Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F109 I2 R1
|
18 |
64.5 |
2321652 |
91.0% |
2112703 |
142.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC |
NC_000913 |
2,533,401 |
Δ10 bp |
intergenic (+21/‑354) |
cysK → / → ptsH |
cysteine synthase A, O‑acetylserine sulfhydrolase A subunit/phosphohistidinoprotein‑hexose phosphotransferase component of PTS system (Hpr) |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
= 2533400 | 2 (0.030) | 58 (0.920) |
48/280 |
0.3 |
95.9% |
intergenic (+20/‑364) |
cysK/ptsH |
cysteine synthase A, O‑acetylserine sulfhydrolase A subunit/phosphohistidinoprotein‑hexose phosphotransferase component of PTS system (Hpr) |
| ? | NC_000913 |
2533411 = |
3 (0.050) | intergenic (+31/‑353) |
cysK/ptsH |
cysteine synthase A, O‑acetylserine sulfhydrolase A subunit/phosphohistidinoprotein‑hexose phosphotransferase component of PTS system (Hpr) |
ACTACAAGAAGATGAAAGCTTTACCAACAAGAATATTGTGGTTATTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2533257‑2533400
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAA > NC_000913/2533411‑2533538
ACTACAAGAAGATGAAAGCTTTACCAACAAGAATATTGTGGTTATTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACCGACAAAACAGCGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATG > 1:1090704/1‑143
GAAGATGAAAGCTTTACCAACAAGAATATTGTGGTTATTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTT > 2:1113864/1‑143
ATGAAAGCTTTACCAACAAGAATATTTAGGTTATGCTACCACCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAACAATGCACCTTTTTAG > 1:733088/1‑143
ATGAAAGCTTTACCAACAAGAATATTGTGGTTATTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCCCTGAGAAAGAATTGCAACAGTACTGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTCTTAG > 2:790666/1‑143
ATGAAAGCTTTACCAACAAGAATATTGTGGTTATTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAG < 1:1090167/143‑1
ATGAAAGCTTTACCAACAAGAATATTGTGGTTATTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAG < 2:25523/143‑1
ATGAAAGCGTTACCAACAAGAATATTGTGGTTATTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAG < 1:111615/143‑1
GAAAGCTTTACCAACAAGAATATTGTGGTTATTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGCAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTCAATATGCACCCTTTTACGT > 1:95021/1‑143
CTTTACCAACAAGAATATTGTGGTTATTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAACTGCACCTTTTCAGGTGCTTT > 2:222600/1‑143
TACCAACAAGAATATTGTGGTTATTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTT < 1:304725/143‑1
TACCAACAAGAATATTGTGGTTATTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGCAATGCCAGCTTGTTAACAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTT > 2:60085/1‑143
CCAACAAGAATATTGTGGTTATTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGT < 1:761787/143‑1
CCAACAAGAATATTGTGGTTATTCTACCATCATCGAGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGCTCTCTTCACTGACAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTCTTCAAAATGAACCTTTTTAGTTGCTcatttat > 2:1015687/1‑136
CCAACAAGAATATTGTGGTTATTCTACCATCATCAGGTCAACGTGATTTTTTCTCCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGT < 2:399093/143‑1
ACAAGAATCGTGTGGTTCTTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTGCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGC < 2:75837/143‑1
gGAATATTGTGGTTATTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTG < 2:1050255/142‑1
AGAATAGTGTGGTTATTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTG < 1:489113/143‑1
GAATATTGTGGTTATTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTGGAGGTGCTTTTTTGTGGACTGC > 1:1134102/1‑143
TGTGGTTATTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCAAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGTTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAA > 2:798719/1‑143
TTATTCTATCTTCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTACTGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTC < 1:1015941/143‑1
CATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGC > 2:1077245/1‑143
ATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCA > 1:947896/1‑143
GGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCCAACTTTCGCCCCTCCTCGCATTG > 1:997707/1‑143
TGAGCGTTATTTACGCCCCGCATTGTTTGCCGCTCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTGGTTAAAAATGCACCTTTGTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACCTTCGTCCCTCCTGGCATTGATT < 2:827871/143‑1
TGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATT < 1:335626/143‑1
GAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTC > 1:833847/1‑143
ATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAACGCACCTTTTGAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGT < 1:341877/143‑1
TTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAAGTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTC < 1:720636/143‑1
TAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGG > 2:369154/1‑143
AGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAA < 1:1113864/143‑1
CCGCAGTGTGTACCGATCTCTTCACTGAGTAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGG < 2:748869/143‑1
CATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCCTTGATTCAGCCTGTCGGACCTGGTAT > 1:810561/1‑143
TTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGCACTGGTGTTTAAC > 1:73086/1‑143
TGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAGCAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCTAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTTATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAAACA > 1:377873/1‑143
ATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTGGGAACTGGTATTTAACCAGACTA > 1:781391/1‑143
ATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTA > 2:696573/1‑143
CTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTA < 2:91097/143‑1
TTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTAT > 2:157509/1‑143
TGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTCTTTTGc > 1:520762/1‑142
AAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCG > 1:53132/1‑143
AGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCG > 1:517465/1‑143
gTTGCAACAGTAAGGCCAGGTTGTTAAAAAGGCACCTTTGTAGGTCCTTATTTGTGGCCTGCTTCAAACGTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAAGCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAA < 2:74305/142‑1
ATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAA < 1:660013/143‑1
TTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAAT > 2:168030/1‑143
TTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAAT < 1:986041/143‑1
CAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTAAGGTGCTTTTTAGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAc > 2:296426/1‑142
AACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAAT > 2:316550/1‑143
AACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACGTTCGCCCATCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATGATTTTGATGCGGGAATTTAAT > 1:437757/1‑143
CAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCG > 1:952870/1‑143
AGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTACCCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGT > 2:718210/1‑143
TAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTGTTTAACCAGCCTACTTATTTTGATGCGCGGAATTATTCGATA > 2:1063125/1‑143
AATGCCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTAC > 1:102624/1‑143
AATGCCAGCTGGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGGATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTAC < 1:596288/143‑1
TGCTAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGGCCCTCCTGGCTTTGATGCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGGCTATTTGTTTTGATGTGCGAACTTAAGCGCTACta > 2:118052/1‑141
CCAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGA < 2:947820/143‑1
CAGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAA > 1:1015786/1‑143
AGCTTGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAA < 1:357652/143‑1
AGCTGGTTAAAAATGCACCTTTTTAGGATCTTTTTTGTAGACTGATTCAAAGTTTCGCCCCTCCTAGAATTGATTCAGGCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAA < 2:127973/143‑1
GCTTGTTAAAAATGCACCGTGTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAA < 1:369154/143‑1
ACTACAAGAAGATGAAAGCTTTACCAACAAGAATATTGTGGTTATTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2533257‑2533400
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAA > NC_000913/2533411‑2533538
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
