Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F1 I2 R1
|
760 |
67.6 |
3323148 |
92.7% |
3080558 |
109.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,366,935 |
C→T |
*326* (TAG→TAA) |
pspF ← |
psp operon transcriptional activator |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,366,935 | 0 | C | T | 100.0%
| 231.1
/ NA
| 72 | *326* (TAG→TAA) | pspF | psp operon transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (39/33); total (39/33) |
TGCGCTGAGCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAA > NC_000913/1366800‑1367068
|
tGCGCTGAGCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTaa < 1:52549/139‑1 (MQ=255)
aGCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGt < 2:1405262/139‑1 (MQ=255)
cccAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTcaaca < 2:1275374/139‑1 (MQ=255)
aCGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgc > 1:678895/1‑139 (MQ=255)
gCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcgc > 2:204200/1‑139 (MQ=255)
aataatGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCgg > 2:529668/1‑139 (MQ=255)
tCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgat > 1:361330/1‑139 (MQ=255)
tCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgat > 2:1369399/1‑139 (MQ=255)
cagATGCGCAGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTGAACAACGCGCGGAACtgatg < 2:975043/137‑1 (MQ=255)
cTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgatg < 1:204200/139‑1 (MQ=255)
gATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTgatgat > 1:137150/1‑139 (MQ=255)
gATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTgatgat < 1:529668/139‑1 (MQ=255)
ctgcgctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACACGCGGAACTGATGATAAGTTa > 2:758431/1‑139 (MQ=255)
tgcgctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTcaacaa > 2:496778/1‑115 (MQ=255)
tgcgctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTcaacaa < 1:496778/115‑1 (MQ=255)
ctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTTATGATAAGTTAAcccc < 1:1369399/139‑1 (MQ=255)
gCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGaa < 1:1104856/112‑1 (MQ=255)
gCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGaa > 2:1104856/1‑112 (MQ=255)
gCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTc > 2:659325/1‑139 (MQ=255)
tGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGt < 1:1139765/87‑1 (MQ=255)
tGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGt > 2:1139765/1‑87 (MQ=255)
tGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAAtt < 2:445793/135‑1 (MQ=255)
tGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAAtt > 1:445793/1‑135 (MQ=255)
cAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcgcg > 2:826464/1‑104 (MQ=255)
cAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcgcg < 1:826464/104‑1 (MQ=255)
cAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCcg < 1:627490/139‑1 (MQ=255)
cAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCcg > 1:89873/1‑139 (MQ=255)
cAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCAGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCcg > 1:1098871/1‑139 (MQ=255)
aaCGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCcgcg < 1:1085063/139‑1 (MQ=255)
acgTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCt < 1:1224969/139‑1 (MQ=255)
ttGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTgg < 1:659325/139‑1 (MQ=255)
atgtatgCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCt > 1:323024/1‑128 (MQ=255)
atgtatgCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCt < 2:323024/128‑1 (MQ=255)
atgtatgCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTatat > 2:1190850/1‑139 (MQ=255)
tgtatgCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCtt > 1:736308/1‑128 (MQ=255)
tgtatgCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCtt < 2:736308/128‑1 (MQ=255)
tgtatgCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATAtt > 1:258118/1‑139 (MQ=255)
gtatgCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcg < 2:974086/83‑1 (MQ=255)
gtatgCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcg > 1:974086/1‑83 (MQ=255)
gtatgCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTg < 2:1228042/130‑1 (MQ=255)
gtatgCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTg > 1:1228042/1‑130 (MQ=255)
tgCCGAATAAAGCATTCACGCCGCACCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTGccc > 1:1066230/1‑139 (MQ=255)
ccGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTTGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTTATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTgg < 2:805540/126‑1 (MQ=255)
ccGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAc < 1:1175769/99‑1 (MQ=255)
ccGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAc > 2:1175769/1‑99 (MQ=255)
ccGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTgg > 1:805540/1‑126 (MQ=255)
ccGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCtt > 1:1338757/1‑139 (MQ=255)
ccGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCtt > 1:146403/1‑139 (MQ=255)
ccGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTCCTGGTTATATTTCCCtt > 1:603512/1‑139 (MQ=255)
cGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCttg > 2:1223850/1‑139 (MQ=255)
aaTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGt < 2:946471/124‑1 (MQ=255)
aaTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGt > 1:946471/1‑124 (MQ=255)
aaTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCttgtt < 1:582639/139‑1 (MQ=255)
aGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGTcgcg > 1:327048/1‑109 (MQ=255)
aGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGTcgcg < 2:327048/109‑1 (MQ=255)
aGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCaaa > 2:381754/1‑139 (MQ=255)
aTTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTg > 1:1274675/1‑139 (MQ=255)
cACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGt < 2:1338757/139‑1 (MQ=255)
aCGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGtt > 1:742825/1‑139 (MQ=255)
gcATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTgcagc < 1:1371316/139‑1 (MQ=255)
cATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCgg > 1:1078186/1‑60 (MQ=255)
cATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCgg < 2:1078186/60‑1 (MQ=255)
ggCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAActct < 1:1223850/139‑1 (MQ=255)
gTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGaa > 1:864084/1‑52 (MQ=255)
gTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGaa < 2:864084/52‑1 (MQ=255)
ttGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCctgctg < 2:146403/139‑1 (MQ=255)
cTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTg > 1:745903/1‑85 (MQ=255)
cTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTg < 2:745903/85‑1 (MQ=255)
cAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCt > 1:1204064/1‑139 (MQ=255)
cTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCaa > 2:17279/1‑116 (MQ=255)
cTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCaa < 1:17279/116‑1 (MQ=255)
cTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGaa > 1:86527/1‑139 (MQ=255)
|
TGCGCTGAGCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAA > NC_000913/1366800‑1367068
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A