGGGGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTGGATGTGGCACAACAGATGATTAGCTATCcgg < 2:310469/278‑1 (MQ=255)
ttCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTGGATGTGGCACAACAGATGATTAGCTATCCGGCGGt < 1:1556773/289‑1 (MQ=255)
gCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTGGATGTGGCACAACAGATGATTAGCTATCCGGCGGTTGATGc < 2:1489260/288‑1 (MQ=255)
gggAACCGCGGTATATAGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTGGATGTGGCACAACAGATGATTAGCTATCCGGCGGTTGATGcc > 2:928039/1‑286 (MQ=255)
ccGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTGGATGTGGCACAACAGATGATTAGCTATCCGGCGGTTGATGCCGCTGTGGc < 1:715501/289‑1 (MQ=255)
tataTGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTGGATGTGGCACAACAGATGATTAGCTATCCGGCGGTTGATGCCGCTGTGGCGAAGtt > 1:1907998/1‑289 (MQ=255)
tGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTGGATGTGGCACAACAGATGATTAGCTATCCGGCGGTTGATGCCGCTGTGGCGAAGTTTGAg < 1:979782/289‑1 (MQ=255)
tGGAGCAGCAGAAGCGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAAGATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGAGGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTGGATGTGGCACAACAGATGATTAGCTATCCGGCGGTTGATGCCGCTGTGGCGAAGTTTGAg < 2:1857795/289‑1 (MQ=255)
ggggcaacaCCAGAGGTGCTGTGGGCGCTGGCAGGTGCGGAATAGGTTGCGGCTTACGTTACGAGTATTGCTGCACGGGGGGCTAGCGGCATTCGGAGTGGAACCGACTTGCAACA‑GTTATAGAAAATGCGTGCGCGGCAGGCGAAGGTGCTAGCAGCGAGTTTCAAAACACCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTGGATGGGGCACAACAGATGATGAGCTAACCGGCGGTTGATGCCGCTGTGGCGAAGTTTGAGc < 2:287343/286‑1 (MQ=255)
cgcAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCt > 2:1023960/1‑73 (MQ=255)
cgcAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTGGa > 1:1640018/1‑228 (MQ=255)
agcaCAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTGGATGTGGCACAACAGATGATTAGCTATCCGGCGGTTGATGCCGCTGTGGCGAAGTTTGAGCAg < 2:974087/286‑1 (MQ=255)
agcaCAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGACAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTGGATGTGGCACAACAGATGATTAGCTATCCGGCGGTTGATGCCGCTGTGGCGAAGTTTGAGCAGGa < 1:43463/288‑1 (MQ=255)
cacaAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAATCAATTACTCTGCCACTGGATGTGGCACAACAGATGATTAGCTATCCGGCGGTTGATGCCGCTGTGGCGAAGTTTGAGCAGGACTg > 1:1603537/1‑289 (MQ=255)
|||
CTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGAGCGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCA‑GTTATTGAAAATGCATGCGCCGCAGGCGAAAGTGCTGGCAGCGAGTTTCAAAACCCCGCGTCAGGCGCTGGACTGCTTACTGGCAGGATGTGAAAGTATTACTCTGCCACTGGATGTGGCACAACAGATGATTAGCTATCCGGCGGTTGATGCCGCTGTGGCGAAGTTTGAGCAGGACTGGCAGG > CP042583/726615‑727172
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
