Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F210 I1 R1
|
4927 |
250.2 |
4002508 |
96.7% |
3870425 |
266.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
623,379 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 623,379 | 0 | A | T | 99.2%
| 609.0
/ NA
| 262 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (110/149); minor base G (1/1); total (112/150) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
| * | CP042583 | 623,380 | 0 | G | C | 99.2%
| 606.6
/ NA
| 262 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base C (112/148); total (112/150) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.09e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 623,381 | 0 | C | G | 99.6%
| 615.4
/ NA
| 262 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (112/149); minor base T (0/1); total (112/150) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
GAGTGGCGTCCGATGAACATGCACTCTTTCACCTGGAGCCCGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGAGCGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCACGCACTCTGACCATCTGGGAAGCGCAGTTCGGTGACTTCGCCAACGGTGCGCAGGTGGTTATCGACCAGTTCATCTCCTCTGGCGAACAGAA > CP042583/623103‑623659
|||
agTGGCGTCCGATGAACATGCACTCTTTCACCTGGTCGCCGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACt > 1:334901/1‑288 (MQ=255)
gTGGCGTCCGATGAACATGCACTCTTTCACCTGGTCGCCGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTc < 1:396865/288‑1 (MQ=255)
gTCCGATGAACATGCACTCTTTCACCTGGTCGCCGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTc > 1:1031121/1‑288 (MQ=255)
gTCCGATGAACATGCACTCTTTCACCTGGTCGCCGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGACGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGACGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAAATGTTCGAATGGGGCGGTGCGGAAAACCTCTGTTACGCCCCGCTGGTTGAATAAGGCACTTCGGTTCGCCTGCCGGGAGAAGAcccgtgtt > 2:335072/1‑281 (MQ=255)
tCCGATGAACATGCACTCTTTCACCTGGTCGCCGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTcgc < 1:1894298/289‑1 (MQ=255)
ccGATGAACATGCACTCTTTCACCTGGTCGCCGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTcgcg < 1:244068/289‑1 (MQ=255)
ccGATGAACATGCACTCTTTCACCTGGTCGCCGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTcgcg < 1:1682035/289‑1 (MQ=255)
cGATGAACATGCACTCTTTCACCTGGTCGCCGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCgg < 2:1132538/289‑1 (MQ=255)
ctTTCACCTGGTCGCCGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCttcttcaccc > 1:909917/1‑284 (MQ=255)
ctTTCACCTGGTCGCCGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCAcc > 2:947220/1‑288 (MQ=255)
ctTTCACCTGGTCGCCGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCg < 1:1655522/289‑1 (MQ=255)
ttCACCTGGTCGCCGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGcc < 1:1370480/289‑1 (MQ=255)
tggtcgccGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCgg < 1:1809081/283‑1 (MQ=255)
tggtcgccGTAACTCAACCGCGAATGGGACGAAGGGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCgg < 2:699585/283‑1 (MQ=255)
ggtcgccGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGATACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGt < 1:1693689/284‑1 (MQ=255)
ggtcgccGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTa > 2:1450097/6‑267 (MQ=255)
ggtcgccGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGt < 1:460261/284‑1 (MQ=255)
ggtcgccGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGt < 1:618714/284‑1 (MQ=255)
ggtcgccGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGt < 1:107904/284‑1 (MQ=255)
ccTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGGGATGAAGCGCCGGCAGGGGGTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAAc < 2:12453/289‑1 (MQ=255)
cAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAg < 1:1316841/289‑1 (MQ=255)
ccACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGGGATGCAGCGACTGCAGGGGCTGGCGAAACGCATAAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCt < 2:1106060/289‑1 (MQ=255)
ccACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGcc > 2:506746/1‑266 (MQ=255)
ccACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGcc < 1:506746/266‑1 (MQ=255)
ccACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAACGCAGTCCGTTTCGCCTCGCGGGTGTAGACCCCGGGCGCGGTACATTGTTCCACCGCCACGAGGTCACCCACACCCAGtac > 2:745743/1‑287 (MQ=255)
cGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAAc > 1:68302/1‑289 (MQ=255)
aTGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACgg < 2:930298/288‑1 (MQ=255)
gggACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGt > 1:211454/1‑265 (MQ=255)
gACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTcc > 2:828973/1‑288 (MQ=255)
gACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTcc > 1:633099/1‑288 (MQ=255)
cGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACt > 2:188848/1‑289 (MQ=255)
