Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F210 I1 R1
|
4928 |
340.1 |
5480506 |
96.9% |
5310610 |
252.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
552,214 |
3 bp→TCA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 552,214 | 0 | A | T | 99.6%
| 591.0
/ NA
| 248 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (129/117); total (130/118) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 552,215 | 0 | G | C | 99.6%
| 587.3
/ NA
| 248 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (130/117); minor base T (0/1); total (130/118) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.76e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
| * | CP042583 | 552,216 | 0 | T | A | 99.6%
| 586.3
/ NA
| 248 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base A (128/117); total (130/118) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
TACCCATTACTGGTGATGATGATTGAAGCGCGTGATCTGGTTAACGATCAGGGAAAACCGCTACTTTATGTCCCCGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTAGTCTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCAGTCTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAAAGTTTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGCAACCGCAGCCAATGCCCGTTGACGATGGTGGGCCAGGCTGTCTGGGCATCATTAAAATTATTTTCTATATTTTTATCTTTGCTGGTTTGATAGGGAAAATACTCCATCTGTTCGGGTGACAGTCGACGTTAATGTGCGGGAAGCCC > CP042583/551935‑552486
|||
ccagtacgtgTGATGATTATTGAAGCCCGTGATCTGGTTAGCGATCAGCGAAAACCGCTAGTTTATGTCCACGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATTGGTAATACCCTGCGATGAATAACTCTCTGCTATGGGGCGTTTACTGATGGTGATGGTTTTGCTCAAATTACGTCAGCCGCGGATCTCACACACGCGCGATACAGAACATACCTTATGTCTATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATTATTAATGCCGa < 2:2507781/280‑1 (MQ=255)
cTGGTGATGATGATTGAAGCGCGTGATCTGGTTAACGATCAGGGAAAACCGCTACTTTATGTCCCCGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGa > 1:999315/1‑289 (MQ=255)
tGGTGATGATGATTGAAGCGCGTGATCTGGTTAACGATCAGGGAAAACCGCTACTTTATGTCCCCGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGCGa > 2:1074182/1‑288 (MQ=255)
gTGATGATGATTGAAGAGCGTGATCTGGTTAACGATCAGGGAAAACCGCTACTTTATGTCCCCGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAgcc > 1:241362/1‑289 (MQ=255)
atgatgatTGAAGCGCGTGATCTGGTTAACGATCAGGGAAAACCGCTACTTTATGTCCCCGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAACAATCATTAATGCCGATTGGGAgcggc > 2:51149/1‑288 (MQ=255)
gcgTGATCTGGTTAACGATCATGGAAAACCGCTACTTTATGTCCCCGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGaaaa < 1:279860/288‑1 (MQ=255)
tCTGGTTAACGATCAGGGAAAACCGCTACTTTATGTCCCCGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGt < 2:2085895/289‑1 (MQ=255)
aaCGGTAAGGGAAACCCGCTACTTTATGGCCCCGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTgg < 2:1513030/289‑1 (MQ=255)
acaataaGGGAAAACCGCTACTTTATGTCCCCGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGa < 1:2331938/283‑1 (MQ=255)
aCGGTCAGGGAAACACGCTACCTTATGTACCCGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGa < 2:1484072/289‑1 (MQ=255)
aGGGAAAACCGCTACTTTATGTCCCCGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTg < 1:2114072/258‑1 (MQ=255)
aGGGAAAACCGCTACTTTATGTCCCCGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTg > 2:2114072/1‑258 (MQ=255)
aGGGAAAACCGCTACTTTATGTCCCCGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTg > 1:1219243/1‑274 (MQ=255)
aGGGAAAACCGCTACTTTATGTCCCCGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTg < 2:1219243/274‑1 (MQ=255)
aGGGAAAACCGCTACTTTATGTCCCCGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCatt > 1:2306049/1‑289 (MQ=255)
gCTACTTTATGTCCCCGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATtcgt < 1:80603/289‑1 (MQ=255)
gCTACTTTATGTCCCCGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATtcgt < 1:1762487/289‑1 (MQ=255)
ttgaTGTCCCCGGCGAGAGCGCCCGTTCTCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGatt < 2:1258735/286‑1 (MQ=255)
ccGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCa > 1:30201/1‑289 (MQ=255)
ccGGCGACAGCGCCCGTACGCGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCa > 2:2585987/1‑289 (MQ=255)
gacgaggcCCGTAGTTGTTTTCATTTATACGAAATACTCAGCTATGAAAACCTATCTGCGCTGGGGCGTTCACTTGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAggcg < 2:1102240/282‑1 (MQ=255)
