Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F210 I1 R1
|
4928 |
340.1 |
5480506 |
96.9% |
5310610 |
252.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
630,606 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 630,606 | 0 | A | T | 100.0%
| 603.7
/ NA
| 251 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (129/122); total (129/122) |
| * | CP042583 | 630,607 | 0 | G | C | 99.6%
| 581.8
/ NA
| 251 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (127/122); total (129/122) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
| * | CP042583 | 630,608 | 0 | C | G | 100.0%
| 594.2
/ NA
| 251 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (129/122); total (129/122) |
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
GGCGCAATGGCGAACGGCGTTTACGGCCCGTATGCCATTTTCGCCTCCGTCAAAATGGTTAGCGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTAGCTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTAGCACACCCGGTGCCGGCATTTTCAGCCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑AGCACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTGGTATTTCACCACCGAAGA > CP042583/630330‑630885
|||
ggCGCAATGGCGAACGGCGTTTACGGCCCGTATGCCATTTTCGCCTCCGTCAAAATGGTTTCGGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGt > 1:816091/1‑288 (MQ=255)
ggCGCAATGGCGAACGGCGTTTACGGCCCGTATGCCATTTTCGCCTCCGTCAAAATGGTTTCGGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGt < 2:1997913/288‑1 (MQ=255)
aCGGCGTTTACGGCCCGTATGCCATTTTCGCCTCCGTCAAAATGGTTTCGGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTctc < 2:419119/289‑3 (MQ=255)
tACGGCCCGTATGCCATTTTCGCCTCCGTCAAAATGGTTTCGGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCtttt < 2:130433/289‑1 (MQ=255)
cccttagtcacttttCGCTTCCGTCACAATGGTTTCGGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACtt < 2:2683350/278‑1 (MQ=255)
cccGTATGCCATTTTCGCCTCCGTCAAAATGGTTTCGGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACtt < 2:816091/289‑1 (MQ=255)
gTATGCCATTTTCGCCTCCGTCAAAATGGTTTCGGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGCTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGGAACGGGCGTTATTGTCGGTGCGATGAATAGCGGCCTTTCGACATCCGCTGTCGGCATTTTCTCGCTCTTttcatttcat > 2:504824/1‑289 (MQ=255)
ttCGCCTCCGTCAGAATGGTTTAGGAATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAAGCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGgcg < 2:2216490/289‑1 (MQ=255)
tacGCCTCCGTCAAAATGGTTTCGTCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGgcg < 1:1697301/287‑1 (MQ=255)
tCGCCTCCGTCAAAATGGTTTCGGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGgcgc > 1:1777985/1‑289 (MQ=255)
ccTCCGTCAAAATGGTTTCGGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCgcggg < 1:395874/289‑1 (MQ=255)
ccTCCGTCAAAATGGTTTCGGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCgcggg < 2:1876234/289‑1 (MQ=255)
ttCCGTCAAAAGGGTGTCGGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGGACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGGCCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCgcggg < 2:1667913/287‑1 (MQ=255)
cGTCAAAATGGTTTCGGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGgt > 1:2545371/1‑289 (MQ=255)
tACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTg > 1:443138/1‑221 (MQ=255)
aCCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGgcg < 2:1783622/289‑1 (MQ=255)
cTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTTCGGGTTATCGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTCGGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCCGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGTGAATGGCGCGGGCGGGTGTAGGGCGGGACTTTGCTTGGTTGGCGCgg > 2:1921124/1‑288 (MQ=255)
ttCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCa < 1:1706835/289‑1 (MQ=255)
ttCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATAGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCCTTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGCTAATGGCGCGGGCGGGGTTATGGCGGGCATTGGCGTGGTTGgccgggga > 2:1449619/1‑283 (MQ=255)
cGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATtggt < 2:837278/289‑1 (MQ=255)
cGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGGGTTATGGCGTGAATTGGCTGGTTTTGCGCTGCGTtggg > 2:1500598/1‑288 (MQ=255)
tGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTggg < 1:2298864/289‑1 (MQ=255)
cGCACCGGGCCTGTTTAAGGGGTTTGAAATTGGGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAGGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCt < 2:1211632/289‑1 (MQ=255)
cGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCTCGGCATTGGTgggg > 1:2561585/1‑286 (MQ=255)
gcgcCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAAt > 2:714534/1‑288 (MQ=255)
cgcCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCCTTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCCGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGcgagt > 2:2266539/1‑284 (MQ=255)
cgcCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATc > 1:1082951/1‑288 (MQ=255)
cgcCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATc > 1:1211632/1‑288 (MQ=255)
cgcCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGACGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCCGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTgggggtggtcatc > 2:1040830/1‑280 (MQ=255)
gcCTGTTTAAAGGGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATctc < 2:1009186/289‑3 (MQ=255)
tttAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTCTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAACTGTCTGGTTCGGCGCGGGACTGGTGGGGGCTGCAATctagact > 2:2587/1‑282 (MQ=255)
aaaGAGTTTGAAATTGAGACCGAGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCaa < 1:694621/289‑1 (MQ=255)
ttGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCgg < 2:2523204/178‑1 (MQ=255)
ttGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACtt > 2:171010/1‑200 (MQ=255)
ttGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGgc < 2:1757636/212‑1 (MQ=255)
ttGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGgc > 1:1757636/1‑212 (MQ=255)
gagaCCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCtttt > 1:1055617/1‑187 (MQ=255)
gAAATCAACCGGGCTGTTGGGGCTGGAAGGTCTTACCGACGGGGCGCTCCCGATGGGGATTGAGGATCGGCGGCGGGTTTTTGGTGCGTTTGTGCTGGGCTCTAGGGTACCGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCa < 2:2078217/288‑1 (MQ=255)
aaTCCACCTTGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGTAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCAcg < 1:2054447/288‑1 (MQ=255)
ccccTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGtt < 1:878889/287‑1 (MQ=255)
tGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGGGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATg > 1:1045038/1‑288 (MQ=255)
aGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTCTGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGGTAAGCATGGCa > 1:2184686/1‑287 (MQ=255)
cTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTa > 1:2403484/1‑287 (MQ=255)
cTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTa > 1:2682128/1‑287 (MQ=255)
ggCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGCATATCGGACTTTTGACACCCGGTGCCGGCATTTTCCCGCTCTTTTTAATTAATGATAATGGCCCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCCGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGTTGCAATT‑TCGACTGCAATTCTCATGGTGTGGACGCGTCACGCGGTTAAGCATTGCAACTa > 2:2477215/1‑285 (MQ=255)
ggCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGgcg < 1:1968973/209‑1 (MQ=255)
cAGGTGTAACCGAGGGGGTGGTCCCGATGGCGAGTGAGGATCCGTGGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATctga < 2:2661304/288‑1 (MQ=255)
tATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCTGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TTGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGGATGGCAACTATCTGACTGAt > 1:1112896/1‑289 (MQ=255)
ccGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGgcg < 2:207149/198‑1 (MQ=255)
ggggCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGTGGGCTGCAATCTCGCA‑TGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCCCGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAAtt > 1:278727/1‑287 (MQ=255)
ggggCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATg > 1:647763/1‑288 (MQ=255)
ggggCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATg > 1:560322/1‑288 (MQ=255)
ggggCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATg > 1:905486/1‑288 (MQ=255)
ggggCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGGGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGGCACGCGGGTAAGCATGGCAACTATctgg > 1:2098599/1‑273 (MQ=255)
ggCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATTCCa > 1:2376040/1‑289 (MQ=255)
ggCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCa > 1:1303945/1‑289 (MQ=255)
cGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGGGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGGGGGGGCTGCAATC‑CCGACTGCAATTTCCCTGATGTGGCGGCTGCACGCGGTTAAGCATGGCCACTATCTGGCTGCTGGCGCAAGGCCATa > 2:1830517/1‑289 (MQ=255)
tgaGATCCGCGGCGGGTTATTGGTTCGTTGGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAacgac < 2:651495/287‑1 (MQ=255)
tCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGa > 2:2058884/1‑289 (MQ=255)
tGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCa < 2:1082951/289‑1 (MQ=255)
gggTTATTGGTTCGTTTGGGCTGGGCTCTTTGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGt < 2:2553073/288‑1 (MQ=255)
ggTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGGGGGGGCAGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGGCACGCGGTTAAGCGTGGCACATCTCTGACTGATTGCGGAATGCCTTAACAAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTa > 2:2031826/1‑288 (MQ=255)
gttcgtttGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCAcg > 1:1679258/6‑207 (MQ=255)
gttcgtttGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGt < 1:1636746/206‑1 (MQ=255)
cgtttGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTcac > 1:469485/3‑289 (MQ=255)
gtgCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGGTAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCAc < 2:905486/289‑1 (MQ=255)
gtgCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCAc < 1:1565582/289‑1 (MQ=255)
gCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAGGCAGTATCTCGCGTTCACATCAcc > 1:1320919/1‑288 (MQ=255)
gCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCAccc < 1:504824/289‑1 (MQ=255)
ggCTCTATGGTAACGGGCGCTGTTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTcgc > 1:1719497/1‑272 (MQ=255)
ggCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCa > 1:785488/1‑289 (MQ=255)
ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATctcgactg > 1:2071582/1‑157 (MQ=255)
tATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGCCTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATg > 1:715253/1‑288 (MQ=255)
tATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGAt < 1:2035360/251‑1 (MQ=255)
tATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGGATCTCGCGTTCACAACAACCCGCaaacgc > 2:2247683/1‑284 (MQ=255)
aTGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCa < 1:2609928/289‑1 (MQ=255)
tGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTa > 1:1540784/1‑221 (MQ=255)
tGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTa < 2:1540784/221‑1 (MQ=255)
ggTAACGGGCGCTATGTTGGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTGTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGGGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACt < 2:1250926/289‑1 (MQ=255)
tAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTTTCCTGATTGGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACCACCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGCCGATGAAAGCAGTACCTCTCGTTCACATCACCCCGCATATCCACTgg > 2:2349556/1‑289 (MQ=255)
aCGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGa > 2:475483/1‑289 (MQ=255)
ggCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGTGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAAGGCCCTAAAAAAAAAGGAAACGACGATGCAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCCATGGGacag > 2:302546/1‑286 (MQ=255)
ggCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCg > 2:160142/1‑289 (MQ=255)
ggCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACCATctgactga > 1:2266929/1‑206 (MQ=255)
cgcTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGAACgag > 2:2406315/1‑289 (MQ=255)
tATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGagag < 1:1830517/288‑1 (MQ=255)
tATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTGTCGACACCCTGTTCCGGCATTGTCTCGCTCTTTTTCCTGCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGGTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑GCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGagag < 1:1250760/288‑1 (MQ=255)
aTTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTg > 1:1446509/1‑289 (MQ=255)
ggTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTGGTAttt < 1:1438750/289‑1 (MQ=255)
gTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCCCAACACCCCGCCTATGCACTGGGATAGGGAATGGttattt > 2:1438750/1‑284 (MQ=255)
gagctGAATATCGGCCTTTCGACTCCCGGGGCCGGCATGTTGTCGCTCTTTGTATTTCATGATAGTGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGGGCGGCAGTGGTGGGGGCTTCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTGGTATTTcac < 2:2100563/285‑1 (MQ=255)
gCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATctgactga > 1:325412/1‑191 (MQ=255)
gCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATATCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTGGTATTTca > 1:305407/1‑288 (MQ=255)
gCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGAATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTGGTAtttaa > 1:1892310/1‑286 (MQ=255)
gATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGGAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTGGTATTTcacc > 1:2517602/1‑288 (MQ=255)
gATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCa < 2:451410/159‑1 (MQ=255)
cGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATgg > 1:2163149/1‑74 (MQ=255)
cGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATgg < 2:2163149/74‑1 (MQ=255)
cGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTa > 1:2469193/1‑158 (MQ=255)
cGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑TCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCa > 2:307800/1‑254 (MQ=255)
|||
GGCGCAATGGCGAACGGCGTTTACGGCCCGTATGCCATTTTCGCCTCCGTCAAAATGGTTAGCGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTAGCTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTAGCACACCCGGTGCCGGCATTTTCAGCCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATC‑AGCACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTGGTATTTCACCACCGAAGA > CP042583/630330‑630885
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