gTACCCCAACAAAGTTGCGATGAAGCGCCTGCAAGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTaca < 2:103765/287‑1 (MQ=255)
aCCCGAACAACGTTGAGATGAAGGGCCTGCCGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACAcgc < 2:1967935/288‑1 (MQ=255)
cccGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCCCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCCCTTACAcccc > 2:1852253/1‑288 (MQ=255)
cGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCt < 1:607277/289‑1 (MQ=255)
aaCAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTc < 1:655793/272‑1 (MQ=255)
aaGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAAc > 2:666199/1‑288 (MQ=255)
aaGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACCCCCCTCCAAc > 2:1188107/1‑288 (MQ=255)
ttGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACata > 2:1583840/1‑288 (MQ=255)
ggagaTGAAGCGGCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCAGCGGGACGGAGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCACGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACatat < 2:1211271/287‑1 (MQ=255)
agaTGAAGCGCCTGCAGGGGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATcc < 1:1786439/288‑1 (MQ=255)
aaGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACCTATCCATAACg > 1:583024/1‑289 (MQ=255)
gcCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGc < 1:1480327/288‑1 (MQ=255)
gcCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGc < 1:1583840/288‑1 (MQ=255)
gcCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTACCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCa < 1:1748866/289‑1 (MQ=255)
gCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGtt > 1:1061775/1‑288 (MQ=255)
gCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGtt < 1:1188107/288‑1 (MQ=255)
tGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTcc < 1:282523/288‑1 (MQ=255)
tGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTcc < 1:828973/288‑1 (MQ=255)
aaagcagaaGCACGGTGCCGGAGGCCGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTGATGTCGTTCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGTTGCGGAAACCCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGAGGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTg < 2:1794221/281‑1 (MQ=255)
aaCGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTg < 1:1207385/289‑1 (MQ=255)
tCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTg < 1:1864709/283‑1 (MQ=255)
cACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGt > 1:1727385/1‑288 (MQ=255)
cggggtgcGGAAGGAGTGGAAAGGCGGGCTCGCGTTGCCAAGATTGATGGCGAGCGCGAGGCGATGGCGGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGCAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTa < 2:207796/281‑1 (MQ=255)
aaggTGCCGGAATCATTGGAAAGGCAAGCGGTCGTTGCCAAGATTAAGGCGGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTGCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTa < 2:1727385/286‑1 (MQ=255)
aCGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTa < 1:1005912/288‑1 (MQ=255)
tGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAAc > 1:356806/1‑206 (MQ=255)
tGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTaca < 1:1239673/228‑1 (MQ=255)
tGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTGCGGGTCCTGGACTCCGTACttt > 2:577594/1‑286 (MQ=255)
aGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACCACCCGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATCTCCATAACGGGCCGGGCCCGTTCCGTGTCTGGGCCTCCGTACTGTCTGACGAAGCa > 2:1856097/1‑289 (MQ=255)
aGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTa > 1:554080/1‑274 (MQ=255)
aGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCa > 2:134307/1‑289 (MQ=255)
aaTGCGGTGTTGGGTTGCCAGGATTTATGGGGGTCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCt < 2:452395/288‑1 (MQ=255)
aaTGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCt < 1:405897/288‑1 (MQ=255)
gTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAACCTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTa < 2:381223/262‑1 (MQ=255)
gTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTa > 1:381223/1‑262 (MQ=255)
gTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGttt > 2:893955/1‑289 (MQ=255)
gTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGttt > 1:721356/1‑289 (MQ=255)
gTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCCGGTCTGGGACTCCGTACTTTCTGAAGGAGCCGTGCggggtttt > 2:1393734/1‑284 (MQ=255)
cgcgTTTCCATGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTTAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTACCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAat < 1:1422028/289‑1 (MQ=255)
cgcgGTGCCAAGATTCACGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGGGAGAAACTGGTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAat < 2:604560/289‑1 (MQ=255)
ccAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTACTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGgcg > 1:1468702/1‑228 (MQ=255)
aGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGc < 1:1545362/289‑1 (MQ=255)
aGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGc < 1:882194/289‑1 (MQ=255)
aGACTTATGGAGAACGCAAGGGGATGGATGCCGGTTAGAAACTGTTCGCATGGGGAGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGATGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGc < 2:1308955/289‑1 (MQ=255)
tGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCa < 1:1393734/289‑1 (MQ=255)
aTCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTaca < 2:1012487/180‑1 (MQ=255)
aTCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTg < 2:1544948/226‑1 (MQ=255)
aTCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGc < 1:941105/277‑1 (MQ=255)
aTCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAAcc > 2:411145/1‑289 (MQ=255)
tCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCa < 1:951649/289‑1 (MQ=255)
gCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCACGCAct < 1:1977025/288‑1 (MQ=255)
ggCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACt > 2:1500710/1‑218 (MQ=255)
ggCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGaagaag > 2:300522/1‑236 (MQ=255)
gaatggtgcgtcTGGGGAGGTGCGGAAAACCGCGCTTACGCCCCGGGGGTTGATGAAGGCAGTCCGGTTCGCCTGTGGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCGAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCACGCACTCTGACCATCTGGGAAgcg < 2:625527/277‑1 (MQ=255)
agcagTTCGACGGGGGGGGTGCGGCAAGCCTCGCTTACGCACCGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCACGCACTCTGACCATCTGGGAAgcgc < 2:29495/284‑1 (MQ=255)
tGGGTCGGCGCCGACAACCTCACTTACGCCCCGCTGGTTGATGAAGGCATTCCTGTTCGCCTGTCTGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGGCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCACGCACTCTGACCATCTGGGAAGCGCAGTTCGGTGAc < 2:1472605/288‑1 (MQ=255)
tGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCACGCACTCTGACCATCTGGGAAGCGCAGTTCGGTGAc < 1:1833593/288‑1 (MQ=255)
gggCGGCACACCTCGCTTCCGCCAGGTGGGTTGGTGAGGGCCTGCCGGTGCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCACGCACTCTGACCATCTGGGAAGCGCAGTTCGGTGACTTCGCCa < 2:1366283/286‑1 (MQ=255)
tGCGGAAAACCTCGCTTCCGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCACGCACTCTGACCATCTGGGAAGCGCAGTTCGGTGACTTCGCCaa < 1:1167088/288‑1 (MQ=255)
cTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCACGCACTCTGACCATCTGGGAAGCGCAGTTCGGTGACTTCGCCAACGGTGCGCAgg > 1:1339160/1‑289 (MQ=255)
gaCGCCACTCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCACGCACTCTGACCATCTGGGAAGCGCAGTTCGGTGACTTCGCCAACGGTGCGCAGGTGGTTa < 1:152936/288‑1 (MQ=255)
cACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGGCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGAGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTACGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCACGCACTCTGACCATCTGGGAAGCGCAGTTCGGTGACTTCGCCAACGGTGCGCAGGTGGTTATCGAc < 2:1675068/289‑1 (MQ=255)
ttGATGAAGGCTTTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCACGCACTCTGACCATCTGGGAAGCGCAGTTCGGTGACTTCGCCAACGGTGCGCAGGTGGTTATCGACCAGTTCa > 1:296686/1‑288 (MQ=255)
ttGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCACGCACTCTGACCATCTGGGAAGCGCAGTTCGGTGAc < 2:242126/251‑1 (MQ=255)
tgatgaAGGCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCACGCACTCTGACCATCTGGGAAGCGCAGTTCGGTGACTTCGCCAACGGTGCGCAGGTGGTTATCGACCAGTTCAt < 1:1881147/288‑1 (MQ=255)
gCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCACGCACTCTGACCATCTGGGAAGCGCAGTTCGGTGACTTCGCCaa > 1:1108454/1‑250 (MQ=255)
gCATTCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCACGCACTCTGACCATCTGGGAAGCGCAGTTCGGTGACTTCGCCAACGGTGCGCAGGTGGTTATCGACCAGTTCATCTCCTCTg > 1:1355927/1‑288 (MQ=255)
tCCGGTTCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCACGCACTCTGACCATCTGGGAAGCGCAGTTCGGTGACTTCGCCAACGGTGCGCAGGTGGTTATCGACCAGTTCATCTCCTCTGGCGa > 1:759011/1‑288 (MQ=255)
ttCGCCTGTCGGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCACGCACTCTGACCATCTGGGAAGCGCAGTTCGGTGACTTCGCCAACGGTGCGCAGGTGGTTATCGACCAGTTCATCTCCTCTGGCGAACAGaa > 2:786501/1‑289 (MQ=255)
|||
GAGTGGCGTCCGATGAACATGCACTCTTTCACCTGGAGCCCGTACCTCAACCACGAATGGGACGAAGAGTACCCGAACAAAGTTGAGATGAAGCGCCTGCAGGAGCTGGCGAAACGCATCAGCACGGTGCCGGAAGCAGTTGAAATGCAGTCTCGCGTTGCCAAGATTTATGGCGATCGCCAGGCGATGGCTGCCGGTGAGAAACTGTTCGACTGGGGCGGTGCGGAAAACCTCGCTTACGCCACGCTGGTTGATGAAGGCATTCCGGTTCGCCTGAGCGGTGAAGACTCCGGTCGCGGTACCTTCTTCCACCGCCACGCGGTGATCCACAACCAGTCTAACGGTTCCACTTACACGCCGCTGCAACATATCCATAACGGGCAGGGCGCGTTCCGTGTCTGGGACTCCGTACTGTCTGAAGAAGCAGTGCTGGCGTTTGAATATGGTTATGCCACCGCAGAACCACGCACTCTGACCATCTGGGAAGCGCAGTTCGGTGACTTCGCCAACGGTGCGCAGGTGGTTATCGACCAGTTCATCTCCTCTGGCGAACAGAA > CP042583/623103‑623659
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A