Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F97 I2 R1
|
17 |
63.6 |
2309030 |
90.9% |
2098908 |
142.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
2,536,312 |
Δ1 bp :: IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp |
coding (479‑484/510 nt) |
crr → |
glucose‑specific enzyme IIA component of PTS |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
2514274 = | NA (NA) | 63 (1.010) |
55/278 |
0.1 |
100% |
noncoding (2/1345 nt) |
IS186 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
= 2536317 |
0 (0.000) | coding (484/510 nt) |
crr |
glucose‑specific enzyme IIA component of PTS |
| * |
? |
NC_000913 |
= 2515616 | NA (NA) | 65 (1.030) |
51/280 |
0.2 |
100% |
noncoding (1344/1345 nt) |
IS186 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
2536312 = |
0 (0.000) | coding (479/510 nt) |
crr |
glucose‑specific enzyme IIA component of PTS |
CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2514418‑2514274
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAGATCAAATTCAATGACAGTATCGCCAACTTT < NC_000913/2536317‑2536176
CCCCGGCATTACGGGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 2:970477/143‑1
CCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG > 1:828868/1‑143
CCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACAAGTTATCGTGAGAGTAATTCCTCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACCACCCTTAAGTTATCGCTTATGGc > 2:1149678/1‑142
CGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGT > 2:517365/1‑143
GGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACAACAACCGTTAAGTTCGCGCGTATGGGgg > 2:440183/1‑141
ATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCA < 1:170524/143‑1
ATTACGTGCCGAAGTATCCAGTCCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCA < 2:181580/143‑1
gTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATCTGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCAC < 1:550126/142‑1
CGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGCGAGTAATTCATCGCCACGTTAAATCATATCAGGCGCAATACCACAACCCCTAAGCTAGCGCTTACGGGTTTCCCCCc > 2:912946/1‑142
GTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCCGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTCATACCCCAACCCTTACGTCAGCGCTTATGGGTTTCACCCAC > 1:722054/1‑143
GTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCTGACATAAGTCTATGAGTCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCAC > 1:1138141/1‑143
GTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTACGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCAC > 1:817694/1‑143
GTGCCGAAGTAGCCAGTTCTGCGGGCTTACCAAGATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCAC < 1:55587/143‑1
CCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGT > 1:921528/1‑143
GAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTA > 1:183700/1‑143
GAAGTATCCAGTTCTGCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTA < 1:792940/143‑1
AAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATCCCACAAACCCTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTAC < 1:272042/143‑1
AAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGGAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTAC > 2:51922/1‑143
CCAGTGCTTCGGGCTTACCGATATGGGCCAGAAGTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCATGTTAAATCACATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACC < 1:57245/143‑1
CAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATAGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCG > 1:654226/1‑143
TTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGT > 1:1081110/1‑143
cccGGCTCACCAATATGGGCCAGCATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATCTCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTT < 1:362741/140‑1
GGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATAT‑AGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGAT < 1:85124/143‑1
CCACTATGGGCCAGAGTTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTT < 2:960193/143‑1
CAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTC > 1:887764/1‑143
AATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTATCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCCGACAGTTTGATCAGGTCT > 2:1015068/1‑143
ATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACAGCTACGCAACCGGACAGTTTGATCAGTTCct > 2:726817/1‑141
tgTGGGCCAGGATTGGCGTCCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTCATTCATAGCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTT < 2:689998/141‑1
TGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTACTACCACAACCCTTCAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTGCCGGCCAGTTTGATCCGTTCTTTGA > 1:623346/1‑143
GGCCCGACTTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGTTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATT < 2:160992/143‑1
GCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTCAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTGCCGGCCAGTTTGATCAGCTCTTGTATTT > 1:1018504/1‑143
GCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGGTAAATCATATCAGGCGTAAGACCACAACCCTTAAGTTAGCGATTATGGGTTTCACCCAAGGTTACGCTGCCGGACAGTTTGATAAGTTCTTTGATTT > 1:1028795/1‑143
CTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTT > 2:561047/1‑143
GACCAGTTATCGAGAAAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGACGTGTGCTTTGATTTCGTACATGTggt > 2:654015/1‑140
ACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGGCCATGTTGGA > 1:770552/1‑143
CAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGA > 1:1074545/1‑143
CAGTTATCGGGGGAGTAATTCAGCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAAGACCACAACCCTTCAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGA < 2:74737/143‑1
AGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGA < 1:1076378/143‑1
AGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCACCCACGATTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGATGATAGCAAACGGAGT > 2:23393/1‑143
ATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGG < 1:561047/143‑1
ATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGG > 1:1051048/1‑143
TTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTTCGTGTTGAAGGTAACAACCGGAGTCAGGG > 1:6148/1‑143
CATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCGCGGTTACGCTACCGGACAGTTTGGTCAGTTCTTTGATTTCGTCAGTGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTA > 1:1007687/1‑143
ATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTCGGAGATAACAACCGGCGTCCGGGTtg > 1:872548/1‑141
ACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGG < 1:842686/143‑1
GTTAAATCATATCCGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCT < 1:154637/143‑1
GTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCT < 1:173933/143‑1
TTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTT > 1:888071/1‑143
TAAATCGTATCAGGCGTAATACCACAACTCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTGCTTTGATTTCGTCCATGTTGTAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTT < 2:819789/143‑1
TCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCT > 2:995393/1‑143
gTATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTC < 2:1138141/142‑1
ATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTC < 1:517365/143‑1
TATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGCGTCAGGGTAGACTTGGCTATATCTTCC > 2:799798/1‑143
ATCAGGCGTCATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCA < 2:776339/143‑1
ATCAGGCGTCACACCTCCACCCTTAAGTTACCGCTTATTGGTTTCCCCCACCGTTACGCTACCGCTCCGTTTGGTCAGTTCTTTGCTTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCA < 2:347570/143‑1
TCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAG > 1:847627/1‑143
GCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTC > 2:110861/1‑85
GCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTC < 1:110861/85‑1
AATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACAGTTACGCTACCGGAAAGTTTGATCAGTACTTTGATTTGGTGAATGTTGGAGATAACAACAGGAGTCAGGGTAGACTTGGCATTCTCTTCCAGAAGCGGga > 2:645921/1‑141
ATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAG > 1:450046/1‑143
tCACAACCCTTCAGTTTGCCGTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGTACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAGATC < 2:855996/142‑1
CACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCCGGGTCGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAGATCA > 1:346967/1‑143
cacCCCGTAAGTTAGCGCTTCTGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGCGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAGATCAAA < 1:904744/140‑1
CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAGATCAAATACA > 1:988824/1‑143
CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCGTCCAGCAGCGGCAGACCAAATTCA > 2:736717/1‑143
TTATGGGCTTCACCCACGGTTACGCTACCGTACAGTTTGATCAGTTCTTTGATGTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAGATCAAATTCAATGACAGTATCGCC < 2:854749/143‑1
TATGGGTTGCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAGATCAAATTCAATGACAGTATCGCCA < 1:827121/143‑1
GTTTCACCCGCGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAGATCAAATTCAATGACAGTATCGCCAACTTT < 2:976025/143‑1
CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2514418‑2514274
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAGATCAAATTCAATGACAGTATCGCCAACTTT < NC_000913/2536317‑2536176
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
