Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F108 I0 R1
|
42 |
63.9 |
1127642 |
97.2% |
1096068 |
264.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,308,355 |
G→T |
22.1% |
L42M (CTG→ATG) |
alsE ← |
allulose‑6‑phosphate 3‑epimerase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,308,355 | 0 | G | T | 22.1%
| 139.5
/ 34.5
| 59 | L42M (CTG→ATG) | alsE | allulose‑6‑phosphate 3‑epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (22/24); new base T (8/5); total (30/29) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.32e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.02e-01 |
CATGACCGTAATTTTATCGGCCTTATGGATATAGTATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGATGGTGCCGATGATCAACCCGCCAATCACCACAGAGAAAATGC > NC_000913/4308074‑4308637
|
cagtaacGTAATTTTATCGGCCTTATGGATATAGTATTTCATGGCCTCAACTTGCGTCTCCGTGTTAAGGATCAGCCTCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTggg < 1:534349/282‑1 (MQ=255)
cATGACCGTAATTTTATCGGCCTTATGGATATAGTATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTggg < 1:440503/288‑1 (MQ=255)
aCCGTAATTTTTTCTGCCTTTTGGATATAGTATTTCCTGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACaa < 2:333798/289‑1 (MQ=255)
aaTTTTATCGGCCTTATGGATATAGTATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGa < 1:301564/289‑1 (MQ=255)
ttttACGGGCCCTATGACTATATTATGTCTTGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAAGATCGGCCCCACTATCATGTCCTGACGGCGGATTTGATCAATCAGGCGGACCGCCTGGCCGTTGATGGTACCCGGATGGAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCCGTTGGGCAATGTAAGCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGGCAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGAAAAAGTGAcc < 2:374235/289‑1 (MQ=255)
tATCGGCCTTATGGATATAGTATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTc < 1:248544/289‑1 (MQ=255)
ataGTATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTgg > 1:256602/1‑289 (MQ=255)
ataGTATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTgg > 2:405144/1‑289 (MQ=255)
ataGTATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTgg > 1:97635/1‑289 (MQ=255)
aGTATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGaa > 2:342419/1‑289 (MQ=255)
tATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGACATCGATGTGGAAGt > 1:69876/1‑289 (MQ=255)
ttCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTaa > 2:287469/1‑288 (MQ=255)
tCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATc > 1:525175/1‑289 (MQ=255)
aaCTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATg > 1:150045/1‑285 (MQ=255)
aGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTaa > 1:233020/1‑289 (MQ=255)
aGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTCACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGAACGTCCATGATATCGATGTGGACGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTaa > 1:155711/1‑289 (MQ=255)
gCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATATGTTCTTTaaa > 2:84675/1‑289 (MQ=255)
atgACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATa < 2:150045/289‑1 (MQ=255)
tgACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATac < 1:287469/289‑1 (MQ=255)
ggcggATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATAcaca < 2:256602/288‑1 (MQ=255)
cggATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGCTAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTa > 1:293446/1‑289 (MQ=255)
aTTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAAc < 1:342419/288‑1 (MQ=255)
tttCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACg < 1:143190/288‑1 (MQ=255)
ttatctcaagcaGGCGGAGCGCCTGGCGGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAATTCTGCTCCCGCACGGGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGGGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACg < 2:69876/283‑1 (MQ=255)
tcaatcaGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAggggg < 2:233020/289‑1 (MQ=255)
cGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTc < 1:405144/288‑1 (MQ=255)
tggtGGTTTCCGGATGCATATTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCcttact < 2:320287/286‑1 (MQ=255)
tGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCcttact < 1:196504/289‑1 (MQ=255)
tGATGCATTCCGGATGCAGAGTGATAAAAGCTTCACCCGAACGCGCCATTTGGGCAAAGTAATACTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGGGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGAGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTTTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCcttact < 2:293446/289‑1 (MQ=255)
atgaAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCg > 2:359725/1‑289 (MQ=255)
tCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGcc > 1:152886/1‑289 (MQ=255)
tCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGcc > 2:361218/1‑289 (MQ=255)
tGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTAATGTTCAATTCATTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGcag > 2:332033/1‑286 (MQ=255)
cgcCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATc > 2:218424/1‑288 (MQ=255)
tGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGccc < 1:359725/286‑1 (MQ=255)
gCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATcacc > 2:282344/1‑289 (MQ=255)
cGGCCGCGTCACCATCGAAGGCAAGTGGGGAGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCGGACTTACGAGGAACAGTGAGAGTGGCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAAt < 2:152886/288‑1 (MQ=255)
cGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTcagca > 2:289857/1‑173 (MQ=255)
cGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTcagca < 1:289857/173‑1 (MQ=255)
cGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATa > 1:234375/1‑289 (MQ=255)
aGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCcttactt > 2:70197/1‑200 (MQ=255)
aGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCcttactt < 1:70197/200‑1 (MQ=255)
tCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAg > 1:238736/1‑288 (MQ=255)
aGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCg > 1:3480/1‑289 (MQ=255)
tttAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCgttgtt > 2:259084/1‑289 (MQ=255)
tAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTcagca > 2:131992/1‑138 (MQ=255)
tAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTcagca < 1:131992/138‑1 (MQ=255)
gaGTTGCCAGGTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGa < 2:3480/288‑1 (MQ=255)
tGCCAGTTTTGTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAATGGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGATg < 2:487023/287‑1 (MQ=255)
aGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACgg > 1:527656/1‑193 (MQ=255)
aGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACgg < 2:527656/193‑1 (MQ=255)
tttttAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGATGGTGCCg < 1:282344/286‑1 (MQ=255)
ccTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGATGGTGCCGATGATCAAcc < 1:361218/289‑1 (MQ=255)
aCTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAAt < 2:162723/231‑1 (MQ=255)
aCTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAAt > 1:162723/1‑231 (MQ=255)
cTTACGAGGAACGGGGAGAGTGTAAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGAGTTCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGGTCGATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGATGGTGCCGATGATCAACCCGcc < 2:297225/288‑1 (MQ=255)
aaCGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGATGGTGCCGATGATCAACCCGCCAATCACcaca > 2:379557/1‑289 (MQ=255)
cGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGATGGTGCCGATGATCAACCCGCCAATCACCACaga > 2:547895/1‑289 (MQ=255)
gtgtCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGATGGTGCCGATGATCAACCCGCCAATCACCACAGAGAAAATgc > 1:106778/1‑289 (MQ=255)
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CATGACCGTAATTTTATCGGCCTTATGGATATAGTATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGATGGTGCCGATGATCAACCCGCCAATCACCACAGAGAAAATGC > NC_000913/4308074‑4308637
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