tataCGAGATACTCAGCGATGAAAAACTCTCGGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGt < 2:2475613/289‑1 (MQ=255)
tataCGAAATACTCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGt < 1:1649036/289‑1 (MQ=255)
tCAGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAattatt > 1:2003162/1‑230 (MQ=255)
aGCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGc > 2:1413559/1‑289 (MQ=255)
gCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGa < 1:922024/174‑1 (MQ=255)
gCGATGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATtcgtcg < 2:1178928/232‑1 (MQ=255)
tGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGCAAcc > 2:189811/1‑288 (MQ=255)
tGAAAAACTCTCTGCGCTGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGCAACCg < 1:2388874/289‑1 (MQ=255)
gcttgggcggtaccTGGTCGGGATGGTTTTGCAAAAATGACGTAAGCTGCGGATCTCACTCAAGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGAGTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTGATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGCAACCGCAGCCAATGCCCGtt < 2:1945462/276‑1 (MQ=255)
tGGGGCGTTCACTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGCAACCGCAGCCAATGCCCGTTGa < 2:590525/289‑1 (MQ=255)
gggctttcactagTCGAGCTGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCTCGGATCTCACTCACGCTTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATCTCTAGTTGCCAACCAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTTATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGCAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGCCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGCAACCGCAGCCAATGCCCGTTGAc < 2:861181/276‑1 (MQ=255)
ggcgttcacTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGCAACCGCAGCCAATGCCCGTTGACGa > 1:1136271/9‑289 (MQ=255)
gttcacTGGTCGGGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGCAACCGCAGCCAATGCCCGTTGACGAtg < 1:51149/283‑1 (MQ=255)
gttcacTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGCAACCGCAGCCAATGCCCGTTGACGAtg < 2:2408977/283‑1 (MQ=255)
ttcacTGGTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATtgtg < 2:537792/147‑1 (MQ=255)
ggTCGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGc > 2:280601/1‑137 (MQ=255)
cGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGCAACCGCAGCCAATGCCCGTTGACGATGGTGGGCCAgg < 1:2432976/288‑1 (MQ=255)
cGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGCAACCGCAGCCAATGCCCGTTGACGATGGTGGGCCAgg < 1:2295224/288‑1 (MQ=255)
cGAGATGGTTTTGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGCAACCGCAGCCAATGCCCGTTGACGATGGTGGGCCAgg < 1:1559574/288‑1 (MQ=255)
tttGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGTCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGCAACCGCAGCCAATGCCCGTTGACGATGGTGGGCCAGGCTGTCTggg < 1:2093381/288‑1 (MQ=255)
tttGCACAAAGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGCAACCGCAGCCAATGCCCGTTGACGATGGTGGGCCAGGCTGTCTGGGc < 1:1179006/289‑1 (MQ=255)
aGGACGTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGCAACCGCAGCCAATGCCCGTTGACGATGGTGGGCCAGGCTGTc < 1:1309432/275‑1 (MQ=255)
gTAAGCCGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGCAACCGCAGCCAATGCCCGTTGACGATGGTGGGCCAGGCTGTCTGGGCATCATTAAAattat < 1:1413559/289‑1 (MQ=255)
ccGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGCAACCGCAGCCAATGCCCGTTGACGATGGTGGGCCAgg < 1:2350535/260‑1 (MQ=255)
ccGCGGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGCAACCGCAGCCAATGCCCGTTGACGATGGTGGGCCAgg > 2:1554135/1‑260 (MQ=255)
gcgGATCTCACTCACGCGTGCTACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGCATCATTAATGCTGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGTAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGTATCCGCAACCGAAGCCAATGCCGTTCGACAATACTGGGCCAGGCTGTCTTGGACTCTTTAAAATCTTTTTCttt > 2:964395/1‑287 (MQ=255)
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gcgGATCTCACTCACGCGTGATACAGAACATACCTTATGGCCATTATATCTAGTTGCCAAACAATTAGTGCAGGCCTGCCAACCTACAGAAGAATCATTAATGCCGATTGTGAGCCGCCTTGATGCAGAAAATCGTTGTCCACTGGAAGCATTAATTATTCGTCGATTATTAATTCAGGCGGCGAATTTTACCGAGAAGCAAACTGTTGAACCGGAGCCGCAACCGCAGCCAATGCCCGTTGACGATGGTGGGCCAgg > 2:2556798/1‑258 (MQ=255)
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|||
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|
| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
